-
Open Access Article
1 - Survey relationship between rs2303169 polymorphism in FBN3 gene in patients with polycystic ovary syndrome
Reyhaneh Kalhor naser kalhor Hourieh Kalhor Mojtaba SohrabiAbstract Introduction: Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a very complex and heterogeneous disorder that genetic and environmental factors have a significant contribution to its creation. PCOS is the commonest endocrine abnormality in 6 to 10 percent of women in fertil MoreAbstract Introduction: Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a very complex and heterogeneous disorder that genetic and environmental factors have a significant contribution to its creation. PCOS is the commonest endocrine abnormality in 6 to 10 percent of women in fertility age that FBN3 gene is one of the most important candidate genes, for PCOS. This gene has 20 polymorphisms. This study examines the relationship between rs2303169 polymorphism in FBN3 gene in women with PCOS. Method: This study is a case-control study which is done on 100 women with PCOS and 100 healthy women. In this research, Tetra-ARMS PCR method was used to study the relationship between rs2390169 genotypes in FBN3 gene and the probability of getting PCOS in both patient and control groups. Connecting data from this study are analyzed statistically using SPSS software, chi-squared tests and Independent student t-test. Results: The results of the research showed no significant relationship between rs2303169 polymorphism in FBN3 gene and PCOS (P = 0.152). Also, CT and TT genotypes increased the probability of getting PCOS to 1,995 and 1,621 times towards CC genotype respectively. Conclusion: For the first time, this study showed that there is no significant relationship between rs2303169 polymorphism in FBN3 gene and PCOS. However, relationship between polymorphisms of other genotypes in FBN3 gene and PCOS needs a wider research in greater populations and different ethnicities in the country. Key words: Polycystic ovary syndrome; Polymorphism; FBN3 gene. Manuscript profile -
Open Access Article
2 - The 3ʹ region length polymorphism of clfa gene in staphylococcus aureus clinical samples isolated from three hospitals in Qom city
reza yari Mohammad Reza Mehrabi Fatemeh Mohammad SalehiIntroduction: Staphylococcus aureus produce enzymes and various toxins for survival, protein, carbohydrate, lipid and Nucleic acid degradation, drug resistance, attachment to host cells and pathogenicity. One of the most important of surface bacterial virulence factors MoreIntroduction: Staphylococcus aureus produce enzymes and various toxins for survival, protein, carbohydrate, lipid and Nucleic acid degradation, drug resistance, attachment to host cells and pathogenicity. One of the most important of surface bacterial virulence factors is clumping factor or Clf A. It protein cause to connect bacteria- Fibrinogen host cell. The aim of this study was to investigate the existence and possible variations in the 3'-end of clf A gene. Materials & Methods: 100 clinical strains isolated from Nekuei(Hedayati), Kamkar(Arabnia) and Shahid Beheshti hospitals were selected after confirmation by microbial, biochemical and molecular 16 srRNA tests. A pair of primers for amplification of variable region genes were used. Results: All strains isolated from three hospitals in Qom city produced 1100 bp amplicons size. The amplicons are sent to the relevant company for sequencing and comparison with standard sequence. Conclusion: According to other studies that were produced 900 to 1000 bp amplicons size by the same primers this is the first report of a gene polymorphism in 3'-end of clf A gene in the world. In this area reported 18 nucleotide minisatellite repeats which causes errors in the DNA replication by DNA polymerase as Replication Slippage. This event has been led to the creation and distribution of new version of the gene in the city of Qom. This study needs further investigation about sequence and encoded protein. Manuscript profile -
Open Access Article
3 - Study of GDF9 Gene Polymorphisms and its Association with Twining Rate in Karakul Sheep Breed
رضا Seyedsharifi نجات بادبرین امجد بهمنی علی مجتهدینInroduction & Objective: One of the most important economic traits in sheep is twining. Genetic studies have identified a set of genes that affect twining with major effects called fertility genes. One of them is GDF9 gene that have been identifying on sheep chromosome MoreInroduction & Objective: One of the most important economic traits in sheep is twining. Genetic studies have identified a set of genes that affect twining with major effects called fertility genes. One of them is GDF9 gene that have been identifying on sheep chromosome 5.This study conducted to investigate the GDF9 gene polymorphism and its relationship with prolificacy trait in Karakul sheep breed.Material and MethodsBlood samples and birth data collected from 100 Karakul sheep at the Karakul breeding station of Sarakhs-Iran. After DNA extraction one pair of specific primer selected to amplify a 1503 bp fragment of the gene and Rsa I enzyme was used to digest the amplified fragment. The results showed a mutation at GDF9 locus in Karakul sheep. The relationship between genotypes and twining rate investigated using SAS 9.1 software.Results: The results showed a significant relationship (PConclusion:Therefore, the mutation in GDF9 gene is a useful mutation and fix it will increase twining rate and will ultimately increase revenue. Manuscript profile -
Open Access Article
4 - Assessment of MOB1A and B gene polymorphisms in oral lichen planus patients
Seyed Fateme Askari Leila Farhad Mollashahi Mohamad Ayoub Rigi Ladiz Dor Mohammad Kordi-Tamandani -
Open Access Article
5 - Association of ACTN3 Gene Polymorphism Strength performance of Adolescent wrestlers in Ardabil
Mohammad GhaderiObjective: Both "environment" and "genetics" are considered as essential factors for the athletic performance of elite people. The aim of this study was to investigate the relationship between ACTN3 gene polymorphism and strength performance in novice junior wrestlers i MoreObjective: Both "environment" and "genetics" are considered as essential factors for the athletic performance of elite people. The aim of this study was to investigate the relationship between ACTN3 gene polymorphism and strength performance in novice junior wrestlers in Ardabil.Methods: The statistical sample of this study was 15 beginner juvenile wrestlers in Ardabil in the age range of 11-16 years. Subjects had a history of 6 months to 1 year. Measured athletic performance included upper body strength (pre-chest test) and lower body strength (Scott test). ACTN3 gene polymorphism was determined and compared using salivary samples using polymerase chain reaction and direct DNA sequencing (Tetra-ARMs PCR). After examining the normality and homogeneity of the data, independent group t-test and chi-square test were used for analysis. Results: The results of the present study showed that a significant difference was observed in the frequency of ACTN3 gene polymorphism in beginner juvenile wrestlers. The frequency of polymorphisms was higher in healthy homozygous (RR) and heterozygous (RX) genotypes, respectively (n = 12 (RR) and n = n (RX), P = 0.001). The results of t-test analysis of independent groups showed a significant discrepancy between upper and lower body strength performance indices between polymorphisms (RR, RX) (upper body: P = 0.3, lower body strength: P = 0.4).Conclusion: In the present study, the results showed the superiority of healthy homozygous (RR) genotype in ACTN3 gene of novice male adolescent wrestlers in Ardabil, and despite the significant difference in strength performance indices between the two genotypes (RR and RX); However, due to the high strength performance in the RR genotype compared to the RX, it can be said that this genotype can be considered as an important factor in talent identification in juvenile wrestlers, especially in mountainous areas. Manuscript profile -
Open Access Article
6 - Identification of microsatellite markers linked to Potato Virus Y (PVY) resistance genes in tobacco using Bulk Segregated Analysis (BSA) method
Marzieh Shazdehahmadi Mohammad Reza Salavati MeybodiOne of the most important viral diseases causing damage on tobacco is Potato Virus Y (PVY) which reduses the quality and quantity of tobacco products. The best way to control the disease is use of resistant cultivars. Molecular markers are used to label resistance genes MoreOne of the most important viral diseases causing damage on tobacco is Potato Virus Y (PVY) which reduses the quality and quantity of tobacco products. The best way to control the disease is use of resistant cultivars. Molecular markers are used to label resistance genes in breeding programs. To determine the microsatellite markers linked to PVY resistance genes in tobacco, this research was conducted in Tirtash Tobacco Research Center, Behshahr, Iran. In the first year, VAM (a resistant cultivar) was crossed with K326 (a susceptible cultivar). F1 seeds were plants and F2 seeds were obtained. F2 plants were transplanted in farm and inoculated with a pure isolate of PVY strain O. Area under disease progress curve (AUDPC) was calculated as phenotypic evaluation. To confirm resistance and susceptibility of the used cultivars’ ten plants of each cultivar were tested by ELISA and resistant and susceptible plants were selected. Using 100 SSR pair primers and BSA method, microsatellite markers linked to PVY resistance genes were determined in resistant and susceptible bulks and in F2 populations. Three primer compounds PT30002, PT20165 and PT20357 produced polymorphism on DNA of resistant and susceptible bulks. These primers were also on single plants of two bulks and F2 populations and the data were analyzed. Markers distance from resistance genes was determined by Mapmaker ver.3.0 software. Based on the results, PT3 marker was located on 17.5 CM and PT1 and PT2 on 18.1 and 37.4 CM distance from resistance gene. Manuscript profile -
Open Access Article
