Real-time PCR

دسترسی آزاد مقاله

1 - خصوصیات پاسخ‌های ایمنی القاء شده ناشی از واکسن زنده تخفیف حدت یافته آبله بزی سویه گرگان بر علیه بیماری لمپی اسکین در گاو
رضا نوریان ناهیده افضل آهنگران حمید رضا ورشوی عباس آزادمهر

ویروس های بیماری لمپی اسکین، آبله بزی وآبله گوسفندی از اعضاء جنس کاپری پاکس ویروس و از خانواده پاکس ویریده هستند. این ویروس ها قرابت ژنتیکی بسیار زیادی دارند. بنابراین استفاده از واکسن های حاوی سوش های کاپری پاکس ویروس مشتق شده از بز و گوسفند برای کنترل بیماری لمپی اسکی چکیده کامل

ویروس های بیماری لمپی اسکین، آبله بزی وآبله گوسفندی از اعضاء جنس کاپری پاکس ویروس و از خانواده پاکس ویریده هستند. این ویروس ها قرابت ژنتیکی بسیار زیادی دارند. بنابراین استفاده از واکسن های حاوی سوش های کاپری پاکس ویروس مشتق شده از بز و گوسفند برای کنترل بیماری لمپی اسکین می تواند مفید باشد. هدف از این مطالعه ارزیابی خصوصیات پاسخ های ایمنی القاء شده ناشی از واکسن آبله بزی بر علیه بیماری لمپی اسکین در گاو می‌باشد. گوساله‌ها از زمان تزریق واکسن تا 5 هفته بعد از آن از نظر ظهور تب و علایم بالینی بطور روزانه مورد معاینه قرار گرفتند. پاسخ های ایمنی هومورال توسط تست خنثی‌سازی سرم و پاسخ های ایمنی سلولی توسط تست‌های MTT Real-time PCR, و ELISA مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج نشان داد که در گوساله های واکسینه شده، تبو تورم موضعی در محل تزریق در مقایسه با گروه کنترل مشاهده شد. در ارزیابی پاسخ ایمنی هومورال افزایش معنی داری در میزان تیتر آنتی‌بادی اختصاصی در گروه واکسینه در مقایسه با گروه کنترل مشاهده شد، بطوریکه این میزان در روز 35 بعد از واکسیناسیون دارای اختلاف معنی داری نسبت به سایر روزها بود (05/0P<). در ارزیابی پاسخ ایمنی سلولی، افزایش معنی داری در بیان ژن IFN-γ در روز 7 و ژن IL-4 در روز 21 بعد از واکسیناسیون در مقایسه با روز صفر و گروه کنترل مشاهده شد (05/0P<) و این در حالی بودکه بیشترین میزان تولید سایتوکاین در مایع رویی کشت سلول برای IFN-γ و IL-4 در روز 21 بعد از واکسیناسیون مشاهده شد (05/0P<). همچنین شاخص تکثیر لنفوسیتی درگوساله‌های واکسینه، در روز‌های 7، 21 و 35 در مقایسه با روز صفر و گروه کنترل افزایش معنی داری را نشان داد (05/0P<). بر اساس نتایج این مطالعه واکسن آبله بزی سوش گرگان با القاء پاسخ های ایمنی هومورال و سلولی قادر به تولید مقادیر مناسبی از آنتی‌بادی های خنثی کننده و همچنین با افزایش قدرت تکثیر لنفوسیتی و بیان و تولید سایتوکاین ها از ایمنی زایی مناسبی جهت استفاده در واکسیناسیون در برابر LSD برخوردار است. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

2 - اثرات استرس حاد حرکتی بر بیان ژنهای Znt1، Znt2، Znt3 و Znt4 در هیپوکامپ موشهای صحرایی نر
مائده نیله چی اکرم عیدی حمید گله داری مهناز کسمتی

امروزه از استرس به عنوان مسئله‌ای رایج در زندگی روزمره یاد می‌شود. استرس می‌تواند با ایجاد اختلال در هموستازی عناصر فلزی مانند روی در سیستم عصبی مرکزی موجب بروز بیماری‌ها یا اختلال در عملکرد بافت‌های مختلف گردد. در این میان عنصر روی نقش مهمی در کارکرد ارگان‌های حیاتی به چکیده کامل

