معرفي نشريه
علمی
مجله زیستفناوری میکروارگانیسمهای محیطی یک مجله با انجام مراحل داوری است که مقالات حاصل از تحقیقات اصلی باکیفیت بالا را بررسی و به چاپ میرساند. مقالات مروری کامل و مروری کوتاه و مقالات ارتباط کوتاه (Short communications) نیز مورد پذیرش است. این مجله تمام جنبههای تحقیقاتی مربوط به کاربردهای زیستفناوری میکروارگانیسمها در محیطهای مختلف مانند هوا، خاک و آب پوشش میدهد. موضوعات مورد توجه شامل میکروارگانیسمهای مهم محیطی در حوزههای زیستفناوری سبز، سفید و آبی هستند. مطالعات بر روی جداسازی و شناسایی هرگونه جدید میکروبی از مناطق مختلف جغرافیایی محلی با کاربرد بالقوه در زیستفناوری مانند زیست پالائی یا تجزیه زیستی آلایندهها در محیطهای مختلف مورد توجه قرار میگیرد. ساختار و عملکرد آنزیمها و پروتئینها یا بیوسنتز متابولیت های قارچی، جلبکی و باکتریایی و سموم مهم داری اثر در محیط زیست و همچنین موضوعات مربوط به فرسایشهای میکروبی، معدنی سازی مواد آلی، میکروبیولوژی نفت، میکروبیولوژی زیر سطح، شکل و عملکرد بیوفیلم و سایر پدیدههای سطحی، چرخه بیوژئوشیمیایی عناصر و میکروبشناسی آثار باستانی قابل توجه است. مطالعات متاژنومیکس و هرگونه پیشرفت بیوانفورماتیک مربوط به جوامع میکروبی در محیطهای مختلف نیز در حوزه این مجله پوشش داده میشود.
مجله زیست فناوری میکروارگانیسم های محیطی در ارزیابی نشریات علمی دانشگاه آزاد اسلامی، دارای رتبه "ب" (B) می باشد.
-
دسترسی آزاد مقاله
1 - بررسی نقش کودهای بیولوژیک بر خصوصیات کمی ذرت شیرین در تراکم های مختلف کاشت
سحر دعائیشماره 6 , دوره 2 , تابستان 1402بهمنظور بررسی اثر کودهای زیستی(بیولوژیک) و تراکم کاشت بر عملکرد و اجزای عملکرد ذرت شیرین(رقم ساری ۲۸۰۲) آزمایشی بهصورت کرت یک بار خرد شده در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی با سه تکرار و بهصورت مزرعهای در سال 1400 در منطقه لاهیجان در استان گیلان به اجرا درآمد. عامل اص چکیده کاملبهمنظور بررسی اثر کودهای زیستی(بیولوژیک) و تراکم کاشت بر عملکرد و اجزای عملکرد ذرت شیرین(رقم ساری ۲۸۰۲) آزمایشی بهصورت کرت یک بار خرد شده در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی با سه تکرار و بهصورت مزرعهای در سال 1400 در منطقه لاهیجان در استان گیلان به اجرا درآمد. عامل اصلی کود زیستی در چهار سطح شاهد=F1، ازته بارور۱ F2=، فسفاته بارور-۲ F3=، فسفاته بارور-۲+ ازته بارور۱F4= بود. عامل فرعی تراکم بوته در سه سطح ۵۵۰۰۰D1=، ۶۵۰۰۰ D2= و ۷۵۰۰۰D3= بوته در هكتار بود. نتایج نشان داد که استفاده از کود زیستی بر ارتفاع بوته، تعداد دانه در بلال، طول بلال، ماده خشک کل، عملکرد دانه و وزن هزار دانه تاثیری مثبت داشت. بیشترین وزن هزار دانه (۳۸۳ گرم) در تیمار F4D2 (کاربرد کود زیستی ازته بارور۱ + فسفاته بارور-۲ و تراکم۶۵ هزار بوته در هکتار)، بیشترین ماده خشک کل (۲۶۲۴۰ کیلوگرم در هکتار) در تیمار F4D2 (کاربرد کود زیستی ازته بارور۱ + فسفاته بارور-۲ و تراکم۶۵ هزار بوته در هکتار)و بیشترین عملکرد دانه (۹۱۴۶ کیلوگرم در هکتار) در تیمار F4D2 (کاربرد کود زیستی ازته بارور۱ + فسفاته بارور-۲ و تراکم۶۵ هزار بوته در هکتار) به دست آمد. نتایج نشان داد که تراکم ۶۵ هزار بوته در هکتار و کاربرد کود زیستی ازته بارور۱ + فسفاته بارور-۲ بهعنوان مناسبترین تیمار بود. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
