بررسی مولکولی سویه‌های استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از زخم و ادرار در کرمانشاه، ایران
محورهای موضوعی : میکروبیولوژیزینب احمدی 1 * , حسین آقاجانی 2 , حسین خدابنده شهرکی 3
1 - گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران
2 - گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران
3 -
کلید واژه: استافیلوکوکوس اورئوس, الگوهای مقاومت آنتی‌بیوتیکی, Multiplex-PCR, RFLP-PCR, ژن کوآگولاز,
چکیده مقاله :
انسان منبع اصلی استافیلوکوکوس اورئوس در طبیعت است. این باکتری یکی از عوامل مهم عفونت‌های بیمارستانی است. بنابراین، مطالعه‌ی توصیف مولکولی این باکتری از اهمیت بالایی برخوردار است. پس از شناسایی و تأیید ۱۰۰ سویه استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از نمونه‌های زخم و ادرار در کرمانشاه با روش‌های استاندارد میکروبیولوژی، آزمایش حساسیت آنتی‌بیوتیکی انجام شد و ژن‌های مقاومت mecA) ، aacA-D، tet K، tet M، msrA، (ermA جدایه‌ها با روش Multiplex-PCR بررسی و ژنوتیپ ژن کوآگولاز جدایه‌ها با روش RFLP-PCR بررسی شد. در آزمایش حساسیت، بیشترین مقاومت به پنی‌سیلین (۹۰درصد) و کمترین مقاومت به نیتروفورانتوئین (۸درصد) گزارش شد. در روش Multiplex-PCR، (49 درصد) از ایزوله‌ها حامل ژن mecA، (24 درصد) aacA-D ، (89 درصد) tetM، (14 درصد) tetK، (40 درصد) ermA و (36 درصد) msrA بودند. در تشخیص پلی‌مورفیسم ژن کوآگولاز از 65 سویه استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از ادرار، پلی‌مورفیسم ژن کوآگولاز در 53 مورد مشاهده شد که ژنوتیپ I(53/61 درصد) و ژنوتیپ VIII (3/12درصد) و ژنوتیپ IX (69/7درصد) بودند. پلی‌مورفیسم ژن کوآگولاز سویه‌های جدا شده از زخم در 22 نمونه مشاهده شد. ژنوتیپ I (85/49 درصد) و ژنوتیپ VIII (20 درصد)گزارش شد. تشخیص و توصیف مولکولی ایزوله‌ها در پیشگیری و کنترل عفونت بسیار مؤثر و کارآمد است.
Human is the main source of Staphylococcus aureus in the nature. This bacterium is one of the important agents of nosocomial infections. Therefore, is study molecular characterization of this bacteria of high important. After identification and confirmation of 100 strains of Staphylococcus aureus isolated from wounds and urine samples in Kermanshah with microbiology standard methods, the antibiotic susceptibility testing was done and resistance genes (mecA, aacA-D, tet K, tet M, msrA, ermA) of isolates were studied with multiplex-PCR method and genotyping of coagulase gene of isolates was studied by RFLP-PCR method. In susceptibility testing were reported greatest resistance to penicillin (90%) and lowest resistance nitrofurantoin (8%). In multiplex-PCR method, (49%) of the isolates carry mecA gene, (24%) aacA-D, (89%) tetM, (14%) tetK, (40%) ermA and (36%) msrA. In the detection polymorphism of coagulase gene from 65 strains of Staphylococcus aureus isolated from urine, coagulase gene polymorphism was observed in 53 cases, genotype I (61.53%) and genotype VIII (12.3%) and genotype IX (7.69%). The coagulase gene polymorphism of strains isolated from wound were observed in 22 samples. Genotype I was reported (42.85%) and genotype VIII (20%) was observed. Detection molecular characterization of isolates is very effective and efficient in prevention and control infection.
1. Bhateja , .Mathur, T, .Pandya M, Fatma T,. Rattan A. Detection of vancomycin resistant Staphylococcos aurus: A comparative study of three different phenotypic screening methods. Indian J Med Microbio. 2005; 23 (1):52-55.
2. McIver CJ, White PA, Jones LA, Karagiannis T, Harkness J, Marriott D. Rawlinson WD. Epidemic strains of Shigella sonnei biotype carrying integrons. J Clin Microbiol. 2002; 40(4):1538-1540.
3. Vila J Pal T. Update on Antibacterial Resistance in Low-Income Countries: Factors Favoring the Emergence of Resistance. Infect Dis J 2010; 4: 38-54
4. Lowy F.D. Antimicrobial resistance: the example of Staphylococcus aureus. J Clin Invest. 2003; 111(9): 1265-1273
5. Rice LB. Antimicrobial resistance in gram positive bacteria. Am J Med. 2003; 119: S11–S19; discussion; 2006; 62–70.
6. Mainous AG, Hueston WJ, Everett CJ, Diaz VA. Nasal carriage of Staphylococcus aureus and methicillin-resistant S. aureus in the United States 2001—2002. Ann Fam Med. 2006; 4 (1):132—137.
