اینتگرون ها نقش اساسی در انتشار ژن های مقاومت آنتی بیوتیکی در بین جدایه های اشريشيا كلي دارند. هدف از این مطالعه، تعیین شیوع اینتگرون های کلاس 1 و 2 در میان جدایه های اشريشيا كلي مولد بتالاکتامازهای وسیع الطیف (ESBLs) جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت های دستگاه ادراری چکیده کامل
اینتگرون ها نقش اساسی در انتشار ژن های مقاومت آنتی بیوتیکی در بین جدایه های اشريشيا كلي دارند. هدف از این مطالعه، تعیین شیوع اینتگرون های کلاس 1 و 2 در میان جدایه های اشريشيا كلي مولد بتالاکتامازهای وسیع الطیف (ESBLs) جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت های دستگاه ادراری مراجعه کننده به بیمارستان آموزشی اهواز در سال 1396-97 بود.
در این مطالعه توصیفی- مقطعی، جدایه ها با استفاده از روش های مرسوم آزمایشگاهی شناسایی شدند. حساسیت آنتی بیوتیکی جدایه ها بوسیله روش دیسک دیفیوژن آگار و تولید آنزیم های ESBLs با استفاده از روش Double disc مورد سنجش قرار گرفت. در نهایت حضور ژن های مربوط به اينتگرون هاي كلاس 1 و 2 با استفاده از روش PCR انجام شد. در بین 123 جدایه اشریشیا کلی تولید کننده ESBLs، بيشترين ميزان مقاومت آنتي بيوتيكي به ترتیب نسـبت بـه سفوتاکسیم، سفتازدیدیم ، کوتریموکسازول، نالیدیکسیک اسید و كمتــرين مقاومــت آنهــا نســبت بــه ايمــي پــنم مشاهده شد.
تعداد 84 (29/68 درصد) جدایه دارای مقاومت دارویی چند گانه (MDR) بودند. تعداد 93 (60/75 درصد) جدایه دارای اینتگرون کلاس 1 و 11 (94/8 درصد) جدایه دارای اینتگرون کلاس 2 بودند. ارتباط معنی داری بین حضور اینتگرون و مقاومت به آنتی بیوتیک های مختلف مشاهده نشد (P > 0/05). شیوع بالای اینتگرون کلاس 1 در بین جدایه های اشريشيا كلي مولد بتالاکتاماز وسیع الطیف ممکن است به مقاومت به آنتی بیوتیک های رایج، کمک کند. بنابراین بررسی فراوانی اینتگرون ها و ارتباط آنها با الگوهای مقاومت آنتی بیوتیکی ضروری بنظر می رسد.
پرونده مقاله
سابقه و هدف: اشریشیاکلی یکی از شاخص های مهم در کنترل کیفیت نمونههای دارویی و واقعی است. هدف از این تحقیق بررسی مقایسهای تشخیص این باکتری با روشهای متداول و استفاده از یک حسگر زیستی برپایه نانولولههای کربنی چندلایه بر روی الکترود شیشهای کربن در نمونههای داروئی و چکیده کامل
سابقه و هدف: اشریشیاکلی یکی از شاخص های مهم در کنترل کیفیت نمونههای دارویی و واقعی است. هدف از این تحقیق بررسی مقایسهای تشخیص این باکتری با روشهای متداول و استفاده از یک حسگر زیستی برپایه نانولولههای کربنی چندلایه بر روی الکترود شیشهای کربن در نمونههای داروئی و واقعی مانند آب میباشد.
مواد و روشها: در این پژوهش تجربی، از روش متداول کشت(پورپلیت) و حسگر زیستی ساختهشده بر پایه نانولولههای کربنی چندلایه بر روی الکترود شیشهای کربن با آرایش GC/MWCNTs/AuNPs/Ab/BSA برای تشخیص اشریشیاکلی استفاده شد. رقتهای CFU/ml 108 × 1- 101 × 1 از باکتری اشریشیاکلی در نمونههای دارویی، و آب در بافر فسفات M1/0 حاوی استامینوفن mM5/0 استفاده گردید. ویژگیهای حسگر زیستی بهوسیله میکروسکوپ الکترونی، روشهای الکتروشیمیایی ولتامتری چرخهای و ولتامتری موجی مربعی بررسی و از باکتریهای مداخلهگر در بررسی عملکرد اختصاصی آن استفاده شد.