2 - سنتز نانوذره اکسید روی آلائیده شده با نقره و ارزیابی اثرات ضد میکروبی آن بر پاتوژنهای باکتریایی شایع جدا شده از محصولات لبنی
خسرو عیسی زادهشماره 6 , دوره 2 , تابستان 1402مهم ترین شاخصه نانو ذرات داشتن نسبت سطح ویژه بیشتر نسبت به همتای خود با اندازه بزرگتر است. هدف از این مطالعه سنتز نانوذره اکسید روی آلائیده شده با نقره و اثرات ضد میکروبی آن بر روی پاتوژنهای شایع باکتریایی جدا شده از محصولات خام لبنی بود. در این تحقیق جهت جداسازی نمو چکیده کاملمهم ترین شاخصه نانو ذرات داشتن نسبت سطح ویژه بیشتر نسبت به همتای خود با اندازه بزرگتر است. هدف از این مطالعه سنتز نانوذره اکسید روی آلائیده شده با نقره و اثرات ضد میکروبی آن بر روی پاتوژنهای شایع باکتریایی جدا شده از محصولات خام لبنی بود. در این تحقیق جهت جداسازی نمونه ها ،45 نمونه محصول خام لبنی بعد از رقیق سازی نمونه ها ، جهت جداسازی استافیلوکوکوس اورئوس و اشرشیا کلی ، به ترتیب به محيط های برد پاركر و سوربیتول مک کانکی آگار انتقال داده شدند و با استفاده از یک سری تست های اختصاصی تشخیص داده شدند. نانو پودر اکسید روی آلائیده شده با نقره به روش سل- ژل سنتز شد.بررسی اثرات ضد میکروبی نانو ذره با روش انتشار در چاهک مورد بررسی قرار گرفت. حداقل غلظت بازدارندگی (MIC) نانوپودر اکسید روی آلائیده شده با نقره و همچنین حداقل غلظت باکتری کشی (MBC)تعیین گردید. میانگین قطر هاله های عدم رشد E. coli PTCC 1399 وE. coli (1) و E. coli(2) به ترتیب 5/22 ،5/18 و 4/15میلی متر در غلظت 50 میلی گرم بر میلی لیتر و میانگین قطر هاله های عدم رشد S. aureus PTCC 1189 ، S. aureus (1)و S. aureus (2) به ترتیب 5/24 ،4/20و 5/19میلی متر در این غلظت بود. میزان MIC برای باکتری E. coli PTCC 1399 برابر با 57/1و اشرشیا کلی (ایزوله 1) و اشرشیا کلی (ایزوله 2) به ترتیب 57/1 و 13/3 میلی گرم بر میلی لیتر تعیین گردید. با توجه به تحقیق حاضر می توان به این نکته رسید که خود نانوذره اکسید روی دارای خاصیت ممانعت کنندگی خوبی روی دو سویه اشرشیا کلی و استافیلوکوکوس اورئوس است.یکی از روشهاي بهبود یا تغییر خواص نانوساختارهایی مانند اکسید روي، ورود ناخالصی در ساختار آن است. در صورت آزمایشات بیشتر می توان از این نانو ذره به عنوان ماده نگهدارنده استفاده کرد. پرونده مقاله
-
دسترسی آزاد مقاله
1 - پویایی فصلی تنوع قارچی اندوفیت درختان Grevillea robusta (بلوط نقره ای)
ابراهیم طالبی گریما آلتایه آشفت آگیتهشماره 5 , دوره 2 , بهار 1402این مطالعه به بررسی تأثیر تغییرات فصلی بر تنوع قارچهای اندوفیت بر روی شاخ و برگ درختان Grevillea robusta در امتداد بزرگراهها در هاواسا، اتیوپی میپردازد. با 765 جدایه قارچی که به 73 مورفوتاکسای متمایز طبقه بندی شدند، 41/90٪ در هشت جنس شناخته شده شناسایی گردیدند، و 58/ چکیده کاملاین مطالعه به بررسی تأثیر تغییرات فصلی بر تنوع قارچهای اندوفیت بر روی شاخ و برگ درختان Grevillea robusta در امتداد بزرگراهها در هاواسا، اتیوپی میپردازد. با 765 جدایه قارچی که به 73 مورفوتاکسای متمایز طبقه بندی شدند، 41/90٪ در هشت جنس شناخته شده شناسایی گردیدند، و 58/9٪ ناشناس باقی ماندند. شایان ذکر است، Phoma و Pestalotiopsis