امروزه از استرس به عنوان مسئله‌ای رایج در زندگی روزمره یاد می‌شود. استرس می‌تواند با ایجاد اختلال در هموستازی عناصر فلزی مانند روی در سیستم عصبی مرکزی موجب بروز بیماری‌ها یا اختلال در عملکرد بافت‌های مختلف گردد. در این میان عنصر روی نقش مهمی در کارکرد ارگان‌های حیاتی به ویژه سیستم عصبی مرکزی ایفا می‌نماید. اختلال در هموستازی روی به نوبه خود موجب ایجاد و یا پیشرفت بیماری‌هایی نظیر آلزایمر، افسردگی، اختلال در یادگیری و ایسکمی می‌گردد. هموستازی روی در بدن توسط پروتئین‌های ZnT و ZIP صورت می‌پذیرد. هدف از این مطالعه بررسی اثر استرس حاد حرکتی در بیان ژن‌های انتقال دهنده روی 1-4 موسوم به Znt1، Znt2، Znt3 و Znt4 در بافت هیپوکامپ موش صحرایی به عنوان یکی از بافت‌هایی که تراکم بالایی از روی را در خود جای داده، می‌باشد. موش‌های صحرایی به دو گروه استرس و کنترل تقسیم بندی شدند. از بافت هیپوکامپ RNA استخراج گردید و تغییرات بیان ژن‌های Znt1، Znt2، Znt3 و Znt4 به وسیله ریل تایم پی سی آر بررسی شد. نتایج نشان داد که بر اثر القای استرس بیان ژن Znt1 افزایش بیان معنی‌دار داشته و در بیان ژن‌های مورد بررسی دیگر تغییر بیان معنی‌دار مشاهده نگردید. شناخت آن دسته از ژن‌های انتقال دهنده روی که بر اثر استرس بیان آن‌ها دستخوش تغییر می‌شود، می‌تواند مسیر یافتن درمان این بیماری را به کمک تنظیم سطح روی در بدن از طریق داروهای حاوی این عنصر ممکن سازد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

3 - ارزیابی بیان ژن های CCND1 و ITGB1 در بیماران مبتلا به سرطان پستان
فرنام قلی پور مارالان شهره زارع کاریزی محمد ابراهیم زاده

سرطان پستان یکی از شایع ترین سرطان‌های شناخته شده و یکی از عوامل مرگ و میر زنان در سراسر دنیا می باشد. لذا بررسی مکانیسم‌های مولکولی دخیل در پیشرفت آن حائز اهمیت است. در مطالعه حاضر میزان بیان ژنهای CCND1 و ITGB1 در 30 بیمار مبتلا به سرطان پستان بررسی گردیده است. استخرا چکیده کامل

سرطان پستان یکی از شایع ترین سرطان‌های شناخته شده و یکی از عوامل مرگ و میر زنان در سراسر دنیا می باشد. لذا بررسی مکانیسم‌های مولکولی دخیل در پیشرفت آن حائز اهمیت است. در مطالعه حاضر میزان بیان ژنهای CCND1 و ITGB1 در 30 بیمار مبتلا به سرطان پستان بررسی گردیده است. استخراج RNA از بافت توموری و نرمال مجاور 30 بیمار مبتلا به سرطان پستان انجام شد. پس از سنتز cDNA و طراحی پرایمر برای ژن های CCND1 و ITGB1، بیان ژن های مذکور با روش Real time-PCR ارزیابی شد. به منظور آنالیز داده‌ها نیز از فرمول 2-ΔΔct استفاده شد و معنادار بودن داده‌ها نیز براساس آزمون T-test(P ≤ 0.05) ارزیابی شد. بیان ژن های CCND1 و ITGB1 در نمونه های بافت های توموری افزایش معنا داری را در مقایسه با نمونه های نرمال نشان دادند (P<0.0001). بیان بالای ژن های سیکلین D1 و ITGB1 که نقش اصلی را در کنترل چرخه سلولی دارند با پیشرفت سرطان رابطه مستقیمی دارند. تایید این نتایج نیازمند مطالعات بیشتر می باشد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

4 - مطالعه اثر غلظت‌های مختلف نمک بر بقای مایکوباکتریوم اویوم زیرگونه پاراتوبرکلوزیس در پنیر سفید فراپالایشی ایرانی
شهرام حنیفیان حسین جدیری

مایکوباکتریوم اویوم زیرگونه پاراتوبرکلوزیس (مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس) به دلیل ارتباط احتمالی با بیماری کرون (Crohn’s disease) در انسان به عنوان یک مخاطره بهداشتی برای سلامتی عمومی محسوب می گردد. هدف این مطالعه بررسی اثر غلظت های مختلف نمک بر بقای مایکوباکتریوم چکیده کامل

