در این تحقیق بررسی توتومریزاسیون و حالت‌های گذار مولکول 3-آمینو-1H-4،2،1- تری‌آزول-5)4H (- اٌن که حاصل از انتقالات 1و3 پروتون بین اتم های اکسیژن و نیتروژن است با استفاده از محاسبات کوانتومی در سطح محاسباتیDFT-B3LYP/6-311++G(d,p)، در فاز گازی و در محیطی با حضور یک و دو مولکول آب انجام شده است. بدین منظور ساختار بهینه توتومرهای مختلف مولکول مورد نظر بدست آمده‌اند. همچنین با استفاده از محاسبات فرکانس در سطح محاسباتی مشابه، خواص ترمودینامیکی تعادل‌های مختلف توتومری از قبیل E∆، H∆، G∆ وKeq بدست آمده‌اند. سپس با استفاده از روش‌های QST2 و QST3 حالت های گذار تعادل‌های توتومری مختلف مولکول3-آمینو-1H-4،2،1- تری‌آزول-5)4H (- اٌن و مقادیر سینتیکی و ترمودینامیکی آنها محاسبه شده‌اند. اثرات تونل‌زنی نیز بر روی سرعت واکنش‌های مربوطه بررسی شده‌اند. نتایج نشان میدهند ثابت سرعت واکنش‌های توتومری مورد بررسی نسبت به اثرات تونل‌زنی حساسیت بالایی دارند و سرعت واکنش های توتومری در حدود چهار تا پنج برابر افزایش می‌یابند. همچنین محاسبات حالت گذارنشان می دهند در غیاب مولکول‌های آب سد انرژی مقدار بالایی دارد و سرعت واکنش های توتومری عمدتاً بدون حضور کاتالیزور خیلی آهسته بوده به عبارتی انجام‌پذیر نیستند. تفاصيل المقالة

در این تحقیق بررسی توتومریزاسیون و حالت‌های گذار 6-هیدروکسی 5-فلوئوروسیتوزین که حاصل از انتقالات 1و3 پروتون بین اتم های اکسیژن و کربن است با استفاده از محاسبات کوانتومی در سطح محاسباتیDFT-B3LYP/6-311++G(d,p)، در فاز گازی و حلال و در محیطی با حضور یک تا سه مولکول آب انجام شده است. بدین منظور ساختار بهینه توتومرهای مختلف مولکول مورد نظر بدست آمده‌اند. همچنین با استفاده از محاسبات فرکانس در سطح محاسباتی مشابه، خواص ترمودینامیکی تعادل‌های مختلف توتومری از قبیل E∆، H∆، G∆ وKeq بدست آمده‌اند. سپس با استفاده از روش‌های QST2 و QST3 حالت های گذار تعادل‌های توتومری مختلف مولکول -هیدروکسی 5-فلوئوروسیتوزین و مقادیر سینتیکی و ترمودینامیکی آنها محاسبه شده-اند. اثرات تونل‌زنی نیز بر روی سرعت واکنش‌های مربوطه بررسی شده‌اند. نتایج نشان میدهند ثابت سرعت واکنش‌های توتومری مورد بررسی در هر دو فاز گاز و حلال نسبت به اثرات تونل‌زنی حساسیت بالایی دارند و سرعت واکنش های توتومری در حدود پنج برابر یا بیشتر افزایش می‌یابند. همچنین محاسبات حالت گذارنشان می دهند در غیاب مولکول‌های آب سد انرژی مقدار بالایی دارد و سرعت واکنش های توتومری عمدتاً بدون حضور کاتالیزور خیلی آهسته بوده به عبارتی انجام‌پذیر نیستند. تفاصيل المقالة

مطالعه ارتباط کمی ساختار-خاصیت جهت پیش بینی قطبیت برخی از حلال ها با استفاده از توصیف کننده های مکانیک کوانتومی و تکنیک ماشین بردار پشتیبان(SVM) انجام شد. مقادیر تجربی قطبیت برای 69 حلال گردآوری شد. این حلال ها شامل هیدروکربن های اشباع و غیراشباع، حلال های شامل هالوژن، سیانید، نیترو، آمید، سولفید، مرکاپتو، فسفات، استر، اتر و غیره بود. در ابتدا ساختار حلال ها، رسم و گروه مناسبی از توصیف کننده‌ها محاسبه شدند. سپس از روش انتخاب مرحله‌ای برای بدست آوردن بهترین توصیف کننده‌ها که بیشترین ارتباط را با قطبیت حلال مورد نظر داشتند استفاده گردید. در ابتدا مدل خطی رگرسیون خطی چند‌گانه(MLR) ساخته شد. سپس برای به دست آوردن نتایج بهتر، از SVM استفاده گردید. داده های آماری، برتری روش SVM را نسبت به روش MLR نشان می دهد. تفاصيل المقالة

