واکنش زنجیره‌ای پلیمراز

دسترسی آزاد مقاله

1 - پراکندگی ژن‌ انتروتوکسین A‌ در استافیلوکوکوس اورئوس‌های جدا شده از پنیر سفید سنتی آب نمکی
خسرو محمدی

مصرف مواد غذایی حاوی انتروتوکسین های استافیلوکوکی، اغلب موجب مسمومیت غذائی می شوند. انتروتوکسین A شایع ترین سم در مسمومیت های استافیلوکوکی شناخته شده است. هدف از این مطالعه تعیین میزان آلودگی پنیرهای سفید آب نمکی تهیه شده به روش سنتی به استافیلوکوکوس اورئوس و شناسایی ژن چکیده کامل

مصرف مواد غذایی حاوی انتروتوکسین های استافیلوکوکی، اغلب موجب مسمومیت غذائی می شوند. انتروتوکسین A شایع ترین سم در مسمومیت های استافیلوکوکی شناخته شده است. هدف از این مطالعه تعیین میزان آلودگی پنیرهای سفید آب نمکی تهیه شده به روش سنتی به استافیلوکوکوس اورئوس و شناسایی ژن کد کننده انتروتوکسین A (sea) بود. در مجموع تعداد 120 نمونه پنیر آزمایش شدند که از این تعداد استافیلوکوکوس اورئوس از 11 (1/9%) نمونه جداسازی شد. نتایج شمارش در محدوده cfu/g 101 × 5/1تا 104 × 6/8 متغیر بود. هیچ کدام از نمونه ها از نظر شاخص مسمومیت با استافیلوکوکوس اورئوس در حد بحرانی (cfu/g 105>) نبود. از هر نمونه پنیر پنج کلونی مشکوک با آزمایش های بیوشیمیایی تأیید شدند. شناسایی استافیلوکوکوس اورئوس در سطح گونه براساس ژن 23S rRNA، ژن ترمونوکلئاز و ژن انتروتوکسین A به روش PCR چندگانه ارزیابی شدند. در مجموع 55 جدایه مورد مطالعه قرار گرفتند. همه جدایه ها بعنوان استافیلوکوکوس اورئوس تأیید شدند. ژن انتروتوکسین A (sea) در 6 (9/10%) جدایه مشاهده شد. طبق نتایج این مطالعه ژن sea در استافیلوکوکوس اورئوس های پنیر سفید سنتی آب نمکی وجود دارد و درصورتیکه شرایط مساعد برای رشد و تولید انتروتوکسین فراهم شود می تواند بعنوان یک مخاطره بالقوه مطرح شود. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

2 - شناسایی یک سویه جدید ویروس تنفسی در ایگوانای سبز (ایگوانا ایگوانا)
پیمان محمدزاده سجاد محمدی

10.30495/jcp.2023.22492

اخیراً نیدوویروس‌ها به‌عنوان عامل احتمالی بیماری‌های تنفسی شدید در خزندگان و بخصوص مارهای پیتون از نقاط مختلفی از جهان توصیف شده‌اند. هدف از این مطالعه، جداسازی عامل بیماری‌زا همراه با تعیین دقیق خصوصیات و نیز بررسی یافته‌های هیستوپاتولوژی در یک ایگوانای ماده می‌باشد. د چکیده کامل

اخیراً نیدوویروس‌ها به‌عنوان عامل احتمالی بیماری‌های تنفسی شدید در خزندگان و بخصوص مارهای پیتون از نقاط مختلفی از جهان توصیف شده‌اند. هدف از این مطالعه، جداسازی عامل بیماری‌زا همراه با تعیین دقیق خصوصیات و نیز بررسی یافته‌های هیستوپاتولوژی در یک ایگوانای ماده می‌باشد. در طی معاینات پس از مرگ، ضایعات پیوگرانولوماتوز و فیبرونکروتیک در سیستم‌هایی غیر از دستگاه تنفس این ایگوانا مشاهده شد و نتایج بررسی واکنش زنجیره‌ای پلیمراز رونویسی معکوس نیز مثبت بود لذا ارتباط بین مشاهده این ضایعات گسترده با نتایج کالبدگشایی حاصل از مطالعه موارد ابتلا به سرپنتوویروس‌های قبلی و نیز میزان و نوع تغییرات در ژنوم سرپنتوویروس شناسایی شده با سرپنتو ویروس قبلی بررسی شد. تلقیح کشت‌ سلولی و سپسRT-PCR برای جمع‌آوری و به دست آوردن ایزوله‌ ویروسی استفاده شد. در ادامه ایمونوهیستوشیمی انجام شد. رنگ‌آمیزی برای نوکلئوپروتئین سرپنتویروس نشان داد که این ویروس نه‌تنها طیف وسیعی از اپیتلیوم (اپیتلیوم تنفسی و گوارشی، سلول‌های کبدی، لوله‌های ادراری، مجاری پانکراس و غیره)، بلکه مونوسیت‌های داخل عروقی، ماکروفاژهای داخل ضایعه و سلول‌های اندوتلیال را نیز آلوده می‌کند. با توالی یابی نسل بعدی، ژنوم کامل برای این‌گونه سرپنتویروس جدید به دست آمد. تجزیه‌وتحلیل ژنوم ویروسی بازیابی شده از این بیماری تنفسی و سیستمیک مرتبط با عفونت سرپنتوویروس، ارتباط توالی با فنوتیپ سایر سویه‌ها را نشان نداد. نتایج نشان داد که این سرپنتوویروس تروپیسم سلولی و بافتی گسترده‌ای دارد و سیر عفونت‌زایی توسط آن می‌تواند متفاوت باشد و در نتیجه گسترش سیستمیک ویروس در بدن ضایعات در طیف گسترده‌ای از بافت‌ها و سیستم‌های مختلف بدن ایجاد می‌کند. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

