RFLP

دسترسی آزاد مقاله

1 - تشخیص و شناسایی گونه‌های کریپتوسپوریدیوم با استفاده از روش‌های Nested PCR (Nested polymerase chain reaction) و (RFLP) Restriction fragment length polymorphism در گوساله‌های شهرستان شاهرود
مصطفی مشکات بهار شمشادی کیومرث امینی

گونه های کریپتوسپوریدیوم به شاخه اپی کمپلکس ها تعلق دارد و پروتوزواهای فرصت طلبی هستند که سیستم های تنفسی و گوارشی در انسان و حیوان ها را آلوده می کند. این مطالعه به منظور بررسی شیوع، تشخیص و شناسایی گونه های کریپتوسپوریدیوم با استفاده از روش های Nested PCR و (RFLP) R چکیده کامل

گونه های کریپتوسپوریدیوم به شاخه اپی کمپلکس ها تعلق دارد و پروتوزواهای فرصت طلبی هستند که سیستم های تنفسی و گوارشی در انسان و حیوان ها را آلوده می کند. این مطالعه به منظور بررسی شیوع، تشخیص و شناسایی گونه های کریپتوسپوریدیوم با استفاده از روش های Nested PCR و (RFLP) Restriction Fragment Length Polymorphism در گوساله های شهرستان شاهرود انجام شد. 256 نمونه ی مدفوع از گوساله های زیر 2 ماه جمع آوری شد و نمونه های مثبت با استفاده از روش زیل-نلسون رنگ آمیزی شدند. پرایمرهای اختصاصی برای بررسی Nested PCR استفاده شد و زیرگونه ها توسط روش RFLP بررسی شدند. نتایج مطالعه میکروسکوپی نشان داد که 27 نمونه (54/10 %) از نمونه های مورد بررسی مثبت بودند. نتایج برای روش Nested PCR نشان داد که از مجموع نمونه های مورد بررسی، به ترتیب 59/92 % و 41/7 % به ترتیب برای کریپتوسپوریدیوم پارووم و کریپتوسپوریدیوم اندرسونی مثبت بودند. نتایج نشان داد که 25 نمونه تحت تأثیر آنزیم VSP در نواحی 104 و 628 جفت باز قرار گرفتند، که نشان دهنده ی که تأیید کننده ی زیرگونه های کریپتوسپوریدیوم پارووم گاوی و زیرگونه ی ژن A بودند. نمونه های تحت تأثیر آنزیم Ssp I قرار گرفتند و نتایج باندهایی را در 385 و 448 جفت باز نشان داد که نشان دهنده ی زیر گونه های C. muris/C. andersoni بودند. نتایج توسط آنزیم dde، باندهایی را در 156، 186 و 224 جفت باز نشان داد که نشان دهنده ی زیر گونه ی C. muris بود. گونه ها و زیرگونه های مختلف با استفاده از روش های مختلف شناسایی شدند که می تواند به کنترل کریپتوسپوریدیوز کمک کند. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

2 - بررسی تنوع ژنتیکی تحت تیپ های مایکوباکتریوم بوویس در ایران توسط روش اسپولیگوتایپینگ و PCR-RFLP
پویان خالقیان کیوان تدین پریسا فرنیا نادر مصوری محدثه مظفری زهرا درخشانی نژاد روح اله کشاورز شجاعت دشتی پور محمد رضا مسجدی علی اکبر ولایتی رایناک قادری سامد برومندفر

پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

3 - بررسی ضایعات کاندیدایی ناخن و تعیین هویت گونه‌های جدا شده با روش‌های قارچ‌شناسی و مولکولی
مژگان سقازاه الهام نجفی

هدف:اونیکومایکوزیس شایع‌ترین بیماری ناخن محسوب می‌شود که مخمرها از عوامل مهم بروز آن می‌باشند. هدف مطالعه حاضر بررسی ضایعات کاندیدیایی ناخن و تعیین هویت گونه‌های جدا شده PCR-RFLP می‌باشد. روش‌شناسی: در این مطالعه مقطعی از 280 بیمار دچار دیستروفی ناخن مراجعه‌کننده به آزم چکیده کامل

هدف:اونیکومایکوزیس شایع‌ترین بیماری ناخن محسوب می‌شود که مخمرها از عوامل مهم بروز آن می‌باشند. هدف مطالعه حاضر بررسی ضایعات کاندیدیایی ناخن و تعیین هویت گونه‌های جدا شده PCR-RFLP می‌باشد. روش‌شناسی: در این مطالعه مقطعی از 280 بیمار دچار دیستروفی ناخن مراجعه‌کننده به آزمایشگاه تخصصی قارچ‌شناسی در تهران نمونه تهیه شد. آزمایش مستقیم و کشت در محیط‌های سابورودکستروز آگار، کروم آگار کاندیدا، کورن میل آگار و تست لوله زایا بر روی مخمرهای جدا شده از ضایعات ناخن انجام گرفت و در نهایت برای تشخیص نهایی گونه‌های کاندیدایی که تعیین هویت نشده، روش مولکولی PCR-RFLP با استفاده از آنزیم Msp1 انجام شد. یافته‌ها:از 280 بیمار، 87 نفر انیکومایکوزیس کاندیدایی داشتند که 54 مورد کاندیدا آلبیکنس و پس از آن به ترتیب کاندیدا پاراپسیلوزیس 16 مورد، کاندیدا تروپیکالیس7 مورد، کاندیدا گلابراتا 6 مورد و کاندیدا کروزئی 3 مورد و یک مورد کاندیدا گیلرموندی بود. به منظور تعیین هویت گونه‌های مجهول و همچنین تائید نتایج حاصل از روش‌های تشخیصی، تست ژنوتیپی بر روی 20 نمونه انجام گردید و نتایج حاصل از کشت و آزمایش مستقیم و همچنین تعیین هویت گونه‌های مجهول را تایید کرد. نتیجه‌گیری:به دلیل زمان‌بر بودن مراحل تشخیصی معمول در آزمایشگاه‌ها از جمله کشت‌، استفاده از روش‌های ژنوتیپی سریع و مطمئن مانند PCR-RFLP که شناسایی را در حد گونه انجام می‌دهد، بسیار کار‌آمد خواهد بود و روش‌های نوین مولکولی می‌تواند در تشخیص و شناسایی گونه‌ها بسیار کمک‌ کننده باشد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

4 - بررسی چند شکلی ژن GDF9 در گوسفند قره گل و ارتباط آن با چند قلوزایی
رضا سید شریفی نجات بادبرین امجد بهمنی علی مجتهدین

زمینه و هدف:یکی از صفات بسیار مهم و اقتصادی در پرورش گوسفند چند قلوزایی است. مطالعات ژنتیکی مشخص نموده است که چند قلوزایی تحت تاثیر مجموعهای از ژنها معروف به ژنهای باروری قرار دارد. از جمله این ژن ها، ژن GDF9است که بر روی کروموزوم شماره 5 گوسفند شناسایی گردید. پژوهش چکیده کامل

زمینه و هدف:یکی از صفات بسیار مهم و اقتصادی در پرورش گوسفند چند قلوزایی است. مطالعات ژنتیکی مشخص نموده است که چند قلوزایی تحت تاثیر مجموعهای از ژنها معروف به ژنهای باروری قرار دارد. از جمله این ژن ها، ژن GDF9است که بر روی کروموزوم شماره 5 گوسفند شناسایی گردید. پژوهش حاضر با هدف بررسی چند شکلی ژن GDF9و رابطه آن با صفت چندقلوزایی در گوسفند قره گل انجام گرفت. روش کار:برای این منظور از 100 راس گوسفند ماده قره گل در ایستگاه اصلاح نژاد قره گل سرخس به صورت تصادفی نمونه خون تهیه و اطلاعات زایش آن ها ثبت گردید. پس از استخراج DNAبا استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی یک قطعه 1503 جفت بازی از ژن GDF9تکثیر شد. قطعه تکثیر شده با استفاده از آنزیم Rsa Iهضم گردید. با استفاده از نرم افزار SAS 9.1ارتباط بین ژنوتیپهای شناسایی شده و صفت چند قلوزایی بررسی شد.یافته ها:نتایج حاصل از هضم آنزیمی وجود جهش را در این جایگاه ژنی تایید نمود و رابطه معنیدار(05/0P) بین ژنوتیپهای مشاهده شده و صفت چند قلوزایی نشان داد، به طوری که حیوانات هتروزیگوت نسبت به هموزیگوتها میزان چند قلوزایی بالاتری داشتند.نتیجه گیری: جهش ایجاد شده در ژن GDF9جهش مفیدی بوده و اقدام برای تثبیت این جهش در طی سالهای آینده به احتمال زیاد موجب افزایش چند قلوزایی، افزایش راندمان تولید مثلی و در نهایت افزایش درآمد دامداران خواهد شد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

5 - بررسی هم بستگی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدیrs1800734وrs4647269 ژن MLH1 در مردان نابارور ایرانی آزواسپرم
مهردخت درپوش زهرا نورمحمدی مسعود شیدایی

مقدمه: ناباروریو مشکلات ناشی از آن امروزه به عنوان یکی از مسایل مهمی است که %15-10زوج هاراتحتتأثیر قرار می دهد.حدود نیمی از کل ناباروری ها مربوط به مردان است. اسپرماتوژنز انسان وابسته به فعالیت هزاران ژن است و نقص در مکانیسم های ترمیم می تواند باعث توقف اسپرماتوژنز شود. چکیده کامل

مقدمه: ناباروریو مشکلات ناشی از آن امروزه به عنوان یکی از مسایل مهمی است که %15-10زوج هاراتحتتأثیر قرار می دهد.حدود نیمی از کل ناباروری ها مربوط به مردان است. اسپرماتوژنز انسان وابسته به فعالیت هزاران ژن است و نقص در مکانیسم های ترمیم می تواند باعث توقف اسپرماتوژنز شود. یکی از پروتئین های دخیلدر سیستم ترمیم ، پروتئینMLH1 است.هدف از این مطالعه بررسی ارتباطپلی مورفیسم هایrs1800734وrs4647269در ژن MLH1با ناباروری آزواسپرمی مردان می باشد.روش کار:در این تحقیق مورد- شاهدی از113مرد مبتلا به ناباروری آزواسپرمی به عنوان بیمار و 101مرد سـالم بـه عنـوان کنتـرل ، نمونه خونجمع آوری شد. پس از استخراجDNA، ژنوتیپ هایپلی مورفیسم هاrs4647269 وrs1800734، توسط روشRFLP-PCRبه ترتیب با کمک آنزیم های HPYCH4IV وPVUII تعیین و با توالی یابی تایید گردید.آزمون مربع کای ،رگرسیون لجستیک و ANOVA به منظور آنالیز داده های ژنتیکی و دموگرافی به کمک نرم افزارهایSPPS و SNPSTATSصورت گرفت.یافته ها : درپلی مورفیسمrs1800734تفاوت معناداری (p<0.05) بین فراوانی ژنوتیپی گروه بیمار و شاهد مشاهده نشد.در بررسیپلی مورفیسم rs4647269در مدل های وراثتی هم بارز (CT ، TT)، بارز(CT/TT) و مغلوب (TT) تفاوت معنی داری بین فراوانی ژنوتیپی بین دو گروه دیده شد.P=0.024) ، P=0.021 ، P=0.036)همچنین در این پلی مورفیسم از نظر حجم اسپرم در صفات نیز تفاوت معنا دار مشاهده شد.(P=0.000)نتیجه گیری : بین پلی مورفیسم rs4647269 ژن MLH1 و ناباروری آزواسپرمی در جمعیت مردان ایرانی مورد مطالعه ارتباط معنا دار بوده و احتمالا می تواند در آن موثر باشد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