مایکوباکتریوم اویوم زیرگونه پاراتوبرکلوزیس (مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس) به دلیل ارتباط احتمالی با بیماری کرون (Crohn’s disease) در انسان به عنوان یک مخاطره بهداشتی برای سلامتی عمومی محسوب می گردد. هدف این مطالعه بررسی اثر غلظت های مختلف نمک بر بقای مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس طی دوره رسیدن و نگه‌داری پنیر سفید فراپالایشی ایرانی است. شیر پاستوریزه گاوی متعاقب فرآیند فراپالایش با تعداد 2 واحد لگاریتمی در هر گرم (Log cfu/g) مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیستلقیح و سپس نمونه های پنیر حاوی مقادیر 2%، 3% و 4% نمک از آن تهیه گردید.تعداد مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس طی دوره رسیدن و نگه‌داری با استفاده از روش های F57-Quantitative Real-Time PCR (F57-qPCR) و کشت ارزیابی شد. به موازات آن، جمعیت باکتری های لاکتیکی کشت آغازگر و خصوصیات فیزیکوشیمیایی در نمونه های پنیر تعیین گردید. بر اساس نتایج مطالعه، کاهش تعداد مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس در نیمه اول دوره نگه‌داری (روز 1 تا روز 30) در تمامی نمونه ها آهسته و غیرمعنی دار (05/0p>) بود. اما با پیشرفت این دوره (از روز 30 تا روز 60)، روند کاهش تعداد مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس سریع و به لحاظ آماری معنی دار (01/0p<) گردید. هم چنین، در پایان دوره نگه‌داری (روز 60) تفاوت تعداد مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس در نمونه های پنیر دارای 4% نمک، به طور معنی داری (01/0>p) کمتر از نمونه های تهیه شده با 2% و 3 % نمک بود. با این حال در تمامی نمونه ها مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس بقای خود را تا انتهای دوره نگه‌داری حفظ نمود. به نظر می‌رسد استفاده از غلظت های بالاتر نمک روند کاهش مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس را تسریع می کند. به علاوه، با توجه به اثر زمان بر روند از بین رفتن مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس، نگه‌داری پنیر سفید فراپالایشی تا اواخر دوره موجب غیرفعال شدن تعداد بیشتری از مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس می گردد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

5 - معرفی مخلوطی بهینه از عصاره‌های مرزنجوش، فوفل و دارفلفل با بالاترین میزان فعالیت علیه بیان ژن انتروتوکسین های A و B استافیلوکوکوس اورئوس
سیدجواد ندافی علی محمدی ثانی اسماعیل عطای صالحی رضا کاراژیان

10.30495/jfm.2022.1930957.1716

با آگاهی یافتن مردم در رابطه با اهمیت عصاره‌های طبیعی با ویژگی‌های ضدمیکروبی و آنتی‌اکسیدانی، امروزه صنعت غذا به دنبال استفاده از این ترکیبات به جای نگهدارنده‌های سنتزی هستند. تا به امروز پژوهشی جهت یافتن یک مخلوط بهینه‌ای از عصاره‌های مرزنجوش، دارفلفل و فوفل علیه بیان چکیده کامل

با آگاهی یافتن مردم در رابطه با اهمیت عصاره‌های طبیعی با ویژگی‌های ضدمیکروبی و آنتی‌اکسیدانی، امروزه صنعت غذا به دنبال استفاده از این ترکیبات به جای نگهدارنده‌های سنتزی هستند. تا به امروز پژوهشی جهت یافتن یک مخلوط بهینه‌ای از عصاره‌های مرزنجوش، دارفلفل و فوفل علیه بیان ژن انتروتوکسین‌هایA و B S. aureus انجام نشده است، لذا در این پژوهش به دنبال یافتن مخلوطی از این عصاره‌ها با بیشترین فعالیت آنتی‌انتروتوکسین‌زایی به کمک Real-time PCR و روش آماری مخلوط می‌باشیم. در صورت موفقیت، این عصاره‌ها را به عنوان یک عامل آنتاگونیست در برابر رشد باکتری‌های بیماری‌زا و بیان ژن انتروتوکسین S.aureus معرفی نماییم. در مرحله اول فعالیت ضد میکروبی سه عصاره مرزنجوش، دارفلفل و فوفل مورد بررسی قرار گرفت که در این میان عصاره مرزنجوش بیشترین فعالیت ضدمیکروبی را نشان داد. از سوی دیگر در میان باکتری‌های مورد آزمون باکتری‌های گرم مثبت حساسیت بیشتری نسبت باکتری‌های گرم منفی داشتند. عصاره‌های مورد آزمون اثر سینرژیستی بر یکدیگر علیه بیان ژن انتروتوکسین‌هایA و B S. aureus داشتند. مخلوطی از عصاره‌ها شامل 47 درصد عصاره مرزنجوش، 27 درصد عصاره دارفلفل و 26 درصد عصاره فوفل بیشترین فعالیت علیه بیان ژن انتروتوکسین‌ها را نشان داد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