3 - تعیین حضور مایکوپلاسما گالی سپتیکوم و مایکوپلاسما سینوویه در سندرم تنفسی مرغان گوشتی شهرستان همدان با روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز.
محمد مهدی گوران جلال شایق

10.30495/jvm.2020.679864

عفونت‌های مایکوپلاسمایی در طیور از اهمیت اقتصادی بالایی برخوردارند و موجب افزایش هزینه‌های ناشی از درمان و کاهش عملکرد طیور می‌شوند. هدف از مطالعه حاضر تعیین حضور مایکوپلاسما گالی‌سپتیکوم و مایکوپلاسما سینوویه در سندرم تنفسی مرغان گوشتی شهرستان همدان با استفاده از واکنش چکیده کامل

عفونت‌های مایکوپلاسمایی در طیور از اهمیت اقتصادی بالایی برخوردارند و موجب افزایش هزینه‌های ناشی از درمان و کاهش عملکرد طیور می‌شوند. هدف از مطالعه حاضر تعیین حضور مایکوپلاسما گالی‌سپتیکوم و مایکوپلاسما سینوویه در سندرم تنفسی مرغان گوشتی شهرستان همدان با استفاده از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز بود. بدین منظور از گله‌های طیور مبتلا به سندرم تنفسی درشهرستان همدان نمونه‌ها با سوآب از قسمت فوقانی نای برداشته شده و اطلاعات هر گله نیز ثبت گردید. نمونه‌ها با استفاده از آزمایش PCR از نظر حضور مایکوپلاسما گالی سپتیکوم و مایکوپلاسما سینوویه ارزیابی شدند. در مجموع تعداد 279 نمونه مورد آزمایش قرار گرفت. نتایج آزمایش PCR نشان داد که آلودگی به مایکوپلاسما گالی‌سپتیکوم در 58/22 درصد کل نمونه-های مورد آزمایش در 39 درصد گله‌های نمونه‌برداری شده مثبت بوده است. همچنین هیچکدام از نمونه‌ها از نظر حضور مایکوپلاسما سینوویه مثبت نبودند. عفونت‌های همزمان شامل برونشیت 83/42 درصد، کلی باسیلوزیس 57/28 درصد و نیوکاسل 77/4 درصد بود. همچنین در 57/28 درصد موارد عفونت همزمان با برونشیت و کلی باسیلوزیس، 53/9 درصد برونشیت و نیوکاسل، و 29/14 درصد برونشیت و آنفلوانزا بصورت همزمان با عفونت مایکوپلاسمایی وجود داشت. نتایج مطالعه حاظر نشان داد که میزان آلودگی با مایکوپلاسما گالی‌سپتیکوم و عفونت‌های همزمان در گله‌های طیور همدان بالا می‌باشد و بایستی در حین بررسی وضعیت گله‌های مبتلا به سندرم تنفسی احتمال عفونت چندگانه به‌ویژه مایکوپلاسما گالی‌سپتیکوم مدنظر قرار گیرد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

4 - بررسی شیوع نئوسپورا کانینوم در شیر نشخوارکنندگان به روش مولکولی
مهتاب علیپور ابراهیم رحیمی امیر شاکریان

10.30495/jvm.2020.676317

نئوسپورا کانینوم انگل تک یاخته داخل سلولی با گسترش جهانی است. این تک یاخته از عوامل اصلی سقط جنین در گاوهای شیری بوده است. تحقیق حاضر به منظور بررسی میزان شیوع فصلی و جغرافیایی نئوسپورا کانینوم در شیر نشخوارکنندگان به روش مولکولی انجام شد. چهارصد و چهل نمونه شیر خام طی چکیده کامل

نئوسپورا کانینوم انگل تک یاخته داخل سلولی با گسترش جهانی است. این تک یاخته از عوامل اصلی سقط جنین در گاوهای شیری بوده است. تحقیق حاضر به منظور بررسی میزان شیوع فصلی و جغرافیایی نئوسپورا کانینوم در شیر نشخوارکنندگان به روش مولکولی انجام شد. چهارصد و چهل نمونه شیر خام طی چهار فصل سال از استان‌های اصفهان، چهارمحال و بختیاری، خوزستان و فارس جمع‌آوری و به آزمایشگاه منتقل شد. نمونه های DNA استخراج شده با استفاده از کیت بوسیله آزمون nested- PCR به منظور ردیابی ژن NC5 نئوسپورا کانینوم ارزیابی شدند. از مجموع 440 نمونه شیر مورد مطالعه، 54 نمونه (27/12 درصد) آلوده به نئوسپورا کانینوم بودند. شیر گاو بیشترین (26 درصد) و شیر گوسفند کمترین (4 درصد) میزان شیوع نئوسپورا کانینوم را داشتند. نمونه های شیر جمع آوری شده در فصل زمستان بیشترین (85/22 درصد) و نمونه های جمع آوری شده در فصل تابستان کمترین (57/8 درصد) میزان شیوع نئوسپورا کانینوم را داشتند. نمونه های شیر جمع آوری شده از استان چهارمحال و بختیاری بیشترین (94/14 درصد) و نمونه های جمع آوری شده از اصفهان کمترین (38/6 درصد) میزان شیوع نئوسپورا کانینوم را داشتند. با توجه به شیوع نسبی این انگل در شیر خام مورد مطالعه، اتخاذ برنامه‌‌های کنترلی بیش ‌از پیش مورد نیاز است. همچنین با توجه به احتمال مصرف فرآورده‌های لبنی سنتی و انتقال آلودگی به انسان، جوشش کامل شیر قبل از مصرف توصیه می‌گردد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

5 - مقایسه ی روش کشت و واکنش زنجیره‌ای پلیمراز در شیوع هلیکوباکتر پولوروم جدا شده از نمونه های کبد مرغ و تعیین مقاومت آنتی بیوتیکی جدایه های بدست آمده
اشکان جبلی جوان سید حسام الدین عمادی چاشمی حمید استاجی حسین اخلاقی

