بررسی فراوانی ژن¬های اینتگرون کلاس 1 ، 2 و 3 در ایزوله¬های اشریشیا¬کلی یوروپاتوژن جدا شده از بیماران دیابتی در شهرستان شهرکرد
محورهای موضوعی : میکروبیولوژینگین دلی سرراکی 1 , فاطمه خداوردی پور 2 , نازیلا ارباب سلیمانی 3
1 - دانش آموخته کارشناسی ارشد میکروبیولوژي، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران
2 - مرکز تحقیقات تغذیه و محصولات ارگانیک، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران.
3 - گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد دامغان، دامغان، ایران
کلید واژه: دیابت, اینتگرون, عفونت ادراری, اشریشیا کلی یوروپاتوژن,
چکیده مقاله :
سویه های اشریشیا کلی یوروپاتوژن شایعترین سویههای بیماریزا در انسان میباشند. مهمترین خصوصیت سویههای اشریشیا کلی یوروپاتوژن، توانایی کلونیزه شدن آنها در سطح سلولهای یورواپیتلیوم میزبان میباشد. مطالعه حاضر بر روی 300 نمونه ادرار بیماران مبتلا به دیابت ملیتوس نوع 2 مشکوک به عفونت ادراری، مراجعه کننده به آزمایشگاه های تشخیص طبی شهرستان شهرکرد در سال 1394 صورت گرفت. 5 تا 10 سی سی نمونه ادرار بیماران دیابتی در ظروف استريل جمع آوری و با استفاده از لوپ کالیبره، 01/0 میلی لیتر از نمونه ادرار سانتریفوژ نشده در شرايط استريل بر روي محيط مک کانکی آگار کشت داده شد. در این تحقیق پس از انجام آزمون PCR به منظور تشخیص قطعی باکتری اشریشیا کلی، حضور توالی ژن 16srRNA تمامی نمونه ها مورد بررسی قرار گرفتند و در حضور پرایمرهای اختصاصی به فراوانی ژن های اینتگرون کلاس 1، 2 و 3 پرداخته شد. از 300 بیمار دیابتی مورد بررسی در 100 نمونه عفونت ادراری تشخیص داده شد که در 51 نمونه (51 درصد) آلودگی به اشریشیا کلی گزارش شد. از 51 ایزوله اشریشیاکلی مورد بررسی اینتگرون کلاس 1 در 30 ایزوله (82/58 درصد)، اینتگرون کلاس 2 در 20 ایزوله (21/39 درصد) و اینتگرون کلاس 3 در 5 ایزوله (80/9 درصد) گزارش گردید. بیشترین مقاومت به آمپی سیلین (66/66 درصد) و کمترین مقاومت به نیتروفورانتوئین (96/1 درصد) گزارش شده است. در تجزیه و تحلیل آماری بین مقاومت به جنتامایسین، ایمیپنم و نیتروفورانتوئین با اینتگرون کلاس 1 ارتباط آماری معنی داری مشاهده گردید(05/0 p-value<).
The most common uropathogenic strains of Escherichia coli strains are pathogenic in humans. The most important feature of uropathogenic Escherichia coli strains, the ability of colonization on the surface of host is the euro epithelium cells.
The present study took place on 300 urine samples of patients with diabetes mellitus type 2 suspected urinary tract infections, referred to clinical laboratories of Shahrekord city, Iran in 1394. 5 to 10 cc of urine samples from diabetic patients were collected and by calibrated loop, 0.01 ml of urine cultured in Mac kanky agar media. After performing PCR test were examined to 16srRNA Escherichia coli gene, all samples tested for the presence of class 1, 2 and 3 integron genes at the present of specific primers.
Of 300 diabetic patients UTI diagnosed in 100 samples. In 51 patients (51%) E.coli was diagnosed. Results indicate that class 1 integron was seen in 30 isolations (58.82%), class 2 in 20 (39.2%) and the third class in 5 ones (9.8%). Most resistance reported to ampicillin (66.66%) and the lowest resistance reported to Nitrofurantoin (1.96%).
Based on statistical analysis had a significant relationship was observed between resistance to gentamicin, imipenem and Nitrofurantoin with class 1 integron (p-value< 0/05).
1. Melanitou E, Fain P, Eisenbarth G. Genetics of Type 1A (immune mediated) diabetes. Journal of Autoimmunity 2003; 21 (2): 93–98.
2. Islami G, Goodarzi S, Fallah F, Goodarzi M. [Prevalence of Escherichia coli and Klebsiella in the integron in children with urinary tract infection, multi-drug resistant]. Shahid Beheshti University of Medical Sciences and Health Services 2011; 34(1) : 61-65.
3. Shaw JE, Sicree RA, Zimmet PZ. Global estimates of the prevalence of diabetes for 2010 and 2030. Diabetes Res Clin Pract 2010; 87 (1): 4-14.
4. Balasoiu D, van Kessel KC, Van kats-Renaud HJ, Collet J, Hoepolman AI. Granulocytes function in women with diabetes and asymptomatic bacteriuria. Diabetes Care 1997; 20: 393–395.
5. Bertoni AG, Saydah S. Diabetes and the risk of infection related mortality in the US. Diabetes Care 2001; 24: 1004–1009.
6. Pozzilli P, Lesli RDG. Infections and diabetes: Mechanisms and prospects for prevention. Diabet Med 1994; 11: 935-941.
7. Carton JA, Maradona JA, Nuno FJ, Fernandez-Alvarez R, Perez-Gonzalez F, et al. Diabetes mellitus and bacteremia: A comparative study between diabetic and non diabetic patients. Eur J Med 1992; 1: 281-287.