7 - The association study of rs3024998 and rs3025000 polymorphisms in VEGF gene with the risk of recurrent pregnancy loss
shohreh zare karizi reza MirfakhraieRecurrent pregnancy loss (RPL) is defined as the occurrence of two or more consecutive pregnancy loss prior to 20th week of gestation. There are several leading causes of RPL including uterine anatomical defects, genetic factors, infectious, immunological, environmental MoreRecurrent pregnancy loss (RPL) is defined as the occurrence of two or more consecutive pregnancy loss prior to 20th week of gestation. There are several leading causes of RPL including uterine anatomical defects, genetic factors, infectious, immunological, environmental and blood dyscariasis. However, despite in a large number of cases no causes have been identified, therefore are introduced as idiopathic. Gene polymorphisms may effect on the incidence of abortion. One of these genes is the vascular endothelial growth factor (VEGF). Present study was aimed to investigate the association of VEGF gene polymorphisms with recurrent spontaneous abortion of the fetus. We conducted a case–control study of 200 women: 100 patients with at least two unexplained consecutive pregnancy losses and 100 healthy controls with at least one live birth and no history of pregnancy loss. Patients with recurrent pregnancy losses due to anatomic, hormonal, chromosomal, infectious, autoimmune, or thrombotic causes were excluded from the study group. Genomic DNA was extracted from peripheral blood lymphocytes. Rs3024998 and rs699947 polymorphisms of VEGF gene were studied using PCR-RFLP technique. Respectively, MaeI and BglII restriction enzymes were used for digestion. Digestion products were visualized by polyacrylamide gel (12%PAGE) electrophoresis. Distribution analysis for homozygous and heterozygous genotypes in the two studied groups was performed by using SPSS ver.18.Genetic differences between case and control groups were calculated by using the chi-square test. Significant difference (P<0.05) was identified between the frequency of allelic status of rs3024998 and rs3025000in two studied groups. Manuscript profile -
Open Access Article
8 - Association study of polymorphisms rs3761548 in FOXP3 gene and Migraine disease
Leila Solgi Sedigheh Farahani شهره زارع کاریزیBackground: FOXP3 is required for the generation and function of regulatory T (Treg) cells. The gene is involved in regulation of inflammatory responses and neuronal cell development. Migraine is an inflammatory disease and is considered as a polygenic multifactorial di MoreBackground: FOXP3 is required for the generation and function of regulatory T (Treg) cells. The gene is involved in regulation of inflammatory responses and neuronal cell development. Migraine is an inflammatory disease and is considered as a polygenic multifactorial disease, and it seems that many genes are involved in this disease. The aim of the present study is to determine if any relation exists between foxp3 rs3761548 gene polymorphisms on the individual susceptibility of migraine. Materials and methods: In this study, 148 patients with clinically definite migraine and 149 ethnically-matched healthy controls participated. Genotyping was performed using PCR-RFLP method for the mentioned polymorphisms in the FOXP3 gene. Logistic regression test were used for estimating odd ration and 95% CI by using SPSS ver.16 software. Results: No significant difference in distribution of foxp3 rs3761548 alleles and genotypes was found in females and males with a history of migraine in comparison to control (p=0.08). Conclusion: This is the first report concerning the association between foxp3 gene polymorphisms and migraine. The further study of FOXP3 related pathways and gene networks might result in the better understanding of the pathophysiology of migraine and related symptoms. Manuscript profile -
Open Access Article
9 - The study of the association of two variants of MLH3(rs175080) andTEX11(rs6525433) in Iranian infertile men
Hanieh Sezavar Zahra Noormohammadi Masoud SheidaiInfertility is one of the most common problems in human societies which estimated between 1 in 6 couples worldwide. It is a complex clinical condition caused by the interaction of genetic and environmental factors. The TEX11 and MLH3 gene plays a key role in the mechani MoreInfertility is one of the most common problems in human societies which estimated between 1 in 6 couples worldwide. It is a complex clinical condition caused by the interaction of genetic and environmental factors. The TEX11 and MLH3 gene plays a key role in the mechanism of DNA repair and crossing over. Methods: In this study, the association of two SNPs of MLH3 (rs175080) and TEX11 (rs6525433) in Iranian infertile men was investigated. One hundred twenty infertile men with azoospermia and 115 healthy individuals were collected as a control. These two polymorphisms were investigated by using tetra-amplification refractory mutation system ((PCR), TETRA - ARMS – PCR), PCR – RFLP, and sequencing were used. Findings and Discussion: The frequency of GG and GA genotypes in MLH3 gene was 30.9% and 69.1% in azoospermia males and 31.3% and 68.7% in the control group (P = 0.619), respectively. The result showed that rs175080 polymorphism in the MLH3 gene and rs6525433 polymorphism in the TEX11 gene were not associated with the risk of Azoospermia. Manuscript profile -
Open Access Article
10 - The correlation of rs4647269 and re1800734 SNPs in MLH1 gene with Iranian male infertility: Azospermia
Mehrdokht Dorpoosh Zahra Noormohammadi Masoud SheidaiIntroduction: Infertility and its problems are considered as one of the most important issues that affect 10-15% of couples. About half of all infertility is related to men. Human spermatogenesis depends on the activity of thousands of genes, and defects in repair mecha MoreIntroduction: Infertility and its problems are considered as one of the most important issues that affect 10-15% of couples. About half of all infertility is related to men. Human spermatogenesis depends on the activity of thousands of genes, and defects in repair mechanisms can stop spermatogenesis. One of the proteins involved in the repair system is the MLH1 protein. The aim of this study was to investigate the association of rs1800734 and rs4647269 polymorphisms in the MLH1 gene with male azoospermic infertility.Methods: In this case-control study, blood samples were collected from 113 men with azoospermia infertility as a patient and 101 healthy men as a control. After DNA extraction, the genotypes of rs4647269 and rs1800734 polymorphisms were determined by RFLP-PCR method using HPYCH4IV and PVUII enzymes, respectively, and confirmed by sequencing. Results: In rs1800734 polymorphism, no significant difference (p <0.05) was observed between the genotypic frequency of the patient and control groups. There was a significant difference between genotypic frequencies between the two groups (P = 0.024), P = 0.021, P = 0.036) Also in this polymorphism in terms of sperm volume in traits (P = 0.000).Conclusion: There is a significant relationship between rs4647269 rs polymorphism of MLH1 gene and azoospermia infertility in the study population of Iranian men and it can probably be effective in it. Manuscript profile -
Open Access Article
11 - Study of a 96-bp insertion polymorphism in the regulatory region of CYP2E1 in cancer patients in comparison with healthy populations in kashan
Hassan Ehteram Mahbube Asghari fahimeh baghbani-araniIntroduction: Cytochrome P450 2E1 (CYP2E1) is involved in the metabolic activation of a wide variety of potential carcinogens, and functional polymorphisms in the CYP2E1 gene have been investigated in relation to various cancers. We examined the relation of the CYP2E1 9 MoreIntroduction: Cytochrome P450 2E1 (CYP2E1) is involved in the metabolic activation of a wide variety of potential carcinogens, and functional polymorphisms in the CYP2E1 gene have been investigated in relation to various cancers. We examined the relation of the CYP2E1 96-bp insertion polymorphism to cancer risk and the interaction between this polymorphism and some lifestyle risk factors.Materials and methods: This study was conducted on 101 samples of patients suffering from four types of lung, breast, stomach and colorectal cancer and 131 healthy individuals as a control group. After extracting DNA from blood samples, the genotype of CYP2E1 96-bp insertion polymorphism was done by molecular PCR method.Results: We found the frequency of the CYP2E1 96-bp insertion to be 66.3 % (67/101) for non-insertion (i/i), 14.9 % (15/101) for heterozygous insertion (i/I) and 18.8 % (19/101) for homozygous insertion (I/I) among case group. The genotypes with allele I (II/Ii) in the CYP2E1 locus have a significant difference in both patient and healthy groups (p value: 0.011). We also found a positive association between smoking and cancer risk (p value:0/004). In this study, the allelic frequencies in normal group were 0.16.4 for I and 0.85.6 for i allele. Conclusion: To conclude, this work is the first study on the genotype distribution of CYP2E1 96-bp insertion polymorphism in Iranian population. The molecular studies on this enzyme provide basis for further epidemiological investigations in populations where the functional mutations in the genes alter therapeutic response and as susceptibility markers for various clinical conditions as well as lifestyle risk factors for cancer. Manuscript profile -
Open Access Article
12 - Polymorphism of coagulase gene in Staphylococcus aureus isolated from buffaloe milk
جلال Shayegh A.R MonadiThe aim of this study was to analyze the coA gene on Staphylococcus aureus isolates collected from milks of native buffaloes in north-west of Iran. For this purpose, seventy five S. aureus isolates were examined by PCR-RFLP. Amplification of coA gene revealed various am MoreThe aim of this study was to analyze the coA gene on Staphylococcus aureus isolates collected from milks of native buffaloes in north-west of Iran. For this purpose, seventy five S. aureus isolates were examined by PCR-RFLP. Amplification of coA gene revealed various amplicons with a sizes of approximately 600, 700, 760 and 850 bp in 12, 25, 29 and 9 of the isolates, respectively. AluI digestion of the amplicons demonstrated that the isolates had the same PCR band size in the same PCR-RFLP patterns. The result of coA gen analysis was similar to the isolates from cattle milk. Manuscript profile -