6 - پلی‌مورفیسم ژن aroA در استافیلوکوکوس اورئوس‌های جدا شده از شیر خام و پنیر سنتی
عزیزه حسین خانی علیرضا منادی سفیدان جلال شایق

10.30495/jfh.2021.1920855.1305

با توجه به بیماری‌زایی استافیلوکوکوس اورئوس و حضور آن در مواد لبنی و اهمیت انتقال این باکتری به واسطه مواد لبنی، هدف از این مطالعه آنالیز ژن aroA در استافیلوکوکوس اورئوس‌های جدا شده از شیر گاو و پنیر سنتی است. بدین منظور تعداد 40 جدایه استافیلوکوکوس اورئوس شامل 14 جدایه چکیده کامل

با توجه به بیماری‌زایی استافیلوکوکوس اورئوس و حضور آن در مواد لبنی و اهمیت انتقال این باکتری به واسطه مواد لبنی، هدف از این مطالعه آنالیز ژن aroA در استافیلوکوکوس اورئوس‌های جدا شده از شیر گاو و پنیر سنتی است. بدین منظور تعداد 40 جدایه استافیلوکوکوس اورئوس شامل 14 جدایه از پنیر سنتی، 19 جدایه از شیر گاو و 7 جدایه از شیر گاومیش به روش PCR-RFLP مورد آزمایش قرار گرفتند. برش آنزیمی پس از تکثیر ژن کوآگولاز با پرایمرهای اختصاصی، با استفاده از آنزیمTaqI به‌عمل آمد. نتیجه تکثیر شده برای ژن aroA تولید باندی با اندازه 1153 جفت باز بود. هضم باند مذکور با آنزیم TaqI سه الگوی مختلف برش از ژن مورد نظر نمایش می‌داد. الگوی اول شامل سه باند، الگوی دوم دو باند و الگوی سوم چهار باند بودند. از 40 نمونه استافیلوکوکوس اورئوس مورد مطالعه در این پژوهش تعداد 29 نمونه حاوی ژن aroA با الگوی سه باندی، 9 نمونه با الگوی دو باندی و 2 نمونه الگوی 4 باندی بودند. با توجه به این که این روش قادر به تشخیص تفاوت بین سویه‌های با منشأ غذایی مختلف نیست، لازم است با روش‌های مکمل جایگزین شود. هم‌چنین نتایج این بررسی نشان‌دهنده نیاز به توجه بیشتر به نکات بهداشتی در تهیه مواد غذایی حاصل از مواد لبنی و نیز توجه بیشتر دامپزشکان در برخورد با استافیلوکوکوس اورئوس و انتخاب رویکرد درمانی مناسب برای آن می‌باشد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

7 - مطالعه پلی‌مورفیسم ژن کوآگولاز در استافیلوکوکوس آرئوس‌های جدا شده از شیر گاومیش
جلال شایق علی رضا منادی

هدف از این مطالعه آنالیز ژن کوآگوالاز در استافیلوکوکوس آرئوس‌های جدا شده از شیر گاومیش‌های بومی در شمال غربی ایران بود. برای این منظور تعداد 75 جدایه استافیلوکوکوس آرئوس به روش PCR-RFLP مورد آزمایش قرار گرفتند. نتیجه تکثیر شده برای ژن کوآگولاز تولید باندهای با اندازه‌ها چکیده کامل

هدف از این مطالعه آنالیز ژن کوآگوالاز در استافیلوکوکوس آرئوس‌های جدا شده از شیر گاومیش‌های بومی در شمال غربی ایران بود. برای این منظور تعداد 75 جدایه استافیلوکوکوس آرئوس به روش PCR-RFLP مورد آزمایش قرار گرفتند. نتیجه تکثیر شده برای ژن کوآگولاز تولید باندهای با اندازه‌های 600، 700، 760 و 850 جفت باز بود که به ترتیب 12، 25، 29 و 9 مورد از جدایه‌های مورد آزمایش را شامل می‌شد. از هضم باندهای مذکور با آنزیم AluI الگوهای متفاوتی از هر اندازه بدست آمد. اما الگوهای متعلق به یک اندازه، مشابه هم بودند. نتایج آنالیز ژن کواگولاز در این مطالعه مشابه نتایج حاصل از جدایه‌های گاوی بودند. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

8 - Detection of New Silent Mutation at 348 bp Position in a CD18 Gene in Holstein Cattle Normal and Heterozygous for Bovine Leukocyte Adhesion Deficiency Syndrome
R.K. Patel R. Kotikalapudi P.S.S. Sunkara

In India, Holstein and its crosses are being used extensively in breeding programmes and all these breeding bulls are screened for autosomal recessive genes. Blood samples are collected in ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) coated tubes and DNA was isolated by using چکیده کامل

In India, Holstein and its crosses are being used extensively in breeding programmes and all these breeding bulls are screened for autosomal recessive genes. Blood samples are collected in ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) coated tubes and DNA was isolated by using phenol-chloroform method. Polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) wereperformed by using bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD) specific primersand TaqI restriction enzyme for diagnosis of bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD) syndrome. The bull was found to be heterozygous for BLAD allele. The PCR product was sequenced by automated sequencer using the ABI big dye Ver 3.1 for detection of mutation at position 383 bp (A/G). Sequence analysis comparison was performed using the codon code aligner 4.0.4 software. The sequence of carrier animal confirmed polymorphism at 383 bp position. The sequence was also compared with sequence of normal Holstein as a control and the sequence available with NCBI (accession No. NC-007299). The comparison of sequences revealed a heterozygous polymorphism at 348 position (T>C) in a carrier animal whereas in homozygous in a control Holstein which was normal for BLAD. The new polymorphism at 348 position was found to be silent as it does not change amino acid (asparagine, AAT>AAC) within exon 4 of CD18 gene. The partial sequence of new polymorphism / silent mutation has already been submitted to NCBI (accession No. KF840683). Further studies have to be carried out to elucidate the possible association of the CD18 silent point mutation at 348 bp position as a potential molecular marker for milk production traits. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

9 - Polymorphism and Sequencing of DGAT1 Gene in Iranian Holstein Bulls
M. Hosseinpour Mashhadi M.R. Nassiri M. Mahmoudi M. Rastin N.E.J. Kashan R. Vaez Torshizi N. Tabasi S.E. Nooraee

Quantitative traits locus for milk production traits has been described on centromeric end of bovine chromosome 14. Reports name the acyl coA: diacylglycerol acyltransferase (DGAT1) gene as a potential candidate gene with dinucleotide substitution (AA to GC) in exon VII چکیده کامل

Quantitative traits locus for milk production traits has been described on centromeric end of bovine chromosome 14. Reports name the acyl coA: diacylglycerol acyltransferase (DGAT1) gene as a potential candidate gene with dinucleotide substitution (AA to GC) in exon VIII which causes the change of lysine to alanine in amino acid (K232A).The aim of the present study was to estimate the frequency of DGAT1 K232A polymorphism in Iranian Holstein bulls as a potential quantitative trait locus (QTL) for marker assisted selection. Sample of 103 Holstein bulls from the Animal Breeding Center of Iran were genotyped for DGAT1 polymorphism (A and K allele). The PCR-RFLP technique was used to study the DGAT1 gene polymorphism. Frequency of KK, KA and AA genotypes were 0.59, 0.41 and zero respectively. The allele frequencies of the DGAT1 gene were 0.7961 and 0.2039 for K and A allele, respectively. The K allele was sequenced and registered in NCBI gene bank with EU075528 accession number. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

10 - Investigation of Bovine Leukocyte Adhesion Deficiency (BLAD) and Complex Vertebral Malformation (CVM) in a Population of Iranian Holstein Cows
B. Hemati S. Gharaie-Fathabad M.H. Fazeli Z. Namvar M. Ranji

In the present research, molecular detection of bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD) and complex vertebral malformation (CVM)in a population of Iranian Holstein cows has been carried outusing milk somatic cells by polymerase chain reaction-restriction fragment le چکیده کامل

In the present research, molecular detection of bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD) and complex vertebral malformation (CVM)in a population of Iranian Holstein cows has been carried outusing milk somatic cells by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP). The BLAD and CVM are monogenic and autosomal recessive heredity lethal syndrome in Holstein-Friesian cattle. BLAD characterized by affecting the haematopoietic system via reduced expression of the adhesion molecules on neutrophils. CVM characterized by intra-uterine mortality with disorders such as short neck, curved legs, abnormality of ribs and some certain heart abnormalities. In the first step of our research program,tank milk samples from 50 herds were collected. PCR-RFLP was performed to detect a point mutation of both CVM and BLAD genes. After DNA extraction, PCR was amplified using specific primers for 136 bp DNA (CD18 gene) and233 bp DNA (SLC35A3 gene).TaqIand EcoT22I enzymes were used to identify both BLAD and CVM alleles of both genes by digestion of PCR products.In these herds, we did not find any affected herd with the mutant allele of BLAD comparing with a positive evidence but the mutation of SLC35A3 gene found in 17 different herds. In the next step of our study a herd with 120 cows was randomly selected for individual test using blood samples. We showed two cows out of 120 were identified as carriers of this gene. In this herd, the total number of dominant homozygote (AA), heterozygote (Aa) and recessive homozygote (aa) genotypes for CVM were 118, 2 and 0, respectively and the frequency of A and a alleles were 0.992 and 0.008, respectively. The other affected herds will be tested in the next step of our research program. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

11 - Association of Melatonin Receptor 1A Gene Polymorphisms with Production and Reproduction Traits in Zandi Sheep
م. حاتمی ق. رحیمی میانجی ا. فرهادی

Melatonin regulates some major physiological processes such as maturation and function of reproductive system, pubertal development, seasonal reproduction and adaptation. The activation of melatonin hormone is mediated by melatonin receptor. Previous studies showed mela چکیده کامل