یافتهها: نتایج تشخیص اشریشیاکلی توسط حسگر زیستی در نمونههای مختلف دارویی و آب ازنظر آماری در مقایسه با روش متداول کشت اختلاف معنیداری نشان نداد. اما حسگر زیستی طراحیشده برای باکتری اشریشیاکلی دارای حساسیت بالا و حداقل حد تشخیص CFU/ml02/3 باکتری اشریشیا کلی در زمان 3 دقیقه بود.
نتیجهگیری: معمولا شاخص های میکروبی مانند اشریشیاکلی را با روش های متداول تشخیص می دهند. پایش میکروبی در ترکیبات دارویی با روش های متداول زمان بر بوده و خطر از دست رفتن محصولات دارویی را نیز به همراه دارد. اما حسگر زیستی در تشخیص این باکتری با صرف هزینه کم و بدون نیاز به غنیسازی در حجم کم نمونهها، کارایی مناسبی دارد.
پرونده مقاله
سابقه و هدف : غربالگری باکتریهای مرتبط با اسفنج ها گامی مهم در اکتشاف داروهای جدید می باشد. هدف از پژوهش حاضر جداسازی و شناسایی باکتریهای مرتبط با اسفنجهای پیرامون جزیره هرمز و یافتن باکتریهای مولد متابولیتهای بازدارنده فعالیت آنزیمهای آلفا گلوکوزیداز و آلفا آمیلاز ب چکیده کامل
سابقه و هدف : غربالگری باکتریهای مرتبط با اسفنج ها گامی مهم در اکتشاف داروهای جدید می باشد. هدف از پژوهش حاضر جداسازی و شناسایی باکتریهای مرتبط با اسفنجهای پیرامون جزیره هرمز و یافتن باکتریهای مولد متابولیتهای بازدارنده فعالیت آنزیمهای آلفا گلوکوزیداز و آلفا آمیلاز بود.
مواد و روشها: در این مطالعه 25 نمونه از اسفنجهای Haliclonaو Niphatea از 6 ایستگاه جمع آوری شدند. شناسایی بر اساس ویژگیهای فنوتیپی انجام شد. باکتریها در محیط نوترینت براث کشت و متابولیتهای ثانویه آنها بوسیله اتیل استات استخراج شد. میزان بازدارندگی متابولیتها در مقابل آلفاآميلاز و آلفاگلوکوزیداز بر اساس روشهای رنگسنجي ارزیابی شد. سمیت متابولیتها علیه رده سلولی نرمال اندوتلیلال بند ناف بررسی شد. باکتریهای مولد با رویکرد تاکسونومی پلیفازی شناسایی شدند.
یافته ها: در کل 105 باکتری جداسازی گردید. باکتریهای ویبریو و باسیلوس با 81/32 و 19/17 درصد در Haliclona sp.. و 51/19 و 15/34 درصد در .Niphatea sp فراوانی غالب را تشکیل دادند. متابولیتهای استخراج شده از 3 جدایه با مقادیر IC50 متغیر ازg/ml µ 0/248 تا 8/366 فعالیت آنزیم آمیلاز را ممانعت کردند. همچنین 4 جدایه مولد متابولیتهای بازدارنده علیه آنزیم آلفاگلوکوزیداز در مقادیر IC50 ازg/ml µ 4/159تا 9/670 بودند. بر اساس نتایج شناسایی پلیفازی جدایههای توانمند شامل Bacillus pumilus HH 165، Pseudomonas lurida HH 124، Streptomyces sp. HN 235، Bacillus tequilensis HN 231 بودند.
نتیجه گیری: در این مطالعه 3 سویه باکتری مولد ترکیبات بازدارنده شامل آنزیمهای آلفاآمبلاز و آلفا گلوکوزیداز و فاقد سمیت سلولی شناسایی گردید. باکتریهای مذکور می توانند کاندیدای مناسبی در مطالعات بیماری دیابت باشند.