به عنوان متنوعترین جنسها ظاهر شدند که به ترتیب 13 و 11 مورفوتاکسا را نشان دادند. در حالی که Alternaria و Xylaria تنوع کمتری را با 3 و 2 morphotaxa نشان دادند. این تحقیق تعداد و تنوع قارچها را در درختانی که در محیطهای آلودهتر قرار داشتند، برگهای نمونهبرداری شده در فصول خشک، آنهایی که علائم بیماری را بروز نمودند، بخشهای پایین برگ و نمونههای میانی را نشان داد. این یافتهها بر مجموعهای غنی از قارچهای اندوفیت مرتبط با برگهای Grevillea robusta در مزارع کنار جادهای در هاواسا تأکید میکند و نیاز به کاوش بیشتر در پویایی این جامعه قارچی است. درک نقش محوری این قارچهای اندوفیت در سلامت درختان، انعطافپذیری اکوسیستم و کاربردهای بالقوه در کشاورزی، جنگلداری و بیوتکنولوژی ضروری است. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
2 - اثرات نانوذرات کیتوزان بر موش های آلوده به لیستریا مونوسیتوژنز
سارا کاظمی راد میر ساسان میرپور مهدی آسمار محمدرضا رضویشماره 4 , دوره 1 , زمستان 1401لیستریا مونوسیتوژنز عامل بیماری لیستریوز است که عوارض زیادی به خصوص در زنان باردار دارد. با توجه به مقاومت آنتی بیوتیکی این باکتری، تلاش های زیادی برای معرفی ترکیبات دارویی مختلف از جمله نانوذرات مبتنی بر ترکیبات بیولوژیکی صورت گرفته است. این تحقیق با هدف بررسی مکانیسم چکیده کامللیستریا مونوسیتوژنز عامل بیماری لیستریوز است که عوارض زیادی به خصوص در زنان باردار دارد. با توجه به مقاومت آنتی بیوتیکی این باکتری، تلاش های زیادی برای معرفی ترکیبات دارویی مختلف از جمله نانوذرات مبتنی بر ترکیبات بیولوژیکی صورت گرفته است. این تحقیق با هدف بررسی مکانیسم اثر نانوذرات کیتوزان بر لیستریا مونوسایتوژنز در بدن یک موجود زنده انجام شد. سویه استاندارد لیستریا مونوسایتوژنز (ATCC 7644) در آزمایشگاه بیمارستان دی (ایران) تهیه و مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. باکتری ها بر اساس آزمایش های بیوشیمیایی مورد بررسی قرار گرفتند. سپس فعالیت ضد باکتریایی غلظتهای 4.88 تا 5000 میکروگرم بر میلیلیتر نانوذرات کیتوزان در برابر استاندارد لیستریا مونوسیتوژنز (ATCC 7644) با روشهایی مورد بررسی و کمترین غلظتهای بازدارنده و باکتریکشی (به ترتیب MIC و MBC) محاسبه شد. اثرات غلظتهای مختلف نانوذرات و آمپیسیلین در موشهای آلوده به باکتری نیز مورد بررسی قرار گرفت. در موشهای آلوده، اثر درمانی با افزایش غلظت نانوذرات افزایش یافت و غلظت 156.25 میکروگرم بر میلیلیتر در مقایسه با سایر تیمارها مؤثرترین بود. همچنین، آمپی سیلین (10 میکروگرم) و نانوذرات کیتوزان با غلظت 39.06 میکروگرم بر میلیلیتر تقریباً اثر درمانی مشابهی داشتند. با شناسایی به موقع آلودگی لیستریا در زنان باردار و استفاده مناسب از نانوذرات کیتوزان به جای داروهای رایج، می توان راه حل جدیدی برای درمان لیستریوز پیدا کرد. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
3 - جداسازی و شناسایی خصوصیات باکتری های همزیست- بیماریزا جدا شده از گیاه شبدر ایرانی