Open Access Article
13 - Study of polymorphism of Growth Hormone-releasing Hormone (GHRH) Alleles in Iranian Sarabi Cows
mehdi khosravi mehdi aminafshar mohammad chamaniSelection based on molecular markers is one of the new methods that may improve progress and accuracy of selection in animal breeding programs. The GHRH gene (Growth Hormone-releasing Hormone) is a candidate gene for marker-assisted selection strategies. Polymorphs of G MoreSelection based on molecular markers is one of the new methods that may improve progress and accuracy of selection in animal breeding programs. The GHRH gene (Growth Hormone-releasing Hormone) is a candidate gene for marker-assisted selection strategies. Polymorphs of GHRH gene are reported to be significantly associated with milk production and constituent traits. In order to study the polymorphism of GHRH gene, blood samples were collected from 112 Sarabi cows. Genomic DNA was extracted and a fragment of 297 bp in size was amplified using polymerase chain reaction. The amplified fragments were subjected to restriction digestion with HaeIII endonuclease enzyme and the resultant digested products were run on 2% Agarose gel. The results revealed the existence of two alleles of GHRH A and GHRH B for the examined locus with frequencies of 0.19 and 0.81 respectively. Three different genotypic variants including GHRH A GHRH A, GHRH A GHRH B and GHRH B GHRH B were identified with genotypic frequencies of 0.0357, 0.3037 and 0.6607 respectively. The χ2 test showed that population is in Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05). These data provide evidence that sarabi cattle breed have a genetic variability, which opens interesting prospects for future selection programs, especially marker-assistant selection. Manuscript profile -
Open Access Article
14 - Investigation of genetic diversity in crested wheatgrass (Agropyron cristatum (L.) Garetn.) populations using RAPD molecular markers
رضا Taghizadeh علیاشرف Jafari, A علی Asghari رجب ChoukanRandom amplified polymorphic DNA (RAPD) markers have been used to characterize the genetic diversity of 10 Iranian populations of crested wheatgrass (Agropyron cristatum). Ten out of 50 tested RAPD primers produced 57 polymorphic bands with presence or absence of patter MoreRandom amplified polymorphic DNA (RAPD) markers have been used to characterize the genetic diversity of 10 Iranian populations of crested wheatgrass (Agropyron cristatum). Ten out of 50 tested RAPD primers produced 57 polymorphic bands with presence or absence of patterns. Genetic distance among populations based on Jaccard’s genetic similarity coefficients ranged from 0.17 to 0.37. The highest similarity was found between 7844 (Baft) vs. 3029 (Bojnourd) populations, whereas the lowest was among 4336 (Kerman) vs. 4056 (Chadegan) and 208 (Isfahan) vs. 1727 (Gorgan). Molecular variance analysis showed significant variation among populations and within populations, with average values of 13.46% and 86.54%, respectively. Analysis of population structure based on F-statistics revealed a higher values (FST=0.15) of variation within populations. The molecular data were subjected to unweighted pair group method with arithmetic average (UPGMA) cluster analysis and populations were partitioned into three groups. Results of principal coordinate analysis strongly supported cluster analysis results. The interpopulation genetic distance showed no association with the geographic distance between the population sites of origin. However, they were in good agreement with the cluster pattern of morphological data that were obtained in the previous experiment. In general, RAPD marker data proved to be a good method of assessing genetic variation among populations of crested wheatgrass. Manuscript profile -
Open Access Article
15 - Evaluation of Staphylococcus aureus coagulase polymorphism isolated from food and human samples
rogayeh bakht avar ahari changiz ahmadizadehStaphylococcus aureus (S. aureus) is one of the significant factors in the development of hospital infections. In the meantime, hospital personnel and foodstuffs are essential factors that can transfer germs to others. Our aim in this study is to determine the frequency MoreStaphylococcus aureus (S. aureus) is one of the significant factors in the development of hospital infections. In the meantime, hospital personnel and foodstuffs are essential factors that can transfer germs to others. Our aim in this study is to determine the frequency of coagulase gene polymorphism in S. aureus isolated from food and human samples. This descriptive cross-sectional study was performed on suspicious samples infected to S. aureus in the microbiology lab of the Faculty of Veterinary Medicine in Islamic Azad University of Tabriz, during the first 6 months of the year 2016. After initial enrichment, the samples were grown in solid media Blood Agar, and Mannitol Salt agar was cultured. To confirm the presence of coagulase gene, Coa G2 and Coa G3 primers were used: Coagulase gene genotyping was performed by the RFLP method. For this purpose, the PCR product was digested in the presence of the enzyme ALUI. The PCR product was digested by agarose gel after digestion. A total of 63 samples, including 11 samples of samples and 52 food samples of 10 hamburgers and 7 samples of chicken and 11 samples of milk 8, cheese samples and 12 samples of ice cream and 1 sample of fish and 3 specimens of the quail were studied. Among them, 35 No genotypes were detected, and 28 samples of S. aureus were found. The results showed that no significant relation was observed between sample types and genotyping of isolated S. aureus strain. that needs further investigation. Manuscript profile -
Open Access Article
16 - بررسی ارتباط بین چندشکلی ژنهای گیرنده ملاتونین نوع یک و آروماتاز با صفات اقتصادی در گوسفند کردی
ز. داوری ورانلو س. حسنی م. آهنی آذری ف. صمدی س. زکیزاده ع.ر. خان احمدیژن­های گیرنده ملاتونین نوع یک (MTNRlA) و آروماتاز (CYP19) از لحاظ ساختاری مشخص گردید و ارتباط بین انواع ژنوتیپ آنها با صفات تولیدمثلی و رشد در گوسفند کردی ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند شیروان مورد بررسی قرار گرفت. DNA ژنومی با استفاده از روش گوانیدین ایزوت Moreژن­های گیرنده ملاتونین نوع یک (MTNRlA) و آروماتاز (CYP19) از لحاظ ساختاری مشخص گردید و ارتباط بین انواع ژنوتیپ آنها با صفات تولیدمثلی و رشد در گوسفند کردی ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند شیروان مورد بررسی قرار گرفت. DNA ژنومی با استفاده از روش گوانیدین ایزوتیوسیانات-سیلیکا ژل استخراج شد. تکثیر قطعات 140 و 824 جفت بازی از اگزون 3 ژن CYP19 و نیز اگزون 2 ژن MTNRA1 توسط واکنش­های زنجیرهای پلیمراز انجام گرفت. هضم آنزیمی محصولات PCR با استفاده از آنزیم­های برشی BstMBI برای ژن CYP19 و RsaI برای ژن MTNRA1 صورت گرفت و جهت بررسی محصولات هضم روی ژل اکریلامید الکتروفورز شدند. دو آلل A و B برای CYP19 و r و R برای MTRN1A در همه جایگاه­های مورد بررسی شناسایی شد. فراوانی­ آللی در ژنMTRN1A برای آلل­هایR و r به ترتیب 49/0 و 51/0، در حالی که در ژن CYP19، 475/0 و 525/0 به ترتیب برای آلل­های A و B بود. در بررسی ارتباط بین چند شکلی ژن MTNRA1 و صفات تعداد بره در هر زایش (LS)، سن اولین زایش (AFL) و فاصله زایش (LI)، نتایج حاکی از عدم ارتباط بین ژنوتیپ­های مشاهده شده و رکورد­های فنوتیپی بود. همچنین چند­شکلی ژن CYP19 روی صفات وزن تولد (BW)، وزن از شیر گیری (WW) وزن 6، 9 و 12 ماهگی (YW) سن اولین زایش (AFL) و فاصله زایش (LI) هیچ تأثیری نداشت. Manuscript profile -
Open Access Article
17 - بررسی نقص ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید و ناهنجاری ستون فقرات در جمعیتی از گاوهای هلشتاین ایران
B. Hemati S. Gharaie-Fathabad M.H. Fazeli Z. Namvar M. Ranjiدر تحقیق حاضر نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید (BLAD) و ناهنجاری ستون فقرات (CVM) در جمعیتی از گاوهای هلشتاین ایران با استفاده از تکنیک واکنش زنجیرهای پلیمراز-چند شکلی طول قطعات محدود شده (PCR-RFLP) مورد مطالعه قرار گرفت. نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید و نا Moreدر تحقیق حاضر نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید (BLAD) و ناهنجاری ستون فقرات (CVM) در جمعیتی از گاوهای هلشتاین ایران با استفاده از تکنیک واکنش زنجیرهای پلیمراز-چند شکلی طول قطعات محدود شده (PCR-RFLP) مورد مطالعه قرار گرفت. نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید و ناهنجاری ستون فقرات از جمله نواقص ژنتیکی اتوزومال مغلوب و کشنده در گاوهای شیری هلشتاین– فریزیرن هستند. نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید یک اختلال ژنتیکی است که از طریق کاهش بیان مولکولهای چسبندگی بر روی سطح نوتروفیلها، بر روی سیستم خون ساز بدن اثر میگذارد و ناهنجاری ستون فقرات به واسطه مرگ زود هنگام جنین با اختلالاتی همچون گردنی کوتاهتر از حد طبیعی، پاهای خمیده، دندههایی غیر طبیعی و برخی ناهنجاریهای قلبی شناسایی میشود. در اولین مرحله از تحقیق، نمونه تانک شیر از 50 گله گاو شیری جمعآوری گردید. از روش PCR-RFLP برای شناسایی جهشهای نقطهای مربوط به ژنهای ناهنجاری ستون فقرات و نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید استفاده گردید. پس از استخراج DNA، واکنش زنجیرهای پلیمراز برای تکثیر قطعه 136 جفت بازی از ژن CD18 و قطعه 233 جفت بازی از ژن SLC35A3 انجام شد. از آنزیم EcoT22 I برای هضم محصولات واکنش زنجیرهای پلیمراز مربوط به ناقلین نقص ژنتیکی ناهنجاری ستون فقرات و از آنزیم Taq I برای هضم محصولات واکنش زنجیرهای پلیمراز مربوط به ناقلین نقص چسبندگی گلبولهای سفید استفاده گردید. گرچه در هیچیک از گلهها الل موتانت مربوط به نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید در مقایسه با گروه شاهد یافت نشد ولی جهش مربوط به ژن SLC35A3 در 17 گله مختلف مشاهده گردید. در مرحله بعد یک گله که شامل 120 راس گاو دوشا بود به طور تصادفی برای تست انفرادی با استفاده از نمونههای خون انتخاب شد و دو رأس گاو به عنوان ناقلین ژن نقص ژنتیکی ناهنجاری ستون فقرات شناسایی شدند. در این گله مجموع تعداد ژنوتیپ­های AA، Aa و aa به ترتیب برابر 118، 2 و 0 رأس بود و فراوانی آلل­های A و a به ترتیب 992/0 و 008/0 برآورد گردید. سایر گلههای ناقل در مراحل بعدی از این تحقیق مورد بررسی قرار میگیرند. Manuscript profile -
Open Access Article
18 - شناسایی جهشهای جدید در دو ژن کاندیدای تخمکگذاری BMP15, GDF9 و ارتباط آن با چندقلوزایی در بز مرخز