10.30495/jvm.2021.1904777.1141

چکیدههلیکوباکتر پولوروم یک عامل بیماریزای گرم منفی و زئونوز است که باعث مشکلات گوارشی در انسان و پرندگان می‌شود. اهداف این مطالعه، بررسی شیوع هلیکوباکتر پولوروم در نمونه‌های کبد مرغ با استفاده از روش‌های کشت باکتریایی و واکنش زنجیره‌ای پلیمراز و همچنین ارزیابی مقاومت آن چکیده کامل

چکیدههلیکوباکتر پولوروم یک عامل بیماریزای گرم منفی و زئونوز است که باعث مشکلات گوارشی در انسان و پرندگان می‌شود. اهداف این مطالعه، بررسی شیوع هلیکوباکتر پولوروم در نمونه‌های کبد مرغ با استفاده از روش‌های کشت باکتریایی و واکنش زنجیره‌ای پلیمراز و همچنین ارزیابی مقاومت آنتی‌بیوتیکی جدایه‌های بدست آمده با استفاده از روش انتشار دیسک در نواحی مختلف شهر سمنان بود. در مجموع، 50 نمونه‌ی‌ کبد بسته بندی شده از مراکز فروش مواد پروتئینی از نواحی مختلف در شهر سمنان تهیه شد. با استفاده از روش کشت باکتریایی و آزمون‌های بیوشیمیایی، 17 نمونه (34%) آلوده به هلیکوباکتر پولوروم بودند. با استفاده از تست واکنش زنجیره‌ای پلیمراز که به موازات روش کشت بر روی نمونه‌های کبد انجام شد، 11 نمونه (22%) از نظر آلودگی به هلیکوباکتر پولوروم تشخیص داده شدند. با توجه به نتایج آزمون تعیین مقاومت آنتی‌بیوتیکی، تمام نمونه‌ها مقاوم به سیپروفلوکساسین و جنتامایسین بودند و کمترین مقاومت نسبت به آمپی‌سیلین، کولیستین و اریترومایسین با فراوانی 14% مشاهده گردید. این مطالعه، اولین بررسی شیوع و مقاومت میکروبی هلیکوباکتر پولوروم در نمونه‌های کبد مرغ است که در شهر سمنان انجام شده و مطالعات بیشتری در این زمینه ضروری به نظر می‌رسد. گذشته از این، مطالعه‌ی حاضر با توجه به حساسیت پایین آزمون‌های بیوشیمیایی در تشخیص هلیکوباکتر پولوروم پیشنهاد می‌کند که تست واکنش زنجیره‌ای پلیمراز می‌تواند به عنوان یک روش حساس و قابل اعتماد در شناسایی هلیکوباکتر پولوروم در نمونه‌های کبد مرغ استفاده شود. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

6 - تشخیص مولکولی میکروب کلامیدوفیلا پسیتاسی در تلفات و موارد مشکوک به عفونت با این عامل بیماری‌زا در طوطی‌سانان شهر تهران
مظاهر شریعت نزاد هادی حق بین نظر پاک نریمان شیخی

میکروب کلامیدوفیلا یک ارگانیسم مشابه با باکتری‌های گرم منفی و داخل سلولی است که در خانواده کلامیدیاسه قرار دارد. در این خانواده گونه‌های مختلفی از کلامیدوفیلا قرار دارند که قادرند میزبان‌های خود را آلوده نمایند. گونه ایجادکننده بیماری در پرندگان، کلامیدوفیلا پسیتاسی است چکیده کامل

میکروب کلامیدوفیلا یک ارگانیسم مشابه با باکتری‌های گرم منفی و داخل سلولی است که در خانواده کلامیدیاسه قرار دارد. در این خانواده گونه‌های مختلفی از کلامیدوفیلا قرار دارند که قادرند میزبان‌های خود را آلوده نمایند. گونه ایجادکننده بیماری در پرندگان، کلامیدوفیلا پسیتاسی است که در انسان هم منجر به بروز بیماری می‌شود. انتقال بیماری از طریق تماس با پرندگان آلوده و خصوصا پرندگان خانواده طوطی سانان و یا ترشحات و وسایل آلوده می‌باشد. هدف کلی از این مطالعه، تشخیص مولکولی میکروب کلامیدوفیلا پسیتاسی در بین پرندگان خانواده طوطی سانان مشکوک به حضور کلامیدوفیلا پسیتاسی در آنها در شهر تهران و با استفاده از روش واکنش زنجیره پلیمراز آشیانه‌ای می‌باشد. در این بررسی سوآب مدفوعی از 23 نمونه طوطی مشکوک به همراه سو آب کلواک از 7 نمونه لاشه مشکوک به حضور کلامیدوفیلا پسیتاسی گرفته شد. نمونه‌ها تا زمان استخراج در دمای 20- درجه سانتیگراد نگهداری شدند. روش استخراج DNA با استفاده از فیلترهای سیلیکا صورت گرفت و در ادامه با استفاده از روش واکنش زنجیره پلیمراز آشیانه‌ای و بر اساس ژن S rRNA16 مورد آزمایش قرار گرفت. نتایج بدست آمده شامل 10 مورد مثبت از بین30 نمونه مورد بررسی بود. با توجه به نتایج حاصل از این تحقیق، اهمیت آموزش افراد نگهداری کننده از طوطی در جهت حفظ سلامت حیوان و پیشگیری از ابتلای انسان مشخص می‌شود. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

7 - بررسی شیوع، تنوع ژنتیکی و مقاومت آنتی‌بیوتیکی کلستریدیوم دیفیسیل در گوشت مرغ و بوقلمون بومی و صنعتی مراکز فروش استان چهارمحال‌وبختیاری
اکبر انصاریان بارزی امیر شاکریان ابراهیم رحیمی زهرا اسفندیاری