نازنین موذن پور منیر دودی لادن رحیم زاده ترابی محمد حسین پزندهشماره 4 , دوره 1 , زمستان 1401بیماریهای گیاهی چه به صورت همهگیریهای نامنظم و چه آسیبهای منظم اثرات مخربی بر گیاهان و عملکرد آنها میگذارند. باکتری هایی نظیر اروینیا، پکتوباکتریوم و کلبسیلا دارای محدوده میزبانی بسیار گسترده ای بوده و می توانند برای تعداد زیادی از گیاهان زینتی و زراعی نقش بیماریزا چکیده کاملبیماریهای گیاهی چه به صورت همهگیریهای نامنظم و چه آسیبهای منظم اثرات مخربی بر گیاهان و عملکرد آنها میگذارند. باکتری هایی نظیر اروینیا، پکتوباکتریوم و کلبسیلا دارای محدوده میزبانی بسیار گسترده ای بوده و می توانند برای تعداد زیادی از گیاهان زینتی و زراعی نقش بیماریزایی داشته باشند یا حتی یک رابطه بیماریزای همزیستی با گیاه برقرار کنند. این دسته باکتریهای مولد انواع بیماری های گیاهی قادرند بر روی غده های بذری و جامعه میکروبی خاک اثر بگذارند. این مطالعه با هدف بررسی و تحلیل مولکولی پاتوژن های همزیست خاص مرتبط با گیاه شبدر ایرانی از منطقه شهرضا در بخش جنوبی اصفهان انجام شد. در این تحقیق، نمونههای گیاه شبدر ایرانیTrifolium resupinatum که دارای ساختار ریشههای گرهدار بودند، ابتدا جداسازی و سپس جهت غربالگری از نقاط مختلف منطقه جنوب اصفهان (شهرضا) جمع آوری و به آزمایشگاه تحقیقاتی واحد فلاورجان منتقل شدند. از محیط کشت مخمر مانیتول آگار برای شناسایی اولیه ایزوله ها استفاده شد. پس از آن نمونههای باکتریایی با استفاده از تستهای مورفولوژیکی، بیوشیمیایی و مولکولی (روش کلنی-PCR) مورد شناسایی قرار گرفتند. یافته های این مطالعه ویژگی های مولکولی سه گونه مجزا به نام های اروینیا کریزانتمی، پکتوباکتریوم کاروتووروم و کلبسیلا اکسی توکا را مشخص کرد. نتایج نشان داد که دو گونه اول یک رابطه بیماریزای همزیستی با گیاه شبدر ایرانی T. resupinatum نشان دادند، در حالی که گونه دوم تهدیدی برای سلامت انسان به عنوان یک پاتوژن بود. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
4 - میکروپلاستیک های دریایی سطحی جدید برای کلونیزیشن، تشکیل بیوفیلم و تجزیه زیستی
ناهید معصومی سید رضا حسینی دوست مرتضی عزیزالهی مریم میان آبادیشماره 2 , دوره 1 , تابستان 1401میکروپلاستیک ها (MPs) در اقیانوس حامل مجموعه های میکروبی هستند و هنگامی که در اقیانوس رها می شوند به سرعت توسط میکروب ها احاطه می شوند. نقش برهمکنش های میکروبی با میکروپلاستیک ها در اکوسیستم های دریایی اخیراً به تفصیل بررسی شده و حضور میکروپلاستیک ها در محیط های دریایی چکیده کاملمیکروپلاستیک ها (MPs) در اقیانوس حامل مجموعه های میکروبی هستند و هنگامی که در اقیانوس رها می شوند به سرعت توسط میکروب ها احاطه می شوند. نقش برهمکنش های میکروبی با میکروپلاستیک ها در اکوسیستم های دریایی اخیراً به تفصیل بررسی شده و حضور میکروپلاستیک ها در محیط های دریایی توجه جهانی را به خود جلب کرده است. میکروپلاستیک ها جوامع بیوفیلم های میکروبی را که از محیط اطراف متمایز هستند، انتقال می دهند. اگرچه میکروارگانیسمهای کلونیزه شده روی میکروپلاستیک ها پلاستیک برای سرنوشت آنها در اکوسیستمهای مختلف مهم هستند، اما تأثیر آن بر سرنوشت آنها تا حد زیادی ناشناخته است. در این بررسی، ما بر ایجاد بیوفیلمهای خاص پلاستیکی (Plastisphere) تمرکز کردیم. غنی سازی باکتری های بیماری زا همراه با عملکردمیکروپلاستیک ها و تخریب میکروبی میکروپلاستیک ها در محیط دریایی، درک بهتری از گسترش پلاستیکره و بیوفیلم در محیطهای دریایی ارائه میدهد و در مورد تجزیه زیستی پلاستیک ها بحث میکند. همچنین، شناسایی بالقوه بیماریزا در پلاستی کره در نظر گرفته شده است. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
