توزیع فراوانی آلل‌ها در ناحیه ′5 ژن‌های CYP19 و ERα در گاوهای سیمنتال و سه نژاد بومی ایران
Subject Areas : Camelف. محمد نژاد سنگدهی 1 , ق. رحیمی میانجی 2 , م. صفدری شاهرودی 3 , س.ع. رضوی-ششده 4 , م. غلامی 5
1 - Department of Animal Science, Faculty of Animal Science and Fishery, Sari Agriculture science and Natural Resources University, Sari, Iran
2 - Department of Animal Science, Faculty of Animal Science and Fishery, Sari Agriculture science and Natural Resources University, Sari, Iran
3 - Department of Animal Science, Faculty of Agricultural Science and Engineering, University of Tehran, Karaj, Iran
4 - Department of Animal Science, Faculty of Animal Science and Fishery, Sari Agriculture science and Natural Resources University, Sari, Iran
5 - Department of Animal Science, Faculty of Agricultural Science and Engineering, University of Tehran, Karaj, Iran
Keywords: پلی مورفیسم, استروژن, نژادهای گاو, ژن CYP19, ژن ERα, پروموتر,
Abstract :
پژوهش حاضر به منظور بررسی دو جایگاه پلی مورف از ژن CYP19 (PvuII و MspI) و یک جایگاه پلی مورف از ژن ERα (SnaBI) در چهار نژاد گاو شامل مازندرانی، تالشی، سیستانی و سیمنتال انجام شد. در مجموع 278 نمونه برای ژن CYP19 و 206 نمونه برای ژن ERα با استفاده از تکنیک PCR-RFLP تعیین ژنوتیپ شدند. برای جایگاه CYP19/PvuII، فراوانی آلل A دامنهای از 89/0 در نژاد مازندرانی تا 98/0 در نژاد تالشی داشت. برای جایگاه CYP19/MspI، تالشی تنها نژاد مونو مورف با ژنوتیپ AA بود. سایر نژادها پلی مورف بودند و فراوانی آلل A از 93/0 (سیمنتال) تا 98/0 (سیستانی) متغیر بود. ژنوتیپ BB در نمونه مورد مطالعه مشاهده نشد. با در نظر گرفتن دو جایگاه در ترکیب با یکدیگر، تنها 5 ژنوتیپ از 8 ژنوتیپ ترکیبی ممکن مشاهده شد. برای جایگاه ERα/SnaBI، همه جمعیتها پلی مورف بودند. بیشترین و کمترین فراوانی آلل A به ترتیب در نژادهای سیستانی (55/0) و سیمنتال (96/0) مشاهده شد. بر اساس شاخص نی، بیشترین فاصله ژنتیکی بین دو نژاد سیستانی و سیمنتال، و کمترین فاصله ژنتیکی بین دو نژاد مازندرانی و تالشی مشاهده شد. نتایج پژوهش حاضر نشان دهنده وجود اختلاف معنی دار در فراوانیهای ژنوتیپی و آللی در بین چهار نژاد مورد بررسی بود. این یافتهها ممکن است در مطالعات آتی مانند مطالعات ارتباطی برای صفات عملکردی در اصلاح نژاد گاو مورد استفاده قرار گیرد.
Barton N.H. (2011). Estimating linkage disequilibria. Heredity. 106, 205-206.
Fürbass R., Kalbe C. and Vanselow J. (1997). Tissue-specific expression of the bovine aromatase encoding gene uses multiple transcriptional start sites and alternative first exons. Endocrinology. 138, 2813-2819.
Ghosh D., Griswold J., Erman M. and Pangborn W. (2009). Structural basis for androgen specificity and oestrogen synthesis in human aromatase. Nature. 457, 219-223.
Hill W.G. and Robertson A. (1968). Linkage disequilibrium in finite populations. Theor. Appl. Genet. 38, 226-231.
Inoue S. and Horie-Inoue K. (2004). Estrogen receptor function and molecular mechanisms. Horm. Rep. Ther. 47, 480-485.