10.30495/jfh.2023.1993402.1415

کلستریدیوم دیفیسیل باکتری بی‌هوازی اجباری، اسپورساز با طول 5-3 میکرومتر و یکی از انتروپاتوژن&lrm;های مهم در انسان و دام است. مصرف آنتی‌بیوتیک به‌عنوان مهم‌ترین عوامل خطر در شیوع این بیماری معرفی ‌شده است. هدف از این مطالعه، بررسی شیوع، مقاومت آنتی‌بیوتیکی و تنوع ژنتیکی چکیده کامل

کلستریدیوم دیفیسیل باکتری بی‌هوازی اجباری، اسپورساز با طول 5-3 میکرومتر و یکی از انتروپاتوژن&lrm;های مهم در انسان و دام است. مصرف آنتی‌بیوتیک به‌عنوان مهم‌ترین عوامل خطر در شیوع این بیماری معرفی ‌شده است. هدف از این مطالعه، بررسی شیوع، مقاومت آنتی‌بیوتیکی و تنوع ژنتیکی باکتری کلستریدیوم دیفیسیل به‌عنوان پاتوژن غذازاد احتمالی جدید در 300 نمونه گوشت مرغ و بوقلمون بومی و صنعتی در استان چهارمحال‌وبختیاری بود. نمونه‌ها جهت جداسازی کلستریدیوم دیفیسیل در محیط کشت کلستریدیوم دیفیسیل موکسالاکتام نورفلوکساسین آگار پس از یک مرحله غنی‌سازی رشد کردند. برای تعیین مشخصات توکسین، ژن‌های tcdAو tcdB از طریق Multiplex PCR شناسایی شدند. حساسیت آنتی‌بیوتیکی این جدایه‌ها بر اساس آزمون MIC تعیین شد.نتایج نشان داد که بیشترین شیوع مربوط به گوشت مرغ بومی (6/5 درصد) و کمترین شیوع، مربوط به گوشت بوقلمون صنعتی (1 درصد) بود. ژن‌های مسئول تولید سموم tcdB و tcdA در کلیه ایزوله‌های کلستریدیوم دیفیسیل مشاهده گردید. همچنین بیشترین مقاومت مربوط به اریترومایسین (85/11 درصد) و کمترین مقاومت مربوط به ونکومایسین (38/97 درصد) بود. باتوجه به جداسازی دو ژن اصلی ایجاد کننده عفونت بیمارستانی در محیط‌های بالینی در مطالعه حاضر، استقرار سیستم‌های بهداشتی در ارتباط با نگهداری گوشت‌های مورد مطالعه ضروری می‌باشد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

8 - بررسی آلودگی توکسوپلاسما گوندای در شتران استان یزد با واکنش زنجیره‌ای پلیمراز
علیرضا سازمند موسی توسلی بیژن اسمعیل نژاد زهرا اسداللهی علی کاظم نیا سیدحسین حکمتی مقدم

تک یاخته توکسوپلاسما گوندای یکی از مهمترین عوامل بیماری های مشترک بین انسان و حیوانات است. لذا در مطالعه ی مقدماتی حاضر به منظور بررسی آلودگی به این انگل، 50 شتر یک کوهانه ی نر و ماده در سنین مختلف که توسط دامداران منطقه یزد نگه داری می شدند مورد آزمایش قرار گرفتند. ه چکیده کامل

تک یاخته توکسوپلاسما گوندای یکی از مهمترین عوامل بیماری های مشترک بین انسان و حیوانات است. لذا در مطالعه ی مقدماتی حاضر به منظور بررسی آلودگی به این انگل، 50 شتر یک کوهانه ی نر و ماده در سنین مختلف که توسط دامداران منطقه یزد نگه داری می شدند مورد آزمایش قرار گرفتند. همه نمونه های خونی با روش واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) با استفاده از ژن 1Bبررسی شدند. نتایج نشان داد که در هیچ یک از شتران بررسی شده توسط روشPCR آلودگی خونی با توکسوپلاسما گوندای وجود نداشت. مطالعه آزمایشگاهی حاضر اولین تلاش در بررسی آلودگی شترهای ایران به توکسوپلاسما گوندای به روش PCRمی باشد. انجام تحقیقات بیشتر در دیگر نواحی کشور در فهم اهمیت بیماری لازم به نظر می رسد. همچنین آلودگی تجربی شترها جهت بررسی سیر بیماری پیشنهاد می شود. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

9 - کاربرد دنسیتومتری ژنومی برای محاسبه جمعیت نسبی باکتری اشریشیا کلی در روده ‌‌ جوجه‌های گوشتی
علیرضا صیداوی

در این مطالعه روش دنسیتومتری برای محاسبه جمعیت نسبی باکتری‌های اشریشیا کلی در بخش‌های مختلف روده جوجه‌های گوشتی مورد بررسی قرار گرفت. پس از آماده‌سازی نمونه‌های محتویات گوارشی، فرآیند خالص‌سازی و استخراج DNA محتویات دوازدهه، ژئوژنوم، ایلئوم و روده کور صورت گرفت. با استف چکیده کامل