5 - بررسی اثرات ضدباکتریایی عصاره متانولی جوزهندی علیه جدایه های کلبسیلا پنومونیه و اسینتوباکتر بومانی مولد بتالاکتاماز وسیع الطیف
الهام نیکویی اشرف کریمی نیکشماره 4 , دوره 1 , زمستان 1401افزایش سویه های مختلف باکتریایی مقاوم به آنتی بیوتیک های مختلف تبدیل به یکی از نگرانی های اصلی سازمان بهداشت جهانی شده است. اخیرا مقاومت باکتریایی از طریق تولید بتالاکتامازهای با طیف وسیع در حال افزایش است و به عنوان یک مشکل درمانی جهانی مطرح می شود لذا تلاش برای اس چکیده کاملافزایش سویه های مختلف باکتریایی مقاوم به آنتی بیوتیک های مختلف تبدیل به یکی از نگرانی های اصلی سازمان بهداشت جهانی شده است. اخیرا مقاومت باکتریایی از طریق تولید بتالاکتامازهای با طیف وسیع در حال افزایش است و به عنوان یک مشکل درمانی جهانی مطرح می شود لذا تلاش برای استفاده از داروهای با منشا گیاهی، برضد باکتری های با مقاومت دارویی اهمیت ویژه ای یافته است.هدف از این مطالعه تعیین اثرات ضدباکتریایی عصاره متانولی جوزهندی علیه جدایه های کلبسیلا پنومونیه و اسینتوباکتر بومانی مولد بتالاکتاماز وسیع الطیف انجام گرفت. برای تهیه عصاره متانولی گیاه از روش ماسراسیون استفاده شد سپس عصاره با کاغذ واتمن شماره یک فیلتر ، و با استفاده از سیستم تقطیر در خلا دوار تغلیظ و خشک گردید. غلظتهای مختلف 80، 40، 20، 10، 5، 5/2، 25/1 و 625/0 میلی گرم بر میلی لیتر از عصاره در حلال دیمتیل سولفوکساید و متانول با حجم برابر تهیه گردید.از مجموع 100 ایزوله باکتریایی، جدایههای مولد بتالاکتاماز به روش فنوتیپی با دیسکهای آنتیبیوتیکی سفوتاکسیم و دیسک ترکیبی سفوتاکسیم/کلاولونیک اسید شناسایی شدند. بر اساس نتایج حاصله، از 60 باکتری کلبسیلا پنومونیه 33 درصد(20 ایزوله) و از 40 باکتری اسینتوباکتر بومانی 50درصد(20ایزوله) از جدایهها مولد بتالاکتاماز بودند. فعالیت ضدباکتریایی بر علیه 20 ایزوله از کلبسیلا پنومونیه و 20ایزوله از اسینتوباکتر بومانی مولد بتالاکتاماز به روش انتشار چاهک بررسی شد. پس از انکوباسیون به مدت 24 ساعت در دمای 37 درجه سانتیگراد میزان حساسیت باکتریها، با اندازهگیری قطر هاله بازدارندگی از رشد تعیین شد. کلیه ایزولههای کلبسیلا پنومونیه و اسینتوباکتر بومانی به عصاره گیاه جوزهندی حساسیت نشان دادند و میانگین حداقل غلظت بازدارندگی از رشد نسبت به کلبسیلا پنومونیه و اسینتوباکتر بومانی مولد بتالاکتاماز به ترتیب 10 و 5 میلیگرم بر میلیلیتر بود. بر اساس نتایج حاصل از این پژوهش، می توان نتیجه گرفت عصارهی گیاه جوزهندی در شرایط آزمایشگاهی قابلیت مهار باکتری های کلبسیلا و اسینتوباکتر را دارد و بر این اساس شاید بتوان در آینده با تحقیقات بیشتر و شناسایی ترکیبات موثر، از این عصاره، به عنوان جایگزین آنتی بیوتیکی جهت درمان ، استفاده کرد. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
6 - مشخصه یابی نانو ساختارهای اکسید ساماریوم خالص و دارای گرافن تهیه شده به روش هیدرو ترمال به عنوان یک عامل بالقوه ضد میکروبی