ددر این مطالعه کنفورماسیون‌های مختلف دی‌پپتید For-Ser-Ala-NH2 ‌با استفاده از روشDFT درسطح محاسباتی B3LYP/6-31G(d) مورد بررسی و تحلیل قرار گرفته است. بدین منظور 54 کنفورماسیون حاصل از تغییر زوایای دووجهی زنجیر جانبی سرین و زنجیر اصلی دی‌پپتید Ser-Ala ( و ) را بهینه نموده و با استفاده از محاسبات فرکانس در سطح مشابه ساختارهای پایدار و مقادیر ترمودینامیکی مربوطه بدست آمده-اند. از بین 54 کنفورماسیون‌های مورد بررسی در این پژوهش، 35 کنفورماسیون یافت شدند و 19 کنفورماسیون یافت نشدند. کنفورمرهایی که یافت نشدند به ساختار هندسی دیگری با سطح انرژی پایین‌تر و پایدارتر مهاجرت نموده‌اند. از بین 35 کنفورماسیون یافت شده پایدارترین و ناپایدارترین کنفورماسیون بوده که اختلاف انرژی نسبی بین این دو 64/14 کیلوکالری بر مول است. همچنین از میان 19 کنفورماسیون یافت نشده با ساختارهای کلی و ، مهاجرت به کنفورمر برای باقیمانده‌های سرین و آلانین، بیشترین مهاجرت بوده است، به عبارتی کنفورمر باعث پایداری بیشتر ساختار دی‌پپتید می‌شود. کلمات کلیدی: دی‌پپتید، For-Ser-Ala-NH2 ، نقشه راماچاندران، زنجیر جانبی ، DFT . تفاصيل المقالة

در این تحقیق سینتیک و ترمودینامیک واکنش اتمسفری ربایش هیدروژن از 4 موضع مستعد مولکول آسنافتیلن در فاز گازی آغاز شده توسط رادیکال هیدروکسیل در سطح محاسباتی MN15L/aug-cc-pVTZ مورد بررسی قرار گرفته است. واکنشهای ربایش هیدروژن از هر 4 کانال تحت مطالعه خودبخودی وگرمازا است. مقادیر ثوابت سرعت (با و بدون اصلاح توسط اثرات کوانتومی تونلی شدن ویگنر و ایکارت)، انرژی های فعالسازی، و توابع ترمودینامیکی فعالسازی تایید کردند که واکنش اتمسفری ربایش هیدروژن آسنافتیلن تحت کنترل سینتیکی است. نسبتهای شاخه ای شدن نشان دادند که فقط محصولات ربایش هیدروژن از مواضع 2 و 3 و 4 قابل مشاهده خواهند بود. تفاصيل المقالة

شیمی درمانی، یکی از مؤثرترین درمان ها برای سرطانها به شمار می رود اما بسیاری از سرطانها در طی درمان با داروهای شیمی درمانی نسبت به اثرات درمانی داروی مصرفی، مقاوم می‌شوند که به آن مقاومت به داروهای چندگانه یا Multi Drug Resistance می گویند. در حال حاضر از برخی داروهای جدید از جمله مشتقات کربوکسیلات جهت کاهش مقاومت دارویی استفاده شده است. در تحقیق حاضر، مطالعه ارتباط کمی ساختار-فعالیت(QSAR) جهت پیش بینی فعالیت دارویی برخی از مشتقات کربوکسیلات با استفاده از روش رگرسیون خطی چند متغیره(MLR) و شبکه های عصبی مصنوعی(ANN) انجام شد. در ابتدا ساختار ترکیبات دارویی، رسم و گروه مناسبی از توصیف کننده‌ها محاسبه شدند. سپس از روش انتخاب مرحله‌ای برای بدست آوردن بهترین توصیف کننده‌ها که بیشترین ارتباط را با فعالیت دارویی ترکیبات مورد نظر داشتند استفاده گردید. در ابتدا مدل خطی رگرسیون خطی چند‌گانه(MLR) ساخته شد. سپس برای به دست آوردن نتایج بهتر از ANN استفاده گردید. داده های آماری، برتری روش ANN را نسبت به روش MLR نشان می دهد. تفاصيل المقالة