در این مطالعه روش دنسیتومتری برای محاسبه جمعیت نسبی باکتری‌های اشریشیا کلی در بخش‌های مختلف روده جوجه‌های گوشتی مورد بررسی قرار گرفت. پس از آماده‌سازی نمونه‌های محتویات گوارشی، فرآیند خالص‌سازی و استخراج DNA محتویات دوازدهه، ژئوژنوم، ایلئوم و روده کور صورت گرفت. با استفاده از دو جفت آغازگر رفت و برگشت، یک واکنش زنجیره‌ای پلیمراز اختصاصی جهت شناسایی اختصاصی کلیه باکتری‌های اشریشیا کلی و یک واکنش زنجیره‌ای پلیمراز اختصاصی برای شناسایی اختصاصی کلیه باکتری‌های موجود در دستگاه گوارش جوجه‌ها انجام گردید. با مقایسه و تجزیه و تحلیل باندهای مرئی شده بر اساس رویه رگرسیون خطی با برون‌یابی با استفاده از تکنیک دنسیتومتری و نرم‌افزار Gel Proc Analyzer، تراکم باندهای اختصاصی باکتری‌های اشریشیا کلی به‌دست آمد. جمعیت این باکتری در سنین مختلف هم به تفکیک بخش‌های متفاوت دستگاه گوارش جوجه‌ها تعیین شد. نتایج آزمایش نشان داد 000004/0 درصد باکتری‌های دوازدهه، 07/0 درصد کل باکتری‌های ژئوژنوم، 64/0 درصد کل باکتری‌های موجود در ایلئوم و 51/2 درصد باکتری‌های روده کور متعلق به گونه اشریشیا کلی بودند. همچنین باکتری اشریشیا کلی در چهار روزگی، 76/1 درصد کل باکتری‌ها، در چهارده روزگی 01/0 درصد کل باکتری‌ها و در سی روزگی 80/0 درصد کل باکتری‌های دستگاه گوارش جوجه‌ها را تشکیل می‌دهند. علاوه بر این معلوم شد در چهار روزگی در ژئوژنوم، ایلئوم و روده کور به ترتیب 30/0، 05/2 و 97/3 درصد کل باکتری‌ها از گونه اشریشیا کلی بوده و در دوازدهه این باکتری وجود نداشت. در چهارده روزگی هم در ژئوژنوم، ایلئوم و روده کور به ترتیب 000009/0، 00011/0 و 08/0 درصد کل باکتری‌ها از گونه اشریشیا کلی بودند و در دوازدهه این باکتری وجود نداشت. در سی روزگی هم در دوازدهه، ایلئوم و روده کور به ترتیب 00011/0، 009/0 و 40/2 درصد کل باکتری‌ها از گونه اشریشیا کلی بودند و در ژئوژنوم این باکتری وجود نداشت. به‌عنوان نتیجه‌گیری کلی شیوه دنسیتومتری مبتنی بر نتایج PCR را می‌توان روشی سودمند برای تعیین جمعیت نسبی باکتری‌های گونه اشریشیا کلی دستگاه گوارش طیور دانست. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

10 - شناسایی تیلریااویس در کنه‌های ناقل بااستفاده ازروش واکنش زنجیره ای پلیمراز(PCR) در استان لرستان
ناصر حقوقی راد سعید هاشمی محمد عبدی گودرزی

بیماری تیلریوز ناشی از تک‌یاخته داخل سلولی به نام تیلریا است که باعث خسارت اقتصادی به صنعت دامپروری در نقاط مختلف ایران می گردد. مطالعه حاضر با هدف شناسایی تیلریا اویس در کنه های سخت در استان لرستان انجام گردید. 265 نمونه کنه از گوش و سطح بدن و 100 لام گسترش خونی از وری چکیده کامل

بیماری تیلریوز ناشی از تک‌یاخته داخل سلولی به نام تیلریا است که باعث خسارت اقتصادی به صنعت دامپروری در نقاط مختلف ایران می گردد. مطالعه حاضر با هدف شناسایی تیلریا اویس در کنه های سخت در استان لرستان انجام گردید. 265 نمونه کنه از گوش و سطح بدن و 100 لام گسترش خونی از ورید گوش گوسفندانی با تاریخچه تب و کم خونی از 5 منطقه مختلف استان لرستان طی فروردین تامرداد سال 1391 جمع‌آوری شد. استخراج DNA از غدد بزاقی کنه ها صورت گرفت و آزمایش PCR با استفاده ازیک جفت پرایمراختصاصی به منظور تکثیر قطعه ژنی به اندازه 520جفت باز متعلق به ژن SSurRNAتیلریا اویس انجام شد.بررسی میکروسکوپیگسترش‌های خونی، اشکال پیروپلاسمی گونه های تیلریا را در 12 مورد(12%) نشان داد.نتایج PCR نشان داد که 37نمونه(34/24%) ازکنه های ریپی سفالوس سانگوئینوس، شامل 21 کنه ماده(81/13%) و 16کنه نر(52/10%)واجدژنوم تیلریااویس بودند،درحالی که درسایر کنه ها ژنوم این انگل یافت نشد. از کل 265کنه، جنس ریپی سفالوس سانگوئینوس، بیشترین (35/57%) و همافیزالیس پونکتاتا،کمترین (01/3%) میزان فراوانی را نشان داد. با توجه به گسترش وسیع ریپی سفالوس سانگوئینوس نسبت به سایر کنه ها به نظر می رسد که این کنه احتمالاًاصلی ترین عامل انتقال تیلریا اویس در استان لرستان ایران باشد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

11 - تشخیص‌روغن پالم در فرمولاسیون ماست با روشDNA بارکدگذاری به وسیله Real-time PCR
محمد دولت آبادی سید علی مرتضوی حسن روان سالار محمد رضا سعیدی اصل احمد پدرام نیا

10.30495/jfst.2021.1935354.1736

یکی از تقلبات رایج در شیر و فرآورده‌های لبنی، افزودن روغن‌های گیاهی با قیمت پائین نظیر روغن پالم با هدف افزایش سودآوری محصولات می‌باشد. بنابراین نیاز فوری برای توسعه تکنیک‌های شناسایی دقیق، سریع و قابل اعتماد برای محافظت از مصرف‌کنندگان در برابر این گونه از تقلبات وجود چکیده کامل

