Selection based on molecular markers is one of the new methods that may improve progress and accuracy of selection in animal breeding programs. The GHRH gene (Growth Hormone-releasing Hormone) is a candidate gene for marker-assisted selection strategies. Polymorphs of G More
Selection based on molecular markers is one of the new methods that may improve progress and accuracy of selection in animal breeding programs. The GHRH gene (Growth Hormone-releasing Hormone) is a candidate gene for marker-assisted selection strategies. Polymorphs of GHRH gene are reported to be significantly associated with milk production and constituent traits. In order to study the polymorphism of GHRH gene, blood samples were collected from 112 Sarabi cows. Genomic DNA was extracted and a fragment of 297 bp in size was amplified using polymerase chain reaction. The amplified fragments were subjected to restriction digestion with HaeIII endonuclease enzyme and the resultant digested products were run on 2% Agarose gel. The results revealed the existence of two alleles of GHRH A and GHRH B for the examined locus with frequencies of 0.19 and 0.81 respectively. Three different genotypic variants including GHRH A GHRH A, GHRH A GHRH B and GHRH B GHRH B were identified with genotypic frequencies of 0.0357, 0.3037 and 0.6607 respectively. The χ2 test showed that population is in Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05). These data provide evidence that sarabi cattle breed have a genetic variability, which opens interesting prospects for future selection programs, especially marker-assistant selection.
Manuscript profile
در تحقیق حاضر نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید (BLAD) و ناهنجاری ستون فقرات (CVM) در جمعیتی از گاوهای هلشتاین ایران با استفاده از تکنیک واکنش زنجیرهای پلیمراز-چند شکلی طول قطعات محدود شده (PCR-RFLP) مورد مطالعه قرار گرفت. نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید و نا More
در تحقیق حاضر نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید (BLAD) و ناهنجاری ستون فقرات (CVM) در جمعیتی از گاوهای هلشتاین ایران با استفاده از تکنیک واکنش زنجیرهای پلیمراز-چند شکلی طول قطعات محدود شده (PCR-RFLP) مورد مطالعه قرار گرفت. نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید و ناهنجاری ستون فقرات از جمله نواقص ژنتیکی اتوزومال مغلوب و کشنده در گاوهای شیری هلشتاین– فریزیرن هستند. نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید یک اختلال ژنتیکی است که از طریق کاهش بیان مولکولهای چسبندگی بر روی سطح نوتروفیلها، بر روی سیستم خون ساز بدن اثر میگذارد و ناهنجاری ستون فقرات به واسطه مرگ زود هنگام جنین با اختلالاتی همچون گردنی کوتاهتر از حد طبیعی، پاهای خمیده، دندههایی غیر طبیعی و برخی ناهنجاریهای قلبی شناسایی میشود. در اولین مرحله از تحقیق، نمونه تانک شیر از 50 گله گاو شیری جمعآوری گردید. از روش PCR-RFLP برای شناسایی جهشهای نقطهای مربوط به ژنهای ناهنجاری ستون فقرات و نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید استفاده گردید. پس از استخراج DNA، واکنش زنجیرهای پلیمراز برای تکثیر قطعه 136 جفت بازی از ژن CD18 و قطعه 233 جفت بازی از ژن SLC35A3 انجام شد. از آنزیم EcoT22 I برای هضم محصولات واکنش زنجیرهای پلیمراز مربوط به ناقلین نقص ژنتیکی ناهنجاری ستون فقرات و از آنزیم Taq I برای هضم محصولات واکنش زنجیرهای پلیمراز مربوط به ناقلین نقص چسبندگی گلبولهای سفید استفاده گردید. گرچه در هیچیک از گلهها الل موتانت مربوط به نقصهای ژنتیکی چسبندگی گلبولهای سفید در مقایسه با گروه شاهد یافت نشد ولی جهش مربوط به ژن SLC35A3 در 17 گله مختلف مشاهده گردید. در مرحله بعد یک گله که شامل 120 راس گاو دوشا بود به طور تصادفی برای تست انفرادی با استفاده از نمونههای خون انتخاب شد و دو رأس گاو به عنوان ناقلین ژن نقص ژنتیکی ناهنجاری ستون فقرات شناسایی شدند. در این گله مجموع تعداد ژنوتیپ­های AA، Aa و aa به ترتیب برابر 118، 2 و 0 رأس بود و فراوانی آلل­های A و a به ترتیب 992/0 و 008/0 برآورد گردید. سایر گلههای ناقل در مراحل بعدی از این تحقیق مورد بررسی قرار میگیرند.