Melatonin regulates some major physiological processes such as maturation and function of reproductive system, pubertal development, seasonal reproduction and adaptation. The activation of melatonin hormone is mediated by melatonin receptor. Previous studies showed melatonin receptor 1A gene (MTNR1A) is highly polymorphic in seasonally breeding species. The aim of the present study was detection of MTNR1Apolymorphism and its association with production (body weights at birth, 1, 3, 6, 9 and 12 month of age) and reproduction (litter size) traits in Zandi sheep using PCR-RFLP methodology. Hundred blood samples were randomly collected and genomic DNA was isolated using modified salting out method. A large fragment of exon 2 of MTNR1A gene was amplified by PCR using specific primer pairs. After amplification, the PCR product was digested with MnII endonuclease. Restricted digestion allowed the determination of two alleles (M, m) and two genotypes (MM, Mm) with frequencies of 0.91, 0.09 and 0.82, 0.18, respectively. Least square means showed that MM individuals had higher body weight at one month of age (BW1) than Mm individuals (P<0.05). No associations were found between observed genotypes and other studied traits.In the subsequent studies using a large number of samples along with the other important parameters such as sire effect and the lamb health status which may influence lamb body weight is recommended. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

12 - Genotyping of Lactoferrin and CXCR1 Genes in Guilan Native Cows and Its Association with Milk Somatic Cell Score
S.H. Hosseini Moghaddam M. Ayatollahi O. Ahadzadeh S.Z. Mirhoseini R. Khataminejad H. Alaei

Lactoferrin and CXCR1 genes are involved in immune responses related to mastitis infection. In this study, the polymorphism and association of lactoferrin (LF) and CXCR1 genes with milk somatic cell counts, as an indicator for mastitis detection, were investigated in Gu چکیده کامل

Lactoferrin and CXCR1 genes are involved in immune responses related to mastitis infection. In this study, the polymorphism and association of lactoferrin (LF) and CXCR1 genes with milk somatic cell counts, as an indicator for mastitis detection, were investigated in Guilan native cow (Taleshi breed) using DNA blood samples of 100 cows from three different geographical zones (west, center, and east of Guilan province). The LF gene with a 301 bp fragment and CXCR1 with a fragment of 311 bp were amplified through PCR by using their specific primers. Then LF polymerase chain reaction (PCR) product was digested by EcoRI enzyme due to a single nucleotide polymorphism (SNP) at the related position (T>C) in intron 6 of LF and CXCR1 PCR product by BaeGI enzyme due to G > C SNP at position +735. Two alleles and three genotypes were observed for both genes in the studied populations. The observed genotypic frequencies of AA, AB, and BB were 52, 39, and 9% for LF and 67, 12, and 20% for CXCR1 locus, respectively. Three genotypes of LF locus were under Hardy-Weinberg equilibrium (P˃0.05) but it was not for CXCR1 locus. The mean of somatic cell counts was 138 × 103/mL, much lower than the reported data of pure-bred and crossbred cattle. Although there was no significant association (p <0.05%) between LF genotypes and somatic cell score (SCS), there was a tendency for association (p <0.1). The CXCR1c.+735 genotype had a significant association (p <0.05) with SCS. Sampling from different regions did not show a significant effect on SCS. The fix effects including lactation month, age, and lactation number had also no significant effect on SCS of the studied native cow. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

13 - Polymorphism of Β-Lactoglobulin (Β-Lg) Gene and Its Association with Milk Yield and Milk Composition on Senduro Goats
F.E. Wardani J. Palayukan A. Furqon S. Suyadi T.E. Susilorini

The objective of this research was to examine the β-lactoglobulin gene polymorphism and its association with milk yield and composition in Senduro goats. A total of 60 lactation Senduro goats aged 2 to 4 years were used in this study. Milk yield and blood samples w چکیده کامل

The objective of this research was to examine the β-lactoglobulin gene polymorphism and its association with milk yield and composition in Senduro goats. A total of 60 lactation Senduro goats aged 2 to 4 years were used in this study. Milk yield and blood samples were collected from dairy goat farms in Burno and Kandangtepus Senduro villages. The 480 bp β-lactoglobulin gene DNA fragments were amplified using the polymerase chain reaction (PCR) method at 60 ˚C annealing for 35 cycles. The genotypes of the β-lactoglobulin gene were determined using the restriction fragment length polymorphism (RFLP) technique with the Sac II restriction enzyme. Association of β-lactoglobulin genotypes with milk yield and composition were analyzed using the ANOVA test. The result showed that the single nucleotide polymorphism (SNP) c.497G > A was detected. The β-lactoglobulin was polymorphic in Senduro goats. There were three genotypes (AA, AG, GG) and two alleles (A and G). The frequency of AA, AG, GG genotypes were 0.4, 0.52, 0.08, respectively, while the frequencies of A and G alleles were 0.66 and 0.34, respectively. There was no association between β-lactoglobulin gene polymorphism and milk yield and composition on Senduro goats. In conclusion, the genotype of the β-lactoglobulin gene did not effect on milk yield, protein, fat, density, lactose, salt, SnF, and total solid. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

14 - A Profile of Single Nucleotide Polymorphisms in Fecundity Genes Among Iranian Sheep Breeds by Using Polymerase Chain Reaction–Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) Method
پ. پتکی س.ض. میرحسینی ف. افراز س.م.ف. وحیدی

Ovulation rate and litter size are traits of fecundity and have a very remarkable economic value that leads to an increase in the production of meat, wool and milk. Therefore, exploring on the candidate and functional genes for these traits is very important. Growth dif چکیده کامل

Ovulation rate and litter size are traits of fecundity and have a very remarkable economic value that leads to an increase in the production of meat, wool and milk. Therefore, exploring on the candidate and functional genes for these traits is very important. Growth differentiation factor 9 (GDF9), bone morphogenetic protein 15 (BMP15) and bone morphogenetic protein receptor-1B (BMPR1B) are the most important of these genes containing single nucleotide polymorphisms (SNPs) markers that are associated with high fertility in sheeps. The aim of this study was to determine the allelic and genotypic frequencies of seven of these SNPs including; G1, G4, G7 and G8 in GDF9 gene, B2 and B4 in BMP15 gene and FecB in BMPR1B gene among 532 sheeps from eleven of Iranian native breeds using polymerase chain reaction–restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. For each mutation region, polymerase chain reactions and digestion reactions with specific endonuclease enzymes, were performed. The results showed that G1 mutation presents among ten breeds except Zandi, G4 mutation in all breeds, and the FecB mutation in two breeds; Kalakuei and Zandi. The G7, G8, B2 and B4 mutations were not observed in any of breeds, and all sheeps were homozygote wild type for these four positions. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

15 - Investigation of Kappa Casein Gene Polymorphism by PCR-RFLP in Najdi Cattle Breed Population in Khuzestan Province
گ. فرهادی م.ت. بیگی نصیری ج. فیاضی ه. روشنفکر

More than 80% of the total milk protein contains caseins that are to forms α-s1, α-s2, β-casein and kappa casein. Kappa casein is smaller than other milk proteins but due to have a role in size and stability of micelles. The present study describes poly چکیده کامل

More than 80% of the total milk protein contains caseins that are to forms α-s1, α-s2, β-casein and kappa casein. Kappa casein is smaller than other milk proteins but due to have a role in size and stability of micelles. The present study describes polymorphism of kappa casein gene. This is the first study of kappa casein gene polymorphism in Najdi cattle of Iran. We used the polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) technique to screen DNA polymorphism in cattle. We amplified the 453 fragment consisting on part of exon 4. The amplified fragment was digested with HinfI restriction endonuclease and subjected to electrophoretic separation in 3% agarose gel. Two alleles were observed, A and B. It gives frequencies of 0.54 and 0.46 for A and B alleles. Also, genotypes AA, AB and BB with frequencies of 35%, 37.5% and 27.5% of the total study population were diagnosed. Existence of Hardy-Weinberg equilibrium indicated that there was not any choice in order to increase or decrease the frequency of genotypes in the kappa-casein population in this herd. Also, in this population kappa-casein gene has medium level of heterozygosity. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

16 - Allele Frequency of c.486A>G Polymorphism of the AA-NAT Gene in Iranian Indigenous and Exotic Sheep Populations
S. Emanizadeh H. Alnajm A. Javanmard J. Shoja A. Rafat

Typically, lambing percentage is classified as a composite trait and is crucial to profitability in domestic sheep farming. In breeding programs, out-of-season reproduction of sheep is an important tool because seasonal reproduction limits productivity and flexibility. چکیده کامل

Typically, lambing percentage is classified as a composite trait and is crucial to profitability in domestic sheep farming. In breeding programs, out-of-season reproduction of sheep is an important tool because seasonal reproduction limits productivity and flexibility. Understanding the complexities of genetic aspects of the none- seasonal reproduction has received significant critical attention in the literature. In this puzzle, the arylalkylamine-N-acetyltransferase (AA-NAT) is a rate-limiting enzyme of the melatonin synthesis pathway and is highlighted as a candidate gene that is responsible for melatonin synthesis and is thus directly associated with out-of-season reproduction in sheep. With this scenario research, we aimed to examine the allele frequency of the polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) polymorphism in the AA-NAT gene in 11 native and exotic sheep populations. A total of 220 blood samples were taken from 11 breeds of sheep, including the exotic breeds Romanov (ROMV) and [Awassi (AWAS), Arabi (ARAB), Naaimi (NAIM) Iraqi native sheep] and [Ghezel (GHZL), Makui (MAKU)], Kurdi (KURD), Baluchi (BALCH), Afshari (AFSR) Iranian native sheep] and two Afshari-Booroola and Romanov-Ghezel F1 cross). Here, we describe the Smal-RFLP genotypes and allele frequency patterns of the (c.486A>G) casual single nucleotide polymorphism (SNP) in the exon of AA-NAT within and between the examined sheep breeds. In addition, PCR sequencing methods were used to double-check A/G and confirmation of PCR-RFLP results. This mutation changed the Arg > Gly structure from helix to helix-effective in improving non-seasonal reproduction. Interestingly, the observed variation of G allele ranged from 0.1 to 0.43 in all study breeds. ROMV is a candidate for non-seasonal sheep breeds and its cross expresses the highest G allele frequency among other breeds studied. The frequency of the AA-NAT genotype was significantly different between breeds in this study. Therefore, the exotic 486A>G mutation created a useful mirror to identify genomics aspects of seasonal/non-seasonal reproduction in sheep. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

17 - The Calpastatin Gene Polymorphism Study and Its Effect on Early Body Weight Traits in Zandi Sheep
ن. پیرویسی ع. نوشری ب. همتی

The goal of this study was investigation of the calpastatin gene polymorphism and its effect on early body weight traits in Zandi sheep by polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. Calpastatin is the main inhibitors of calpain چکیده کامل