یکی از تقلبات رایج در شیر و فرآورده‌های لبنی، افزودن روغن‌های گیاهی با قیمت پائین نظیر روغن پالم با هدف افزایش سودآوری محصولات می‌باشد. بنابراین نیاز فوری برای توسعه تکنیک‌های شناسایی دقیق، سریع و قابل اعتماد برای محافظت از مصرف‌کنندگان در برابر این گونه از تقلبات وجود دارد. هدف از پژوهش حاضر، استفاده از روش DNA بارکدگذاری با انجام PCR زمان واقعی به عنوان یک روش قابل اعتماد برای ردیابی تقلب روغن پالم با سطوح 2، 3، 4 ، 5 ، 10، 30، 50 و 100 درصد و نمونه کنترل مثبت و منفی در ماست است. نتایج بدست آمده از مطالعه حاضر حاکی از آن بود که بیشترین و کمترین غلظت DNA استخراج شده به ترتیب متعلق به نمونه روغن پالم 3 درصد و 100 درصد بود؛ در حالی که در بین تمام نمونه‌ها، غلظت DNA استخراج شده در روغن کنجد و بعد از آن در نمونه روغن کنترل کمتر از سایر نمونه‌ها تعیین گردید. در نمونه‌های مورد بررسی کمترین و بیشترین میزان جذب (10mm) به ترتیب مربوط به نمونه روغن کنترل (غیر از پالم) و روغن پالم 100 درصد بود. بین نمونه‌های روغن پالم 4 درصد، 5 درصد و روغن کنجد تفاوت معنی‌داری در میزان جذب وجود نداشت. دامنه مورد نظر برای تشخیص تقلب روغن پالم از 05/0 تا 100 درصد روغن پالم بود. حد کمی‌سازی(LOQ) وحد تشخیص(LOD)به ترتیب برابر با 1/0 درصد و 05/0 درصد روغن پالم بود. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

12 - Survey on Carrier State of Sheep in <i>Chlamydia pecorum</i> Infection
ن. موری بختیاری س. براتی س. گودرزی

Over the last 40 years, evidence has accumulated to suggest the ubiquitous presence of infections with intracellular bacteria of the genus Chlamydia in different livestock species. Different methods to clinical specimens substantiated such widespread, but mostly clinica چکیده کامل

Over the last 40 years, evidence has accumulated to suggest the ubiquitous presence of infections with intracellular bacteria of the genus Chlamydia in different livestock species. Different methods to clinical specimens substantiated such widespread, but mostly clinically unapparent, presumably low-level infections. In this initial epidemiological study, we addressed the question of chlamydial infection of conjunctiva and genital tract in apparently healthy sheep. In this research, 33 sheep and 20 goats which had previously been exposed to the possibility of sexual transmission of Chlamydia, examined by conjunctiva (53 swabs) and vaginal swab (53 swabs). After DNA extraction by boiling method, presence of Chlamydia pecorum was investigated by nested PCR. Chlamydia pecorum strain W73 was used as positive control. In this research, 10 infected swab samples (from 106 swab samples) contain of 7 vaginal (70%) and 3 conjunctival swabs (30%) were detected. All positive vaginal swabs and 3 positive conjunctival swabs were related to aborted and adult animals, respectively. According to higher percentage of Chlamydia pecorum infection in apparently healthy sheep,carrier state in sheep is more probable than goats. Vaginal secretion is more important route of chlamydial infection dissemination towards conjunctival secretion. Because of high risk of chlamydial infection in cows, attention to role of sheep in disease epidemiology was recommended. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

13 - Investigation of Bovine Leukocyte Adhesion Deficiency (BLAD) and Complex Vertebral Malformation (CVM) in a Population of Iranian Holstein Cows
B. Hemati S. Gharaie-Fathabad M.H. Fazeli Z. Namvar M. Ranji

In the present research, molecular detection of bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD) and complex vertebral malformation (CVM)in a population of Iranian Holstein cows has been carried outusing milk somatic cells by polymerase chain reaction-restriction fragment le چکیده کامل

In the present research, molecular detection of bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD) and complex vertebral malformation (CVM)in a population of Iranian Holstein cows has been carried outusing milk somatic cells by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP). The BLAD and CVM are monogenic and autosomal recessive heredity lethal syndrome in Holstein-Friesian cattle. BLAD characterized by affecting the haematopoietic system via reduced expression of the adhesion molecules on neutrophils. CVM characterized by intra-uterine mortality with disorders such as short neck, curved legs, abnormality of ribs and some certain heart abnormalities. In the first step of our research program,tank milk samples from 50 herds were collected. PCR-RFLP was performed to detect a point mutation of both CVM and BLAD genes. After DNA extraction, PCR was amplified using specific primers for 136 bp DNA (CD18 gene) and233 bp DNA (SLC35A3 gene).TaqIand EcoT22I enzymes were used to identify both BLAD and CVM alleles of both genes by digestion of PCR products.In these herds, we did not find any affected herd with the mutant allele of BLAD comparing with a positive evidence but the mutation of SLC35A3 gene found in 17 different herds. In the next step of our study a herd with 120 cows was randomly selected for individual test using blood samples. We showed two cows out of 120 were identified as carriers of this gene. In this herd, the total number of dominant homozygote (AA), heterozygote (Aa) and recessive homozygote (aa) genotypes for CVM were 118, 2 and 0, respectively and the frequency of A and a alleles were 0.992 and 0.008, respectively. The other affected herds will be tested in the next step of our research program. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

14 - بررسی وابستگی شیوع انگل خونی بابزیا در گوسفندان شهرستان اندیمشک در فصل بهار و تابستان، به جنس و سن و فصل
فروغ کجباف بهنام پدرام لیلا درخشان علی میرزاوند شقایق قناد

انگل بابزیا ن یکی از انگل هایی است که سبب بروز خسارات های عمده ای در صنعت دامپروری می باشد. شناسایی دام های حامل بابزیا اهمیت خاصی در کنترل و پیشگیری بیماری دارد. مشاهده میکروسکوپی انگل تک‌یاخته در گسترش خونی رنگ آمیزی شده در فرم حاد کمک کننده است و در آزمون‌های سرولوژی چکیده کامل

