بررسی تنوع ژنتیکی ارقام مختلف انگور Vitis vinifera با استفاده ازنشانگر مولکولی ISSR
محورهای موضوعی : مجله علمی- پژوهشی اکوفیزیولوژی گیاهی
عطیه خلخالی
1
,
حسین عباسپور
2
1 - کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه ازاد اسلامی واحد دامغان
2 - دانشیار گروه زیست شناسی دانشگاه آزاد اسلامی واحد دامغان
کلید واژه: تنوع ژنتیکی, مارکر مولکولی, انگور, آنالیزهای استاتیک, درخت فیلوژن,
چکیده مقاله :
انگور یکی از محصولات مهم باغی در دنیا و ایران به شمار می‌رود و از تنوع ژنتیکی بالایی برخوردار است لذا هدف در این پژوهش بررسی تنوع ژنتیکی و ارزیابی ارقام مطرح انگور (Vitis vinifera) در سطح مولکولی با استفاده از نشانگر ISSR بود. به منظور استخراج DNAاز روش تغییر یافته Doyle and Doyle استفاده شد و در گام بعد 12 ژنوتیپ با 12 آغازگر مورد بررسی قرار گرفتند. تجزیه خوشه‌ای با دو نرم‌افزار PopGen32 و SPSS9انجام شد. خوشه‌بندی حاصل با هردو نرم افزار واریته‌ها را در 5 گروه مجزا قرار داد. در تجزیه داده‌ها، درصد پلی‌مورفیسم 49/96 درصد و تعداد لوکوس پلی‌مورف 55 بدست آمدند. ضریب کوفنتیک برای ضریب تشابه جاکارد و نی، 8/0 است که نشان دهنده برازش خوب بین دندروگرام و ماتریس شباهت اصلی است. باندهایی که به طور واضح قابل مشاهده بودند مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که در مجموع 353 باند توسط این نشانگرها تولید شد. اندازه باندها بین 200 تا 3000 جفت باز متغیر بود. در این بین بیشترین تشابه برای واریته‌های 1 (سبز شاه پسند) و 7 (خلیلی بیدانه قوچان) با مقدار 619/0 و کمترین تشابه برای واریته‌های 10(پیر قلی شماره2) و 2 (مال کاشمر) با مقدار 205/0 بود. از آنجا که بیشترین میزان باند توسط آغازگر a (56 باند) مشاهده شد، این آغازگر بهتر از سایر آغازگرها توانست فاصله ژنتیکی واریته‌های مربوط به آغازگر را مشخص کند.
Grapes is one of the most important horticultural products in the world and Iran and has a wide gnetic diversity, so the purpose of this research was to investigate of the genetic diversity and to asses of introduced grapes cultivars (Vitis vinifera) at the molecular level using ISSR marker. For DNA extraction, it was used modified method of Doyle and Doyle and at the next step, 12 genotypes were examined by 12 primers. Cluster analysis was performed by PopGen32 and SPSS9 softwares. The resulted clustering were divided cultivars into 5 groups by both softwares. In analyzing data, the percentage of polymorphism and the number of polymorphic loci were obtained 96.49 percent and 55 respectively. Cophenetic coefficient is 0.8 for Jaccard coefficient and straw, is indicating a fine fit between the dendrogram and the main similarity matrix. The bands that were Obviously visible were reviewed. Results showed that 353 bands were generated by the markers totally. The size of bands was various between 200 and 3000 bp. The highest similarity was 0.619 for number one (sabz Shah Pasand) and number 7 (currants Khalili Ghouchan) varieties and the least one was 0.205 for number10 (Pir Golli 2) and number 2 (Kashmar Mall) varieties. Because the most amount of bond were observed by primer a (56 bands), this primers was able to determine the genetic gap of Primerrelated varieties better than other primers.
_||_