The goal of this study was investigation of the calpastatin gene polymorphism and its effect on early body weight traits in Zandi sheep by polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. Calpastatin is the main inhibitors of calpain-calpastatin enzyme system that play an important role in regulating the protein regeneration process. Genomic DNA was extracted by whole blood samples from 124 randomly selected Zandi breed sheep using salting out method. Birth weight, weight on 150 days old and daily weight gain from birth to 150 days old were recorded. The exon and intron 1 of ovine calpastatin gene were amplified to produce a 622 bp fragment. The PCR products were digested with MspI restriction enzyme and electrophoresised on agarose gel. Results showed 80.6% and 19.4% allele frequencies for A and B alleles and 65.32%, 4.04% and 30.64% genotype frequencies for AA, BB and AB genotypes, respectively. X2 and G2 tests showed the Hardy-Weinberg equilibrium for studied locus. The effect of calpastatin genotype on growth traits was insignificant, but genotype BB had the best performance among all the three traits, which indicates the better performance of normal allele (B) than mutant allele (A) for these traits. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

18 - RFLP Analysis of Beta‐Lactoglobulin Gene in Swamp and Murrah Buffaloes Using a Single Restriction Enzyme
W. Nualchuen K. Srisakwattana S. Chethasing K. Tasripoo S. Usawang R. Hengtrakulsin M. Kamonpatana

An attempt has been made to analyze the distribution of the beta-lactoglobulin genotype in swamp buffaloes and Murrah buffaloes utilizing polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP). Blood samples were taken from 50 swamp buffaloes and 5 چکیده کامل

An attempt has been made to analyze the distribution of the beta-lactoglobulin genotype in swamp buffaloes and Murrah buffaloes utilizing polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP). Blood samples were taken from 50 swamp buffaloes and 50 Murrah buffaloes. The DNA was extracted by the phenol-chloroform method. The PCR-RFLP was performed using beta-lactoglobulin gene primers and a single restriction enzyme, Hae III. The enzyme digested products were separated by electrophoresis on 2.5%agarose gel. All the 100 DNA samples of swamp and Murrah buffaloes resulted in 398 bp product on amplifying beta-lactoglobulin gene. Those PCR products (398 bp fragment) were digested with Hae III produced only one type of restriction pattern yielding five fragments of 113, 99, 89, 73 and 24 bp. One hundred DNA samples of swamp and Murrah buffalo were examined in this study and revealed no polymorphism at the beta-lactoglobulin gene locus. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

19 - Survey of FecXL Locus of BMP15 Gene and Growth Hormone (GH) Gene and Their Effects on Lambing Rate in Zel Sheep
S. Yousefi L. Shahmohammadi M. Ahani Azari S. Zerehdaran E. Dehnavi

The GH gene and BMP15 gene have been used as candidate genes for marker-assisted selection in different livestock species. Random blood samples were obtained from 180 Zel sheep breed to study genetic polymorphism of these genes. DNA was extracted from blood samples and چکیده کامل

The GH gene and BMP15 gene have been used as candidate genes for marker-assisted selection in different livestock species. Random blood samples were obtained from 180 Zel sheep breed to study genetic polymorphism of these genes. DNA was extracted from blood samples and a 365 bp fragment from the exon V of the ovine growth hormone gene and a 312 bp region from exon II of BMP15 gene were amplified by polymerase chain reaction. SSCP analysis showed three conformational patterns (A, B and C) for GH gene but for FecXL locus of BMP15 no banding patterns were observed in the animals tested. Results indicated that there were no significant associations (P>0.05) between polymorphism of the GH loci and lambing rate. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

20 - Genotypic and Allelic Frequencies of IGF1 and IGF2 Genes in Broilers Analysed by Using PCR‐RFLP Techniques
T. Shah S. Deshpande U. Dasgupta K.M. Singh C.G. Joshi

A polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) test was performed to investigate the allele frequencies of the insulin-like growth factor (IGF1 and IGF2 genes) in 90 broilerchickens. A 793 bp fragment of IGF1 gene and 1146 bp fragment of چکیده کامل

A polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) test was performed to investigate the allele frequencies of the insulin-like growth factor (IGF1 and IGF2 genes) in 90 broilerchickens. A 793 bp fragment of IGF1 gene and 1146 bp fragment of IGF2 gene were amplified and digested with HinfI and Hsp92II restriction enzymes,respectively. Two types of alleles of A and B and three types of genotypes of AA, AB and BB were observed in both genes. The results indicated predominant B-allele (0.85) was higher for IGF1 butA-allele (0.5611) IGF2 in the broiler population. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

21 - Investigation of (Stearoyl-CoA Desaturase 1) SCD1 Gene Polymorphism in Khuzestan Buffalo Population Using PCR-RFLPMethod
ک. تقی‌زاده م.ت. بیگی نصیری ج. فیاضی م. بوجارپور

Stearoyl-CoA desaturase (SCD) is a rate-limiting enzyme in the biosynthesis of monounsaturated fatty acids (MUFA). A number of studies support the hypothesis that SCD gene regulation and polymorphism may affect fatty acid composition and fat quality in meat and milk. Si چکیده کامل

Stearoyl-CoA desaturase (SCD) is a rate-limiting enzyme in the biosynthesis of monounsaturated fatty acids (MUFA). A number of studies support the hypothesis that SCD gene regulation and polymorphism may affect fatty acid composition and fat quality in meat and milk. Single nucleotide polymorphisms in the coding region of the bovine stearoyl-CoA desaturase gene have been predicted to result in p. 293A (alanine at amino acid 293) and p. 293V (valine at amino acid 293) alleles at the stearoyl-CoA desaturase1 locus. The objective of this study was to characterize polymorphisms of stearoyl-CoA desaturase 1 (SCD1) gene in Khuzestan buffalo population. This is the first study of SCD1 gene polymorphism in Iranian buffalo. The blood samples were taken from 85 buffalo of Khuzestan-Iran population. Genomic DNA was extracted using a kit DIAtom DNA prep. After this, PCR reactions were made by using primers that encloses exon V. A 400 bp fragment amplified with standard PCR method. The PCR products were digested by NCO1 restriction enzyme with PCR-RFLP method. All samples were genotyped on 3% agarose gels stained with ethidium bromide. Electrophoretic mobility shift determined that there were not genetic differences between these animals in the studied region by using NCOI enzyme. Also, this study showed that genotype frequencies were not in Hardy-Weinberg equilibrium for SCD1 gene. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

22 - The Influence of Growth Hormone Gene Polymorphism on Growth Rate of Young Cattle
ت.ا. سدیخ ای.ی. دولماتووا ف.ر. والیتوو ر.س. گیزاتولین ل.ا. کالاشینکووا

Beef production is an important development area in animal breeding with meat quality being determined by both paratypic and genetic factors. In this regard evaluating genetic material for the presence of desirable allele combinations of genes associated with growth and چکیده کامل

Beef production is an important development area in animal breeding with meat quality being determined by both paratypic and genetic factors. In this regard evaluating genetic material for the presence of desirable allele combinations of genes associated with growth and development indicators, as well as meat qualities of animals have a certain scientific and practical significance. The aim of the study was to determine the influence of growth hormone gene polymorphism on the growth rate of bull calves of different breeds kept in the Bashkortostan Republic. The method of polymerase chain reaction (PCR) followed by the analysis of restriction fragment length polymorphism (PFLP) (SNP GH-L127V) was used to genotype Hereford (115 heads), Limousine (114 heads), Black-and-White (200 heads), Bestuzhev (200 heads) bull calves being fattened. The conducted research showed that there is a similar distribution of genotypes among bull calves of meat breeds with GHLL homozygous genotype being more common (47.83% and 52.63%). Black-and-White and Bestuzhev bull calves have a higher frequency of GHLV heterozygous genotype (62.50% and 59.0%). Hereford, Limousine and black-and-white bulls have a greater frequency of GHL allele (0.69; 0.71; 0.51), Bestuzhev animals have a higher rate of GHV allele (0.62). The paper presents the influence of somatotropin hormone gene polymorphism on some meat productivity and growth rate indicators of young animals. Thus, GHLL-genotyped Hereford, Limousine, and Black-and-White bull calves had significantly higher live weight (pre-slaughter live weight) as well as absolute and average daily live weight gains at the end of rearing. According to the results GHLV-genotyped animals were in the second place and GHVV-genotyped bulls ranked the last. As a result of the one-way analysis of variance, there has been found a high proportion of the studied polymorphism factor in developing meat productivity and growth rate indicators for Limousine, Black-and-White and Hereford bull calves. Genotyping by the GH gene as an additional criterion can be used in the selection of animals to improve cattle meat quality. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

23 - Calpastatin Gene Polymorphism in Raini and Tali Goat in the Kerman Province
و. بهرام‌پور ا. محمدی

Restriction fragment length polymorphisms (RFLP) have been identified at the goat. The objective of the present study was to determine polymorphisms of calpastatin locus in Raini and Tali goats of the goats in Kerman Province, improving meat quality traits superior meat چکیده کامل

Restriction fragment length polymorphisms (RFLP) have been identified at the goat. The objective of the present study was to determine polymorphisms of calpastatin locus in Raini and Tali goats of the goats in Kerman Province, improving meat quality traits superior meat quality by selection. Calpastatin gene effect on quality and tenderness meat, to identify different genotype of this gene was randomly selected 150 Tali and 150 Raini goats, and blood samples were collected from total of animals using ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) tubes. DNA was extracted from blood according to DNA preparation kit to determine the genetic relationship among studied goat animals. Amplification was performed using polymerase chain reaction (PCR). Two alleles (A and B) and three genotypes, (AA, BB and AB) were observed. The frequencies of the observed genotypes for Tali and raini were 38.4, 9.6, 52 and 17, 71, 12 for AA, BB and AB, respectively. And allele frequencies were 0.47, 0.53 and 0.12, 0.88 for A and B, in Tali and Raini goats respectively. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

24 - DRB1 Gene Patterns of Two Iranian Sheep Breeds
M. Sohrabi V. Molaee R. Osfoori M. Nikmard M.P. Eskandari Nasab

Genetic improvement programs may improve disease resistance in animal production. The best-characterized genetic control of disease resistance and immune response in animals is the one associated with the Major Histocompatibility Complex (MHC). The ovine lymphocyte anti چکیده کامل

Genetic improvement programs may improve disease resistance in animal production. The best-characterized genetic control of disease resistance and immune response in animals is the one associated with the Major Histocompatibility Complex (MHC). The ovine lymphocyte antigenof DRB1 gene encodes cell surface glycoproteins that initiate immune responses by presenting processed antigenic peptides to CD4 + T helper cells. DRB1 is the most polymorphic gene in sheep and it has been extensively evaluated as a candidate marker for associations with various ovine diseases and immunological traits. Aim of this study was to analyze exon 2 Ovar-DRB1 gene polymorphism in two Iranian native sheep breeds (Afshari and Zel). PCR products were characterized by the restriction fragment length polymorphism (RFLP) technique using two restriction enzymes, RsaI and HaeIII. In the studied groups of Afshari Sheep and Zel Sheep of Iran we were able to identify 9 restriction patterns (a, b, c, d, e, f, g, h and i) for the fragments of exon 2 Ovar-DRB1 gene with RsaI enzymatic digestion and 5 patterns (a, b, c, d and e) with HaeIII enzyme, including one previously unrecognized allele (c).Our results indicate that exon 2 of the Ovar-DRB1 gene is highly polymorphic in both breeds. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