6 - The Effects of Various Essential Oils of Medical Plant Seeds and Spices on Digestion Characteristics and Population Changes of Ruminal Anaerobic Fungi in in vitro Condition
م. سجادیان م. دانش مسگران ع.ر. وکیلی

The effect of essential oils (EO) of medical plant seeds and spices on rumen microbial fermentation of alfalfa hay, sugar beet pulp and barley grain (as substrate) were evaluated under in vitro conditions. In vitro incubations were carried out using the gas production m چکیده کامل

The effect of essential oils (EO) of medical plant seeds and spices on rumen microbial fermentation of alfalfa hay, sugar beet pulp and barley grain (as substrate) were evaluated under in vitro conditions. In vitro incubations were carried out using the gas production method with glass syringes. Treatments were as follows; a control (no additive), monensin, EO of cinnamon, black pepper seed, cumin seed, fennel seed and garlic oil (200 and 400 µL/g DM). Monensin was used as a positive control in the medium at 5 µmol. Data on gas production were fitted using an exponential equation. Results showed that compared to control treatments, monensin had a significant increase on gas production (P<0.05), and cumin seed EO decreased gas production of the feed samples (200 and 400 µL). The effects of treatments on in vitro ruminal fermentation characteristics were tested using an in vitro culture inoculated by mixed rumen microbes. The test treatments were as follows; control (no additive), EO of cinnamon, black pepper seed, cumin seed and fennel seed. Evaluations were made for medium pH, ammonia nitrogen concentration and dry matter disappearance after a 48 h incubation period. To evaluate the effect of EO on in vitro ruminal fungi populations, a sample was taken from the medium after a 120 h incubation period and fungal population was determination by real-time polymerase chain reaction. Compared to the control treatment, cumin and cinnamon additions resulted in a significant decrease (P<0.05) on disappearance of dry matter in the feed samples. In the present study, additions of all tested EO to alfalfa hay treatment showed a significant increase in the final pH of the culture (P<0.05). However, cinnamon addition resulted in a significant decrease in medium ammonia nitrogen concentration for each of the feed samples (P<0.05). Results of the present study also demonstrate that addition all of the tested EO to alfalfa hay had a significantly decrease on in vitro ruminal fungal population (P<0.05). پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

7 - Dlk1 Gene Expression in Different Tissues of Lamb
S.H. Masoudzadeh M.R. Mohammadabadi A. Khezri O.A. Kochuk-Yashchenko D.M. Kucher O.I. Babenko M.V. Bushtruk S.V. Tkachenko R.V. Stavetska N.I. Klopenko V.P. Oleshko M.V. Tkachenko I.V. Titarenko

Delta-like 1 homolog or pre-adipocyte factor 1 (Dlk1) is one of the most significant genes and widely expresses all over mammal’s development. Some of the functions identified for Dlk1gene are development of muscle, healing of wound, adipocytes proliferation, live چکیده کامل

Delta-like 1 homolog or pre-adipocyte factor 1 (Dlk1) is one of the most significant genes and widely expresses all over mammal’s development. Some of the functions identified for Dlk1gene are development of muscle, healing of wound, adipocytes proliferation, liver, lung and pancreas development. It also prevents Notch gene conducting toward to govern several operations such like cellular proliferation and differentiation. The aim of this study was to assay the expression of Dlk1 gene in liver, humeral and femur muscles, brain, adipose, testis and rumen tissues of Kermani lambs. Tissue samples from thirty male lambs of Kermani sheep with approximately the similar weight and age from the Animal Science Research and Training Station of Shahid Bahonar University of Kerman were picked up. Total RNA was isolated, cDNA was synthesized and Real-Time PCR was performed. SAS and REST softwares were used for analyzing the results. The Dlk1 gene was expressed in all studied tissues of Kermani sheep. The highest expression of Dlk1 gene expression was observed in liver tissue. There was no statistically significant difference between rumen and femur (leg) muscle, between humeral muscle and liver and between adipose and brain tissue (P>0.05). The lowest expression was related to testicular tissue. Based on results of current study, it can be concluded that this gene has pleiotropic effects with different major and minor outcomes in different tissues. But, for reaching to more decisive conclusion for any tissue, it is necessary to carry out further research noticing various physiological, epigenetic and genetic conditions. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