7. Edmond MB, Wenzel RP, Pasculle AW. Vancomycin resistant Staphylococcus aureus: perspectives on measures needed for control. Ann Intern Med. 1996; 124: 329-334.
8. Aubert G, Passot S, Lucht F, Dorche G. Selection of vancomycin- andteicoplanin resistant Staphylococcus haemolyticusd uring teicoplanin treatmentof S. epidermidisinfection. J Antimicrob Chemother. 1990; 25:491-493.
9. 9. Hiramatsu K, Hanaki H, Ino T, Yabuta K, Oguri T, Tenover FC. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus clinical strain with reduced vancomycin susceptibility. J Antimicrob Chemother. 1997;40: 135 – 136
10. Schmitz FJ, Fluit AC, Gondolf M. The prevalence of aminoglycoside resistance and corresponding resistance genes in clinical isolates of staphylococci from 19 European hospitals. J Antimicrob Chemother. 2000; 43:253-259.
11. Kim YK, Kim JS, Kim HS, Song W, Cho HC, Lee KM. [Molecular typing of Staphylococcus aureus isolated from blood on the basis of coagulase gene polymorphism and toxin genes.Korean J Lab Med. 2008; 28 (4):286-2892.
12. Kumar R, Yadav BR, Singh RS. Genetic determinants of antibiotic resistance in Staphylococcus aureus isolates from milk of mastitic crossbred cattle. Curr Microbiol. 2010; 60: 379-386.
13. Ugwu MC, Odimegwu DC, Ibezim EC, and Esimone CO. Antibiotic Resistance Patterns of Staphylococcus aureus isolated from Nostrils of Healthy Human Subjects in a Southeastern Nigeria Locality. Macedonian Journal of Medical Sciences. 2009; 15; 2(4):294-300.
14. Tuncer I, Kalem F, Çosar M, Arslan U. Antibiotic susceptibility of staphylococcus aureus strains isolated from blood stream infections. Turk Microbiol Cem Drug. 2009; 39 (1-2): 22-26.
15. Al-Ruaily. Khalil OM. . Detection of (mecA) gene in methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) at Prince A/Rhman .Sidery Hospital, Al-Jouf, Saudi Arabia .J Med Genetics and Genomics. 2011; 3 (3) 41 – 45.
16. Duran, Ozer B, Duran GG, Onlen Y, Demir C. Antibiotic restance genes and susccptibilitypatteyns in staphylococci. Indian J Med Res. 2010; 135: 389-396.
17. Zmantar T, Chaieb K, Ben Abdallah F, Ben Kahla-Nakbi A, Ben Hassen A, Mahdouani K, Bakhrouf A. Multiplex PCR detection of the antibiotic resistance genes in Staphylococcus aureusstrains isolatedfrom auricular infections. Folia Microbiol. 2008; 53: 357-362.
18. M Salehi V, Razavilar H, Mirzaei A, Javadi SM. Use of restriction fragment length polymorphism to characterize methicillin-resistant Staphylococcus aureus in dairy products. Biology and Medicine. 2012; 4 (3): 117–120.
19. AK SK, Shetty PJ, Chidambaram A, Ranganathan R. Detection of mecA genes of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus by Polymerase Chain Reaction. Int J Health Rehabil Sci. 2012; 1(2): 64-68
20. Akpaka PE, Kissoon S,. Swanston WH, Monteil M. Prevalence and antimicrobial susceptibility pattern of methicillin resistant Staphylococcus aureus isolated from Trinnidad and Tobage. Ann Clin Microbiol Antimicrob. 2006; 3: 5: 16
21. De Carvalho MJ, Pimenta F, Hayashida M, Gir E, da Silva AM, Barbosa CP. Canini SR, Santiago S. Prevalence of methicillin-resistant and methicillin susceptible S. aureus in the saliva of health professionals. Clinics (Sao Paulo). 2009; 64(4): 295-302.
22. Liakopoulos A, Foka A, Vourli S, Zerva L, Tsiapara F, Protonotariou E, Dailiana Z, Economou M, Papoutsidou E, Koutsia-Carouzou C, Anastassiou ED, Diza E, Zintzaras E, Spiliopoulou I, Petinaki E. Aminoglycoside-resistant staphylococci in Greece: prevalence and resistance mechanisms. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2011; 30 (5):701-705.
23. Kanevsky SU, Jayarao BM, Sordill LM. Phylogenic relationship of Staphylococcus aureus from bovine mastitis based on cougulase gen polymorphism. Vet Microbiol. 1999. 71:53-58
24. Georgel P, Crozat K, Lauth X, Makrantonaki E, Seltmann H, Sovath S, Hoebe K, et al. A toll-like receptor 2-responsive lipid effector pathway protects mammals against skin infections with gram-positive bacteria. Infect Immun. 2005; 73 (8):4512-4521.
25. Montesinos I, Salido E, Delgado T, Cuervo M, Sierra A. Epidemiology Genotyping of (MRSA) by (PFGE) at a university Hospital and comparison with antibiotyping and protein A and coagulase gene polymorphisms. J Clin Microbiol. 2005; 40(6):2119-2125.