بررسی چند شکلی ژن کاپا کازئین با استفاده از تکنیک PCR-RFLP در جمعیت گاوهای نجدی استان خوزستان

Subject Areas : Camel

گ. فرهادی ¹ , م.ت. بیگی نصیری ² , ج. فیاضی ³ , ه. روشنفکر ⁴

1 - Department of Animal Science, Ramin Agricultural and Natural Resources University, Mollasani, Ahvaz, Iran
2 - Department of Animal Science, Ramin Agricultural and Natural Resources University, Mollasani, Ahvaz, Iran
3 - Department of Animal Science, Ramin Agricultural and Natural Resources University, Mollasani, Ahvaz, Iran
4 - Department of Animal Science, Ramin Agricultural and Natural Resources University, Mollasani, Ahvaz, Iran

Received: 2013-06-05 Accepted : 2013-08-01 Published : 2014-06-01

Keywords: PCR-RFLP, چند شکلی, ژن کاپا کازئین, گاو نجدی,

Abstract :

کازئین‌ها بیش از 80 درصد کل پروتئین شیر را به خود اختصاص می‌دهند و به اشکال AlphaS1، AlphaS2، بتا کازئین و کاپا کازئین می‌باشند. کاپا کازئین از نظر اندازه از دیگر کازئین‌ها کوچکتر بوده ولی به دلیل نقش آن ‌در اندازه و پایداری میسل، تعیین ‌کننده‌ی خصوصیات کارخانه‌ای شیر می‌باشد. مطالعه حاضر به بررسی چند شکلی ژن کاپا کازئین می‌پردازد. این مطالعه اولین بررسی چند شکلی ژن کاپا کازئین در گاو نجدی ایران است. واکنش زنجیر‌ه‌ای پلیمراز جهت بررسی چند شکلی DNA در 80 گاو استفاده شد. در همه گاوها، تکثیر قطعه 453 جفت بازی از اگزون 4 ژن کاپا کازئین انجام شد. قطعه تکثیر شده ژن کاپا کازئین به وسیله آنزیم محدودکنندهHinfI، مورد هضم قرار گرفت. محصولات هضم شده توسط الکتروفورز بر روی ژل آگارز 3 درصد تفکیک شدند. محصولات هضم شده وجود دو آلل A و Bبا فراوانی‌های 54/0 و 46/0 را آشکار ساخت. همچنین ژنوتیپ‌های AA، AB و BBبا فراوانی‌های 35 درصد، 5/37 درصد و 5/27 درصد در کل جمعیت مورد مطالعه وجود تعادل هاردی-واینبرگ را نشان دادند که نشان می‌دهد که هیچ گونه انتخاب در جهت افزایش یا کاهش فراوانی ژنوتیپی ژن کاپا کازئین در این گله صورت نگرفته است. همچنین سطح هتروزیگوسیتی مربوط به ژن کاپا کازئین در جمعیت مورد مطالعه متوسط ارزیابی گردید.

References:

Alexander L.J., Stewart A.F., Mackinlay A.G. and Kapelinskaya T.V. (1988). Isolation and characterization of the bovine kappa-casein gene. European J. Biochem. 178, 395-401.
Azevodo A.L.S., Nassimento C.S., Steinberg R.S., Carvalho M.R.S., Peixoto M.G.G.D., Teodoro R.L., Guuimaraes S.E.F. and Machado M.A. (2008). Genetic polymorphism of the kappa casein gene in Brazilian cattle. Genet. Mol. Res. 7(3), 623-630.
Boettcher P.J., Tixier-Boichard M., Toro M.A., Simianer H., Eding H., Gandini G., Joost S., Garcia D., Colli L. and Ajmone-Marsan P. (2010). Objectives, criteria and methods for using molecular genetic data inpriority setting for conservation of animal genetic resources. J. Anim. Genet. 41(1), 64-77.
Brka M., Hodzic A., Reinsch N., Zecevic E., Dokso A., Djedovic R., Rukavina D., Kapur L., Vegara M., Sabanovic M. and Ravic I. (2010). Polymorphism of the kappa-casein gene in two Bosnian autochthonous cattle breeds. Arch. Tierz. 53, 277-282.
Dromuller C., Hamann H. and Distl O. (2001). Candidate gene markers for litter size in different German pig lines. J. Anim. Sci. 79, 2565-2570.
Dromuller C., Hamann H. and Distl O. (2001). Candidate gene markers for litter size in different German pig lines. J. Anim. Sci. 79, 2565-2570.
Farrell H.M., Jimenez-Falores R., Bleck R., Brown G.T. and Butler E.M. (2004). Nomenclature of the proteins of cows milk-sixth revision. J. Dairy Sci. 87, 1614-1674.
Ferretti L., Leone P. and Sgaramella V. (1990). Long range restriction analysis of the bovine casein genes. Nucl. Acid Res.18, 6829-6833.
Galila A.S.E. and Darwish S.F. (2008). A PCR-RFLP assay to detect genetic variants of kappa-casein in cattle and buffalo. Arab J. Biotechnol. 11, 11-17.
Jann O.C., Prinzenberg F.M., Luikart G., Caroli A. and Erhardt G. (2004). High polymorphism in the kappa-casein (CSN3) gene from wild and domestic caprine species revealed by DNA sequencing. J. Dairy Res. 71, 188-195.
Komisarek J., Waskowicz K. and Dorynek Z. (2006). Analysis of the relationship between two single nucleotide polymorphisms of the butyrophilin (BTN1A1) gene and milk production traits in Jersey cattle. Anim. Sci. 1, 45-52.
Konovalova E.N., Seltcov V.I. and Zinoveva N.A. (2004). Polymorphism gene kappa casein and its effects on production traits cows Simmental breeds. Pp. 24-25 in Proc. 4^th Conf., Prob. Biotechnol. Farm Anim. VIJ. Dobrovitsy. Russia.
Kumar D., Gupta N., Ahlawat S.P.S., Satyanarayana R., Sunder S. and Gupta S.C. (2006). Single strand confirmation polymorphism (SSCP) detection in exon I of the α-lactalbumin gene of Indian Jamunapri milk goats (Capra hircus). Genet. Mol. Biol. 29, 271-74.
Lara M.A.C., Gama L.T., Bufarah G., Sereno J.R.B., Celegato E.M.L. and de Abreu U.P. (2002). Genetic polymorphisms at the kappa-casein locus in Pantaneiro cattle. Arch. Zootech. 51, 99-105.
Lien S. and Rogne S. (1993). Bovine casein haplotypes: number, frequencies and applicability as genetic markers. Anim. Genet. 24, 373-376.
Shende T.C., Sawane M.P. and Pawar V.D. (2009). Genotyping of Andharpuri buffalo for k-casein using PCR-RFLP. Tamilnadu J. Vet. Anim. Sci. 5(5), 174-178.
Tinaev A.S. (2003). Effects of polymorphic milk protein genes on milk yield at heifer black-pied breed. All-Russian Research Institute of Animal Breeding. Moscow. Russia.
Wu X.L., Mac Neil M.D., De S. and Xiao Q.J. (2005). Evaluation of candidate gene effects for beef backfat via Bayesian model selection. Genet. 125, 103-113.