25 - Allelic Polymorphism of Calpastatin Gene (CAST) in Khalkhali Goats: A Possible Marker for Meat Tenderness
ا. زارعیان جهرمی M. رنجبری س. خالقی&rlm;زاده س. احراری ا. احراری م. قوی&rlm;پیشه

Calpastatin (CAST) is a specific inhibiter of Calpains, playing a role in meat tenderization and myogenesis. In the present study the polymorphism of the CAST gene ofKhalkhali goat in Azerbaijan province in Iran was investigated by polymerase chain reaction and restrict چکیده کامل

Calpastatin (CAST) is a specific inhibiter of Calpains, playing a role in meat tenderization and myogenesis. In the present study the polymorphism of the CAST gene ofKhalkhali goat in Azerbaijan province in Iran was investigated by polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism technique (PCR-RFLP). Genomic DNA was extracted from whole blood samples collected from 200 Khalkhali goats. A 1552 bp in the region between exons 6 and 7 of the CAST gene was amplified by standard PCR, using the locus specific primers. Two alleles (A and B) and three genotypes (AA, BB and AB) were observed. The frequencies of the observed genotypes were49.7, 0.09 and 41.4 for AA, BB and AB, respectively. Allele frequencies were 0.705, 0.295 for A and B, respectively. The average heterozygosity for CAST gene was 0.416 and the expected heterozygosity was 0.417. For homozygosity these numbers were 0.91 and 0583, respectively and the chi-square test showed significant (P<0.01) deviation from Hardy-Weinberg equilibrium for this locus in this population. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

26 - Polymorphism of the Growth Hormone Gene and Its Effect on Production and Reproduction Traits in Goat
ف. غلامحسین زاده گوکی م.ر. محمدآبادی م. اسدی فوزی

Growth hormone (GH) has an effect on a broad variety of physiological parameters such as lactation, reproduction, growth and metabolism. Thus, the aim of this study was to detect GH gene polymorphism and its association with breeding values of production and reproductio چکیده کامل

Growth hormone (GH) has an effect on a broad variety of physiological parameters such as lactation, reproduction, growth and metabolism. Thus, the aim of this study was to detect GH gene polymorphism and its association with breeding values of production and reproduction traits in Raini Cashmere goat. Breeding values were estimated using records on 26731 Raini Cashmere goats. To study GH gene polymorphism, 300 animals were selected based on their estimated breeding values (EBVs) for these traits. Then the animal’s genotype was determined using PCR-RFLP. The genotype frequencies for AA, AB and BB were 0.15, 0.85 and 0, respectively. The number of observed alleles, number of effective alleles, expected heterozygosity, observed heterozygosity, mean of heterozygosity, expected homozygosity, observed homozygosity, Nei’s index, Shanon’s index and Fixation index (Fis) were 2, 1.96, 0.49, 0.85, 0.49, 0.51, 0.15, 0.49, 0.69 and -0.74, respectively. Results showed that mean estimated breeding values for birth type, fleece weight and birth weight traits in different genotypes varies, of course these differences were not statistically significant (P>0.05). However, for fleece weight and birth type traits AB genotype had higher EBV. Due to the relatively high diversity of growth hormone gene in Raini Cashmere goat and its association with important economic traits, using growth hormone gene in breeding programs of this breed can lead to acceptable genetic progress and applying AA genotype for birth weight trait and AB genotype for fleece weight and birth type traits can be used as an indirect marker for selection of superior animals. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

27 - Polymorphism of some Genes Associated with Meat-Related Traits in Egyptian Sheep Breeds
کا.ف. ماهروس م.اس. حسنان م. ابدل مردی اچ.آی. شافی اچ.ای. روشدی

The genetic polymorphism of some genes related to meat production in three Egyptian sheep breeds (Barki, Rahmani and Osseimi) was studied. The candidate genes were: Calpastatin, Myostatin, Diacylglycerol-acyltransferase1, Insulin-like growth factor binding protein-3 and چکیده کامل

The genetic polymorphism of some genes related to meat production in three Egyptian sheep breeds (Barki, Rahmani and Osseimi) was studied. The candidate genes were: Calpastatin, Myostatin, Diacylglycerol-acyltransferase1, Insulin-like growth factor binding protein-3 and Booroola fecundity gene. The technique applied was the restriction fragment length polymorphism for the polymerase chain reaction products. Polymorphism was found in the genes: Calpastatin, MyostatinandDiacylglycerol-acyltransferase 1, while no polymorphism was exhibited by the other two genes, Insulin-like growth factor binding protein-3 and the Booroola fecundity in the three breeds understudy. Calpastatin locus digested with MspI had two genotypes MM and MN. The highest allelic frequency was for allele M. The same locus Calpastatin digested with NcoI also exhibited two genotypes MM and MN. The NN genotype was absent with both the MspI and the NcoI enzymes in all breeds. Myostatin digested with DraI had two genotypes AB and BB. The AA genotype cannot be detected. The highest allelic frequency was for allele B. Diacylglycerol-acyltransferase1 digested with AluI showed two genotypes CC and CT. The highest allelic frequency was for allele C. The detected CT genotype might explain the moderate intramuscular fat content and muscle marbling in the Egyption sheep breeds. Each of the remaining two loci (Insulin-like growth factor binding protein-3 and the Booroola fecundity) had only one genotype, BB genotype for Insulin-like growth factor binding protein-3 digested with HaeIII and ++ genotype for the Booroola fecundity digested with AvaII enzyme, therefore they are not recommended in the selection program. The result of Chi-square analysis indicated that the three Egyptian sheep breeds were in Hardy-Weinberg equilibrium. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

28 - The Effect of Uncoupling Protein Polymorphisms on Growth, Breeding Value of Growth and Reproductive Traits in the Fars Indigenous Chicken
آ. محمدی‌فر م.ر. محمدآبادی

The avianuncoupling protein (avUCP) is a member of the mitochondrial transporter superfamily that uncouples proton entry in the mitochondrial matrix from ATP synthesis. The polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method was used to چکیده کامل

The avianuncoupling protein (avUCP) is a member of the mitochondrial transporter superfamily that uncouples proton entry in the mitochondrial matrix from ATP synthesis. The polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method was used to estimate the allele and genotype frequencies of the UCP/HhaI polymorphisms and to determine associations between these polymorphisms and the growth traits, breeding value of growth and reproductive traits in the Fars indigenous chicken. For this purpose phenotype information of 18 successive generations from 200 birds were analyzed using a univariate animal model in ASREML procedure. The evaluation of the association between this single nucleotide polymorphisms (SNP) with reproductive traits suggests a positive effect of TC genotype with age at first egg (ASM) compared with CC genotype. In addition, TC genotype was significantly associated with the breeding value of age at first egg compared with the CC genotype (P<0.05). In conclusion, our results suggest that the TC genotype of the UCP gene is associated with age at sexual maturity (ASM) and breeding value of age at sexual maturity and UCP polymorphisms may be used as DNA markers for selection in the breeding process of the Fars indigenous chicken. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

29 - The Effect of SNP c.100800G > A on CAST|Cfr13I Gene Polymorphisms with Ultrasound Imaging of Meat Characteristics and Growth Traits in Bali Cattle
N.M.P. Setyani R. Priyanto J. Jakaria

Bali cattle are known as native cattle from Indonesia, which commonly utilized as beef-producing animals. Calpastatin gene (CAST) plays essential role in meat quality. The aim of this study was to verify the effect of single-nucleotide polymorphism (SNP) c.100800G>A چکیده کامل

Bali cattle are known as native cattle from Indonesia, which commonly utilized as beef-producing animals. Calpastatin gene (CAST) plays essential role in meat quality. The aim of this study was to verify the effect of single-nucleotide polymorphism (SNP) c.100800G>A on the CAST|Cfr13I gene associated with meat characteristics and growth traits in Bali cattle. The meat characteristics, growth traits profile, and blood samples of Bali cattle (n=52 animals) obtained from BPTU Bali Cattle Denpasar, Bali Province. Comparison used were Belgian Blue (n=30 animals), Wagyu (n=7 animals), Limousin (n=14 animals), and Peranakan Onggole (PO) (n=30 animals). Ultrasound measurement was conducted to study the meat characteristics. The examination of the CAST gene polymorphisms used polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method digested by Cfr13I enzyme and the analysis of effect of the CAST|Cfr131 gene on meat characteristics and growth traits in Bali cattle used t test with SAS 9.4 program. Bali cattle revealed polymorphic homozygous genotype (GG) and heterozygous genotype (GA) with allele frequencies of G and A were 0.923 and 0.077, respectively. In comparison, other breeds beef cattle, including Belgian Blue, Limousin, Wagyu, and PO, showed only the GG genotype with allele frequency of G was 1.000. The CAST|Cfr13I gene showed no significant association (P>0.05) with Bali cattle meat characteristics and growth traits. In conclusion, the SNP c.100800G > A may not be purposed as a marker for Bali cattle meat characteristics and growth traits. It was suggested that further study with a higher number of animals would be necessary to validate the effect of the SNP c.100800G > A on the CAST gene with the actual beef cutting of Bali cattle. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

30 - Association of Kappa-Casein Gene Polymorphism with some Biochemical Blood Indicators in Guilan Native Cattle of Iran (Bos indicus)
A. Sobar Poorrajabi Ghaziyani S.Z. Mirhoseini N. Ghavi Hossein-Zadeh Z. Ansari Pirsaraei H. Dehghanzadeh

Evaluation of the blood and milk biochemical parameters always is considered as effective key factor for animal health and dairy products. In order to assess the association of kappa-casein (K-CN) genetic variants with blood biochemical indicators, blood samples were ra چکیده کامل

Evaluation of the blood and milk biochemical parameters always is considered as effective key factor for animal health and dairy products. In order to assess the association of kappa-casein (K-CN) genetic variants with blood biochemical indicators, blood samples were randomly and individually collected from 126 Iranian Guilan native cattle. Blood plasma was used to measure blood glucose, urea, cholesterol, triglycerides and thyroxine concentrations. The genomic DNA was extracted from the whole blood by the modified Salting Out method. The 350 bp fragment of kappa-casein gene was amplified using polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and a pair of specific primers was digested by HinfI restriction enzyme. In general, two alleles of A and B with the frequencies of 0.726 and 0.274 and two genotypes of AA and AB with frequencies of 0.452 and 0.548 were detected, respectively. The chi-square test result showed that the studied population was not in Hardy-Weinberg equilibrium. Results of statistical analysis revealed that there was significant difference between glucose, cholesterol and thyroxin levels in both sexes which are associated with the greater levels of testosterone and thyroid hormones in bulls than cows. However, there was no significant difference between males and females for urea and triglyceride levels (P>0.05). There was no significant difference between AA and AB genotypes of kappa-casein (K-CN) gene in Guilan native cattle for the blood parameters measured (P>0.05). According to the current results, kappa casein gene singly cannot be an appropriate marker to study the blood parameters in native cattle of Guilan. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