8 - Chalcone Isomerase Gene Expression in Different Stages of Petunia Hybrida Flowering and Various Flower Colors
Fatemeh Keykha Akhar Abdolreza Bagheri Nasrin Moshtaghi Masoud Fakhrfeshani

Petunia (Petunia hybrida) is one of the important plants in horticultural industry. This plant is being used as a model ornamental plant and is one of the most important plants in floriculture market. Flavonoids are the main pigment in this plant. So, genetic engineerin چکیده کامل

Petunia (Petunia hybrida) is one of the important plants in horticultural industry. This plant is being used as a model ornamental plant and is one of the most important plants in floriculture market. Flavonoids are the main pigment in this plant. So, genetic engineering with the goal of color alteration in petunia is focused on flavonoids. To gain a global perspective on genes differentially expressed in petunia’s flowers pigment pathway, we investigated the expression of chalcone isomerase (chi) as an essential gene in biosynthesis pathway of pigment production in different types of flower color of petunia and various stages of flowering in this plant. Also, we measured the concentration of total flavonoids, anthocyanins and naringenin to evaluate the probably relationship between the expression profile of chi gene and the concentration of mentioned pigments. The results indicated that chalcone isomerase expression had different profile in different petal color of P. hybrida. So that, the most chi expression observed in red petunia flowers. Naringenin concentrations was the most value in this color flower. In comparison of flowering stages, stage 1, had the most expression. In other words, when the flowers fully closed (bud stage), chi expression and concentration was in the highest value. Our results showed that chi is a key gene in pigment biosynthesis pathway so that in absence of this gene, pigment pathway will be stopped. Identification of effective genes in different pathways of secondary metabolite production will assist in accurate selection of genes for genetically modification of pathways and production of various metabolites. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

9 - شناسایی فعالیت و بیان ژن پمپ افلاکس سویه های مقاوم به سیپروفلوکساسین استافیلوکوکوس اورئوس
زهرا توکلی حسن صاحب جمعی لیلا پیشکار زهره علی مددی حسن نوربازرگان امیر میرزایی

سابقه و هدف: باکتری استافیلوکوکوس اورئوس یکی از مهمترین عوامل عفونت‌زای بیمارستانی می‌باشد. اخیرا سویه‌های استافیلوکوکوس اورئوس نسبت به آنتی بیوتیک سیپروفلوکساسین مقاوم شده‌اند و پمپ افلاکس در این مقاومت نقش مهمی را ایفا می‌کند. هدف از این مطالعه، بررسی وجود ژن های پمپ چکیده کامل

سابقه و هدف: باکتری استافیلوکوکوس اورئوس یکی از مهمترین عوامل عفونت‌زای بیمارستانی می‌باشد. اخیرا سویه‌های استافیلوکوکوس اورئوس نسبت به آنتی بیوتیک سیپروفلوکساسین مقاوم شده‌اند و پمپ افلاکس در این مقاومت نقش مهمی را ایفا می‌کند. هدف از این مطالعه، بررسی وجود ژن های پمپ افلاکس (norA و norB)، بیان و فعایت آن در سویه‌های مقاوم به سیپروفلوکساسین استافیلوکوکوس اورئوس بود .مواد و روش ها: در این مطالعه، تعداد 250 نمونه بالینی به منظور جداسازی سویه های استافیلوکوکوس اورئوس، بررسی مقاومت آنتی بیوتیکی، وجود و بیان ژن‌های پمپ افلاکس norA و norB در آنها به ترتیب توسط روش های PCR و real-time PCR مورد مطالعه قرار گرفت. در انتها، پمپ افلاکس فعال در سویه‌های مقاوم به سیپروفلوکساسین استافیلوکوکوس اورئوس توسط روش اتیدیوم بروماید بررسی شد.یافته ها: از مجموع نمونه های مورد برررسی، 50 سویه استافیلوکوکوس اورئوس جداسازی شد که از این میان 12 جدایه (24%) مقاوم به سیپروفلوکساسین بودند. میزان شیوع ژن های norA و norB در سویه‌های مقاوم به سیپروفلوکساسین به ترتیب 100% و 83% بود. همچنین تمامی سویه‌های مقاوم به سیپروفلوکساسین دارای پمپ افلاکس فعال بودند. نتایج real-time PCR نشان داد که اختلاف معنی داری در میزان بیان پمپ ‌های افلاکس در سویه‌های مقاوم به سیپروفلوکساسین وجود دارد. نتیجه گیری: نتایج این مطالعه نشان داد که پمپ‌های افلاکس norA و norB نقش مهمی در ایجاد مقاومت به سیپروفلوکساسین ایفا می‌کند. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