ب. عارفنژاد ی. مهدیزاده آ. جوانمرد م.ج. ضمیری ع. نیازیژنهای کاندیدای BMP15، GDF9 دو ژن مسئول تخمکگذاری محسوب میشود که نقش کلیدی آن در عملکرد باروری پستانداران ماده به اثبات رسیده است. بنابراین میتواند سناریوی خوبی برای تحقیقات پیرامون بهبود باروری در برنامههای انتخاب بر اساس اطلاعات نشانگر باشد. هدف از پژوهش حاضر، شناس Moreژنهای کاندیدای BMP15، GDF9 دو ژن مسئول تخمکگذاری محسوب میشود که نقش کلیدی آن در عملکرد باروری پستانداران ماده به اثبات رسیده است. بنابراین میتواند سناریوی خوبی برای تحقیقات پیرامون بهبود باروری در برنامههای انتخاب بر اساس اطلاعات نشانگر باشد. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی تنوع ژنتیکی و ارتباط جهشهای شناخته شده در سطح دو ژن عمده ذکر شده با صفت چندقلوزایی در بزهای نژاد مرخز میباشد. برای این منظور، شناسایی جهشهای محتمل موجود در این ژنها با سه فناوری RFLP، SSCP و توالییابی متعاقب انجام واکنش زنجیره پلیمراز صورت گرفت. از نتایج مشاهده شده این مطالعه شناسایی جهش جایگزینی گوانین/ آدنین در محل 1026 جفت بازی توالی و جهش از نوع کدونهای مترادف در ناحیه 1049 جفت بازی از ژن BMP15 بود. همچنین، با استفاده از آنزیم محدودگر BcnI متعاقب تکثیر اختصاصی ناحیه از اگزون دوم ژن GDF9 مجددا حضور جهش از نوع جایگزینی اسید امینه گلوتامین به جای اسید آمینه پرولین اثبات شد. از نتایج جالب برگرفته از این مطالعه وجود ارتباط آماری معنیدار بین ژنوتیپهای مشاهده شده حاصل از هضم آنزیمی و فنوتیپ چندقلوزایی در بزهای مرخز (01/0>P) میباشد که در واقع پیام اصلی و کلیدی این پژوهش تظاهر چندقلوزایی بالا در افراد حامل ژنوتیپ هتروزیگوت برای ژن GDF9 میباشد. بهرحال پیشنهاد محققان تحقیق به تکرار آزمایش با اندازه نمونه بیشتر و بررسی اعتبار و تکرارپذیری نتایج در نژادهای بز دیگر میباشد. Manuscript profile -
Open Access Article
19 - ارتباط چندشکلیهای ژن IGF-I با صفات لاشه در گوسفندان نژاد مهربان با استفاده از روش SSCP
S. Behzadi S.R. Miraei-Ashtiani M. Sadeghi P. Zamani R. Abdoliانتخاب به کمک ژنتیک مولکولی با استفاده از ژن­های اختصاصی یک روش پیشنهاد شده برای بهبود ژنتیکی صفات مهم اقتصادی در دامها می­باشد. ژن IGF-I ممکن است نقش­های مهمی در رشد بافت­های متفاوت شامل سلول­های عضلانی، غضروف و استخوان بازی کند. اهداف مطالعه حاضر Moreانتخاب به کمک ژنتیک مولکولی با استفاده از ژن­های اختصاصی یک روش پیشنهاد شده برای بهبود ژنتیکی صفات مهم اقتصادی در دامها می­باشد. ژن IGF-I ممکن است نقش­های مهمی در رشد بافت­های متفاوت شامل سلول­های عضلانی، غضروف و استخوان بازی کند. اهداف مطالعه حاضر برآورد فراوانی­های هاپلوتایپی چندشکلی­های ژن IGF-I در گوسفندان نژاد مهربان و تعیین ارتباط بین این چندشکلی­ها و صفات لاشه در 439 حیوان بودند. واکنش زنجیره­ای پلیمراز با استفاده از روش­های چندشکلی­ آرایش فضایی رشتههای منفرد (PCR-SSCP) و توالی یابی برای شناسایی تفاوت­های ژنتیکی بکار گرفته شدند. دو چندشکلی تک نوکلئوتیدی (C114G و G116A) و دو تغییر آمینو اسیدی (S5T و G6S) با سه الگوی متفاوت در قطعه تکثیر شده از ژن IGF-I شناسایی شدند. ارتباط الگوهای ژن IGF-I با کلسترول و تریگلیسرید خون معنی­دار (05/0P<) و برای ضخامت چربی پشتی و وزن لاشه متمایل به معنی­دار (1/0P<) بود. دیگر صفات مطالعه شده تحت تأثیر معنیداری به وسیله الگوهای متفاوت ژن IGF-I قرار نگرفتند. این یافته­ها نشان می­دهند که چندشکلی­های ژن IGF-I ممکن است به عنوان نشانگرهای DNA برای انتخاب در فرآیندهای اصلاح نژادی در گوسفندان نژاد مهربان مورد استفاده قرار گیرند. Manuscript profile -
Open Access Article
20 - Molecular Screening of Varroa-Resistant Trait of Honey Bee Colonies based on NorpA2 Candidate Gene Polymorphism: A Genetic Case-Control Study
B. Sepehri S. Alijani A. Javanmard H. Johnmohammadi K. Hasanpur -
Open Access Article
21 - آنالیز هورمون رشد در بزهای نژاد آلپاین و سانن با استفاده از روش PCR-SSCP
ر. خاتمی نژاد س. یوسفی م. آهنی آذریدر این مطالعه به منظور بررسی چند شکلی ژن هورمون رشد به عنوان یک ژن کاندیدا، نمونههای خون به طور تصادفی از 34 بز نژاد آلپاین و 42 بز نژاد سانن به دست آمد. DNA از نمونههای گرفته شده استخراج و ناحیه 365 جفت بازی از اگزون 5 ژن هورمون رشد توسط واکنش زنجیرهای پلیمراز Moreدر این مطالعه به منظور بررسی چند شکلی ژن هورمون رشد به عنوان یک ژن کاندیدا، نمونههای خون به طور تصادفی از 34 بز نژاد آلپاین و 42 بز نژاد سانن به دست آمد. DNA از نمونههای گرفته شده استخراج و ناحیه 365 جفت بازی از اگزون 5 ژن هورمون رشد توسط واکنش زنجیرهای پلیمراز تکثیر شد. محصولات PCR توسط روش SSCP بر روی ژل پلی اکریل آمید مورد آنالیز قرار گرفتند. نتایج آنالیز نشان داد که برای ژن مورد مطالعه چهار الگوی باندی متفاوت G1، G2،G3 و G4 به ترتیب با فراوانیهای 38/0 ،21/0 ،23/0 و 18/0 در بز آلپاین و 48/0، 21/0 ، 17/0 و 14/0 در بز نژاد سانن مشاهده شدند. Manuscript profile -
Open Access Article
22 - چندشکلیهای تک نوکلئوتیدی (SNPs) جدید در ناحیههای اینترون 2 و اگزون 3 ژن لپتین در گاوهای Sumba Ongole
و.پ.ب. پوترا پ.پ. آگونگژن لپتین (LEP) گاوی به ­طور وسیعی به­ عنوان یک ژن کاندیدا برای انتخاب مولکولی برای بهبود صفات تولیدی گاوها استفاده شده است. این پژوهش برای تعیین چندشکلیهای تک نوکلئوتیدی (SNPs) در ژن LEP گاوهای Sumba Ongole (SO, Bos indicus) با استفاده از روش توالی­ یابی ان Moreژن لپتین (LEP) گاوی به ­طور وسیعی به­ عنوان یک ژن کاندیدا برای انتخاب مولکولی برای بهبود صفات تولیدی گاوها استفاده شده است. این پژوهش برای تعیین چندشکلیهای تک نوکلئوتیدی (SNPs) در ژن LEP گاوهای Sumba Ongole (SO, Bos indicus) با استفاده از روش توالی­ یابی انجام شد. در این پژوهش مجموعهای از 31 حیوان برای تجزیه و تحلیل استفاده شدند. تحقیق نشان داد که مجموعهای از 16 SNPs در ژن LEP شناسایی شدند. یک توالی 2025 جفت بازی از ژن LEP در این مطالعه بررسی شد و شامل اینترون 2 (1002 جفت باز) و اگزون 3 (1023 جفت باز) بود. مقدار محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) از 0.06 (پایین) تا 0.37 (متوسط) متغییر بود. مجموع 16 چندشکلی در ژن LEP گاوهای SO ارزش PIC متوسط داشتند (0.25<PIC<0.50) و شامل 12 چندشکلی در اینترون 2 و چهار چندشکلی در اگزون 3 میشدند. چندشکلیهای با ارزش PIC متوسط در اینترون 2 (g.2325G/T؛ g.2423A/C؛ g.2448C/T؛ g.2456C/G؛ g.2466C/T؛ g.2778T/A؛ g.2857G/A) و اگزون 3 (g.3260T/C؛ g.3272T/C؛ g.3356C/T؛ g.3468G/A) شناسایی شدند. چندشکلی g.3468G/A به­ عنوان چندشکلی جدید در ژن LEP گاوهای SO معرفی شد که در دیگر نژادهای گاو گزارش نشده است. این چندشکلی باعث تغییر اسیدآمینه از گلایسین (GGG) به آرژنین (AGG) شد. دو نوع از جهش در ژن LEP گاوهای SO شناسایی شد و شامل ترانسورژن (44 درصد) و ترانزیشن (56 درصد) بود. نتیجه گرفته شد که ژن LEP در گاوهای SO چندشکلی نشان داد و دارای پتانسیل برای انتخاب مولکولی در برنامه اصلاح نژادی از طریق تحقیقات عمیق است. Manuscript profile -
Open Access Article
23 - بررسی چند شکلی ژن کاپا کازئین با استفاده از تکنیک PCR-RFLP در جمعیت گاوهای نجدی استان خوزستان
گ. فرهادی م.ت. بیگی نصیری ج. فیاضی ه. روشنفکرکازئینها بیش از 80 درصد کل پروتئین شیر را به خود اختصاص میدهند و به اشکال AlphaS1، AlphaS2، بتا کازئین و کاپا کازئین میباشند. کاپا کازئین از نظر اندازه از دیگر کازئینها کوچکتر بوده ولی به دلیل نقش آن در اندازه و پایداری میسل، تعیین کنندهی خصوصیات کارخانهای شیر م Moreکازئینها بیش از 80 درصد کل پروتئین شیر را به خود اختصاص میدهند و به اشکال AlphaS1، AlphaS2، بتا کازئین و کاپا کازئین میباشند. کاپا کازئین از نظر اندازه از دیگر کازئینها کوچکتر بوده ولی به دلیل نقش آن در اندازه و پایداری میسل، تعیین کنندهی خصوصیات کارخانهای شیر میباشد. مطالعه حاضر به بررسی چند شکلی ژن کاپا کازئین میپردازد. این مطالعه اولین بررسی چند شکلی ژن کاپا کازئین در گاو نجدی ایران است. واکنش زنجیرهای پلیمراز جهت بررسی چند شکلی DNA در 80 گاو استفاده شد. در همه گاوها، تکثیر قطعه 453 جفت بازی از اگزون 4 ژن کاپا کازئین انجام شد. قطعه تکثیر شده ژن کاپا کازئین به وسیله آنزیم محدودکنندهHinfI، مورد هضم قرار گرفت. محصولات هضم شده توسط الکتروفورز بر روی ژل آگارز 3 درصد تفکیک شدند. محصولات هضم شده وجود دو آلل A و Bبا فراوانیهای 54/0 و 46/0 را آشکار ساخت. همچنین ژنوتیپهای AA، AB و BBبا فراوانیهای 35 درصد، 5/37 درصد و 5/27 درصد در کل جمعیت مورد مطالعه وجود تعادل هاردی-واینبرگ را نشان دادند که نشان میدهد که هیچ گونه انتخاب در جهت افزایش یا کاهش فراوانی ژنوتیپی ژن کاپا کازئین در این گله صورت نگرفته است. همچنین سطح هتروزیگوسیتی مربوط به ژن کاپا کازئین در جمعیت مورد مطالعه متوسط ارزیابی گردید. Manuscript profile -
Open Access Article
24 - Search for Association between Ovine Wingless-Type MMTV Integration Site Family Member (Wnt10A) Genes with Supernumerary Teat in Ghezel and Romanov Sheep
S. Eydivandi S. Eghbalsaied M. Momen E. Khajouei A. Javanmard S.M. Ghoreishifar -
Open Access Article
25 - مطالعه چندشکلی ژن کالپاستاتین و تأثیر آن روی صفات وزن اولیه بدن در گوسفند زندی
ن. پیرویسی ع. نوشری ب. همتیهدف از این تحقیق بررسی چندشکلی ژن کالپاستاتین و تأثیر آن روی صفات وزن اولیه بدن در گوسفند زندی با استفاده از تکنیک PCR-RFLP بود. کالپاستاتین ممانعت کننده اصلی سیستم آنزیمی کالپاین-کالپاستاتین بوده و نقش مهمی در تنظیم مسیر پروتئین­ سازی بر عهده دارد. DNA ژنومی با است Moreهدف از این تحقیق بررسی چندشکلی ژن کالپاستاتین و تأثیر آن روی صفات وزن اولیه بدن در گوسفند زندی با استفاده از تکنیک PCR-RFLP بود. کالپاستاتین ممانعت کننده اصلی سیستم آنزیمی کالپاین-کالپاستاتین بوده و نقش مهمی در تنظیم مسیر پروتئین­ سازی بر عهده دارد. DNA ژنومی با استفاده از نمونههای خون کامل 124 رأس گوسفند زندی انتخاب ­شده به ­صورت تصادفی و با استفاده از روش استخراج نمکی تهیه گردید. همچنین وزن تولد، وزن 150 روزگی و افزایش وزن روزانه تولد تا سن 150 روزگی ثبت گردید. تکثیر ناحیه 622 جفت بازی اگزون و اینترون 1 ژن کالپاستاتین انجام شد. محصول PCR با استفاده از آنزیم برشی MSP I هضم و روی ژل آگارز الکتروفورز گردید. نتایج دو آلل A و B به ترتیب با فراوانیهای 80.6 و 19.4 و سه ژنوتیپ AA، BB و AB به ترتیب با فراوانیهای 65.32، 4.04 و 30.64 را نشان داد. آزمون­های X2 و G2 برقراری تعادل هاردی-واینبرگ در جایگاه مورد مطالعه را نشان داد. اثر ژنوتیپ کالپاستاتین روی صفات رشد غیرمعنی­دار بود اما ژنوتیپ BB بهترین عملکرد را در هر سه صفت نشان داد که نشان دهنده عملکرد بهتر آلل نرمال (B) نسبت به آلل موتان (A) برای این صفات است. Manuscript profile -
Open Access Article
26 - RFLP Analysis of Beta‐Lactoglobulin Gene in Swamp and Murrah Buffaloes Using a Single Restriction Enzyme
W. Nualchuen K. Srisakwattana S. Chethasing K. Tasripoo S. Usawang R. Hengtrakulsin M. Kamonpatana -
Open Access Article
27 - توزیع فراوانی آللها در ناحیه ′5 ژنهای CYP19 و ERα در گاوهای سیمنتال و سه نژاد بومی ایران