31 - Lack of Association between Somatotropin Receptor Gene Polymorphism and Birth Weight of Iranian Indigenous Sistani Cattle
آ. جوانمرد س. ر. میرایی آشتیانی آ. ترکمن زهی م. مرادی شهر بابک

The objective of the present study was to determine polymorphism within the promoter region of somatotropin receptor genes in indigenous Sistani cattle (Bos indicus) and associations between this polymorphism and breeding value of birth weight. The pedigree structure wa چکیده کامل

The objective of the present study was to determine polymorphism within the promoter region of somatotropin receptor genes in indigenous Sistani cattle (Bos indicus) and associations between this polymorphism and breeding value of birth weight. The pedigree structure was included by considering 1173 animals with 600 progeny birth weight data obtained from a Zhark breeding station in Sistan and Baluchistan. Heritability was estimated for birth weight using different univariate models with the derivative-free approach of restricted maximum likelihood algorithm (DFREML). The average weight of each birth was 23.9 ± 3.16 kg. The effects of non-genetic factors were significant (P<0.01) for birth weight. Direct heritabilities (h2) in single trait analyses were 0.31 ± 0.06. Genomic DNA was isolated from blood and semen using conventional methods. Polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assays were used to genotype this candidate gene in 72 individuals with the birth weight record. The observed allele size was similar to that reported in the literature. The Sistani cattle showed higher frequency of alleles ALuI (+) than ALuI (-) in population. Statistical analysis was conducted to test the association of this polymorphism with the breeding value of birth weight data. There was not significant association between producing genotypes and birth weight trait. Future research on another candidate gene and growth trait strongly is encouraged to deep in the understanding of growth pattern in this breed. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

32 - Association of Bovine Lactoferrin Gene with Mastitis in Frieswal Cattle
پ. شارما اس.ان.اس. پارمار ام.اس. تاکور د.اس. نایوریال ر. رنجان

ThirtyFrieswal lactating cows were screened for clinical and subclinical mastitis and subsequently classified into healthy, subclinically affected and clinically affected groups each group comprising of 10 cows. Polymorphism of cow lactoferrin (LTF) gene promoter was de چکیده کامل

ThirtyFrieswal lactating cows were screened for clinical and subclinical mastitis and subsequently classified into healthy, subclinically affected and clinically affected groups each group comprising of 10 cows. Polymorphism of cow lactoferrin (LTF) gene promoter was determined by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). The results showed that LFT gene promoter was polymorphic among different groups which indicated that its polymorphism was correlated to mastitis infection. The allelic frequency of C and G allele was 0.42 and 0.58 and they were associated with clinical and subclinical mastitis. It was found that LTF gene polymorphism and mastitis are highly associated with each other. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

33 - Polymorphisms in Melanocortin Receptor 1 Gene in Goat Breeds: A Window for Coat Color Controling Mechanism
آ. جوانمرد ب. عارف نژاد ر. عبداللهی آرپناهی م.ح. مرادی

The broad goal of this research was to examine the nature of the Melanocortin receptor 1 (MC1R) locus on the coat color phenotype of seven goat breeds with different color coat. Blood samples were collected from five Iranian indigenous (Khalkhal, Markhor, Naeini, Najdi چکیده کامل

The broad goal of this research was to examine the nature of the Melanocortin receptor 1 (MC1R) locus on the coat color phenotype of seven goat breeds with different color coat. Blood samples were collected from five Iranian indigenous (Khalkhal, Markhor, Naeini, Najdi and Tali) and two exotic (Cashmere and Saanen) goat breeds. Polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) technique and DNA sequencing were used to detect polymorphism of theMC1Rgene. Digestion of polymerase chain reaction products with EarI revealed two alleles of A and B and three genotypes of AA, AB and BB. The observed allele size was similar to previous reports. The genotype and gene frequencies for each breed were determined and shown to be variable among the breeds. In the goat breeds with black / brown coat color, AA genotype showed a higher frequency than white color goat breeds. In this aspect, Tali had only AA and AB genotypes and Cashmere had AB and BB genotypes. Comparison of genotype frequencies using χ2 test showed significant (P<0.01) differences between colored and white coat phenotypes. The Lys226Arg (A676G) mutation of the MC1R was verified by sequencing distinguished the B allele from the A allele. The phylogenetic tree also separated these breeds into two clusters, including exotic breeds with white / yellow coat color and indigenous breeds with black/brown phenotype. A replacement mutation was verified in Lys to Arg at position 676 bp. In conclusion, the results of this study confirmed the previous findings onMC1R gene as a useable tool for breed identification and white mohair marketing and production. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

34 - بررسی ارتباط واریانت های ژن UBE2B با تاثیر بر تکامل اسپرم و ناباروری ادیوپاتیک در جمعیتی از مردان شمال ایران
الهام سیاسی محمد صادق صفایی

ناباروری یک مشکل کلینیکی عمده است که حدود 10 تا 15 درصد زوج ها را در سراسر جهان درگیر می کند. 40 تا 50 درصد ناباروری زوجین مربوط به مردان است که می تواند ناشی از برهم کنش بین فاکتورهای ژنتیکی و محیطی باشد. در %58 -37 از موارد ناباروری در مردان هیچ دلیل قابل شناسایی دیده چکیده کامل

ناباروری یک مشکل کلینیکی عمده است که حدود 10 تا 15 درصد زوج ها را در سراسر جهان درگیر می کند. 40 تا 50 درصد ناباروری زوجین مربوط به مردان است که می تواند ناشی از برهم کنش بین فاکتورهای ژنتیکی و محیطی باشد. در %58 -37 از موارد ناباروری در مردان هیچ دلیل قابل شناسایی دیده نمی شود. این گروه در جایگاه ناباروری با منشأ ناشناخته قرار می‌گیرند. ژن UBE2B و تغییرات آن به عنوان یکی از این عوامل ژنتیکی ناشناخته محسوب می گردند. هدف این مطالعه بررسی ارتباط پلی مورفیسم های T293G و A20016G از ژن UBE2B با ناباروری در جمعیت مردان شمال ایران بود.در این مطالعه نمونه خون 60 مرد بارور و60 مرد نابارور گرفته شد. پس از استخراج DNA از نمونه ها، فراوانی اللی و ژنوتیپی واریانت‌های مذکور به روش PCR-RFLP تعیین گردید. نتایج مطالعه ما اختلاف معنی داری در فراورنی آللی بین افراد بیمار و سالم در پلی مورفیسم هایT293G ( P=0.66) و A20016G ( P=0.52 ) از ژن UBE2B نشان نداد. با توجه به اینکه در فراوانی آلل های مورد مطالعه در گروه بیمار و کنترل تفاوت معنیداری وجود نداشت، به نظر می‌رسد بین این پلی مورفیسم ها و ناباروری ادیوپاتیک مردان شمال ایران ارتباطی وجود نداشته باشد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

35 - ارتباط پلی مورفیسم های T886C در ژن TAS2R38 و C109869T در ژن SLC6A14 با ناباروری ادیوپاتیک مردان ایرانی
الهام سیاسی احمد ال یاسین جواد مولا

10.30495/jdb.2023.1963938.1321

مقدمه: میزان شیوع ناباروری در مردان 15- 10درصد است و برای حدود 50% موارد ناباروری مردان نمی‌توان علت خاصی یافت. این وضعیت به عنوان ناباروری ایدیوپاتیک نامیده می‌شود و یکی از علل ناباروری ادیوپاتیک در مردان عوامل ژنتیکی می باشد. بنابراین هدف این تحقیق بررسی ارتباط بین دو چکیده کامل

مقدمه: میزان شیوع ناباروری در مردان 15- 10درصد است و برای حدود 50% موارد ناباروری مردان نمی‌توان علت خاصی یافت. این وضعیت به عنوان ناباروری ایدیوپاتیک نامیده می‌شود و یکی از علل ناباروری ادیوپاتیک در مردان عوامل ژنتیکی می باشد. بنابراین هدف این تحقیق بررسی ارتباط بین دو پلی مورفیسم T886C در ژن TAS2R38 و C109869T در ژن SLC6A14 با ناباروری ادیوپاتیک مردان در جمعیتی از بیماران ایرانی بود.مواد و روش ها: در این تحقیق از 200 نمونه خون، شامل گروه بیمار که 100 مرد با نابابروری ادیوپاتیک (الیگواسپرم و ازواسپرم) و 100 نفر گروه کنترل بودند استخراج DNA، انجام گرفت. ژنوتایپینگ دو پلی مورفیسم مورد مطالعه، با استفاده از روش های مولکولی HRM-PCR Corbett ، PCR-RFLP و Sequencing انجام گرفت، سپس نتایج انالیز اماری شد.نتایج: برای پلی مورفیسم T886C در ژن TAS2R38 تفاوت معنی دار بین گروه بیماران و گروه کنترل مشاهده نشد (P=0.9) و نتایج نشان داد که بین این پلی مورفیسم با جمعیت مردان نابارور ایرانی ارتباطی وجود ندارد. فراوانی پلی مورفیسم C109869T در ژن SLC6A14 دارای تفاوت معنی دار بین گروه بیمار و کنترل بود (P=0.04) و با ناباروری آدیوپاتیک در جمعیت مردان ایرانی مورد مطالعه ارتباط معنی دار نشان داد. بحث: بنابر نتایج این مطالعه، پلی مورفیسم C109869Tدر ژن SLC6A14 در ایجاد ناباروری آدیوپاتیک در جمعیت مردان ایرانی موثر است و می تواند با ایجاد اولیگواسپرمی و آزواسپرمی، سبب ناباروری در مردان ایرانی گردد. برای تایید نتایج مطالعات در نمونه های بیشتر توصیه می گردد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

36 - بررسی روش های مختلف برای شناسایی ژنوتیپ های گونه های جنس Armillaris (قارچ عسلی)
سپیده قهاری

10.30495/jdb.2023.1975728.1347

هدف از مطالعه اخیر مقایسه SI با استفاده از سه روش دیگر برای تمایز ژنوتیپ ها است که عبارتند از: روش چند شکلی قطعات DNA حاصل از تکثیر تصادفی (RAPD)، بررسی الل های تیپ-آمیزشی و آنالیز ایزوآنزیم ها RAPD و الل های تیپ-آمیزشی در 73 ایزوله، که متعلق به 36 ژنوتیپ شناسایی شده بر چکیده کامل

