جداسازی و شناسایی خصوصیات باکتری های همزیست- بیماریزا جدا شده از گیاه شبدر ایرانی

محورهای موضوعی : Biotechnological Journal of Environmental Microorganisms

نازنین موذن پور ¹ , منیر دودی ² , لادن رحیم زاده ترابی ³ , محمد حسین پزنده ⁴

1 - گروه میکروبیولوژی ، واحد فلاورجان، دانشگاه آزاد اسلامی ، اصفهان ، ایران
2 - گروه میکروبیولوژی ، واحد فلاورجان ، دانشگاه آزاد اسلامی ، اصفهان ، ایران
3 - گروه میکروبیولوژی ، واحد فلاورجان ، دانشگاه آزاد اسلامی ، اصفهان ، ایران
4 - گروه داروسازی و سم شناسی ، دانشکده داروسازی ، دانشگاه علوم پزشکی همدان ، همدان ، ایران

تاریخ دریافت : 1401/09/18 تاریخ پذیرش : 1401/10/04 تاریخ انتشار : 1401/10/06

کلید واژه: باکتری های بیماریزا, همزیستی , گیاه شبدر, رفتار فنوتیپک , رفتار ژنوتیپیک ,

چکیده مقاله :

بیماری‌های گیاهی چه به صورت همه‌گیری‌های نامنظم و چه آسیب‌های منظم اثرات مخربی بر گیاهان و عملکرد آنها می‌گذارند. باکتری هایی نظیر اروینیا، پکتوباکتریوم و کلبسیلا دارای محدوده میزبانی بسیار گسترده ای بوده و می توانند برای تعداد زیادی از گیاهان زینتی و زراعی نقش بیماریزایی داشته باشند یا حتی یک رابطه بیماریزای همزیستی با گیاه برقرار کنند. این دسته باکتریهای مولد انواع بیماری های گیاهی قادرند بر روی غده های بذری و جامعه میکروبی خاک اثر بگذارند. این مطالعه با هدف بررسی و تحلیل مولکولی پاتوژن های همزیست خاص مرتبط با گیاه شبدر ایرانی از منطقه شهرضا در بخش جنوبی اصفهان انجام شد. در این تحقیق، نمونه‌های گیاه شبدر ایرانیTrifolium resupinatum که دارای ساختار ریشه‌های گره‌دار بودند، ابتدا جداسازی و سپس جهت غربالگری از نقاط مختلف منطقه جنوب اصفهان (شهرضا) جمع آوری و به آزمایشگاه تحقیقاتی واحد فلاورجان منتقل شدند. از محیط کشت مخمر مانیتول آگار برای شناسایی اولیه ایزوله ها استفاده شد. پس از آن نمونه‌های باکتریایی با استفاده از تستهای مورفولوژیکی، بیوشیمیایی و مولکولی (روش کلنی-PCR) مورد شناسایی قرار گرفتند. یافته های این مطالعه ویژگی های مولکولی سه گونه مجزا به نام های اروینیا کریزانتمی، پکتوباکتریوم کاروتووروم و کلبسیلا اکسی توکا را مشخص کرد. نتایج نشان داد که دو گونه اول یک رابطه بیماریزای همزیستی با گیاه شبدر ایرانی T. resupinatum نشان دادند، در حالی که گونه دوم تهدیدی برای سلامت انسان به عنوان یک پاتوژن بود.

چکیده انگلیسی:

Plant diseases have a significant impact on plants and their crop yields, causing extensive epidemics and recurrent damages that result in profound negative effects. Bacteria such as Erwinia, Pectobacterium, and Klebsiella have a very wide host range and can play a pathogenic role for a large number of ornamental and agricultural plants or even establish a symbiotic relationship with the plant. This group of bacteria that cause all kinds of plant diseases are able to affect seed tubers and the soil microbial community. The objective of this investigation was to identify and classify the distinct symbiotic pathogens associated with Trifolium resupinatum plants obtained from the Shahreza region located in the southern part of Isfahan, Iran. In this investigation, T. resupinatum specimens harboring nodular root structures were initially identified and subsequently retrieved from various locations in the southern region of Isfahan (Shahreza), before being transported to the laboratory. The Yeast Mannitol Agar (YMA) medium underwent a cultivation procedure, subsequent to which the bacterial samples were subjected to molecular identification utilizing morphological and biochemical tests. Additionally, the colony-PCR technique was employed to achieve definitive identification. This study examined the molecular features of three distinct species namely Erwinia chrysanthemi, Pectobacterium carotorum, and Klebsiella oxytoca. It was revealed that the former two species exhibited a symbiotic pathogenic relationship with the T. resupinatum plant, while the latter species posed a threat to human health as a pathogen.