ف. محمد نژاد سنگدهی ق. رحیمی میانجی م. صفدری شاهرودی س.ع. رضوی-ششده م. غلامیپژوهش حاضر به منظور بررسی دو جایگاه پلی مورف از ژن CYP19 (PvuII و MspI) و یک جایگاه پلی مورف از ژن ERα (SnaBI) در چهار نژاد گاو شامل مازندرانی، تالشی، سیستانی و سیمنتال انجام شد. در مجموع 278 نمونه برای ژن CYP19 و 206 نمونه برای ژن ERα با استفاده از تکنیک PC Moreپژوهش حاضر به منظور بررسی دو جایگاه پلی مورف از ژن CYP19 (PvuII و MspI) و یک جایگاه پلی مورف از ژن ERα (SnaBI) در چهار نژاد گاو شامل مازندرانی، تالشی، سیستانی و سیمنتال انجام شد. در مجموع 278 نمونه برای ژن CYP19 و 206 نمونه برای ژن ERα با استفاده از تکنیک PCR-RFLP تعیین ژنوتیپ شدند. برای جایگاه CYP19/PvuII، فراوانی آلل A دامنه­ای از 89/0 در نژاد مازندرانی تا 98/0 در نژاد تالشی داشت. برای جایگاه CYP19/MspI، تالشی تنها نژاد مونو مورف با ژنوتیپ AA بود. سایر نژادها پلی مورف بودند و فراوانی آلل A از 93/0 (سیمنتال) تا 98/0 (سیستانی) متغیر بود. ژنوتیپ BB در نمونه مورد مطالعه مشاهده نشد. با در نظر گرفتن دو جایگاه در ترکیب با یکدیگر، تنها 5 ژنوتیپ از 8 ژنوتیپ ترکیبی ممکن مشاهده شد. برای جایگاه ERα/SnaBI، همه جمعیت­ها پلی مورف بودند. بیشترین و کمترین فراوانی آلل A به ترتیب در نژادهای سیستانی (55/0) و سیمنتال (96/0) مشاهده شد. بر اساس شاخص نی، بیشترین فاصله ژنتیکی بین دو نژاد سیستانی و سیمنتال، و کمترین فاصله ژنتیکی بین دو نژاد مازندرانی و تالشی مشاهده شد. نتایج پژوهش حاضر نشان دهنده وجود اختلاف معنی دار در فراوانی­های ژنوتیپی و آللی در بین چهار نژاد مورد بررسی بود. این یافته­ها ممکن است در مطالعات آتی مانند مطالعات ارتباطی برای صفات عملکردی در اصلاح نژاد گاو مورد استفاده قرار گیرد. Manuscript profile -
Open Access Article
28 - ارتباط چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP) g.281G > A ژن CAST با کیفیت گوشت بز بوئرکا
ا. آنتنیوس س.پ. گینتینگ س. الایزر ا. تاریگان س. سلهودین آی.گ.س. بودیساتریا آ.پ.ز.ن.ل. ساری د.ن.ه. هاریونو د. ماهارانیژن کالپاستاتین به عنوان یک ژن کاندید برای کیفیت گوشت در گاو، گوسفند و مرغ شناخته شده است. هدف از این مطالعه شناسایی چندشکلیهای ژن CAST و ارتباط آن با صفات گوشت در بز بوئرکا بود. دادههای PH، از دست دادن پخت (CL)، نیروی برشی Warner-Bratzler (WBSF)، ظرفیت نگهداری آب (WHC Moreژن کالپاستاتین به عنوان یک ژن کاندید برای کیفیت گوشت در گاو، گوسفند و مرغ شناخته شده است. هدف از این مطالعه شناسایی چندشکلیهای ژن CAST و ارتباط آن با صفات گوشت در بز بوئرکا بود. دادههای PH، از دست دادن پخت (CL)، نیروی برشی Warner-Bratzler (WBSF)، ظرفیت نگهداری آب (WHC)، کلسترول، آب، خاکستر، چربی، و محتوای پروتئینی رکورد برداری شدند. توالییابی 21 نمونه، پنج چندشکلی تکنوکلئوتیدی در اینترون 12 ژن CAST در بز بوئرکا، به نامهای g.146C > A، g.224A > G، g.281G > A، g.737C > T و g.431G > A نشان داد. تنها چندشکلی تک­نوکلئوتیدی (SNP) g.281G > A برای تعیین ژنوتیپ استفاده شد. فراوانی ژنوتیپی و آللی براساس g.281G > A نشان دهنده 14.29 درصد (ژنوتیپ GG) و 85.71 درصد (ژنوتیپ GA) همراه با 57 درصد آلل G و 43 درصد آلل A بود. آزمون کای-اسکوئر انحراف از تعادل هاردی-واینبرگ (HWE) (05/0P<) در بز بوئرکا را نشان داد. چندشکلی g.281G > A نشان دهنده دارا بودن اثر معنیدار بر CL بود. حیوانات با ژنوتیپ GA درصد CL کمتری در مقایسه با حیوانات GG داشتند. در نتیجهگیری، SNP انتخاب شده میتواند برای شناسایی گوشت دارای CL پایین در بز بوئرکا استفاده شود. Manuscript profile -
Open Access Article
29 - مطالعه چند شکلی ژن DGAT1 و ارتباط آن با صفات وزن لاشه و بازده لاشه در گوسفند نژاد مغانی
ف. علاء نوشهر ع. رأفتژن دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز (DGAT1) به عنوان ژن کاندیدا برای صفات کیفی گوشت گوسفند شناخته شده است. یک چند شکلی تک نوکلئوتیدی منجر به ایجاد جهش (C به T) در جایگاه AGCT آنزیم اندونوکلئاز AluI میشود. به منظور مطالعه چند شکلی ناحیه T487C در اگزون 17 ژن DGAT1 به طور ت Moreژن دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز (DGAT1) به عنوان ژن کاندیدا برای صفات کیفی گوشت گوسفند شناخته شده است. یک چند شکلی تک نوکلئوتیدی منجر به ایجاد جهش (C به T) در جایگاه AGCT آنزیم اندونوکلئاز AluI میشود. به منظور مطالعه چند شکلی ناحیه T487C در اگزون 17 ژن DGAT1 به طور تصادفی از 150 گوسفند مغانی، خون­گیری و استخراج dna به عمل آمد. واکنش زنجیره­ای پلیمراز برای تکثیر قطعه 309 جفت بازی از اگزون 17 ژن DGAT1 با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی انجام گرفت. نتایج آنالیز PCR-RFLP نشان داد که SNP دارای سه ژنوتیپ TT (37 و 272bp ) ، TC (37، 272 و 309 bp) و CC (309bp ) می­باشد. همچنین فراوانی دو آلل T و C به ترتیب برابر با 829/0 و 171/0 مشاهده شد. آنالیز آماری ارتباط معنی­داری را بین صفات وزن دنبه و ضخامت چربی پشت با ژنوتیپ­ها نشان داد. به طوریکه گوسفندان دارای ژنوتیپ CC به طور معنی­داری (05/0P<) دنبه سنگین­تر و ضخامت چربی بیشتری نسبت به گوسفندان با ژنوتیپTT ، داشتند. در نتیجه از چند شکلی نشان داده شده ممکن است بتوان در برنامه­های اصلاح نژادی گوسفند مغانی از طریق انتخاب ژنوتیپ­های برتر، برای بهبود صفات وزن لاشه و بازده لاشه بهره جست. Manuscript profile -
Open Access Article
30 - بررسی چند شکلیهای جایگاههای ژنی FSHβ و FSHR و ارتباط آنها با عملکرد صفات تولیدی و تولیدمثلی در گوسفندان نژاد ایران بلک، آرمان و بلوچی
ن. نظیفی ق. رحیمی میانجی ز. انصاری پیر سراییهدف از مطالعه حاضر بررسی چند شکلی در ژن گیرنده هرمون محرک فولیکولی (FSHR) و ژن زیر واحد بتای هرمون محرک فولیکولی (FSHβ) و ارتباط آن با صفات نرخ زایش و افزایش وزن بدن در گوسفندان نژاد بلوچی، ایران بلک و آرمان میباشد. در ابتدا ردیابی چند شکلی در ژن FSHβ به کمک Moreهدف از مطالعه حاضر بررسی چند شکلی در ژن گیرنده هرمون محرک فولیکولی (FSHR) و ژن زیر واحد بتای هرمون محرک فولیکولی (FSHβ) و ارتباط آن با صفات نرخ زایش و افزایش وزن بدن در گوسفندان نژاد بلوچی، ایران بلک و آرمان میباشد. در ابتدا ردیابی چند شکلی در ژن FSHβ به کمک تکنیک PCR-RFLP و آنزیمهای محدود کننده ACCI و HinfI انجام شد و هیچ نوع الگوی باندی چند شکلی در این جایگاه ژنی نشان داده نشد. در مرحله بعد به منظور مطالعات بیشتر در این جایگاه ژنی از تکنیک SSCP استفاده شد که در نتیجه آن ژنوتیپهای AA و AC در گوسفندان نژاد بلوچی، ژنوتیپهای AA و AB در گوسفندان نژاد ایران بلک مشاهده شد ولی کلیه نمونههای مربوط به گوسفندان نژاد آرمان فقط ژنوتییپ AA را نشان دادند. رد­یابی چند شکلی در ژن FSHR به کمک تکنیک PCR-RFLP و تیمار آنزیمی MSCI انجام شد و سه نوع ژنوتیپ AA، AB و BB در بین نژادهای مورد مطالعه مشاهده شد. آلل B در هر سه نژاد مورد مطالعه بیشترین فراوانی را داشت. آنالیز تجزیه واریانس این جایگاههای ژنی به کمک نرم افزار SAS انجام شد. آزمون مقایسه میانگین دانکن نشان داد که چند شکلیهای هر دو جایگاه ژنی FSHR و FSHβ تأثیر معنی داری را روی صفت نرخ زایش در نژاد بلوچی دارند. همچنین نشان داد که آلل جهش یافته می­تواند متوسط نرخ زایش را به صورت قابل توجهی نسبت به آلل وحشی افزایش دهد. آنالیز دادههای مربوط به صفت وزن بدن در سنین مختلف و چند شکلی در جایگاه ژنی FSHβ، در هیچ یک از سه نژاد مورد مطالعه اختلاف معنی داری را نشان نداد. مطالعات چند شکلی در جایگاه ژنی FSHR و صفات افزایش وزن بدن نشان دهنده وجود اختلاف معنی داری در نژاد آرمان است، و نشان داد که آلل وحشی عملکرد بهتری دارد. این اطلاعات می­تواند در برنامههای اصلاح نژادی در پرورش گوسفند مورد استفاده قرار بگیرد و سبب بهبود عملکرد تولیدی و تولیدمثلی شود. Manuscript profile -
Open Access Article
31 - چندشکلی تک نوکلئوتیدی ژن GDF9 در گوسفندان نژادهای بهمئی و لک قشقایی و ارتباط آنها با چندقلوزایی
م. محقق دولت آبادی ج. حبیبیزادفاکتور رشد و تمایز-9 (GDF9) متعلق به خانواده بزرگ فاکتور انتقال رشد بتا بوده که در فولیکول­های در حال رشد تخمدان به شدت بیان میشود، و با صفات باروری در گوسفند ارتباط زیادی دارد. بنابراین، ژن کد کننده GDF9 میتواند به عنوان نشانگر ژنتیکی جهت بهبود عملکرد تولیدمثلی Moreفاکتور رشد و تمایز-9 (GDF9) متعلق به خانواده بزرگ فاکتور انتقال رشد بتا بوده که در فولیکول­های در حال رشد تخمدان به شدت بیان میشود، و با صفات باروری در گوسفند ارتباط زیادی دارد. بنابراین، ژن کد کننده GDF9 میتواند به عنوان نشانگر ژنتیکی جهت بهبود عملکرد تولیدمثلی در گوسفند استفاده شود. از این رو، هدف از این مطالعه بررسی ژن باروری GDF9 در دو نژاد گوسفند بومی، بهمئی و لک قشقایی، استان کهگیلویه و بویراحمد ایران بود. برای این منظور، ماده ژنتیکی از تعداد 20 رأس میش بهمئی و 20 رأس میش لک قشقایی (10 رأس تکقلوزا و10 رأس دوقلوزا از هر نژاد) استخراج گردید. طول کامل هر دو اگزون 1 و 2 در ژن GDF9 گوسفند توسط 3 جفت آغازگر تکثیر شد و شناسایی چندشکلیهای تک نوکلئوتیدی (SNPs) در قطعات تکثیر شده با استفاده از روش تعیین توالی مستقیم تعیین گردید. اولین و سومین قطعه تکثیر شده از ژن GDF9 تنها یک ژنوتیپ در هر دو نژاد نشان داد. نتایج تعیین توالی قطعه دوم 4 چندشکلی تک نوکلئوتیدی آشکار کرد که از آنها 3 جهش در اگزون 2 و 1 جهش جدید در اینترون ژن GDF9 بود. هیچ ارتباط معنیداری بین ژنوتیپهای ترکیبی جهشهای شناسایی شده با صفت چندقلوزایی در هر دو نژاد مشاهده نشد. به طور کلی، دو نژاد از نظر ساختار ژنتیکی نسبت به ژن GDF9 متفاوت بودند. توزیع فراوانی چندشکلیهای تک نوکلئوتیدی شناسایی شده در ژن GDF9 در دو نژاد متفاوت بود. Manuscript profile -
Open Access Article
32 - تأثیر چندشکلی ژن هورمون رشد روی نرخ رشد گاوهای جوان
ت.ا. سدیخ ای.ی. دولماتووا ف.ر. والیتوو ر.س. گیزاتولین ل.ا. کالاشینکوواتولید گوشت یک منطقه توسعهای مهم در پرورش حیوانات است با کیفیت گوشت که توسط فاکتورهای پاراتیپیک و ژنتیکی تعیین میشود. از این رو ارزیابی ماده ژنتیکی برای حضور ترکیبات آللی مطلوب ژنهای مرتبط با رشد شاخصهای توسعه و همچنین کیفیت گوشت حیوانات از اهمیت علمی و عملی خاصی بر Moreتولید گوشت یک منطقه توسعهای مهم در پرورش حیوانات است با کیفیت گوشت که توسط فاکتورهای پاراتیپیک و ژنتیکی تعیین میشود. از این رو ارزیابی ماده ژنتیکی برای حضور ترکیبات آللی مطلوب ژنهای مرتبط با رشد شاخصهای توسعه و همچنین کیفیت گوشت حیوانات از اهمیت علمی و عملی خاصی برخوردار است. هدف از این مطالعه تعیین تأثیر چندشکلی ژن هورمون رشد روی نرخ رشد گوسالههای نر نژادهای مختلف نگهداری شده در جمهوری باشقیرستان بود. روش واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) به همراه آنالیز چندشکلی قطعات طولی قابل هضم (RFLP) (SNP GH-L127V) برای تعیین ژنوتیپ گوسالههای نر پرواری هرفورد (115 رأس)، لیموزین (114 رأس)، سیاه و سفید (200 رأس) و بستوژو (200 رأس) استفاده شد. پژوهش انجام شده نشان داد که یک توزیع مشابه ژنوتیپی بین گوسالههای نر نژادهای گوشتی وجود دارد با ژنوتیپ هموزیگوت GHLLمتداولتر (47.83 درصد و 52.63 درصد). گوسالههای نر سیاه و سفید و بستوژو فراوانی بالاتر از ژنوتیپ هموزیگوت GHLVداشتند (62.50 درصد و 59.0 درصد). نرهای هرفورد، لیموزین و سیاه و سفید فراوانی بالاتری از آلل GHLداشتند (0.69، 0.71 و 0.51)، حیوانات بستوژو نرخ بالاتری از آلل GHv(0.62) داشتند. مقاله تأثیر چندشکلی ژن هورمون سوماتوتروپین روی برخی از شاخصهای بهرهوری گوشت و نرخ رشد حیوانات جوان ارائه میدهد. بنابراین، گوسالههای نر ژنوتیپ شده GHLLهرفورد، لیموزین، و سیاه و سقید وزن زنده قابل توجه بالاتری (وزن زنده پیش از کشتار) و همچنین افزایش وزن زنده مطلق و متوسط روزانه در پایان دوره پرورش داشتند. بر اساس نتایج، حیوانات ژنوتیپ شده GHLVدر مکان دوم و نرهای ژنوتیپ شده GHVVرتبه آخر را داشتند. به عنوان نتیجه آنالیز واریانس یک سویه، نسبت بالایی از فاکتور چندشکلی مورد مطالعه در توسعه شاخصهای بهرهوری گوشت و نرخ رشد برای گوسالههای نر لیموزین، سیاه و سفید و هرفورد یافت شده است. ژنوتیپ ژن GH به عنوان یک معیار فرعی میتواند در انتخاب حیوانات برای بهبود کیفیت گوشت گاو مورد استفاده قرار گیرد. Manuscript profile -
Open Access Article
33 - Analysis of Genetic Diversity in Berari Goat Population of Maharashtra State