عباس باقری خطیبانی سمیه سعادت نیاول سمانه رسولی جمنانی حسین میلانی مقدمشماره 5 , دوره 2 , بهار 1402کاربردهای فریبنده و چشمگیر مواد مبتنی بر اکسید ساماریم در علم نیمه هادی ها، علاقه به سنتز و مطالعه خواص فیزیکی آنها را ایجاد کرد. بنابراین، پس از تهیه اکسید ساماریوم خالص و پودرهای گرافن/اکسید ساماریوم از طریق تکنیک هیدروترمال با استفاده از پراش اشعه ایکس (XRD)، میکروسک چکیده کاملکاربردهای فریبنده و چشمگیر مواد مبتنی بر اکسید ساماریم در علم نیمه هادی ها، علاقه به سنتز و مطالعه خواص فیزیکی آنها را ایجاد کرد. بنابراین، پس از تهیه اکسید ساماریوم خالص و پودرهای گرافن/اکسید ساماریوم از طریق تکنیک هیدروترمال با استفاده از پراش اشعه ایکس (XRD)، میکروسکوپ الکترونی روبشی نشر میدانی (FESEM)، طیفسنجی فروسرخ تبدیل فوریه (FTIR)، طیفسنجی رامان، و طیفسنجی UV-Visible، خواص ساختاری، نوری و مورفولوژیکی نمونه ها مورد ارزیابی قرار گرفته است. با استفاده از XRD، ثابت های شبکه و برخی پارامترهای ساختاری مرتبط تعیین شد. تغییر گاف نواری اپتیکی نیز با کمک جذب محاسبه شده است. دادههای XRD نشان داد که فاز مکعبی اکسید ساماریوم در هر دو نمونه غالب است، حتی اگر یک پیک پراش شدید گرافن در نمونه گرافن/اکسید ساماریوم مشاهده شود. تجزیه و تحلیل SEM، Raman و FTIR، اثرات افزودن گرافن را بر شبکه اصلی اکسید ساماریوم نشان داد. علاوه بر این، کاهش گاف نواری اپتیکی ناشی از گرافن نیز قابل توجه بود. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
7 - آنالیز این-سیلیکو از فضای برهمکنش شیمیایی ایجاد شده توسط دیکلوفناک سدیم و رسپتورهای کوروم سنسینگ Las در سودوموناس آئروژینوزا
شیرین شاهنگیانشماره 4 , دوره 1 , زمستان 1401بیشتر خصوصیات بیماری زایی سودوموناس آئروژینوزا که یک باکتری گرم منفی فرصت طلب است، توسط سیستم های سنجش حد نصاب آن کنترل می شود. بنابراین، مسدود کردن مسیرهای سنجش حد نصاب می تواند به عنوان یک استراتژی مناسب برای مقابله با سودوموناس آئروژینوزا استفاده شود. داروهای ضد الته چکیده کاملبیشتر خصوصیات بیماری زایی سودوموناس آئروژینوزا که یک باکتری گرم منفی فرصت طلب است، توسط سیستم های سنجش حد نصاب آن کنترل می شود. بنابراین، مسدود کردن مسیرهای سنجش حد نصاب می تواند به عنوان یک استراتژی مناسب برای مقابله با سودوموناس آئروژینوزا استفاده شود. داروهای ضد التهاب غیر استروئیدی از جمله محبوب ترین مواد شیمیایی مورد استفاده در درمان عفونت های میکروبی هستند. در مطالعه حاضر، فضای برهمکنش شیمیایی دیکلوفناک سدیم، یک داروی ضدالتهاب غیراستروئیدی معروف، در مقابله با دو گیرنده اصلی سیستم سنجش حد نصاب در سودوموناس آئروژینوزا (LasI و LasR) بررسی شده است. ساختارهای بهینه شده لیگاندها و گیرندهها با استفاده از AutoDock Vina که بخشی از نرمافزار PyRx است، تحت شبیهسازی داکینگ مولکولی قرار گرفتند. نتایج به دستآمده از داکینگ مولکولی و تحلیل فضای برهمکنشی، انرژیهای اتصال مناسبی را برای دیکلوفناک سدیم در مقابله با هر دو گیرنده نشان داد. اگرچه، انرژی اتصال دیکلوفناک سدیم برای گیرنده LasR منفی تر بود که نشان دهنده میل ترکیبی بالاتر دیکلوفناک سدیم برای این گیرنده است. در نهایت، بر اساس نتایج بدست آمده، پیشنهاد میشود که دیکلوفناک سدیم پتانسیل خوبی برای اتصال به هر دو گیرنده دارد، که این به نوبه خود می تواند با کاهش بیان برخی از ژن های مربوط به فاکتورهای بیماری زایی همراه باشد. بنابراین، دیکلوفناک سدیم را می توان به عنوان یک مهارکننده بالقوه برای سیستم حد نصاب در سودوموناس آئروژینوزا در نظر گرفت. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