10 - تشخیص سریع ویروس لارینگو تراکئیت عفونی (ILTV) با استفاده از روش Real-time PCR مبتنی بر ژن اختصاصی UL27
سمانه ظهیری یگانه محمد صادق هاشم زاده احسان ظفری مهدی تات محمد نجاراصل بنت الهدی زهرایی روح الله درستکار

سابقه و هدف: ویروس لارینگو تراکئیت عفونی (ILTV)، از مهمترین عوامل بیماری زا از نظر اقتصادی در صنعت طیور است. ماکیان تنها مخزن اصلی این ویروس به شمار می آیند. در حال حاضر برای تشخیص این ویروس روش سریع، حساس و دقیقی وجود ندارد. این مطالعه با هدف ارزیابی و معرفی یک روش دقی چکیده کامل

سابقه و هدف: ویروس لارینگو تراکئیت عفونی (ILTV)، از مهمترین عوامل بیماری زا از نظر اقتصادی در صنعت طیور است. ماکیان تنها مخزن اصلی این ویروس به شمار می آیند. در حال حاضر برای تشخیص این ویروس روش سریع، حساس و دقیقی وجود ندارد. این مطالعه با هدف ارزیابی و معرفی یک روش دقیق مولکولی با استفاده از تکنیک Real-time PCR و مبتنی بر ژن اختصاصی UL27 ویروس ILT، به منظور تشخیص سریع این ویروس انجام شد. مواد و روش ها: در این مطالعه تجربی، پس از تهیه نمونه ویروسی، DNA مربوطه با استفاده از کیت استخراج اسیدهای نوکلئیک از ویروس استخراج گردید. سپس حضور ژن اختصاصی UL27 ویروس، ابتدا با روش PCR با استفاده از پرایمرهای اختصاصی و در نهایت با تکنیک Real-time PCR با استفاده از پرایمرها و پروب اختصاصی مورد ارزیابی قرار گرفت. یافته ها: مشاهده قطعه مورد انتظار 96 جفت بازی در آنالیز ژل الکتروفورز، حضور ژن اختصاصی UL27 را در نمونه های ویروسی تأیید نمود. همچنین نتایج ارزیابی سنجش Real-time PCR نیز بر روی نمونه های یاد شده مثبت بود. نتیجه گیری: این مطالعه نشان داد که روش مولکولی Real-time PCR روش مناسبی برای تشخیص سریع و دقیق ویروس لارینگو تراکئیت عفونی، به واسطه ردیابی ژن اختصاصی UL27 می باشد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

11 - راه‌اندازی روش real-time PCR به منظور شناسایی مستقیم حساسیت به کلاریترومایسین در هلیکوباکتر پیلوری
صادق قربانی دالینی محمد کارگر عباس دوستی پژمان عباسی نگار صعود

سابقه و هدف: مقاومت هلیکوباکتر پیلوری به کلاریترومایسین تا حد قابل توجهی باعث کاهش اثرات درمانی داروی مذکور گردیده است. هدف از این پژوهش ارزیابی روش مستقیم real-time PCR و مقایسه آن با روش دیسک دیفیوژن برای شناسایی مقاومت به کلاریترومایسین در هلیکوباکتر پیلوری می باشد. چکیده کامل

سابقه و هدف: مقاومت هلیکوباکتر پیلوری به کلاریترومایسین تا حد قابل توجهی باعث کاهش اثرات درمانی داروی مذکور گردیده است. هدف از این پژوهش ارزیابی روش مستقیم real-time PCR و مقایسه آن با روش دیسک دیفیوژن برای شناسایی مقاومت به کلاریترومایسین در هلیکوباکتر پیلوری می باشد. مواد و روش&zwnj;ها: این پژوهش به&zwnj;صورت تجربی برروی 45 نمونه بیوپسی تهیه شده از بیماران دارای اختلالات گوارشی انجام شد. در تمامی نمونه&zwnj;های مورد بررسی وجود هلیکوباکتر پیلوری با کشت، RUT و PCR معمولی تایید گردید. همچنین مقاومت به کلاریترومایسین با استفاده از روش CLSI (Clinical and Laboratory Standard Institute) و real-time PCR با استفاده از پروب اختصاصی ناحیه پپتیدیل ترانسفراز ژن 23S rRNA هلیکوباکتر پیلوری انجام شد. یافته&zwnj;ها: با استفاده از روش دیسک دیفیوژن، 20 نمونه حساس (44/44%) و 25 نمونه مقاوم (56/55%) به کلاریترومایسین شناسایی گردید. اما با استفاده از روش real-time PCR در 20 نمونه ژنوتیپ مقاوم (44/44%)، 5 نمونه ژنوتیپ مخلوط (11/11%) و در 20 نمونه ژنوتیپ حساس (44/44%) به کلاریترومایسین شناسایی گردید. همچنین نتایج نشان داد که حساسیت این تکنیک برابر 40 باکتری یا 80 کپی از ژن 23S rRNA می باشد. نتیجه گیری: نتایج نشان داد که روش real-time PCR دارای حساسیت و دقت مناسبی برای شناسایی مقاومت به کلاریترومایسین در کمترین زمان ممکن است. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