P. Mishra A.S. Ali S.V. Kuralkar S.P. Dixit R.A.K. Aggarwal P.S. Dangi N.K. Verma -
Open Access Article
34 - ارتباط ژن PIT1 با درصد چربی شیر در گاو هلشتاین
ز. ابراهیمی حسینزاده م.ر. محمدآبادی ع. اسمعیلیزاده الف خضری ع. نجمی نوریژن فاکتور نسخه برداری ویژه هیپوفیز (PIT1) مسئول رشد و توسعه هیپوفیز و بیان ژن ترشح این هورمون در پستانداران است. ژن PIT1 به عنوان یک نشانگر ژنتیکی کاندیدا برای صفات رشد، لاشه و نیز تولید شیر معرفی شده است. در حیوانات شیری مزرعه­ای، هدف اصلی انتخاب بهبود و افزایش تول Moreژن فاکتور نسخه برداری ویژه هیپوفیز (PIT1) مسئول رشد و توسعه هیپوفیز و بیان ژن ترشح این هورمون در پستانداران است. ژن PIT1 به عنوان یک نشانگر ژنتیکی کاندیدا برای صفات رشد، لاشه و نیز تولید شیر معرفی شده است. در حیوانات شیری مزرعه­ای، هدف اصلی انتخاب بهبود و افزایش تولید شیر و ترکیبات شیر می­باشد. ژن­های پروتئین شیر و هورمون­ها ژن­های کاندیدای عالی برای آنالیز پیوستگی با جایگاه­های صفات کمی (QTL) می­باشند، زیرا دارای اهمیت بیولوژیکی روی صفات کمی جالب و مفید هستند. لذا در این مطالعه، ارتباط و همبستگی بین چند شکلی ژن PIT1 و درصد چربی شیر در گاوهای هلشتاین استان خراسان رضوی ایران مورد آنالیز قرار گرفت. تعداد 100 گاو هلشتاین از یک گله 1000 رأسی در استان خراسان رضوی مطالعه شد. DNA ژنومی از خون کامل استخراج گردید. یک جفت پرایمر برای تکثیر ژن PIT1 استفاده شد و محصولات PCR روی ژل آگارز 1 درصد الکتروفورز شدند. سپس محصولات PCR با آنزیم برشی HinfI هضم شدند. نتایج به وسیله نرم افزار PopGene آنالیز شدند و فراوانی آللی A و B برای ژن PIT1 به ترتیب 25/0 و 75/0 به دست آمد. فراوانی ژنوتیپهای AA، AB و BB، تعداد آلل واقعی، تعداد آلل مؤثر، هتروزیگوسیتی مورد انتظار، هتروزیگوسیتی مشاهده شده، متوسط هتروزیگوسیتی، هموزیگوسیتی مورد انتظار، هموزیگوسیتی مشاهده شده، شاخص نئی و شاخص شانون به ترتیب 6، 40 و 54 درصد، 2، 60/1، 37/0، 40/0، 37/0، 62/0، 59/0، 37/0 و 56/0 محاسبه شد. نتیجه آزمون کای اسکور نشان داد که در جمعیت تعادل هاردی- واینبرگ برقرار است. برای محاسبه ارتباط بین درصد چربی شیر و ژنوتیپهای مشاهده شده از نرم افزارSAS و رویه آماری GLM استفاده شد و نتایج نشان داد که اثر ژنوتیپ بر درصد چربی معنی دار است (01/0>P) و ژنوتیپ AB بیشترین اثر را بر روی درصد چربی شیر داشت. نتایج نشان داد که ژنوتیپهای PIT1 روی درصد چربی شیر اثر دارند، لذا پیشنهاد می­دهند که این چندشکلی می­تواند به عنوان یک نشانگر ملکولی برای این صفت استفاده شود. Manuscript profile -
Open Access Article
35 - Association between Ovoinhibitor (OIH) Gene Polymorphism and Egg Quality Traits in Golden Kamper Hybrid Chickens (Gallus gallus domesticus)
D. Retnosari B.S. Daryono -
Open Access Article
36 - Association between the Melanocortin-4 Receptor (MC4R) Gene Polymorphisms and Growth Trait in Sumba Ongole Cattle
A. Fathoni S. Sumadi I.G.S. Budisatria A.P.Z.N.L. Sari D. Maharani -
Open Access Article
37 - Polymorphisms in GDF9 Gene and Its Relationship with Litter Size in Five Breeds of Black Goats
G.Q. Zhu Q.I. Wang Y.G. Kang Y.Z. Lv B.Y. Cao -
Open Access Article
38 - چندشکلی مرتبط با برخی از صفات گوشت در نژادهای گوسفند مصری
کا.ف. ماهروس م.اس. حسنان م. ابدل مردی اچ.آی. شافی اچ.ای. روشدیچندشکلی ژنتیکی برخی از ژن­های مرتبط با تولید گوشت در سه نژاد گوسفند مصری (بارکی، رحمانی و اُسیمی) مورد مطالعه قرار گرفت. ژن­های کاندیدا شامل کالپاستاتین، میوستاتین، دی­آسیل گلیسرول استیل ترانسفراز 1، پروتئین شماره 3 متصل شوده به فاکتور رشد شبه انسولینی و ژن Moreچندشکلی ژنتیکی برخی از ژن­های مرتبط با تولید گوشت در سه نژاد گوسفند مصری (بارکی، رحمانی و اُسیمی) مورد مطالعه قرار گرفت. ژن­های کاندیدا شامل کالپاستاتین، میوستاتین، دی­آسیل گلیسرول استیل ترانسفراز 1، پروتئین شماره 3 متصل شوده به فاکتور رشد شبه انسولینی و ژن باروری برولا بودند. برای این هدف از روش PCR-RFLP استفاده شد. چندشکلی در ژن­های کالپاستاتین، میوستاتین و دی­آسیل گلیسرول استیل ترانسفراز 1 مشاهده گردید ولی در ژن­های پروتئین شماره 3 متصل شوده به فاکتور رشد شبه انسولینی و ژن باروری برولا چندشکلی دیده نشد. کالپاستاتین با کمک آنزیم MspI هضم شده و دو ژنوتیپ MM و MN مشاهده شد. بیشترین فراوانی آللی مربوط به آلل M بود. جایگاه کالپاستاتین با کمک آنزیم NcoI نیز هضم شده و ژنوتیپ­های MM و MN دیده شدند. ژنوتیپ NN در هر دو آنزیم MspI و NcoI در کلیه نژادها دیده نشد. میوستاتین توسط DraI هضم شده و دو ژنوتیپ AB و BB مشاهده گردید. ژنوتیپ AA تشخیص داده نشد. بیشترین فراوانی آللی مربوط به آلل B بود. دی­آسیل گلیسرول استیل ترانسفراز 1 توسط AluI هضم شد و دو ژنوتیپ CC و CT ایجاد نمود. بیشترین فراوانی آللی مربوط به آلل C بود. ژنوتیپ CT می­تواند بیانگر وجود چربی بین ماهیچه­ای و ماربلینگ ماهیچه­ای متوسط در نژادهای گوسفند مصری باشد. هر کدام از دو جایگاه ژنی دیگر (پروتئین شماره 3 متصل شوده به فاکتور رشد شبه انسولینی و ژن باروری برولا) تنها یک ژنوتیپ (ژنوتیپ BB در پروتئین شماره 3 متصل شوده به فاکتور رشد شبه انسولینی هضم شده با آنزیم HaeIII و ژنوتیپ ++ در ژن باروری برولا هضم شده با آنزیم AvaII) داشتند. بنابراین استفاده از این جایگاه­ها در برنامه­های انتخاب توصیه نمی­شود. نتایج آنالیز مربع کای نیز نشان داد که این سه نژاد گوسفند مصری در تعادل هاردی-واینبرگ بودند. Manuscript profile -
Open Access Article
39 - اثر چندشکلیهای UCP روی صفات رشد، ارزش اصلاحی صفات رشد و صفات تولیدمثلی در مرغ بومی فارس
آ. محمدیفر م.ر. محمدآبادیپروتئین غیر مزدوج طیور (avUCP) عضوی از فوق خانواده ناقلین میتوکندریایی است که ورود پروتئین به ماتریکس میتوکندری را از سنتز ATP آزاد می­کند. از روش PCR-RFLP برای برآورد فراوانی­های آللی و ژنوتیپی چندشکلی­های UCP/HhaI استفاده شد و همبستگی بین این چندشکلی­ه Moreپروتئین غیر مزدوج طیور (avUCP) عضوی از فوق خانواده ناقلین میتوکندریایی است که ورود پروتئین به ماتریکس میتوکندری را از سنتز ATP آزاد می­کند. از روش PCR-RFLP برای برآورد فراوانی­های آللی و ژنوتیپی چندشکلی­های UCP/HhaI استفاده شد و همبستگی بین این چندشکلی­ها و صفات رشد، ارزش­ اصلاحی صفات رشد و تولیدمثلی در مرغ بومی فارس محاسبه شد. برای این منظور اطلاعات فنوتیپی 18 نسل متوالی از 200 پرنده با استفاده از مدل حیوانی تک صفتی با روش ASREML آنالیز شد. ارزیابی همبستگی بین این SNP با صفات تولیدمثلی اثر مثبت ژنوتیپ TC را با سن اولین تخم­گذاری (ASM) در مقایسه با ژنوتیپ CC پیشنهاد می­کند. به علاوه، ژنوتیپ TC همبستگی معنیداری با ارزش اصلاحی سن اولین تخم­گذاری در مقایسه با ژنوتیپ CC نشان داد (05/0>P). در نتیجه، نتایج این پژوهش پیشنهاد می­کند که ژنوتیپ TC ژن UCP با سن بلوغ جنسی (ASM) و ارزش اصلاحی سن بلوغ جنسی همبستگی دارد و چندشکلی­های UCP می­توانند به عنوان نشانگرهای DNA برای انتخاب در فرآیند اصلاح نژاد مرغ بومی فارس مورد استفاده قرار گیرند. Manuscript profile -
Open Access Article
40 - بررسی ملکولی اگزون 2 ژن BMP15 به روش PCR-SSCP در گوسفند نژاد بلوچی ایران
A. Gholibeikifard M. Amin Afshar M. Hosseinpour Mashhadi H. Mohammadiبالا بودن نرخ تخمکگذاری و برهزایی یکی از مهمترین عوامل تأثیرگذار بر افزایش کارآیی تولید مثل و به تبع آن افزایش کارآیی اقتصادی در صنعت پرورش گوسفند به حساب میآیند. علاوه بر تأثیر ژنهای کوچک اثر، صفت چندقلوزایی تحت تأثیر ژنهای بزرگ اثر نیز میباشد. پروتئین مورفوژنتی Moreبالا بودن نرخ تخمکگذاری و برهزایی یکی از مهمترین عوامل تأثیرگذار بر افزایش کارآیی تولید مثل و به تبع آن افزایش کارآیی اقتصادی در صنعت پرورش گوسفند به حساب میآیند. علاوه بر تأثیر ژنهای کوچک اثر، صفت چندقلوزایی تحت تأثیر ژنهای بزرگ اثر نیز میباشد. پروتئین مورفوژنتیک استخوان شماره 15 (BMP15) عضو فوق خانواده فاکتور رشد تغییر شکل دهنده بتا (TGF-β) میباشد که به طور خاص در اووسیت بیان شده و نقش تعیین کنندهای در باروری گوسفند دارد. گزارش شده جهشهای مختلف در این ژن با روش حساس به دوز سبب افزایش نرخ تخمکگذاری و ناباروری در گوسفند میگردد. شش جهش در ژن BMP15 شناسایی شدهاند که دارای اثر عمده بر روی باروری گوسفند است. هدف این پژوهش بررسی جهش لوکوس FecXL در باروری گوسفند نژاد بلوچی ایرانی بوده است. نمونههای خون کامل از وداج گردن و با استفاده از لوله خلاء دار حاوی ماده ضد انعقاد EDTA جمعآوری شدند و سپس DNA ژنومی از همه نمونهها استخراج گردید. برای تعیین الگوهای باندی از روش چند شکلی فضایی تک رشتهای (SSCP) و همچنین توالی یابی استفاده گردید. نمونههای تعیین ژنوتیپ شده در این مطالعه وقوع آلل جهش یافته برای لوکاس FecXL را تأیید نکرد و تمامی نمونهها در هر دو جایگاه از اگزون 2 ژن BMP15 دارای ژنوتیپ مونومورف بودند. Manuscript profile -
Open Access Article
41 - Analysis of the Efficiency for the Pig-Tailing Technique to Dissect the Molecular Parameters Based on Microsatellite Markers: Camels (Camelus dromedaries) as Model
M. Bitaraf Sani N. Asadzadeh R. Nahavandi Z. Roudbari S.A. Rafat A. Mirjalili A. Javanmard -
Open Access Article
42 - استفاده از چندشکلیهای ریزماهوارهای موجود در ژن Ovar-DRB1 جهت تعیین مقاومت ژنتیکی نسبت به نماتودهای دستگاه گوارش در گوسفندان دنبهدار قزل
ر. حاجی علیزاده ولیلو س.ع. رافت م. فیروزآمندی م. ابراهیمیاین پژوهش به منظور شناسایی دام­های دارای مقاومت ژنتیکی نسبت به نماتودهای دستگاه گوارش (GIN) با استفاده از چندشکلی­های ریزماهواره­ای موجود در ژن Ovar-DRB1 برههای نژاد قزل ایرانی طراحی شد. در پژوهش حاضر 120 بره نر قزل 4 تا 6 ماهه به صورت تصادفی از 6 گله گوسف Moreاین پژوهش به منظور شناسایی دام­های دارای مقاومت ژنتیکی نسبت به نماتودهای دستگاه گوارش (GIN) با استفاده از چندشکلی­های ریزماهواره­ای موجود در ژن Ovar-DRB1 برههای نژاد قزل ایرانی طراحی شد. در پژوهش حاضر 120 بره نر قزل 4 تا 6 ماهه به صورت تصادفی از 6 گله گوسفند متفاوت در استان آذربایجان شرقی انتخاب شدند (تعداد 20 گوسفند در هر گله). این برهها به صورت طبیعی با GINها آلوده شده و نمونههای مدفوعی هر حیوان نیز جهت شمارش تعداد تخم­انگل موجود در مدفوع (FEC) به صورت دوبار در هفته و با یک هفته فاصله جمعآوری شد. نمونههای خونی نیز جهت استخراج DNA جمعآوری شدند و PCR به منظور افزوده­سازی اگزون شماره ­2 و توالی­های ریزماهوارهای موجود در اینترون شماره­2 ژن Ovar-DRB1 انجام شد. دادهها با استفاده از رویه مختلط در نرم افزار SAS آنالیز شدند. در پژوهش حاضر 24 ژنوتیپ و 20 آلل برای ژن Ovar-DRB1 شناسایی شدند. نتایج نشان دادند که حضور آللی به طول 510 جفت ­باز (که آلل F نامیده شد) در هر دو دامهای هموزیگوت و هتروزیگوت دارای رابطه­ قابل­توجه معنی­داری (01/­0P<) با کاهش FEC دارد، در حالیکه حضور آللی به طول 506 جفت­باز (که آلل E نامیده شد) در دام­های هموزیگوت نیز دارای رابطه معنی­داری (01/­0P<) با افزایش میزان FECمی باشد. بنابراین این پژوهش رابطه قابل­توجه معنی­داری را بین چندشکلی­های ریزماهوارهای موجود در ژن Ovar-DRB1 و مقاومت به GIN در برههای نژاد قزل نشان داد. Manuscript profile -
Open Access Article
43 - مطالعه چند شکلی ژن GDF9 در گوسفند نژاد مغانی ایران