Manuscript profile
تاثیر ژن 1A گیرنده ملاتونین بر نرخ زایش در 150 میش نژاد گوسفند زل و نائینی مورد مطالعه قرار گرفت. به منظور تعیین چند شکلی­ها از تکنیک PCR-RFLPبا کمک دو آنزیم محدود کننده MnlI و RsaI استفاده شد. دو آلل M و C در هر دو نژاد دارای بیشترین فراوانی بودند. ژنوتیپ &n More
تاثیر ژن 1A گیرنده ملاتونین بر نرخ زایش در 150 میش نژاد گوسفند زل و نائینی مورد مطالعه قرار گرفت. به منظور تعیین چند شکلی­ها از تکنیک PCR-RFLPبا کمک دو آنزیم محدود کننده MnlI و RsaI استفاده شد. دو آلل M و C در هر دو نژاد دارای بیشترین فراوانی بودند. ژنوتیپ MMدر نژاد زل با فراوانی 52/0 و در نژاد نائینی با فراوانی 60/0 فراوانترین ژنوتیپ بود. در نژاد زل ژنوتیپ CT با فراوانی 45/0 و در نژاد نائینی ژنوتیپ CC با فراوانی 44/0 بیشترین فراوانی را نشان دادند. ژنوتیپ MMCTبا فراوانی (25/0) فراوانترین ژنوتیپ بود. در آنالیز تجزیه واریانس اختلاف معنیداری بین ژنوتیپهای MTNR1Aو صفت نرخ زایش در نژاد نائینی نشان داده نشد، در حالیکه ژنوتیپهای mm و Mm در نژاد زل عملکرد بهتری را در میانگین نرخ زایش نشان دادند. به نظر میرسد با انتخاب گوسفندان با این ژنوتیپها بتوان نرخ زایش در نژاد زل را بهبود بخشید. آللهای mC و mT در هر دو نژاد زل و نائینی تأثیر مثبتی بر نرخ برهزایی نشان دادند. ژنوتیپ mmCT بیشترین میانگین نرخ زایش را در بین سایر ژنوتیپها داشت. در پایان، چند شکلی در جایگاه ملاتونین میتواند تنها بخشی از تنوع ژنتیکی فعالیت جنسی فصلی در این دو نژاد را توجیه نماید در نتیجه عملکرد سایر ژنها را هم باید مورد توجه قرار داد.