12 - راه اندازی روش Real-time PCR برای تشخیص و تعیین کمی ویروس سرخک با استفاده از ژن F
طاهره زارعی خسرو آقایی‌پور فرشید کفیل‌زاده عبدالحمید شوشتری

سابقه و هدف: با وجود کنترل بیماری سرخک در جهان، اما گزارش&zwnj;هایی از ابتلا به این ویروس در جمعیت&zwnj;های واکسینه شده وجود دارد. بنابراین تشخیص دقیق و به&zwnj;موقع این ویروس ضروری است. روش&zwnj;های جدید مولکولی در تشخیص ویروس ارائه شده است که توان تعیین مقدار این ویرو چکیده کامل

سابقه و هدف: با وجود کنترل بیماری سرخک در جهان، اما گزارش&zwnj;هایی از ابتلا به این ویروس در جمعیت&zwnj;های واکسینه شده وجود دارد. بنابراین تشخیص دقیق و به&zwnj;موقع این ویروس ضروری است. روش&zwnj;های جدید مولکولی در تشخیص ویروس ارائه شده است که توان تعیین مقدار این ویروس را ندارند. هدف از این پژوهش راه اندازی روش Real-time PCR با استفاده از ژن F ویروس سرخک می&zwnj;باشد. مواد و روش&zwnj;ها: این مطالعه با طراحی دو پرایمر و یک پروب راه اندازی و از ژن F کلون شده در داخل پلاسمید pET-22b(+) استفاده گردید. رقت&zwnj;های متوالی در مبنای 10 از پلاسمید استاندارد حاوی ژن آماده شد و منحنی استاندارد رسم گردید. جهت انجام پروژه از کیت Taq Man ساخت شرکت ABI استفاده گردید. یافته&zwnj;ها: حداقل 30 ذره ویروسی در هر واکنش مشخص گردید و در محدوده رقت&zwnj;های 4-10تا 9- 10 معادل ( 101×3- 106×3) نسخه بهترین حالت خطی برای منحنی استاندارد دیده شد. نتیجه گیری: نتایج نشان داد که تکنیک Real-time PCR می&zwnj;تواند به عنوان روشی بسیار اختصاصی و سریع برای تشخیص و تعیین تعداد ویروس سرخک از نمونه&zwnj;های حاوی این ویروس به&zwnj;کار رود. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

13 - بررسی بیان ژنSCAMP5 وmiR هدف آن در بافت بیماران گلیوبلاستوما مولتی‌فرم
نسرین کریمی حمیدرضا خیری منجیلی وجیهه زرین پور محمدمهدی فرقانی فرد

10.22034/ascij.2022.1926616.1243

گلیوبلاستومامولتی فرم (GBM) یکی از بدخیم ترین و رایج ترین تومورهای مغزی است و پس از درمان ترکیبی فعلی، بقای بیمار نسبتاً ضعیف است و این بیماری همواره کشنده است. هدف ازاین مطالعه بررسی بیانSCAMP5 به عنوان بیومارکر احتمالی در گلیوبلاستوما مولتی فرم و بررسی miR هدف این ژن چکیده کامل