8 - بهینه سازی تولید آنزیم های پلی فنل اکسیداز و پراکسیداز توسط سویه های بومی باسیلوس جداسازی شده از چای تخمیری
محمد فائزی قاسمیشماره 1 , دوره 1 , بهار 1401چای (Camellia sinensis) گونه ای از درختچه های همیشه سبز یا درختان کوچک از خانواده گیاهان گلدار Theaceae است. یکی از مراحل اصلی در تولید چای سیاه، فرآیند تخمیر است که در آن باکتری ها می توانند نقش داشته باشند. این مطالعه با هدف استفاده از روش تغییر یک فاکتور در یک زمان چکیده کاملچای (Camellia sinensis) گونه ای از درختچه های همیشه سبز یا درختان کوچک از خانواده گیاهان گلدار Theaceae است. یکی از مراحل اصلی در تولید چای سیاه، فرآیند تخمیر است که در آن باکتری ها می توانند نقش داشته باشند. این مطالعه با هدف استفاده از روش تغییر یک فاکتور در یک زمان (OFAT) و طراحی آزمایش ها به روش تاگوچی برای بهینه سازی تولید پلی فنل اکسیداز (PPO) و پراکسیداز (POD) توسط باسیلوس گونه انجام شد. نتایج نشان داد که ساکارز و گلوکز بیشترین تأثیر را بر تولید آنزیم های پلی فنل اکسیداز و پراکسیداز توسط سویههای باسیلوس جدا شده از چای کاملاً تخمیر شده از خود نشان دادند.;این سویه هابه ترتیب Bacillus sp. (TB3);و B. licheniformis (TB14);بودند. علاوه بر این، نتایج نشان داد که بهترین منابع نیتروژن برای تولید PPO توسط Bacillus sp. (TB3) و POD توسط licheniformis (TB14) B.; به ترتیب نیترات سدیم و کربنات آمونیوم بودند. بر اساس نتایج بهدستآمده، اجزای محیط برای تولید PPO توسط Bacillus sp. (TB3) در pH 7 به شرح زیر بود: 0.5٪ ساکارز، 1٪ پپتون، 0.8٪ عصاره مخمر، 0.2٪ کازئین هیدرولیز شده، 00.2٪ پتاسیم دی هیدروژن فسفات،0.005٪ از منیزیم سولفات 1٪ و هپتاهیدرات. نیترات سدیم. علاوه بر این، محیط کشت بهینه برای تولید POD توسط B. licheniformis (TB14) در pH 7 به شرح زیر بود: 0.3٪ گلوکز، 1٪ پپتون، 0.8٪ عصاره مخمر، 0.2٪ کازئین هیدرولیز شده، 0.02٪ درصد پتاسیم دی هیدروژن فسفات و0.005 درصد هپتا هیدرات سولفات منیزیم. افزایش تولید آنزیم PPO و POD به ترتیب حدود 8 و 6 برابر بیشتر از محیط کشت پایه بود. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
9 - تجزیه و تحلیل in silico پتانسیل ممانعت کنندگی داروهای ضد التهابی غیر استروئیدی اصلی علیه مسیر Las کروم سنسینگ در سودموناس آئروژینوزا
حسین زحمتکش بهنام راستیشماره 3 , دوره 1 , پاییز 1401ظهور مقاومت دارویی، شکست درمانی و توسعه عفونت های سودوموناس آئروژینوزا در درجه اول به تشکیل بیوفیلم و عوامل حدت وابسته به سیستم سنجش حد نصاب نسبت داده می شود. پتانسیل ضد میکروبی برخی از داروهای ضد التهاب غیر استروئیدی مانند ایبوپروفن در مطالعات آزمایشگاهی مشخص شده است چکیده کاملظهور مقاومت دارویی، شکست درمانی و توسعه عفونت های سودوموناس آئروژینوزا در درجه اول به تشکیل بیوفیلم و عوامل حدت وابسته به سیستم سنجش حد نصاب نسبت داده می شود. پتانسیل ضد میکروبی برخی از داروهای ضد التهاب غیر استروئیدی مانند ایبوپروفن در مطالعات آزمایشگاهی مشخص شده است. در اینجا، یک تجزیه و تحلیل داکینگ برای بررسی برهمکنش میان