Manuscript profile
هدف از تحقیق حاضر مطالعه چند شکلی تک نوکلئوتیدی در ژن­ DRD1 و ارتباط آن با صفات رشد و تولید تخم مرغ در جمعیت مرغان بومی آذربایجان غربی با روش PCR-SSCP بود. برای این منظور نمونه­های خون از 180 قطعه مرغ بومی واقع در ایستگاه اصلاح نژاد مرغ بومی آذربایجان غربی گرفته More
هدف از تحقیق حاضر مطالعه چند شکلی تک نوکلئوتیدی در ژن­ DRD1 و ارتباط آن با صفات رشد و تولید تخم مرغ در جمعیت مرغان بومی آذربایجان غربی با روش PCR-SSCP بود. برای این منظور نمونه­های خون از 180 قطعه مرغ بومی واقع در ایستگاه اصلاح نژاد مرغ بومی آذربایجان غربی گرفته شد. استخراج DNA به روش بهینه یافته نمکی صورت گرفت. قطعه 283 جفت بازی ژن DRD1با استفاده از واکنش زنجیره­ای پلیمراز تکثیر گردید. روش تفاوت فرم فضایی رشته­های منفرد (SSCP) جهت شناسایی چند شکلی در نمونه­ها بکار برده شد. برای شناسایی جهش تک نوکلئوتیدی از روش توالی­یابی استفاده گردید. برای این منظور 4 نمونه از هر الگوی باندی متفاوت برای توالی­یابی ارسال گردید که در نتیجه آن سه نوع ژنوتیپ AA، AG و GG به­ ترتیب با فراوانی 42/0، 49/0 و 09/0 مشاهده شدند. از رویه GLM نرم افزار SAS برای آنالیز داده­ها استفاده گردید. نتایج این تحقیق نشان داد که ناحیه مورد بررسی این ژن چند شکل می­باشد، بین ژنوتیپهای مشاهده شده و صفات تولید تخم ­مرغ ارتباط معنیداری وجود دارد. بنابراین این ژن می­تواند به عنوان جایگاه ژنی کاندیدا و یا پیوسته با ژن بزرگ اثر مرتبط با صفات تولید مثلی در مرغ بومی باشد.
Manuscript profile
در این مطالعه به منظور بررسی چند شکلی ژن هورمون رشد به عنوان یک ژن کاندیدا، نمونههای خون به طور تصادفی از 34 بز نژاد آلپاین و 42 بز نژاد سانن به دست آمد. DNA از نمونههای گرفته شده استخراج و ناحیه 365 جفت بازی از اگزون 5 ژن هورمون رشد توسط واکنش زنجیرهای پلیمراز More
در این مطالعه به منظور بررسی چند شکلی ژن هورمون رشد به عنوان یک ژن کاندیدا، نمونههای خون به طور تصادفی از 34 بز نژاد آلپاین و 42 بز نژاد سانن به دست آمد. DNA از نمونههای گرفته شده استخراج و ناحیه 365 جفت بازی از اگزون 5 ژن هورمون رشد توسط واکنش زنجیرهای پلیمراز تکثیر شد. محصولات PCR توسط روش SSCP بر روی ژل پلی اکریل آمید مورد آنالیز قرار گرفتند. نتایج آنالیز نشان داد که برای ژن مورد مطالعه چهار الگوی باندی متفاوت G1، G2،G3 و G4 به ترتیب با فراوانیهای 38/0 ،21/0 ،23/0 و 18/0 در بز آلپاین و 48/0، 21/0 ، 17/0 و 14/0 در بز نژاد سانن مشاهده شدند.
Manuscript profile
کازئینها بیش از 80 درصد کل پروتئین شیر را به خود اختصاص میدهند و به اشکال AlphaS1، AlphaS2، بتا کازئین و کاپا کازئین میباشند. کاپا کازئین از نظر اندازه از دیگر کازئینها کوچکتر بوده ولی به دلیل نقش آن در اندازه و پایداری میسل، تعیین کنندهی خصوصیات کارخانهای شیر م More
کازئینها بیش از 80 درصد کل پروتئین شیر را به خود اختصاص میدهند و به اشکال AlphaS1، AlphaS2، بتا کازئین و کاپا کازئین میباشند. کاپا کازئین از نظر اندازه از دیگر کازئینها کوچکتر بوده ولی به دلیل نقش آن در اندازه و پایداری میسل، تعیین کنندهی خصوصیات کارخانهای شیر میباشد. مطالعه حاضر به بررسی چند شکلی ژن کاپا کازئین میپردازد. این مطالعه اولین بررسی چند شکلی ژن کاپا کازئین در گاو نجدی ایران است. واکنش زنجیرهای پلیمراز جهت بررسی چند شکلی DNA در 80 گاو استفاده شد. در همه گاوها، تکثیر قطعه 453 جفت بازی از اگزون 4 ژن کاپا کازئین انجام شد. قطعه تکثیر شده ژن کاپا کازئین به وسیله آنزیم محدودکنندهHinfI، مورد هضم قرار گرفت. محصولات هضم شده توسط الکتروفورز بر روی ژل آگارز 3 درصد تفکیک شدند. محصولات هضم شده وجود دو آلل A و Bبا فراوانیهای 54/0 و 46/0 را آشکار ساخت. همچنین ژنوتیپهای AA، AB و BBبا فراوانیهای 35 درصد، 5/37 درصد و 5/27 درصد در کل جمعیت مورد مطالعه وجود تعادل هاردی-واینبرگ را نشان دادند که نشان میدهد که هیچ گونه انتخاب در جهت افزایش یا کاهش فراوانی ژنوتیپی ژن کاپا کازئین در این گله صورت نگرفته است. همچنین سطح هتروزیگوسیتی مربوط به ژن کاپا کازئین در جمعیت مورد مطالعه متوسط ارزیابی گردید.