8. Boyko EJ, Fihn SD, Scholes D, Abraham L, Monsey B. Risk of urinary tract infection and asymptomatic bacteruria among diabetes and nondiabetic postmenopausal women. J Am Epidemiol 2005; 161: 557-564.
9. Stapleton A. Urinary tract infection in patients with diabetes. Am J Med 2002;113(1A): 80- 84.
10. Hosking DJ, Bennet T, Hampton JR. Diabetic autonomic neuropathy. J Diabetes Care 1978; 27: 1043-54.
11. Ronald A, Ludwig E. Urinary tract infection in adults with diabete. J Antimicrobial Agent 2001; 17: 287-289.
12. Brown JS, Wessells H, Chancellor MB, Howards SS, Stamm WE, et al. Urologic complication of diabetes. Diabetes Care 2005; 8(1): 177–185.
13. Thomas GN, Jiang CQ, Taheri S, Xiao ZH, Tomlinson B, et al. A systematic review of life style modification and glucose intolerance in the prevention of type 2 diabetes. Cur Diabetes Rev 2010; 6: 378-87.
14. Kargar M, Daneshvar M, Homayoun M. [Surveillance of virulence markers and antibiotic resistance of shiga toxin purchase in Shiraz]. ISMJ 2011; 14: 76-83.
15. Wilson BA, Salyers AA, Whitt DD. Bacterial Pathogenesis a Molecular Approach. 3rd ed Washington DC ASM Press 2010; 91-11.
16. Rowe-Magnus DA, Guerout AM, Ploncard P, Dychinco B, Davies J, Mazel D. The evolutionary history of chromosomal super integrons provides an ancestry for multiresistant integrons. Proc Natl Acad Sci USA 2001; 98(2):652-657.
17. Stokes HT, Hall RM. A novel family of potentially mobile DNA elements encoding site-specific gene-integration functions: integrons. Molecular microbiology 1989; 3(12):1669-83.
18. Stalder T, Barraud O, Casellas M, Dagot C, Ploy MC. Integron involvement in environmental spread of antibiotic resistance. Fron Microbiol 2012; 3(119):1-14.
19. Barlow RS, Gobius KS. Diverse class 2 integrons in bacteria from beef cattle sources. J Antimicrob Chemother 2006; 58(6): 1133-1138.
20. Partridge SR, Tsafnat G, Coiera E, Iredell JR. Gene cassettes and cassette arrays in mobile resistance integrons. FEMS microbiology reviews 2009; 33(4):757-84.
21. Clinical Laboratory Stards Institute(CLSI). Performance Stards for Antimicrobial Disk Susceptibility Tests, Approved stard-Ninth Edition (M2-A9). Clinical Laboratory Stards Institute, Wayne, PA. 2006.
22. National Committee for Clinical Laboratory Standards(NCCLS). Methods for disk antimicrobial susceptibility tests for bacteria that grow aerobically. Approved standard M7-A5. Wayne, Pa. 2003.
23. Turton JF, Perry C, Elgohari S, CV. H. PCR characterization and typing of Klebsiella pneumoniae using capsular type-specific, variable number tandem repeat and virulence gene targets. J Med Microbiol. 2010; 59(4):541-7.
24. Kerrn MB, Klemmensen T, Frimodt-Møller N, Espersen F. Susceptibility of Danish Escherichia coli strains isolated from urinary tract infections and bacteraemia, and distribution of sul genes conferring sulphonamide resistance. Journal of Antimicrobial Chemotherapy 2002; 50, 513–516.
25. Schwartz T, Kohnen W, Jansen B, Obst U. Detection of antibiotic resistant bacteria and their resistance genes in wastewater, surface water, and drinking water biofilms. FEMSMicrobiol Eco 2003; 43(2): 325–335.
26. Kümmerer K. Resistance in the environment. J Antimicrob Chemother 2004; 54(3): 311-320.
27. Hussein AI, Ahmed AM, Sato M, Shimamoto T. Characterization of integrons and antimicrobial resistance genes in clinical isolates of Gram-negative bacteria from Palestinian hospitals. Microbiol Immunol 2009; 53(11): 595-602.
28. Machado E, Canton R, Baquero F. Integron content of extended-spectrum-b-lactamase-producing Escherichia colistrains over 12 years in a single hospital in Madrid, Spain. Antimicrob Agents Chemother 2005; 49 (5): 1823-1829.
29. Dillon B, Thomas L, Mohmand G, Zelynski A, Iredell J. Multiplex PCR for screening of integrons in bacterial lysates. J Microbiol Methods 2005; 62(2): 221-232.
30. Farshad Sh, Japoni A, Hosseini M. [Low Distribution of Integrons among Multidrug resistant E.coli Strains Isolate from Children with community-Acquired urinary tract infections in Shiraz, Iran]. Polish J Microbiol 2008; 57 (3): 193-198.
31. Falakian Z, Nikokar I, Nafisi MR, Karimi A M V. [Frequency of class 1 Integrons among Escherichia coli isolates of patients with urinary tract infection Iran]. J Clin Infect Dis 2011; 6 (4): 24.
32. Ranjbaran M, Zolfaghari M, Japoni-Nejad A, Amouzandeh Nobaveh AR, Abtahi H, Nejad M, et al. Molecular investigation of integrons in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated from urinary tract infections. J Mazandaran Univ Med Sci 2013; 23(105):20-7.
33. Islami G, Seyed Javadi S, Fallah H F G. Prevalence of integrons in multi drug resistance E. coli and Kelebsiella isolated from urinary tract infections in children. Pajohandeh 2010; 34(1):61-5.