هفت داروی ضد التهاب غیر استروئیدی و پروتئین های سیستم Las انجام شد. در ابتدا، ساختار سه بعدی NSAID های منتخب (دیکلوفناک سدیم، ایبوپروفن، کتوپروفن، مفنامیک اسید، ملوکسیکام، ناپروکسن و تنوکسیکام) و لیگاند طبیعی LasR (3-oxo-C12-HSL) از پایگاه داده PubChem دریافت شد. همچنین ساختارهای کریستالی LasI Synthase و پروتئین فعال کننده رونویسی LasR از بانک داده پروتئین به دست آمد. سپس، تجزیه و تحلیل اتصال مولکولی با استفاده از نرم افزار AutoDock Vina برای بررسی توانایی NSAID های انتخاب شده برای مهار گیرنده LasI/LasR مورد استفاده قرار گرفت. بر اساس یافتههای ما، اکثر NSAIDهای انتخاب شده برهمکنشهای مطلوبی با پروتئینهای LasI/R نشان دادند. علاوه بر این، کتوپروفن قویترین برهمکنشها را با هر دو پروتئین نشان داد. به طور خلاصه، این کار نشان می دهد که NSAID ها، به ویژه کتوپروفن و ناپروکسن، پتانسیل امیدوارکننده ای به عنوان کاندید برای تحقیقات بیشتر آزمایشگاهی و درون تنی برای مهار مدارهای کروم سنسینگ در سودوموناس آئروژینوزا را دارند پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
10 - بررسی شدت اثر تنش های محیط بر روی رشد ، پروفایل پروتئینی و ویژگیهای بیوشیمیایی سودوموناس آئروژینوزا ATCC 27853
آزیتا تیشه یار محمد فائزی قاسمی نور امیر مظفریشماره 2 , دوره 1 , تابستان 1401سودوموناس آئروژینوزا عامل اصلی عفونتهای بیمارستانی و مقاوم به اکثر آنتیبیوتیکها است. این مطالعه باهدف بررسی تأثیر شرایط مختلف تنش بر رشد، مشخصات پروتئینی و ویژگیهای بیوشیمیایی این باکتری انجام شد. سلولهای 27853 Pseudomonas aeruginosa ATCC در فاز لگاریتمی در معرض چکیده کاملسودوموناس آئروژینوزا عامل اصلی عفونتهای بیمارستانی و مقاوم به اکثر آنتیبیوتیکها است. این مطالعه باهدف بررسی تأثیر شرایط مختلف تنش بر رشد، مشخصات پروتئینی و ویژگیهای بیوشیمیایی این باکتری انجام شد. سلولهای 27853 Pseudomonas aeruginosa ATCC در فاز لگاریتمی در معرض تنشهای متفاوت مانند غلظت سوکروز، اتانول، اسید، فشار اسمزی و CoCl2 قرار گرفتند. پس از هر شرایط تنش، رشد و بقای سلولهای باکتری تعیین شد. مشاهدات میکروسکوپی تغییرات مورفولوژی را در شرایط مختلف تنش نشان داد. 27853 P. aeruginosa ATCC تا 3 pH ،;(V/V) % 55اتانول و;CoCl2;را تا;(W/V) %7 تحمل کرد ولی فراتر از این مقادیر، باکتری توانایی خود را برای زنده ماندن از دست داد. حداکثر تحمل به سوکروز حدود 35 درصد (W/V) بود. نتایج نشان داد که شرایط تنشهای مختلف نمیتواند بر ویژگیهای اصلی بیوشیمیایی تأثیر بگذارد. تصویر میکروسکوپ الکترونی روبشی سلولهای; P. aeruginosa ATCC 27853که در معرض شرایط تنش مختلف قرار گرفتند، تغییرات گستردهای را در مورفولوژی سلولها نشان داد. علاوه بر این، پس ازتیمار با تنشهای مختلف، تغییرات قابلتوجهی در الگوی کلی پروتئین P. aeruginosa 27853;براساس تجزیهوتحلیل SDS-PAGE مشاهده شد. میتوان نتیجه گرفت که تنشهای شدید محیطی تأثیرات زیادی بر الگوی رشد، ویژگیهای فنوتیپی والگوی پروتئین این باکتری;دارد. اگر تنشها بهیکباره ایجاد شوند، باعث مرگ میشوند، اما اگر بهآرامی تحت تأثیر قرار گیرند و برای مدت طولانیتر، اکثر باکتریها قادر خواهند بود قسمتهای آسیبدیده را ترمیم کنند و رشد دوباره از سر گرفته شود. پرونده مقاله