Manuscript profile
ژن دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز (DGAT1) به عنوان ژن کاندیدا برای صفات کیفی گوشت گوسفند شناخته شده است. یک چند شکلی تک نوکلئوتیدی منجر به ایجاد جهش (C به T) در جایگاه AGCT آنزیم اندونوکلئاز AluI میشود. به منظور مطالعه چند شکلی ناحیه T487C در اگزون 17 ژن DGAT1 به طور ت More
ژن دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز (DGAT1) به عنوان ژن کاندیدا برای صفات کیفی گوشت گوسفند شناخته شده است. یک چند شکلی تک نوکلئوتیدی منجر به ایجاد جهش (C به T) در جایگاه AGCT آنزیم اندونوکلئاز AluI میشود. به منظور مطالعه چند شکلی ناحیه T487C در اگزون 17 ژن DGAT1 به طور تصادفی از 150 گوسفند مغانی، خون­گیری و استخراج dna به عمل آمد. واکنش زنجیره­ای پلیمراز برای تکثیر قطعه 309 جفت بازی از اگزون 17 ژن DGAT1 با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی انجام گرفت. نتایج آنالیز PCR-RFLP نشان داد که SNP دارای سه ژنوتیپ TT (37 و 272bp ) ، TC (37، 272 و 309 bp) و CC (309bp ) می­باشد. همچنین فراوانی دو آلل T و C به ترتیب برابر با 829/0 و 171/0 مشاهده شد. آنالیز آماری ارتباط معنی­داری را بین صفات وزن دنبه و ضخامت چربی پشت با ژنوتیپ­ها نشان داد. به طوریکه گوسفندان دارای ژنوتیپ CC به طور معنی­داری (05/0P<) دنبه سنگین­تر و ضخامت چربی بیشتری نسبت به گوسفندان با ژنوتیپTT ، داشتند. در نتیجه از چند شکلی نشان داده شده ممکن است بتوان در برنامه­های اصلاح نژادی گوسفند مغانی از طریق انتخاب ژنوتیپ­های برتر، برای بهبود صفات وزن لاشه و بازده لاشه بهره جست.