گلیوبلاستومامولتی فرم (GBM) یکی از بدخیم ترین و رایج ترین تومورهای مغزی است و پس از درمان ترکیبی فعلی، بقای بیمار نسبتاً ضعیف است و این بیماری همواره کشنده است. هدف ازاین مطالعه بررسی بیانSCAMP5 به عنوان بیومارکر احتمالی در گلیوبلاستوما مولتی فرم و بررسی miR هدف این ژن می باشد. در این مطالعه 50 نمونه بافت مبتلا به گلیوبلاستوما مولتی فرم قبل از درمان و 50 نمونه بافت سالم حاشیه تومور GBM به عنوان نمونه کنترل جمع آوری شد. برای تمام نمونه ها، استخراج RNA و سنتز cDNA صورت گرفت. بیان ژن SCAMP5 با استفاده از روشReal-time PCR بررسی شد و از ژنACTB به عنوان کنترل داخلی استفاده شد. تجزیه وتحلیل آماری داده ها با استفاده از نرم افزار GraphPad Prism نسخه8 انجام شد. برای بررسی ارزش بیومارکری ژن SCAMP5 از منحنیRoc استفاده شد. کاهش بیان ژن SCAMP5 در نمونه های گلیوبلاستوما مولتی فرم مشاهده شد و بیان آن با مشخصات پاتولوژی بیماران مقایسه شد. بیان ژن SCAMP5 با سن بیماران با 05/0 p ˂از لحاظ آماری معنادار بود و بیان ژن با جنسیت با 005/0 p ˃از لحاظ آماری معنادار نمی باشد. SCAMP5 در بافت توموری بیماران مبتلا بهGBM به مراتب کمتر از بافت سالم اطراف تومور بیان شده بود. نتایج نشان داد که در بیمارانی با سن بیشتر از 50 سال میزان بیان ژن SCAMP5 کاهش یافت. بررسی منحنی ROC نشان داد که ژن SCAMP5 می تواند دارای ارزش بیومارکری باشد. با توجه به این بررسی شاید بتوان از بیان این ژن به عنوان مارکر یک راه تشخیصی زودهنگام استفاده کرد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

14 - بررسی تغییرات بیانLncRNA SNHG15 در بافت بیماران گلیوبلاستوما مولتی فرم با روش Real Time PCR
سحر شاکری یکتا الهام مسلمی سویار ساری فاطمه روح اله حمیدرضا خیری

10.22034/ascij.2022.1970970.1439

گلیوبلاستوما یک تومور بدخیم تهاجمی مغز و نخاع است. شواهد متعدد نقش انکوژنی مولکول های RNA طولانی غیرکدکننده (lncRNA) را در طیف گسترده ای از انواع سرطان ها از جمله گلیوما نشان می دهد و بسیار مهم است، با این حال، عملکرد تومورزایی lncRNA در گلیوم تا حد زیادی نامشخص است. شو چکیده کامل

گلیوبلاستوما یک تومور بدخیم تهاجمی مغز و نخاع است. شواهد متعدد نقش انکوژنی مولکول های RNA طولانی غیرکدکننده (lncRNA) را در طیف گسترده ای از انواع سرطان ها از جمله گلیوما نشان می دهد و بسیار مهم است، با این حال، عملکرد تومورزایی lncRNA در گلیوم تا حد زیادی نامشخص است. شواهد فزاینده نشان داده که lncRNA ها ازجمله LncRNA SNHG15، نقش مهمی در پاتوفیزیولوژی بیماری های انسانی، به ویژه در پاتوژنز و پیشرفت سرطان ها دارند. در این مطالعه 25 بلوک بافت پارافینه مبتلایان به گلیوبلاستوما مولتی فرم و بافت حاشیه توموری جمع آوری و استخراج RNA انجام شد. سنتز cDNA و بررسی بیان SNHG15 با تکنیک Real Time PCR انجام گرفت. منحنی ROC جهت بررسی ارزش بیومارکری رسم و تجزیه و تحلیل آماری توسط GraphPad Prism v.8.0.1 انجام شد. افزایش بیان بالای SNHG15 در نمونه بافت افراد بیمار نسبت به بافت حاشیه توموری به ثبت رسید (0001/0>p ) ارتباط معناداری در بیان این ژن، در بیماران با سنین بیش از 50 سال و کمتر از 50 سال (6573/0p =)، در لوب های پیشانی، گیجگاهی، آهیانه، پس سری (9802/0 p =)، بقا در بیش از 12 ماه و کمتر از 12 ماه (5007/0p =) مشاهده نشد و فقط در جنسیت زن و مرد ارتباط معنادار به ثبت رسید (0001/0p =). بیان LncRNA SNHG15 در بافت توموری بیماران مبتلا به گلیوبلاستوما مولتی فرم بیشتر از بافت حاشیه توموری به ثبت رسید. با بررسی منحنی ROC این احتمال می رود که LncRNA SNHG15 بتواند به عنوان مارکر زیستی مطرح شود اما نیاز به مطالعات بیشتری دارد. پرونده مقاله

فهرست مقالات Real-time PCR

سکوی نشر دانش

پیوندهای سایت

مراکز مرتبط

پشتیبانی

صفحات رسمی