F. Ala Noshahr A. Rafatخانواده پروتئین­های TGF-B از فاکتورهای مهم رشد و تفرق فولیکول­های تخمدانی می­باشند. سه ژن مهم از فوق خانواده B شامل فاکتور 9 (GDF9)، BMP15 و BMPR-IB در رشد و تخمک­زایی ضروری می­باشند. جهش­های مختلفی در ژن GDF9 سبب افزایش تخمک­گذاری و تولید مث Moreخانواده پروتئین­های TGF-B از فاکتورهای مهم رشد و تفرق فولیکول­های تخمدانی می­باشند. سه ژن مهم از فوق خانواده B شامل فاکتور 9 (GDF9)، BMP15 و BMPR-IB در رشد و تخمک­زایی ضروری می­باشند. جهش­های مختلفی در ژن GDF9 سبب افزایش تخمک­گذاری و تولید مثل در گوسفند می­شود. در این مطالعه نمونه­های خونی از 150 گوسفند نژاد مغانی جمع­آوری و با افزودن EDTA نگهداری و به آزمایشگاه انتقال یافت. سپس DNA آنها به کمک روش نمکی استخراج گردید. کمیت و کیفیت DNA حاصله به ترتیب توسط روش­های اسپکتوفتومتری و ژل الکتروفورز بررسی شد. توسط یک جفت پرایمر قطعه­ای از DNA ( bp462) از اگزون ژن GDF9 استحصال گردید. محصولات حاصل از هضم PCR توسط آنزیم HhaI جانشینی باز G به A را در لوکاس GDF9 نشان داد. آلل وحشی این ژن (+/G) با دو جایگاه محدود کننده منجر به تولید سه قطعه DNA 156، 52 و bp 254 و آلل جهش یافته (-/G) با یک جایگاه برش سبب تولید دو قطعه 52 و bp 410 شد. فراوانی ژنوتیپی برای ژنوتیپ­های (+/+)G، (-/+)G و (-/-)G به ترتیب 66/0، 24/0 و 1/0 به دست آمد. با توجه به مطالعه صورت گرفته چند شکلی ژن GDF9 در گوسفند نژاد مغانی معنی­دار به دست آمد. Manuscript profile -
Open Access Article
44 - Genetic Polymorphism Detection of the Exon 1 Region of Acetyl-CoA Carboxylase Alpha Gene in Iranian Mahabadi Goat Breed
س. جوزی شکالگورابی ح. مرادی شهربابک م. عباسی فیروزجائی آ. قربانی -
Open Access Article
45 - Study of association between UBE2B variants with susceptibility to Idiopatic infertility in North Iranian male population
elham siasi Mohamad sadegh safai Infertility is a major clinical problem that involved about 10 to 15 percent of couples worldwide. Male infertility include 40 to 50 percent of all infertility cases and 37-58% of male infertility are unknown, as idiopathic male infertility. This disease is caused More Infertility is a major clinical problem that involved about 10 to 15 percent of couples worldwide. Male infertility include 40 to 50 percent of all infertility cases and 37-58% of male infertility are unknown, as idiopathic male infertility. This disease is caused by the interaction between genetic and environmental factors. UBE2B gene and its variations is one of the genetic factors in idiopathic male infertility. In this research was studied relation of T293G and A20016G polymorphism in UBE2B genes with the possibility of male infertility in Northern Iranian population. For this study, samples from 60 fertile men and 60 infertile men were selected. Then DNA was extracted from samples. Genotype and allele frequencies of the variants were determined by PCR- RFLP. Statistical analysis in this study showed no significant association between patient and control groups for T293G (P = 0.66) and A20016G (P = 0.52) SNPs, in UBE2B gene. The results were indicated that two SNPs was not associated with idiopathic male infertility in Northern Iranian male population. Manuscript profile -
Open Access Article
46 - Study of MNSODA16V gene polymorphisms of genes involved in type II diabetes patients in the population of Mazandaran province
zeynab noroozi Abbas Ali Dehpour joybariOne of the genes that can play a role in increasing the incidence of type 2 diabetes is the MNSODA16V gene. In this study, the relationship between this gene and type 2 diabetes mellitus among Mazandaran people was studied. About 1cc of blood containing EDTA (CBC) plasm MoreOne of the genes that can play a role in increasing the incidence of type 2 diabetes is the MNSODA16V gene. In this study, the relationship between this gene and type 2 diabetes mellitus among Mazandaran people was studied. About 1cc of blood containing EDTA (CBC) plasma were obtained from 50 infected and 50 individuals. In order to determine the amount and quality of DNA, two methods of quantitative evaluation using spectrophotometric method and qualitative evaluation using electrophoresis were used. In order to estimate the DNA concentration, 4 μl of the DNA base solution was mixed with one μl of the sampler buffer and evaporated once in the wells of 1.2% agarose gel in the TAE buffer. To evaluate the PCR product, 2% agarose gel was performed. 5 μl of the product of each reaction, with 1 ml of color, was transferred to gel wells and electrophoresis at 100 volts for 1.5 hours. The gel was stained in Ethidium bromide solution (0.5 mg / ml) for 20 minutes, and then transferred to distilled water from the dye gel apparatus. Unfortunately, due to the repeated use of up to 3 times and the use of the DNA extraction kit, this is not the work process and needs to be further explored. For this reason, this study shows little success with the association of MNSODA16V polymorphism and also requires more study in different populations to better understand the role of MNSODA16V. Manuscript profile -
Open Access Article
47 - Study of relation on breast cancer and rs3803662 polymorphism of TOX3 gene in Iranian female population by Tetra Arms PCR
elham siasi Bahare Ghane fatemeh ashrafiObjective: TOX3 gene plays an important role in the risk of breast cancer in females. Polymorphisms were identified in this gene, that can associated with breast cancer. The aim of this study was relation between breast cancer and rs3803662 polymorphism of TOX3 gene in MoreObjective: TOX3 gene plays an important role in the risk of breast cancer in females. Polymorphisms were identified in this gene, that can associated with breast cancer. The aim of this study was relation between breast cancer and rs3803662 polymorphism of TOX3 gene in Iranian females by Tetra Arms PCR. Materials and Methods: Blood samples were collected from 50 normal groups and 50 Breast cancer Patients. Then was extracted DNA from samples. Genotype frequency of this polymorphism in TOX3 gene were determined by using Tetra Arms PCR. Results: Genotyp frequency for TT, TC and CC in normal groups was 10%, 88% and 2%, and For patient groups was 6% , 50% and 44%, respectively. Frequency of CC recessive homozygous genotype of rs3803662 polymorphism in TOX3 gene between normal groups and breast cancer patients was statistical significant difference (P < 0.05). Conclusion: This research for first time was studied relation between the risk of breast cancer and presence of rs3803662 polymorphism in TOX3 gene in Iranian females. The results of this study was showed that presence of rs3803662 polymorphism in TOX3 gene, as genetic marker, can associated with breast cancer in Iranian female. Manuscript profile -
Open Access Article
48 - Association of single nucleotide polymorphisms T886C in TAS2R38 gene and C109869T in SLC6A14 gene with Idiopathic infertility in Iranian men
elham siasi ahmad aleyasin javad mowlaObjective: Frequency of male infertility is 10-15% and there is not definite reason in 50% of infertility in men. This form of infertility is named idiopathic infertility and genetic factors are one of male infertility causes. Therefore, aim of this study was investigat MoreObjective: Frequency of male infertility is 10-15% and there is not definite reason in 50% of infertility in men. This form of infertility is named idiopathic infertility and genetic factors are one of male infertility causes. Therefore, aim of this study was investigation on association between T886C polymorphism in TAS2R38 gene and C109869T polymorphism in SLC6A14 gene with Iranian idiopathic infertile male. Materials and Methods: For this study. DNA was extracted from 200 blood samples consist of 100 men with idiopathic infertility (oligospermic and azoospermia) and 100 fertile men as control groups. Genotyping of two studied polymorphisms were performed by using of molecular methods, HRM-PCR Corbett, PCR-RFLP and Sequencing, then results were statistical analyzed.Results: For T886C polymorphism in TAS2R38 gene statistical analysis showed no significant difference between patient and control groups (P=0.9) and results shown was not association between this polymorphism and idiopathic male infertility in Iranian population. Frequency of C109869T polymorphism in SLC6A14 gene was different in infertile patients and control groups (P=0.04) and is indicated significant relationship with idiopathic male infertility in studied Iranian men population.Conclusion: According to this research results, The C109869T polymorphism in SLC6A14 gene is actual in affected of idiopathic infertility in Iranian men population and could cause oligospermia and azoospermia and created infertility in Iranian male. For confirming these results is recommended study on more samples. Manuscript profile -
Open Access Article
49 - Evaluation of pathogenicity and polymorphism of ompH gene in Pasteurella multocida
Maryam Oulad Yahya Tahamtan Nooshin SohrabiBackground & Objectives: Pasteurella multocida is a Gram-negative facultative bacterium, causing respiratory diseases in various domestic and wild animals. The aim of this study was isolation and identification of P. multocida and investigation of ompH gene polymorp MoreBackground & Objectives: Pasteurella multocida is a Gram-negative facultative bacterium, causing respiratory diseases in various domestic and wild animals. The aim of this study was isolation and identification of P. multocida and investigation of ompH gene polymorphism of in goats P. multocida isolates. Material & Methods: In a cross-sectional study a total of 160 swab samples from nose and throat of goats infected with Pasteurellosis in Fars province were collected. The ompH gene polymorphism in 26 isolates was genotyped by PCR-RFLP technique. Restriction digestion was performed using HindIII and EcoRI endonuclease enzymes. Each sample was injected into two mice at a concentration of 0.5 McFarland's standard. After ompH gene digestion by endonuclease enzymes, RFLP patterns were compared with mice mean dead time (MDT). Results: Each HindIII and EcoRI enzymes made different patterns, which were remarkable in comparison with MDT in mice. All lethal isolates had MDT less than 24 hours. Out of 29 P. multocida isolates, 89.6 % were lethal in mice. Conclusion: According to established patterns, MDT in mice was different. Based on the results, the samples with more frequent patterns killed mice in a shorter time and were more lethal. Enzyme digestion patterns can be used to detect virulent and pathogenic strains and to provide vaccine strains. Considering the variability of these strains, the production of multiple vaccines is necessary. Manuscript profile -