Jedrzejczak M., Grzesiak W., Szatkowska I., Dybus A., Muszynska M. and Zaborski D. (2011). Association between polymorphisms of CYP19, CYP21 and ER1 genes and milk production traits in Black-and-White cattle. Turkish J. Vet. Anim. Sci. 35, 41-49.
Jedrzejczak M., Szatkowska I., Zych S., Grzesiak W., Czerniawska-Piątkowska E. and Dybus A. (2006). Evaluation of associations of the polymorphism in the placenta-specific promoter 1.1 of the CYP19 gene in Black and White and Jersey cattle with milk production traits. Arch. Tierz. 49, 311-314.
Kalbe C., Fürbass R., Schwerin M. and Vanselow J. (2000). Cis-acting elements regulating the placenta-specific promoter of the bovine Cyp19 gene.J. Mol. Endocrinol. 25, 265-273.
Kowalewska-Luczak I. (2009). Study of the genetic structure of dairy cattle based on polymorphism within the aromatase gene. Russian J. Genet. 45, 926-931.
Kowalewska-Luczak I. (2010). Polymorphism of the CYP19 gene and milk production traits of dairy cattle. Turkish J. Vet. Anim. Sci. 34, 493-496.
Kowalewska-Luczak I., Michniewicz E. and Kulig H. (2013). Effect of CYP19 SNPs on milk production traits of Jersey cows. Acta Sci. Pol., Zootech. 12, 33-40.
Miller S.A., Dykes D.D. and Polesky H.F. (1988). A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucl. Acids. Res. 16, 1215.
Simpson E.R. and Davis S.R. (2001). Minireview: aromatase and the regulation of oestrogen biosynthesis some new perspectives. Endocrinology. 142, 4589-4594.
Szatkowska I., Grzesiak W., Jędrzejczak M., Dybus A., Zaborski D. and Jankowiak D. (2011). An analysis of CYP19, CYP21 and ER genotypes in Polish Holstein-Friesian cows with regard to the selected reproductive traits. Acta Vet. Brno. 80, 065-071.
Szreder T. and Zwierzchowski L. (2004). Polymorphism within the bovine estrogen receptor gene 5’ region. J. Appl. Genet. 45, 225-236.
Szreder T. and Zwierzchowski L. (2007). Estrogen receptors and their genes potential markers of functional and production traits of farm animals. Mol. Biol. Rep. 34, 207-211.
Szreder T., Oprządek J., Żelazowska B., Dymnicki E. and Zwierzchowski L. (2011). Polymorphism A/C in exon 7 of the bovine estrogen receptor α (ERα) gene and its association with functional and milk production traits in Red and White cattle. Anim. Sci. Pap. Rep. 29, 281-291.
Szreder T., Żelazowska B., Oprządek J. and Zwierzchowski L. (2008). Expression in promoter variant of the ERα gene in Bos taurus liver. Mol. Biol. Rep. 35, 65-71.
Szreder T., Żelazowska B., Zwierzchowski L. and Pareek C.S. (2007). A novel nucleotide sequence polymorphism in the 5′-noncoding region of bovine estrogen receptor α gene, the RFLP-SnaBI. Biochem. Genet. 45, 255-262.
Vanselow J., Fürbass R., Rehbock F., Klautschek G. and Schwerin M. (2004). Cattle and sheep use different promoters to direct the expression of the aromatase cytochrome P450 encoding gene, CYP19, during pregnancy. Domest. Anim. Endocrinol. 27, 99-114.
Vanselow J., Kühn C., Fürbass R. and Schwerin M. (1999). Three PCR/RFLPs identified in the promoter region 1.1 of the bovine aromatase gene (CYP19). Anim. Genet. 30, 232-233.
Wang M.H., Jia T.Y., Jiang N., Wang L., Hu X.H. and Luo Z. (2010) Inferring linkage disequilibrium from non-random samples. BMC Genomics. 11, 328-332.