Manuscript profile
هدف از مطالعه حاضر بررسی چند شکلی در ژن گیرنده هرمون محرک فولیکولی (FSHR) و ژن زیر واحد بتای هرمون محرک فولیکولی (FSHβ) و ارتباط آن با صفات نرخ زایش و افزایش وزن بدن در گوسفندان نژاد بلوچی، ایران بلک و آرمان میباشد. در ابتدا ردیابی چند شکلی در ژن FSHβ به کمک More
هدف از مطالعه حاضر بررسی چند شکلی در ژن گیرنده هرمون محرک فولیکولی (FSHR) و ژن زیر واحد بتای هرمون محرک فولیکولی (FSHβ) و ارتباط آن با صفات نرخ زایش و افزایش وزن بدن در گوسفندان نژاد بلوچی، ایران بلک و آرمان میباشد. در ابتدا ردیابی چند شکلی در ژن FSHβ به کمک تکنیک PCR-RFLP و آنزیمهای محدود کننده ACCI و HinfI انجام شد و هیچ نوع الگوی باندی چند شکلی در این جایگاه ژنی نشان داده نشد. در مرحله بعد به منظور مطالعات بیشتر در این جایگاه ژنی از تکنیک SSCP استفاده شد که در نتیجه آن ژنوتیپهای AA و AC در گوسفندان نژاد بلوچی، ژنوتیپهای AA و AB در گوسفندان نژاد ایران بلک مشاهده شد ولی کلیه نمونههای مربوط به گوسفندان نژاد آرمان فقط ژنوتییپ AA را نشان دادند. رد­یابی چند شکلی در ژن FSHR به کمک تکنیک PCR-RFLP و تیمار آنزیمی MSCI انجام شد و سه نوع ژنوتیپ AA، AB و BB در بین نژادهای مورد مطالعه مشاهده شد. آلل B در هر سه نژاد مورد مطالعه بیشترین فراوانی را داشت. آنالیز تجزیه واریانس این جایگاههای ژنی به کمک نرم افزار SAS انجام شد. آزمون مقایسه میانگین دانکن نشان داد که چند شکلیهای هر دو جایگاه ژنی FSHR و FSHβ تأثیر معنی داری را روی صفت نرخ زایش در نژاد بلوچی دارند. همچنین نشان داد که آلل جهش یافته می­تواند متوسط نرخ زایش را به صورت قابل توجهی نسبت به آلل وحشی افزایش دهد. آنالیز دادههای مربوط به صفت وزن بدن در سنین مختلف و چند شکلی در جایگاه ژنی FSHβ، در هیچ یک از سه نژاد مورد مطالعه اختلاف معنی داری را نشان نداد. مطالعات چند شکلی در جایگاه ژنی FSHR و صفات افزایش وزن بدن نشان دهنده وجود اختلاف معنی داری در نژاد آرمان است، و نشان داد که آلل وحشی عملکرد بهتری دارد. این اطلاعات می­تواند در برنامههای اصلاح نژادی در پرورش گوسفند مورد استفاده قرار بگیرد و سبب بهبود عملکرد تولیدی و تولیدمثلی شود.
Manuscript profile
بالا بودن نرخ تخمکگذاری و برهزایی یکی از مهمترین عوامل تأثیرگذار بر افزایش کارآیی تولید مثل و به تبع آن افزایش کارآیی اقتصادی در صنعت پرورش گوسفند به حساب میآیند. علاوه بر تأثیر ژنهای کوچک اثر، صفت چندقلوزایی تحت تأثیر ژنهای بزرگ اثر نیز میباشد. پروتئین مورفوژنتی More
بالا بودن نرخ تخمکگذاری و برهزایی یکی از مهمترین عوامل تأثیرگذار بر افزایش کارآیی تولید مثل و به تبع آن افزایش کارآیی اقتصادی در صنعت پرورش گوسفند به حساب میآیند. علاوه بر تأثیر ژنهای کوچک اثر، صفت چندقلوزایی تحت تأثیر ژنهای بزرگ اثر نیز میباشد. پروتئین مورفوژنتیک استخوان شماره 15 (BMP15) عضو فوق خانواده فاکتور رشد تغییر شکل دهنده بتا (TGF-β) میباشد که به طور خاص در اووسیت بیان شده و نقش تعیین کنندهای در باروری گوسفند دارد. گزارش شده جهشهای مختلف در این ژن با روش حساس به دوز سبب افزایش نرخ تخمکگذاری و ناباروری در گوسفند میگردد. شش جهش در ژن BMP15 شناسایی شدهاند که دارای اثر عمده بر روی باروری گوسفند است. هدف این پژوهش بررسی جهش لوکوس FecXL در باروری گوسفند نژاد بلوچی ایرانی بوده است. نمونههای خون کامل از وداج گردن و با استفاده از لوله خلاء دار حاوی ماده ضد انعقاد EDTA جمعآوری شدند و سپس DNA ژنومی از همه نمونهها استخراج گردید. برای تعیین الگوهای باندی از روش چند شکلی فضایی تک رشتهای (SSCP) و همچنین توالی یابی استفاده گردید. نمونههای تعیین ژنوتیپ شده در این مطالعه وقوع آلل جهش یافته برای لوکاس FecXL را تأیید نکرد و تمامی نمونهها در هر دو جایگاه از اگزون 2 ژن BMP15 دارای ژنوتیپ مونومورف بودند.