Open Access Article
50 - The association between IL-27 gene polymorphism (-964 A/G) and clinical outcome due to infection with Helicobacter pylori
Elham Moazamian Manuchehr Rasouli Sadaf AsaeiBackground & Objectives: Helicobacter pylori is one of the most common pathogen bacteria in human being. Almost half of the population of the world are infected with this bacteria, and it has been known an important factor in gastrointestinal diseases such as; chron MoreBackground & Objectives: Helicobacter pylori is one of the most common pathogen bacteria in human being. Almost half of the population of the world are infected with this bacteria, and it has been known an important factor in gastrointestinal diseases such as; chronic gastritis, gastric ulcer and gastric cancer. Interleukin-27 is a pro-inflammatory cytokine expressed by a novel subset of CD4+ Th cells, and it causes the occurrence and strengthening the inflammatory response. This study was aimed to analysis of association between IL-27 polymorphisms and clinical outcomes due to infection with H. pylori. Materials & Methods: A case-control study has been performed on 434 people 149 patient cases (100 gastritis and 49 ulcerative gastritis), 58 gastritis cases but H. pylori negative and 227 healthy controls. Genomic DNA was extracted and genotypes of IL-27 (-964 A/G) polymorphism were assessed through polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Finally the results were compared between these patient and control groups. Results: The frequency of A allele was higher in gastric patients (78.5%) in comparison with the control group (75.6%). However, these differences were not significant. In addition, the distributions of genotypes were not significantly different between the study groups. Conclusion: These results suggest that IL-27 (rs964 A/G) polymorphism gene is not directly involved as a genetic risk factor in the predisposition to H. pylori. Manuscript profile -
Open Access Article
51 - Association between IL-12 Receptor beta-1 gene polymorphisms and Tuberculosis between Iranian Population
Noor olhoda Saadaee Jahromi Parissa Farnia Mohammad Kargar Mehdi Kazem pour Jamileh Nowroozi Mohammad Reza Masjedi Aliakbar VelayatiBackground and objectives: Tuberculosis (TB) is the most common cause of death due to infectious disease, worldwide. In fact only 10% of people infected with Mycobacterium tuberculosis develop clinical disease which suggests , the role of host genetic factors in s MoreBackground and objectives: Tuberculosis (TB) is the most common cause of death due to infectious disease, worldwide. In fact only 10% of people infected with Mycobacterium tuberculosis develop clinical disease which suggests , the role of host genetic factors in susceptibility against TB. For this reason, we aimed to determined IL-12 gene polymorphism among PTB cases. Material and method: A case-control study was carried out in one hundred twenty TB patient and one hundred sixty seven healthy control individuals. The Single Nucleotide Polymorphism (SNP ) in 5 regions of IL12 RB1 gene +705A/G +1158T/C, +1196G/C,+1664C/T and +1637 G/A were determinate by PCR-RFLP. Results: No significance differences were detected at +1664 C/T and +1637 G/A allele frequencies. Conclusion: In this study, the IL-12 gene polymorphism at +1664 C/T and +1637G/A allele were associated with susceptibility against TB. Although, further studies suggested on more number of samples. Manuscript profile -
Open Access Article
52 - The Correlation Between Vitamin D Deficiency and Vitamin D Receptor Polymorphisms and The Frequency of Type 2 Diabetes Mellitus Complications Among Egyptian Patients
Sahar H. Ahmed Khaled E. Foad Amer E. Ahmed Nagla U. Mohamed Dina Sabry -
Open Access Article
53 - Investigating C23237T Polymorphism of Cyp3a4 Gene in Healthy People of West Mazandaran in Terms of Age and Gender
Fatemeh Heidarian Vida Hojati Reza Golijani MoghadamCYP3A4 gene is located on chromosome 7 and the largest number of substrates among cytochrome p450 enzymes belongs to it. The CYP3A4 gene is present in the endoplasmic reticulum of all tissues except the brain, although the main place of accumulation of its protein is in MoreCYP3A4 gene is located on chromosome 7 and the largest number of substrates among cytochrome p450 enzymes belongs to it. The CYP3A4 gene is present in the endoplasmic reticulum of all tissues except the brain, although the main place of accumulation of its protein is in the liver and prostate. Because there have not been many studies on the polymorphisms of this gene, especially in Iran, this study was conducted in order to investigate the C23237T polymorphism of Cyp3a4 gene in 103 healthy male and female subjects aged 7 months to 79 years-old in the west of Mazandaran. In this research, whole blood was collected from healthy male and female individuals in the western cities of Mazandaran province. For each person, information related to age, sex, family history, alcohol and tobacco consumption, and the patient's medication were recorded. ARMS-PCR technique was used in this study. Data analysis was done using SPSS 2016 software and chi square test. The significant level of polymorphism relationship with gender and age of people was considered as p < 0.05. The results of the research showed that 70 people had the heterozygous status of the mutated AG genotype, the frequency of which was 67.96%. There was no significant relationship between genotype frequency and patients' age. Also, there is no significant relationship between C23237T polymorphism of Cype3a4 gene with age (p = 0.81) and gender (p = 0.845). According to the results of this research, it can be considered that people in any age group and with any gender have the same probability of contracting the disease. Manuscript profile -
Open Access Article
54 - The Study of VEGF405CG Gene Polymorphisms Involved in Type II Diabetes Patients in the Population of Mazandaran Province
Z. Noroozi A.A. Dehpour JoybariType 2 diabetes is the most common diabetes and includes about 90% of all diabetic cases in the world. The most common gene polymorphism (VEGF405CG) is in the untranslated region of 5UTR, 405CG polymorphism probably has an effect on the level of expression after the gen MoreType 2 diabetes is the most common diabetes and includes about 90% of all diabetic cases in the world. The most common gene polymorphism (VEGF405CG) is in the untranslated region of 5UTR, 405CG polymorphism probably has an effect on the level of expression after the gene translation and increases the gene products. VEGF is a vascular endothelium factor that plays an important role in DR pathogenicity as an angiogenic and capillary permeability factor. Therefore, VEGF405CG may be a good candidate for potential of catching diabetes type 2. The purpose of this study was to determine the relationship between this gene and diseases such as type 2 diabetes in the population of Mazandaran province. The tested specimens consisted of 50 patient and 50 healthy people referring to the Atieh and Shahid Babaei laboratories. About 1 ml of blood containing EDTA (CBC) from 50 patient and 50 healthy individual was taken as a control after obtaining informed consent. In order to determine the amount and quality of DNA, which is a very important step in the RFLP method, spectrophotometric and electrophoresis method were used for quantitative and qualitative evaluation, respectively. To estimate the concentration of DNA, 4 μl of the base DNA solution was mixed with 1 μl of the sampler buffer and in a well, 1.5% agarose gel was evacuated in TAE buffer. A PCR product was evaluated on an2 % agarose gel. 5 μl of product of each reaction with 1 ml of color transferred to gel wells and electrophoresis was performed at a voltage of 100 V for 1.5 hours. The gel was stained in ethidium bromide solution (0.5 mg/ml) for 20 minutes and after transferred to distilled water was photographed with gel dock. This study does not show any association between VEGF405CG polymorphism among type II diabetic patients and further study is needed in different populations to better understanding the role of VEGF405CG. Manuscript profile -
Open Access Article
55 - analysis of Association among ISSR Markers and Important Traits in Different Soybean Cultivars by Regression Method
zahra malekmohamadi hosein sabori abas beyabani ebrahim hezarjaribi ahmadreza dadras.One of the big advances in identifying markers is the identification of continuous markers with agronomic traits, as well as the value of markers in the analysis of heritability of traits in crops is specified. In this study was assessed, the relationship between agron More.One of the big advances in identifying markers is the identification of continuous markers with agronomic traits, as well as the value of markers in the analysis of heritability of traits in crops is specified. In this study was assessed, the relationship between agronomic traits and molecular marker ISSR in different genotypes of soybean. The genetic diversity different genotypes of soybean by using the 10 ISSR primer showed that Among 68 amplified fragment of cultivars were generated, 34 fragments were ploy morphic. PIC values varied between 0.147 to 0.058 for primers. Maximum level of marker index obtained for primer PRI-6 with value of 8.39 which indicating a higher resolution of this primer than the other. Association analysis was performed using structure matrix and statistical models of GLM and MLM by using TASSEL software for 21 variables. The MLM model in 5 percent probability level identified 6 markers related to evaluated traits. According to the results of Association analysis the highest of coefficient determination was for ISSR9-2 with 0.21 percent explanation of variation of number main branch. A total of, due to the high genetic diversity statistics, the ISSR10-1, ISSR2-3 and ISSR2-4 markers can be used to other breeding programs Manuscript profile
Sanad
Sanad is a platform for managing Azad University publications
Links
Related Centers
Technical Support
Official pages
The rights to this website are owned by the Raimag Press Management System.
Copyright © 2021-2024