انگل بابزیا ن یکی از انگل هایی است که سبب بروز خسارات های عمده ای در صنعت دامپروری می باشد. شناسایی دام های حامل بابزیا اهمیت خاصی در کنترل و پیشگیری بیماری دارد. مشاهده میکروسکوپی انگل تک‌یاخته در گسترش خونی رنگ آمیزی شده در فرم حاد کمک کننده است و در آزمون‌های سرولوژیکی اغلب گونه های بایزیا قابل تفریق نبوده و نتایج منفی و مثبت کاذب نیز عموماً در این آزمون ها مشاهده می شود. هدف از این مطالعه، مقایسه شیوع انگل بابزیا در گوسفندان شهرستان اندیمشک در فصل بهار و تابستان 1401 و بررسی اثر جنسیت و سن بر میزان شیوع بابزیا در این نمونه‌ها، به روش مولکولی واکنش زنجیره‌ای پلیمراز بود. از 100 رأس گوسفند ماده و 100 رأس گوسفند نر به ظاهر سالم، از مناطق مختلف شهرستان اندیمشک به صورت کاملاً تصادفی خونگیری به عمل آمد و به آزمایشگاه ارسال شدند. پس از استخراج DNA از خون، واکنش زنجیره‌ای پلیمراز انجام شد و پس از انجام الکتروفورز و بررسی اسیدنوکلئیک‌ها، اطلاعات به دست آمده با استفاده از نرم افزار spss و روش آماری T- test و محاسبه میانگین و انحراف معیار، مورد آنالیز آماری قرار گرفتند.شیوع انگل خونی بابزیا در گوسفندان ماده بررسی شده بیشتر از شیوع آن در نرها بوده است و همچنین شیوع این انگل خونی در گوسفندان بالای 2 سال حاضر در این مطالعه بیشتر از شیوع آن در گوسفندان زیر 2 سال بود اما اختلاف میان میزان شیوع در نرها و ماده ها و همچنین این اختلاف از نظر سنی، معنا دار نبود. نتایج حاصل از مطالعه‌ی ما نشان داد که میزان شیوع انگل خونی بابزیا در گوسفندان شهرستان اندیمشک در فصل بهار و تابستان، وابسته به جنس و سن و فصل نیست. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

15 - بررسی ژن‌های بتالاکتاماز TEM و SHVدر انتروکوکوس فکالیس مقاوم به جنتامایسین جداشده از گوشت‌های قرمز مصرفی.
رضوان شیروانی محمدرضا مهرابی محسن میرزایی

زمینه و هدف: انتروکوکوسها جز فلور طبیعی دستگاه‌گوارش انسان می‌باشند. توانمندی بالای آن‌ها برای کسب ژن‌های مقاومت به آنتی‌بیوتیک، درمان آن‌ها را با مشکلات جدیدی مواجه کرده است. انتروکوکوس فکالیس یکی از باکتری‌های آلوده‌کننده‌ی گوشت می‌باشد و سبب ایجاد عفونت‌های قابل‌توجه چکیده کامل

زمینه و هدف: انتروکوکوسها جز فلور طبیعی دستگاه‌گوارش انسان می‌باشند. توانمندی بالای آن‌ها برای کسب ژن‌های مقاومت به آنتی‌بیوتیک، درمان آن‌ها را با مشکلات جدیدی مواجه کرده است. انتروکوکوس فکالیس یکی از باکتری‌های آلوده‌کننده‌ی گوشت می‌باشد و سبب ایجاد عفونت‌های قابل‌توجهی در انسان می‌گردد. هدف از این مطالعه بررسی شیوع ژن‌های bla TEM و bla SHV در انتروکوکوس فکالیسهای مقاوم به جنتامایسین در گوشت‌های مصرفی می‌باشد. روش‌ بررسی: 181 نمونه انتروکوکوس از گوشت‌های مصرفی کشتارگاه‌ شهرستان بروجرد پس از جمع‌آوری با استفاده از آزمایش‌های بیوشیمیایی شناسایی شدند. سپس آزمایش حساسیت آنتی‌بیوتیکی بر روی این جدایه‌ها با روش دیسک دیفیوژن بر اساس دستور CLSI انجام گردید و در نهایت فراوانی ژن‌های bla TEM و bla SHV در سویه‌های مقاوم به جنتامایسین با استفاده از پرایمرهای اختصاصی، با روش PCR موردبررسی قرار گرفت. یافته‌ها: از 181 نمونه، 81 نمونه انتروکوکوس فکالیس جدا شد. با آزمایش آنتی‌بیوگرام مشخص گردید 96/29% از سویه‌ها به اریترومایسین، 56/79% به پنی‌سیلین، 41/96% به تتراسیکلین، 39/50% به آمپی‌سیلین، 39/50% به کلرامفنیکل،15/86% به لینزولید، 8/64% به جنتامایسین، 4/38% به استرپتومایسین، 3/70% به سیپروفلوکساسین و 2/46% به مروپنم مقاوم بودند و در بین 7 سویه‌ی مقاوم به جنتامایسین ژن‌های bla TEM و bla SHV مشاهده نشد. نتیجه‌گیری: با توجه به این موضوع که ژن‌های مولد آنزیم‌های بتالاکتاماز از طریق پلاسمید به‌ آسانی منتقل می‌شوند، عدم ردیابی ژن‌های مذکور در میان باکتری‌های موردبررسی نشان می‌دهد که این ژن‌ها همراه ژن‌های عامل مقاومت به جنتامایسین منتقل نمی‌شوند، بنابراین رابطه‌ی منطقی و معنی‌داری بین این ژن‌ها و آنتی‌بیوتیک مورد‌بررسی مشاهده نشد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

16 - غربالگری مولکولی مخمرهای مولد آستاگزانتین تراوشات درختان توس استان البرز
فائزه اجرلو محسن واعظ جعفر همت