Manuscript profile
خانواده پروتئین­های TGF-B از فاکتورهای مهم رشد و تفرق فولیکول­های تخمدانی می­باشند. سه ژن مهم از فوق خانواده B شامل فاکتور 9 (GDF9)، BMP15 و BMPR-IB در رشد و تخمک­زایی ضروری می­باشند. جهش­های مختلفی در ژن GDF9 سبب افزایش تخمک­گذاری و تولید مث More
خانواده پروتئین­های TGF-B از فاکتورهای مهم رشد و تفرق فولیکول­های تخمدانی می­باشند. سه ژن مهم از فوق خانواده B شامل فاکتور 9 (GDF9)، BMP15 و BMPR-IB در رشد و تخمک­زایی ضروری می­باشند. جهش­های مختلفی در ژن GDF9 سبب افزایش تخمک­گذاری و تولید مثل در گوسفند می­شود. در این مطالعه نمونه­های خونی از 150 گوسفند نژاد مغانی جمع­آوری و با افزودن EDTA نگهداری و به آزمایشگاه انتقال یافت. سپس DNA آنها به کمک روش نمکی استخراج گردید. کمیت و کیفیت DNA حاصله به ترتیب توسط روش­های اسپکتوفتومتری و ژل الکتروفورز بررسی شد. توسط یک جفت پرایمر قطعه­ای از DNA ( bp462) از اگزون ژن GDF9 استحصال گردید. محصولات حاصل از هضم PCR توسط آنزیم HhaI جانشینی باز G به A را در لوکاس GDF9 نشان داد. آلل وحشی این ژن (+/G) با دو جایگاه محدود کننده منجر به تولید سه قطعه DNA 156، 52 و bp 254 و آلل جهش یافته (-/G) با یک جایگاه برش سبب تولید دو قطعه 52 و bp 410 شد. فراوانی ژنوتیپی برای ژنوتیپ­های (+/+)G، (-/+)G و (-/-)G به ترتیب 66/0، 24/0 و 1/0 به دست آمد. با توجه به مطالعه صورت گرفته چند شکلی ژن GDF9 در گوسفند نژاد مغانی معنی­دار به دست آمد.
Manuscript profile
.One of the big advances in identifying markers is the identification of continuous markers with agronomic traits, as well as the value of markers in the analysis of heritability of traits in crops is specified. In this study was assessed, the relationship between agron More
.One of the big advances in identifying markers is the identification of continuous markers with agronomic traits, as well as the value of markers in the analysis of heritability of traits in crops is specified. In this study was assessed, the relationship between agronomic traits and molecular marker ISSR in different genotypes of soybean. The genetic diversity different genotypes of soybean by using the 10 ISSR primer showed that Among 68 amplified fragment of cultivars were generated, 34 fragments were ploy morphic. PIC values varied between 0.147 to 0.058 for primers. Maximum level of marker index obtained for primer PRI-6 with value of 8.39 which indicating a higher resolution of this primer than the other. Association analysis was performed using structure matrix and statistical models of GLM and MLM by using TASSEL software for 21 variables. The MLM model in 5 percent probability level identified 6 markers related to evaluated traits. According to the results of Association analysis the highest of coefficient determination was for ISSR9-2 with 0.21 percent explanation of variation of number main branch. A total of, due to the high genetic diversity statistics, the ISSR10-1, ISSR2-3 and ISSR2-4 markers can be used to other breeding programs
Manuscript profile
Sanad
Sanad is a platform for managing Azad University publications