پرونده مقاله
سابقه و هدف: گونه Ephedra intermedia از خانواده Ephedraceae، گیاهی درختچه ای و جزو بازدانگان ابتدایی محسوب می شود. هدف از این مطالعه سنتز نانوذرات نقره از عصاره این گونه به منظور بررسی اثرات ضد میکروبی و آنتی اکسیدانی آن می باشد .
مواد و روش ها: ابتدا عصاره متانولی ت چکیده کامل
سابقه و هدف: گونه Ephedra intermedia از خانواده Ephedraceae، گیاهی درختچه ای و جزو بازدانگان ابتدایی محسوب می شود. هدف از این مطالعه سنتز نانوذرات نقره از عصاره این گونه به منظور بررسی اثرات ضد میکروبی و آنتی اکسیدانی آن می باشد .
مواد و روش ها: ابتدا عصاره متانولی تهیه شده و با استفاده از نمک نقره، نانوذره نقره سنتز گردید . براي تأیید نانوذرات نقره از دستگاه اسپکتروفتومتري و برای بررسی ابعاد و شکل آن از میکروسکوپ الکترونی روبشی استفاده شد. برای بررسی ترکیبات آلی احتمالی که در سنتز نانوذرات نقش دارند آنالیز FTIR و برای تعیین غلظت نانو ذرات ،آنالیز توسطAAS انجام و خواص آنتی اکسیدانی به روش DPPH بررسی شد . به منظور ارزیابی فعالیت ضد میکروبی از MBCو MIC و روش دیسک گذاری استفاده گردید .
یافته ها: نانو ذرات تولید شده به شکل کروي و در محدوده 89-30 نانومتر قرار داشتند و موثرترین گروه عاملی که در تولید آن نقش داشتند گروه هیدروکسیلی(O-H) و ترکیبات آلکنی (C=C) بودند و غلظت نانوذرات بیوسنتزی در25/2 میلی گرم بر لیتر نشان از غلظت بالای نانو درات سنتز شده دارد. نتایج آزمون MIC و MBC یکسان بود و غلظت آن 2000 میکروگرم در میلی لیتر بوده است.
نتیجه گیری: نتایج این پژوهش نشان داد که نانو ذره بیوسنتزی حاصل از Ephedra Intermedia نسبت به نانوذره تجاری تاثیر بیشتری در مهار رشد باکتری ها دارد از این رو میتواند به عنوان یک جایگزین در کاربردهای دارویی، پزشکی و ضدعفونی کننده ها مورد استفاده قرار گیرد.
پرونده مقاله
سابقه و هدف: يكي از گروههای ژنی مهم كه در برخی از باکولوویروسهای بیمارگر حشرات حفاظتشدهاند، ژنهای ̗انهانسین هستند. در تحقیق حاضر، توالیهای نوکلئوتیدی و پروتئینی انهانسین و روابط فیلوژنتیک میان آنها همراه با تجزیهوتحلیل کدونی توالیهای نوکلئوتیدی و نواحی حفاظتش چکیده کامل
سابقه و هدف: يكي از گروههای ژنی مهم كه در برخی از باکولوویروسهای بیمارگر حشرات حفاظتشدهاند، ژنهای ̗انهانسین هستند. در تحقیق حاضر، توالیهای نوکلئوتیدی و پروتئینی انهانسین و روابط فیلوژنتیک میان آنها همراه با تجزیهوتحلیل کدونی توالیهای نوکلئوتیدی و نواحی حفاظتشده با استفاده از پایگاههای محاسباتی بررسیشد.
مواد و روشها: شصت و هفت توالي نوکلئوتیدی و اسیدآمینهای مربوط به ژن ̗انهانسین از بانکژن استخراج و برای رسم درخت فیلوژنتیکی بر مبنای روش حداکثر احتمال استفادهشد. توالیهای نوکلئوتیدی مربوط به نُه ژن منتخب برای بررسی فراوانی کدونها انتخاب و از پایگاه سکوئنس مانیپیولیشن سوئیت استخراج شدند. برای مشاهده نواحی حفاظتشده در توالیهای اسیدآمینهای از سایت موتیفسرچ استفاده شد.
