بررسی فراوانی و الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی عفونت های Acinetobacter spp. در مراکز درمانی شهرکرد

محورهای موضوعی : زیست شناسی سلولی تکوینی گیاهی و جانوری ، تکوین و تمایز ، زیست شناسی میکروارگانیسم

توحید پیری قراقیه ¹ , عباس دوستی ² , سیدعباس میرزایی ³

1 - گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران
2 - مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران.
3 - مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی، انستیتوی علوم پایه بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد ، شهرکرد ، ایران.

تاریخ دریافت : 1400/02/30 تاریخ پذیرش : 1400/06/01 تاریخ انتشار : 1400/09/01

کلید واژه: طراحی پرایمر, Acinetobacter spp, حساسیت آنتی بیوتیکی,

چکیده مقاله :

مطالعه انجام شده به برآورد میزان شیوع و الگوی مقاومت ضد میکروبی ایزوله های Acinetobacter spp. از نمونه های مختلف بالینی پرداخته است. با نرم افزارهای بیوانفورماتیکی Primer Express و Gene Runner طراحی پرایمر برای جنس Acinetobacter spp. انجام شد. تایید صحت پرایمر توسط ابزار آنلاین BLASTn و برنامه Sequence Match انجام شد. ایزوله های Acinetobacter از نمونه‌های مختلف بالینی با روش‌های استاندارد بیوشیمیایی و تست PCR شناسایی شدند. آزمایشات حساسیت ضدمیکروبی و تشخیص بیوفیلم برای ایزوله‌های شناسایی شده به روش استاندارد دیسک‌دیفیوژن مطابق پروتکل CLSI‌ و میکروتیترپلیت انجام شد. پرایمر طراحی شده Acinetobacter spp را با Query Cover و نمره Per. Ident برابر با 100% شناسایی کرد. از 60 نمونه بالینی، 243 ایزوله باکتریایی به دست آمد.‌131ایزوله (9/53 %) مربوط به باکتری های گرم مثبت و 112 ایزوله (09/46 %) مربوط به باکتری های گرم منفی بود که 43 ایزوله (69/17 %) به عنوان Acinetobacter ، شناسایی شد. مطابق آزمون PCR 31 سویه (5/77 %) به عنوان Acinetobacter baumannii، 7 سویه (5/17 %) به عنوانAcinetobacter lwoffii ، 2 سویه (5%) به عنوان junii Acinetobacter شناسایی شد. مطالعه حساسیت آنتی بیوتیکی نشان داد که تمام سویه های جداشده MDR بوده و 5/87 % ایزوله ها XDR بودند. تمام ایزوله های Acinetobacter بیوفیلم مثبت بوده و با میانگین کل 213/0 به عنوان بیوفیلم قوی شناخته شدند. با توجه به بررسی انجام شده پیشگیری و جلوگیری از عفونت این جنس باکتریایی خصوصا Acinetobacter baumannii بسیار مهم و ضروری می باشد.

چکیده انگلیسی:

the study estimated the prevalence and pattern of antimicrobial resistance of Acinetobacter spp. isolate from different clinical specimens. Primer design for Acinetobacter spp. was performed with Bioinformatics software Primer Express and Gene Runner. Primer authentication was performed by BLASTn online tool and Sequence Match program. Acinetobacter isolates were identified from different clinical specimens by standard biochemical methods and PCR tests. Antimicrobial susceptibility tests and biofilm detection were performed for isolates identified by standard disk diffusion method according to CLSI‌ protocol and Microtiter plate. Acinetobacter spp. were identified by designed primer with Query Cover and Per. Ident 100%. From 60 clinical samples, 243 bacterial isolates were obtained. 131 isolates (53.9%) were related to gram-positive bacteria and 112 isolates (46.09%) were gram-negative bacteria, of which 43 isolates (17.69%) Were identified as Acinetobacter spp. According to the PCR test, 31 strains (77.5%) were identified as Acinetobacter baumannii, 7 strains (17.5%) as Acinetobacter lwoffii, 2 strains (5%) as Acinetobacter junii. Antibiotic susceptibility study showed that all isolated strains were MDR and 87.5% of isolates were XDR. However, only 12.5% of the isolates were sensitive to carbapenems, All Acinetobacter isolates were biofilm positive and were identified as strong biofilms with a total mean of 0.213. According to the study, it is clear that infection with Acinetobacter can lead to significant challenges in the country's health care system in the future. To this end, finding solutions to prevent infection of this bacterial genus, especially Acinetobacter baumannii, is very important and necessary.