هدف از مطالعه اخیر مقایسه SI با استفاده از سه روش دیگر برای تمایز ژنوتیپ ها است که عبارتند از: روش چند شکلی قطعات DNA حاصل از تکثیر تصادفی (RAPD)، بررسی الل های تیپ-آمیزشی و آنالیز ایزوآنزیم ها RAPD و الل های تیپ-آمیزشی در 73 ایزوله، که متعلق به 36 ژنوتیپ شناسایی شده بر اساس آنالیز بودند، مورد استفاده قرار گرفتند. بررسی تعداد محدودی از ایزوله ها با استفاده از پلی مورفیسم ایزوآنزیم انجام شد. RAPDs، الل های تیپ آمیزشی و SI در هر سه مورد ایزوله های تمایز یافته از طریق واکنش های SI شامل دو زیرگروه با فنوتیپ های RAPD متفاوت بودند. در دو مورد گروه های تمایز یافته از طریق واکنش های SI مجموعه مشابهی از الل های تیپ آمیزشی را به اشتراک گذاشتند. آنالیز ایزوآنزیم نشان دهنده تفاوت های بین گونه ای و تفاوت های ناچیز بین ژنوتیپ های یک گونه یکسان بود. این یافته ها باعث شده تا استفاده از SI به عنوان روشی روتین و معتبر برای مطالعات اپیدمیولوژیک گونه های Armillaria در نظر گرفته شود.در گروه یکسانی از ایزوله ها، پروفایل های قطعه EcoR I مربوط به DNA میتوکندری نیز بررسی شدند. این آنالیز ژنوتیپ ها را مجددا در ’تیپ های میتوکندریایی‘ گروه بندی کرد که سیتوپلاسم معمولی را به اشتراک گذاشته و احتمالا از طریق تولید مثل جنسی ارتباط نزدیکی با یکدیگر دارند. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

37 - بررسی ارتباط چهار پلی مورفیسم در ژن TNP2 با روند اسپرماتوژنز و ایجاد ناباروری مردان
الهام سیاسی احمد آل یاسین جواد مولا

در اسپرماتوژنز انسان، پروتامین ها به عنوان پروتئین های متصل شونده به DNA اسپرم جایگزین هیستون ها می شوند. برای تمایز و بلوغ اسپرم جایگزینی هیستون ها با پروتامین ها ضروری است. آسیب در ژن های کد کننده پروتامین ها می تواند منجر به تخریب اسپرماتوژنز و عدم تشکیل اسپرم کامل چکیده کامل

در اسپرماتوژنز انسان، پروتامین ها به عنوان پروتئین های متصل شونده به DNA اسپرم جایگزین هیستون ها می شوند. برای تمایز و بلوغ اسپرم جایگزینی هیستون ها با پروتامین ها ضروری است. آسیب در ژن های کد کننده پروتامین ها می تواند منجر به تخریب اسپرماتوژنز و عدم تشکیل اسپرم کامل شده و در نتیجه سبب ناباروری مردان گردد. در این تحقیق به بررسی حضور چهار پلی مورفیسم در ژن TNP2 از ژن های خانواده پروتامین ها و ارتباط آن با ایجاد ناباروری ادیوپاتیک در مردان ازواسپرمی و الیگواسپرمی ایرانی پرداخته شده است. حضور چهار پلی مورفیسم T1019G،G1272C، G deletion at 1036 and 1046در ژن TNP2، پس از استخراج DNA از نمونه خون 96 مرد ازواسپرم و اولیگو اسپرم با ناباروری ادیوپاتیک و 100 نفر گروه کنترل با روش PCR-RFLP و PCR-SSCP بررسی شد و سپس با روش Sequencing نتایج تایید شد.فراوانی ژنوتایپ CC از پلی مورفیسم G1272C بین گروه بیمار و کنترل تفاوت نشان داد ولی با آنالیز آماری اختلاف معنی دار بین حضور این پلی مورفیسم در مقایسه گروه بیمار با کنترل مشاهده نشد (P>0/05). همچنین پلی مورفیسم های T1019G و G deletion at 1036 and 1046در هیچ یک از گروه بیمار و کنترل مشاهده نشد. مقایسه نتایج این تحقیق با مطالعات انجام شده در این زمینه نشان داد که بین حضور این چهار پلی مورفیسم بررسی شده در ایجاد ازواسپرمی و اولیگواسپرمی با ناباروری ادیوپاتیک در جمعیت مردان ایرانی ارتباط معنی داری وجود ندارد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

38 - ارزیابی بیماری زایی و پلی مورفیسم ژن omph پاستورلا مولتاسیدا
مریم اولاد یحیی تهمتن نوشین سهرابی

سابقه و هدف: پاستورلا مولتاسیدا باکتری گرم منفی است که باعث بیماری های تنفسی در حیوانات اهلی و وحشی می شود. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی باکتری پاستورلا مولتاسیدا و نیز بررسی پلی مورفیسم ژن ompH در این باکتری انجام شد. مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی تعداد 160 چکیده کامل

سابقه و هدف: پاستورلا مولتاسیدا باکتری گرم منفی است که باعث بیماری های تنفسی در حیوانات اهلی و وحشی می شود. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی باکتری پاستورلا مولتاسیدا و نیز بررسی پلی مورفیسم ژن ompH در این باکتری انجام شد. مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی تعداد 160 نمونه سوآب بینی و حلق از بزهای مبتلا به پاستورلوز در استان فارس جمع آوری گردید. طبقه بندی مولکولی و پلی مورفیسم 26 جدایه با روش RFLP-PCR و به کمک آنزیم های برش دهنده HindIII و EcoRI انجام گرفت. هر نمونه با غلظت نیم مک فارلند به دو سر موش تزریق شد. پس از برش ژن ompH توسط آنزیم های اندونوکلئاز، در نهایت الگوهای ایجاد شده با مدت زمان مرگ موش ها مقایسه گردید. یافته ها: آنزیم های HindIII و EcoRI هر کدام الگوهای متفاوتی ایجاد کردند که در مقایسه با میانگین زمان مرگ موش ها قابل توجه بود. تمامی جدایه های کشنده میانگین زمان مرگ زیر 24 ساعت داشتند. همچنین از مجموع 29 پاستورلا مولتاسیدا جدا شده، 89.6 درصد قادر به مرگ موش ها بودند. نتیجه گیری: با توجه به الگوهای ایجاد شده، مدت زمان مرگ در موش ها نیز متفاوت بود. بر این اساس نمونه های دارای الگوهای پر تکرار موش ها را در زمان کوتاهتری از بین بردند و کشنده تر بودند. الگوهای ناشی از هضم آنزیمی به منظور شناسایی سویه های حاد و بیماری زا و در نتیجه تهیه سویه های واکسینال به کار می رود. بنابراین با توجه به تنوع پذیری این سویه ها تهیه واکسن های چندگانه ضرورت پیدا می کند. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

39 - بررسی پلی مورفیسم ژن کواگولاز استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از عفونت های دستگاه تنفسی در شهرکرد
مریم رئیسی الهه تاج بخش حسن ممتاز

سابقه و هدف: عفونت دستگاه تنفسی یکی از شایع ترین بیماری های عفونی در جهان است که در اثر التهاب حاد دستگاه تنفس فوقانی توسط حمله باکتری هایی مانند استافیلوکوکوس اورئوس به این قسمت ایجاد می گردد. هدف از این مطالعه بررسیپلی مورفیسم ژن کواگولاز استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده چکیده کامل

سابقه و هدف: عفونت دستگاه تنفسی یکی از شایع ترین بیماری های عفونی در جهان است که در اثر التهاب حاد دستگاه تنفس فوقانی توسط حمله باکتری هایی مانند استافیلوکوکوس اورئوس به این قسمت ایجاد می گردد. هدف از این مطالعه بررسیپلی مورفیسم ژن کواگولاز استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از عفونت های دستگاه تنفسی در شهرکرد می باشد. مواد و روش ها: این مطالعه مقطعی- توصیفی بر روی 200 نفر از افراد مشکوک به عفونت های دستگاه تنفس فوقانی مراجعه کننده به کلینیک امام علی شهرستان شهرکرد صورت گرفت. از محیط های بلاد آگار و مانیتول سالت آگار برای کشت نمونه ها استفاده شد. کلنی های مشکوک توسط آزمون های میکروب شناسی شناسایی شدند. در نهایت پس از استخراج DNA، محصول PCR در حضور آنزیم AluI مورد هضم آنزیمی واقع گردید و ژنوتیپ ژن کواگولاز به روش RFLP تعیین شد. یافته ها: در مجموع 60 نفر (30 %) از افراد مورد بررسی به استافیلوکوکوس ‌اورئوس آلوده بودند. 42 جدایه دارای باند 970 جفت بازی و 18 جدایه دارای باند 730 جفت بازی بودند. پس از هضم محصول PCR با آنزیم AluI ، در 42 جدایه سه باند 160، 320 و 490 جفت باز (ژنوتیپ I)، در 16 جدایه دو باند 240 و 490 جفت باز (ژنوتیپ VIII) و در 2 جدایه دو باند 320 و 410 جفت باز (ژنوتیپ IX) مشاهده گردید. نتیجه گیری: نتایج به دست آمده نشان می دهد که جدایه های استافیلوکوکوس اورئوس کواگولاز مثبت جدا شده از عفونت دستگاه تنفسی در شهرکرد بیشتر متعلق به ژنوتیپ نوع I می باشند که می تواند منبع بالقوه ای برای انتشار این ژنوتیپ در جامعه محسوب گردد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

40 - مقایسه روش PCR-RFLP با روش‌های بیوشیمیایی در تشخیص عوامل سل ریوی انسانی
بهنام رفیعی علی اصغر فرازی داود صادقی سپیده غنی راضیه نظری روح اله کشاورز کیوان تدین نادر مصوری مصوری

سابقه و هدف: بیماری سل هنوز هم یکی از مهم&zwnj;ترین عوامل مرگ و میر در بسیاری از کشورها است. کمپلکس مایکوباکتریوم توبرکیلوسیس از مجموعه&zwnj;ای از باکتری&zwnj;ها با شباهت ژنتیکی زیاد تشکیل شده است که با توجه به طولانی بودن زمان کشت تعیین هویت آن&zwnj;ها بسیار مشکل است. چکیده کامل