یافتهها: درخت رسمشده بر اساس توالیهای نوکلئوتیدی و اسیدآمینهای، به ترتيب دو و سه گروه اصلی را به نمایشگذاشت. تواليهاي آگروتیس سگتومگرانولوویروس، اپروفترا بروماتا نوکلئوپلیهدرویروس و كوريستونورا فوميفرانا مالتيپل نوکلئوپلیهدروویروس هر كدام در گروه مجزاي خود قرارداشتند. در تمام نه توالی نوکلئوتیدی منتخب، کدونهای فراوانتر شامل ATG و TGG بودند که به ترتیب مربوط به اسیدآمینههای متیونین و تریپتوفان هستند. در توالیهای اسید آمینهای، توالی حفاظتشدة HEXXH مشخصشد. توالیهای حفاظت نشدة متناظر HAISF، HCMAE، QTLGD، HQXXH و HVXXH در برخی مشاهدهشدند.
نتیجهگیری: از آنجا که تولید و ترشح هر چه بیشتر آنزیم انهنسين میتواند برای افزایش فعالیت حشرهکشی باکولوویروسها استفاده شود و بصورت تجاری برای کنترل آفات بکاررود، مطالعات بیوانفورماتیک برای پیشبینی ویژگیهای نوکلئوتیدی و اسیدآمینهای پروتئینهای مذکور در این زمینه بویژه با تولید باکولوویروسهای نوترکیب میتواند بسیار راهگشاباشد.
پرونده مقاله
زمینه و هدف: مایکوپلاسما گالی سپتیکوم، عامل بیماری مزمن تنفسی در جوجه های ماکیان، از نظر اقتصادی مهم ترین گونه مایکوپلاسما است که خسارات اقتصادی فراوان در سراسر جهان ایجاد می کند. فراوان ترین پروتئین های غشایی در مایکوپلاسما گالی سپتیکوم pMGA ، لیپوپروتئین هایی با حدود چکیده کامل
زمینه و هدف: مایکوپلاسما گالی سپتیکوم، عامل بیماری مزمن تنفسی در جوجه های ماکیان، از نظر اقتصادی مهم ترین گونه مایکوپلاسما است که خسارات اقتصادی فراوان در سراسر جهان ایجاد می کند. فراوان ترین پروتئین های غشایی در مایکوپلاسما گالی سپتیکوم pMGA ، لیپوپروتئین هایی با حدود 67 کیلو دالتون می باشد. ژنهای خانواده pMGA پتانسیل فوقالعادهای برای ایجاد تنوع در ساختار آنتی ژنی سطح سلولهای مایکوپلاسما گالیسپتیکوم دارند. هدف از این مطالعه مقایسه الگوهای پروتئین pMGA بین سویه ها و میزبان های مختلف مایکوپلاسما گالی سپتیکوم بود.
مواد و روشها: ژنومهای کامل مایکوپلاسما گالیسپتیکوم در GenBank تا ژانویه 2020 بررسی و توالیهای pMGA1.2 شناسایی، گروهبندی و کدگذاری شدند. پروتئین pMGA1.2 با طول 650 اسید آمینه بین دو میزبان مختلف (مرغ و فنچ خانگی) توسط نرم افزار بیوانفورماتیک در ژنوم های کامل مایکوپلاسما گالی سپتیکوم مورد بررسی قرار گرفت.
یافتهها: ژن pMGA1.2 در سویههای مختلف مایکوپلاسما گالیسپتیکوم پنج گروه اصلی با بیش از 10 درصد واگرایی نشان داد. بر اساس تراز چند توالی، یک الگوی خاص در جدایه فنچ خانگی شناسایی شد. جالب توجه است که دو موتیف خاص 480DNQNVSNQ487 و SNVSSPSY647 639 درژن pMGA1.2 ازسویه TS-11 یافت شد که می تواند به عنوان نشانگر برای شناسایی و تمایز این سویه واکسن از مایکوپلاسما گالی سپتیکوم بیماری زا استفاده شود.
نتیجه گیری: در این مطالعه نشان داده شد که پروتئین pMGA1.2 دارای نواحی آنتی ژنی اپی توپ سلول- B است که در تمام ایزوله ها حفظ شده است و می تواند در طراحی تست سرولوژیکی برای تشخیص آنتی بادی علیه مایکوپلاسما گالی سپتیکوم قابل استفاده باشد.
پرونده مقاله