در این تحقیق، واکنش نوآرایی کورتیوس مولکول اُکسالیل دی آزید(ODA) برای کنفورمرهای سین-سین و آنتی-آنتی در فاز گازی و حلال‌های آی و سیکلوهگزان مورد بررسی قرار گرفته است. در فاز گازی کنفورمرهای سین-سین و آنتی-آنتی ODAو حالات گذار مربوط به واکنش‌های نوآرایی آنها با استفاده از روش تئوری تابع چگال (DFT)، در سطوح محاسباتیWB97XD ، M06-2X، B3LYP و سری پایه6-311++G(2d,d,p) و روشCBS-QB3 بهینه شده‌اند و در حلال محاسبات در سطحB3LYP/6-311++G(2d,d,p) صورت گرفته است. کنفورمر سین-سین طی یک مکانیسم یک مرحله‌ای هماهنگ (Concerted) و کنفورمر آنتی-آنتی با استفاده از یک مکانیسم دو مرحله‌ای (Stepwise)، و به ترتیب با عبور از 1 و 2 حالت گذار تحت نوآرایی کورتیوس قرار گرفته و محصول کربونیل دی ایزوسیانات (CAI) را ایجاد می‌کنند. در مکانیسم Concerted انرژی آزاد گیبس فعالسازی مسیر رفت کمتر از برگشت است، به عبارتی در مسیر برگشت انرژی آزاد گیبس فعالسازی حدود 4 برابر مسیر رفت هستند. در مکانیسم Stepwise مرحله اول گرماگیر و مرحله دوم فرایندی گرمازا است. در فاز حلال برای مکانیسم یک مرحله‌ای با افزایش ضریب دی الکتریک حلال سد انرژی فعالسازی کاهش می‌یابد. تفاصيل المقالة

تفاصيل المقالة

تفاصيل المقالة

تفاصيل المقالة

تفاصيل المقالة

تفاصيل المقالة

تفاصيل المقالة

در این تحقیق با استفاده از محاسبات کوانتومی در فاز گازی در دو سطح محاسباتی B3LYP/6-311+G(d,p) و M06-2X/6-311+G(d,p)، ساختارهای چرخشی β فرم L دی پپتید محافظت شده سرین-آلانین بر روی نقشه راماچاندران مورد بررسی قرار گرفته اند. از بین 243 کنفورمر محتمل دی پپتید محافظت شده N-For-ser-ala-NH2، 26 کنفورمرساختار چرخشیβ را دارند. نظریه کوانتومی اتم ها در مولکول ها برای بررسی طبیعت پیوندهای هیدروژنی بین مولکولی ساختارهای چرخشی βمورد استفاده قرار گرفته است. نتایج بدست آمده مشخص می کنند که کنفورمر متعلق به نوع V ساختارهای βبه دلیل تشکیل سه پیوند هیدروژنی، پایدارترین ساختار چرخشیβ در بین همه ساختارها است. در حالی که ناپایدارترین ساختار چرخشیβ ( )، متعلق به نوع I، به ترتیب دو و یک پیوند هیدروژنی در دو سطح محاسباتی B3LYP/6-311+G(d,p) و M06-2X/6-311+G(d,p) را تشکیل می دهد. تفاصيل المقالة

یک روش به نسبت ساده برای سنتز خالص و پایدار بلورهای هیدروکسی آپاتیت در دمای پایین به وسیله ی فرایند سل- ژل معرفی شده است. در این پژوهش خلوص فازی HA سنتز شده به وسیله ی روش سل – ژل از کلسیم نیترات چهارآبه و تری اتیل فسفات به ترتیب به عنوان پیش مواد حاوی کلسیم و فسفات مورد کاوش قرار گرفت. برای تعدادی از نمونه ها، در ابتدا سل فسفر به مدت 24 ساعت به وسیله ی آب مقطر آب‌کافت شد. تاثیر پارامترهای فرایند سل – ژل شامل دمای محلول مخلوط شده، زمان ماند (aging)و عملیات حرارتی بر تکامل فاز آپاتیت به طور سیستماتیک و همزمان مطالعه شد. این بررسی همزمان و سیستماتیک پارامترهای فرایند سل – ژل وجه برتری کار انجام شده در مقایسه با کار دیگران است. روش های طیف سنجی زیر قرمز (IR)، پراش پرتو X، عملیات حرارتی(DTA) و آنالیز عنصری به‌وسیله‌ی میکروسکوپ الکترونی روبشی(SEM) برای بررسی تکامل ساختاری در طول سنتز HA به کار رفتند. افزایش زمان ماند باعث کاهش ناخالصی کلسیم اکسید (CaO) شد. هم‌چنین، افزایش دمای محلول واکنش تا 80درجه ی سانتی گراد اثر مثبت بر حذف فازهای ناخالصی گذاشت. با افزایش دمای کلسینه کردن به بیش از 600درجه ی سانتی گراد فازهای ناخالصی کلسیم فسفاته ناپدید شدند. میکروگراف های SEM نشانگر ساختار به شدت به هم چسبیده شده در مقیاس نانو برای پودرهای کلسینه شده نمونه ها ست. تفاصيل المقالة