سابقه و هدف: بیماری سل هنوز هم یکی از مهم&zwnj;ترین عوامل مرگ و میر در بسیاری از کشورها است. کمپلکس مایکوباکتریوم توبرکیلوسیس از مجموعه&zwnj;ای از باکتری&zwnj;ها با شباهت ژنتیکی زیاد تشکیل شده است که با توجه به طولانی بودن زمان کشت تعیین هویت آن&zwnj;ها بسیار مشکل است. هدف از این پژوهش، ارزیابی روش PCR-RFLP برای افتراق مایکوباکتریوم توبرکیلوسیس و مایکوباکتریوم بویس و مقایسه نتایج آن با آزمون&zwnj;های بیوشیمیایی است. مواد و روش&zwnj;ها: 68 نمونه خلط از بیماران سل ریوی با اسمیر مثبت از مراکز بهداشتی و درمانی استان مرکزی جمع آوری و در محیط کشت&zwnj;های اختصاصی کشت شد. همچنین 10 جدایه مایکوباکتریوم بویس مربوط به مناطق مختلف ایران و 6 سویه استاندارد مایکوباکتریوم برای مقایسه استفاده گردید. پس از انجام تست&zwnj;های بیوشیمیایی، آزمون PCR براساس ژن کاذب oxyR انجام گرفت. سپس الگوی برش محصول تکثیر یافته با استفاده از آنزیم AluI مورد ارزیابی قرار گرفت. یافته&zwnj;ها: در همه جدایه&zwnj;های انسانی مایکوباکتریوم توبرکیلوسیس یک قطعه و در جدایه&zwnj;های گاوی 3 قطعه پس از برش توسط آنزیم مشاهده شد. از نمونه&zwnj;های مورد پژوهش تنها در یک مورد مایکوباکتریوم بویس تشخیص داده شد. همچنین نتایج حاصل از آزمون PCR-RFLP با نتایج حاصل از تست&zwnj;های بیوشیمیایی هماهنگی 100% داشت. نتیجه گیری: روش PCR-RFLP روشی سریع و دقیق به&zwnj;منظور افتراق مایکوباکتریوم بویس از سایر اعضای کمپلکس مایکوباکتریوم توبرکیلوسیس می&zwnj;باشد و می&zwnj;تواند در تشخیص اولیه و درمان مورد استفاده قرار گرفت. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

41 - Investigation of Cosenza Mutation in Patients with Deficiency of Glucose-6-Phosphate Dehydrogenase (G6PD) in North West of Iran
Omolbanin Javadi omoalbanin Javadi Habib Onsori habib onsori

10.22034/jchr.2015.544094

Glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) is a greatly polymorphic enzyme encoded by human X-linked gene. G6PD deficit is the most public enzymopathy in human with about 400 million people affected globally. It is the main controlling enzyme in the hexose monophosphate s چکیده کامل

Glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) is a greatly polymorphic enzyme encoded by human X-linked gene. G6PD deficit is the most public enzymopathy in human with about 400 million people affected globally. It is the main controlling enzyme in the hexose monophosphate shunt catalase the oxidation of glucose-6-phosphateÂ to 6-phosphogluconolacton and the creation of reducing equals in the form of NADPH to meet the cellular redox formal and its absence origin hemolytic anemia - favism and newborn jaundice. Mutation in this enzyme cause three major types of unusual phenotype, including Mediterranean, Chatham and Cosenza. In this study, by Rapid Genomic DNA Extraction (RGDE) method, from 90 blood samples of unrelated male and female patients with genetic deficiency of G6PD, DNA was removed and next digestion by Eco81I enzymes, in order to research for Cosenza mutation, they were analyzed by means of PCR-RFLP. Sequencing methods were used. Of 90 patients, one patient had a Cosenza mutation frequency of 1.01%. Eighty-nine patients (98.99%) were not affected by the Cosenza-type mutation. Accordingly, Cosenza mutation is not regarded as the most common mutation in Iranian North-west population.Â Â Â پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

42 - فراوانی آللی و ژنوتیپی ژن کالپاستاتین در گوسفندان قزل، آرخامرینو و آمیخته‌های آن‏ها
قربان الیاسی زر&rlm;&lrm;&lrm;ین‌قبایی جلیل شجاع محمدرضا نصیری ام‌البنین پیراهری آرش جوانمرد

کالپاستاتین نقش تنظیمی در رشد ماهیچه‌ها و تردی گوشت بعد از کشتار دام دارد که ژن کنترل کننده آن بر روی کروموزوم شماره 5 گوسفند جای گرفته است. ارتباط برخی از شکل های آللی این ژن با افزایش وزن و صفات لاشه در گوسفند کشف شده است که این امر در نتیجه جانشینی ساده 1 نوکلئوتید د چکیده کامل

کالپاستاتین نقش تنظیمی در رشد ماهیچه‌ها و تردی گوشت بعد از کشتار دام دارد که ژن کنترل کننده آن بر روی کروموزوم شماره 5 گوسفند جای گرفته است. ارتباط برخی از شکل های آللی این ژن با افزایش وزن و صفات لاشه در گوسفند کشف شده است که این امر در نتیجه جانشینی ساده 1 نوکلئوتید در اگزون I ژن کالپاستاتین است که با تکنیک RFLP با آنزیم های برشی MspI و یا NcoI تشخیص داده می‌شود و می‌تواند به عنوان نشان گری در جهت اصلاح نژاد به کار گرفته شود. هدف از این تحقیق بررسی تنوع ژنتیکی ژن کالپاستاتین در گوسفند با روش MspI/RFLP است. در این تحقیق نمونه‌های خون از 137 رأس گوسفند (65 رأس گوسفند قزل، 42 رأس گوسفند آرخامرینو و 30 رأس گوسفند آمیخته آرخامرینو× قزل) جمع‌آوری گردید. DNA ژنومی از 50 میکرولیتر خون با روش سیلیکاژل استخراج گردید و برای ارزیابی کیفیت و کمیت DNA روش های ژل مونیتورینگ و اسپکتروفوتومتری مورد استفاده قرار گرفت. پس از استخراج DNA ژنومی، تکثیر ناحیه چندشکل ژن کالپاستاتین به طول 570 جفت باز با آغازگرهای اختصاصی Ovine Calp-F و Ovine Calp-R صورت گرفت. جهت برش آنزیمی قطعات DNA تکثیر شده، از آنزیم MspI استفاده گردید. محصولات هضم شده، بر روی ژل آگارز 5/1% الکتروفورز شده و با اتیدیوم‌بروماید رنگ‌آمیزی گردید. پس از تعیین ژنوتیپ تمامی نمونه‌های مورد مطالعه، از نرم‌افزار Popgene 1.32 برای بررسی آماری داده‌ها استفاده گردید که فراوانی آلل M در گوسفند قزل 69%، گوسفند آرخامرینو 48%، و آمیخته‌های F1 این دو نژاد 50% به دست آمد. بر اساس نتایج این مطالعه، جمعیت های مورد مطالعه در تعادل هاردی- واینبرگ قرار داشتند و این نشان می دهد که در جمعیت های گوسفندان مورد مطالعه، انتخاب ژنتیکی در راستای اصلاح نژاد برای ژن کالپاستاتین صورت نگرفته است. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

43 - مقایسه چندشکلی موجود در ناحیه اینترون 2 ژن لپتین (Leptin) در گاوهای تالشی و هلشتاین با استفاده از تکنیک PCR-RFLP
علیرضا دهناد آرش جوانمرد فضل&rlm; اله افراز قربان الیاسی زرین‌قبایی

‌‌‌‌ اختلافات‌ عمده‌ای‌ در تولید شیر، گوشت‌ و صفات‌ تولیدمثلی‌ گاوهای تالشی و هلشتاین مشاهده‌ می‌شود. در این تحقیق به منظور شناخت مکانیزم های مولکولی به وجود آورنده این تفاوت ها در سطح ژن ها، چندشکلی موجود در ناحیه اینترون2 ژن لپتین در دو جمعیت گاو مذکور مورد مقایسه قرا چکیده کامل

‌‌‌‌ اختلافات‌ عمده‌ای‌ در تولید شیر، گوشت‌ و صفات‌ تولیدمثلی‌ گاوهای تالشی و هلشتاین مشاهده‌ می‌شود. در این تحقیق به منظور شناخت مکانیزم های مولکولی به وجود آورنده این تفاوت ها در سطح ژن ها، چندشکلی موجود در ناحیه اینترون2 ژن لپتین در دو جمعیت گاو مذکور مورد مقایسه قرار گرفت. برای این منظور استخراج DNA به کمک روش تغییر یافته نمکی از نمونه‌های خون 100 رأس گاو (70 رأس گاو تالشی و 30 رأس گاو هلشتاین) صورت گرفت و واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز (PCR) جهت تکثیر قطعه 422 جفت بازی از اینترون 2 ژن لپتین انجام گرفت. قطعه تکثیر شده سپس به وسیله آنزیم محدودالاثر Sau3AI جهت تشخیص ژنوتیپ های این ژن مورد هضم آنزیمی قرار گرفت. فراوانی ژنوتیپ های AA، AB و BB به ترتیب 42/61، 42/31 و 16/7 درصد در گاوهای تالشی و 7/56، 3/43 و صفر درصد در گاوهای هلشتاین به دست آمد. فراوانی های آللی برای آلل های A و B نیز به ترتیب 1/77 و 9/22 درصد در گاوهای تالشی و 3/78 و 7/21 درصد در گاوهای هلشتاین برآورد گردید. در هیچ کدام از دو جمعیت مورد مطالعه از نظر جایگاه ژنی لپتین تعادل هاردی- واینبرگ برقرار نبود. هم چنین هتروزیگوتی پایین بود و این امر ممکن است در آینده مشکلات اصلاح نژادی را سبب شود. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

44 - بررسی تنوع ژنتیکی قارچ عامل بیماری آنتراکنوز گردو Ophiognomonia leptostyla (Fr.) Sogonov در منطقه ITS و IGS با استفاده از نشانگر CAPS در شمال غرب ایران
مهدی میانجی حمید عبدالهی سلیمان جمشیدی

به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی قارچ عامل بیماری آنتراکنوز گردو Ophiognomonia leptostyla در شمال غرب ایران تعداد 25 جدایه از مناطق مختلف جمع آوری و با استفاده از روش تک اسپورسازی خالص شدند. استخراج DNA از میسلیوم قارچ با استفاده از روش لیو و همکاران انجام شد. تکثیر منطقه I چکیده کامل

به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی قارچ عامل بیماری آنتراکنوز گردو Ophiognomonia leptostyla در شمال غرب ایران تعداد 25 جدایه از مناطق مختلف جمع آوری و با استفاده از روش تک اسپورسازی خالص شدند. استخراج DNA از میسلیوم قارچ با استفاده از روش لیو و همکاران انجام شد. تکثیر منطقه ITS-rDNA توسط جفت آغازگر اختصاصی، ITS1 و ITS4 انجام گردید. هم&lrm;چنین منطقه IGS-rDNA با استفاده از جفت آغازگر NS1R و LR13R تکثیر شد. نوارهایی به طول 600 جفت باز و 2320-2300 جفت باز از تکثیر منطقه ITS و IGS به دست آمد. قطعات تکثیر شده توسط پنج آنزیم برش دهنده EcoRI، HindIII، TagI، HinfI و BamHI مورد هضم قرار گرفتند. از مجموع آنزیم های برشی مورد استفاده EcorI، TagI و BamHI فاقد محل برش بر محصولات تکثیری منطقه ITS و HinfI و BamHI نیز فاقد محل برش بر محصولات تکثیری منطقه IGS بودند. گروه بندی جدایه های مورد مطالعه بر اساس الگوهای نواری هر دو منطقه در سطح شباهت 75 درصد، آن&lrm;ها را در چهار گروه طبقه بندی نمود. پرونده مقاله

فهرست مقالات RFLP

سکوی نشر دانش

پیوندهای سایت

مراکز مرتبط

پشتیبانی

صفحات رسمی