سابقه و هدف: مخمرهای مولد کاروتنوئید دارای پراکنش وسیعی در مناطق مختلف دنیا می‌باشند. در این بین جداسازی مخمرهای مولد کاروتنوئید با ارزش آستاگزانتین تنها از مناطق محدود و زیستگاه‌های خاص گزارش شده‌اند. این مطالعه با هدف بکارگیری روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز چندگانه برای چکیده کامل

سابقه و هدف: مخمرهای مولد کاروتنوئید دارای پراکنش وسیعی در مناطق مختلف دنیا می‌باشند. در این بین جداسازی مخمرهای مولد کاروتنوئید با ارزش آستاگزانتین تنها از مناطق محدود و زیستگاه‌های خاص گزارش شده‌اند. این مطالعه با هدف بکارگیری روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز چندگانه برای غربالگری مولکولی سریعتر جدایه‌ها با توان تولید آستاگزانتین از تراوشات درختان توس استان البرز و بررسی کارآیی آن انجام شد.مواد و روش‌ها: این پژوهش بصورت مقطعی با نمونه‌برداری در اردیبهشت ماه 1397 از یکی از رویشگاه‌های طبیعی درختان توس گونه بتولا پندولا در استان البرز صورت پذیرفت. پس از جداسازی مخمرها بر روی محیط‌های انتخابی و خالص‌سازی کلنی‌هایی با رنگ‌های متنوع صورتی تا قرمز، اسیدنوکلئیک ژنومی مخمرها استخراج و غربالگری مولکولی جدایه‌ها از نظر قابلیت تولید آستاگزانتین با واکنش زنجیره‌ای پلیمراز چندگانه بررسی گردید.یافته ها: از مجموع 42 کلنی واجد رنگدانه در هنگام نمونه‌برداری و جداسازی اولیه، تعداد 23 کلنی به رنگ‌های صورتی تا قرمز با روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز چندگانه مورد ارزیابی قرار گرفتند. از بین این جدایه‌ها سه مورد مثبت و بقیه منفی تشخیص داده شدند. صحت نتایج با تعیین ترادف ریبوزومی تایید شد.نتیجه‌گیری: مطالعه حاضر بیانگر قابلیت روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز چندگانه در غربالگری مولکولی سریع و مقرون به صرفه جدایه‌های مخمری مولد آستاگزانتین و امکان بکارگیری این روش برای بررسی زیستگاه‌های طبیعی دیگر این مخمرها می‌باشد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

17 - مطالعه بیوانفورماتیک و روابط فیلوژنتیک جدایه‌های ایرانی باکتری باسیلوس تورینجینسیس با استفاده از توالی ژن SrDNA16 16
مریم راشکی مجتبی مرتضوی

10.30495/jmw.2022.1959243.2021

سابقه و هدف: باکتری گرم مثبت باسیلوس تورینجینسیس بلور‌های پروتین‌ با خاصیت حشره‌کشی تولید ‌می‌کند. تحلیل توالی‌های کوچک ژنrDNA برای مطالعه تکامل و رده‌بندی موجودات زنده به‌کار‌ می‌رود. این مطالعه با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره‌ای پلیمراز ‌روی توالی S Rdna 16 از پنج جد چکیده کامل

سابقه و هدف: باکتری گرم مثبت باسیلوس تورینجینسیس بلور‌های پروتین‌ با خاصیت حشره‌کشی تولید ‌می‌کند. تحلیل توالی‌های کوچک ژنrDNA برای مطالعه تکامل و رده‌بندی موجودات زنده به‌کار‌ می‌رود. این مطالعه با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره‌ای پلیمراز ‌روی توالی S Rdna 16 از پنج جدایه‌ بومی باسیلوس تورینجینسیس انجام‌ شد. مواد و روشها: بررسی ویژگی‌ها و روابط فیلوژنتیک میان پنج توالی جدایه‌های بومی همراه با جدایه‌های دیگر موجود در بانک ژن و سایر گونه‌های جنس باسیلوس، با نرم‌افزار مسکوئیت و پایگاه leBIBIQBPP انجام‌ شد. یافتهها: پنج جدایه بومی به میزان 92/06 تا 99/93 درصد با یکدیگر و به میزان 99/73 تا ۱۰۰ درصد با سایر جدایه‌های باسیلوس تورینجینسیس شباهت داشتند. درخت فیلوژنتیک نشان ‌داد Bt 1019،Bt 1020 وBt 1039 در گروه اول وBt 1001 وBt 1091 در گروه دوم قرار‌گرفتند. بر اساس تحلیل توالیBt 1001 با کمک leBIBIQBPP، کمترین فاصله با با‌سیلوس فریگوریتولرانس بدست ‌آمد، همچنین توالیBt 1091 نیز بیشترین شباهت را با باکتری مذکور نشان‌ داد. توالی باسیلوس آنتراسیس به Bt 1019 نزدیک بود. توالیBt 1020 بیشترین نزدیکی را با باسیلوس سرئوس داشت. در مورد Bt 1039 علاوه بر باسیلوس سرئوس، کمترین فاصله با باسیلوس مارکورستینکتوم مشاهده ‌شد. نتیجهگیری: بلور‌های پروتینی در باکتری‌های بومی مشاهده ‌شدند. بلاست توالی ژن S rDNA 16 در جدایه‌های بومی بیشترین شباهت را به جدایه‌های باسیلوس تورینجینسیس موجود در بانک ژن نشان ‌داد. همچنین به دلیل استخراج بلورهای سم از جدایه ها، نتایج پیش‌بینی‌ کرد سه جدایه بومی Bt 1019،Bt 1020 وBt 1039 علیه آفات بالپولکداران و دو جدایهBt 1001 وBt 1091 علیه آفات سخت‌ بالپوش می‌توانند موثر و سمی باشند. پرونده مقاله

فهرست مقالات واکنش زنجیره‌ای پلیمراز

سکوی نشر دانش

پیوندهای سایت

مراکز مرتبط

پشتیبانی

صفحات رسمی