فهرست مقالات عباس دوستی


  • مقاله

    1 - بررسی فراوانی و الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی عفونت های Acinetobacter spp. در مراکز درمانی شهرکرد
    زیست شناسی تکوینی , شماره 4 , سال 13 , پاییز 1400
    مطالعه انجام شده به برآورد میزان شیوع و الگوی مقاومت ضد میکروبی ایزوله های Acinetobacter spp. از نمونه های مختلف بالینی پرداخته است. با نرم افزارهای بیوانفورماتیکی Primer Express و Gene Runner طراحی پرایمر برای جنس Acinetobacter spp. انجام شد. تایید صحت پرایمر توسط ابزا چکیده کامل
    مطالعه انجام شده به برآورد میزان شیوع و الگوی مقاومت ضد میکروبی ایزوله های Acinetobacter spp. از نمونه های مختلف بالینی پرداخته است. با نرم افزارهای بیوانفورماتیکی Primer Express و Gene Runner طراحی پرایمر برای جنس Acinetobacter spp. انجام شد. تایید صحت پرایمر توسط ابزار آنلاین BLASTn و برنامه Sequence Match انجام شد. ایزوله های Acinetobacter از نمونه‌های مختلف بالینی با روش‌های استاندارد بیوشیمیایی و تست PCR شناسایی شدند. آزمایشات حساسیت ضدمیکروبی و تشخیص بیوفیلم برای ایزوله‌های شناسایی شده به روش استاندارد دیسک‌دیفیوژن مطابق پروتکل CLSI‌ و میکروتیترپلیت انجام شد. پرایمر طراحی شده Acinetobacter spp را با Query Cover و نمره Per. Ident برابر با 100% شناسایی کرد. از 60 نمونه بالینی، 243 ایزوله باکتریایی به دست آمد.‌131ایزوله (9/53 %) مربوط به باکتری های گرم مثبت و 112 ایزوله (09/46 %) مربوط به باکتری های گرم منفی بود که 43 ایزوله (69/17 %) به عنوان Acinetobacter ، شناسایی شد. مطابق آزمون PCR 31 سویه (5/77 %) به عنوان Acinetobacter baumannii، 7 سویه (5/17 %) به عنوانAcinetobacter lwoffii ، 2 سویه (5%) به عنوان junii Acinetobacter شناسایی شد. مطالعه حساسیت آنتی بیوتیکی نشان داد که تمام سویه های جداشده MDR بوده و 5/87 % ایزوله ها XDR بودند. تمام ایزوله های Acinetobacter بیوفیلم مثبت بوده و با میانگین کل 213/0 به عنوان بیوفیلم قوی شناخته شدند. با توجه به بررسی انجام شده پیشگیری و جلوگیری از عفونت این جنس باکتریایی خصوصا Acinetobacter baumannii بسیار مهم و ضروری می باشد. پرونده مقاله

  • مقاله

    2 - شناسایی سیستم ترشحی T6SS و پورین غشایی موثر در مقاومت آنتی‌‏بیوتیکی در جدایه‌های اسینتوباکتر بامانی مقاوم به چند دارو
    دنیای میکروب ها , شماره 1 , سال 14 , بهار 1400
    سابقه و هدف: سیستم ترشحی تیپ 6 (T6SS) و وجود پمپ افلاکس قوی به واسطه پورین غشایی، از شاخصهای مهم بیماری‌زایی اسینتوباکتر بامانی میباشند. این مطالعه با هدف ردیابی سیستم ترشحی T6SS و پورین غشایی و همچنین الگوی مقاومت آنتیبیوتیکی در جدایههای کلنیکی انجام شد.مواد و روش‌ه چکیده کامل
    سابقه و هدف: سیستم ترشحی تیپ 6 (T6SS) و وجود پمپ افلاکس قوی به واسطه پورین غشایی، از شاخصهای مهم بیماری‌زایی اسینتوباکتر بامانی میباشند. این مطالعه با هدف ردیابی سیستم ترشحی T6SS و پورین غشایی و همچنین الگوی مقاومت آنتیبیوتیکی در جدایههای کلنیکی انجام شد.مواد و روش‌ها: این پژوهش به صورت مقطعی - توصیفی بر روی 33 سویه اسینتوباکتر بامانی جدا شده از نمونههای بالینی خون، ادرار، تراشه تنفسی و زخم انجام شد. حساسیت آنتیبیوتیکی جدایهها با روش دیسک دیفیوژن مطابق پروتکل CLSI مورد بررسی قرار گرفت. همچنین فراوانی ژنهای کدکننده افکتور پروتینهای ترشح شده از سیستم ترشحی تیپ 6 و پورین غشایی با استفاده از آزمون Multiplex PCR انجام شد.یافته‌ها: با استفاده از روش مولکولی، 31 سویه اسینتوباکتر بومانی شناسایی شد. جدایه های اسینتوباکتر بامانی حساسیت 93/55 % به کلیستینسولفات نشان دادند. کمترین میزان حساسیت مربوط به پنج کلاس آنتی بیوتیکی فلوروکینولونها (12/9%)، سفالوسپورینها (6/45%)، آمینوگلیکوزیدها (6/45%)، ماکرولیدها (16/1%) و آنتیبیوتیک مهارکننده (12/1%) بود. نتایج نشان داد که علاوه بر فنوتیپ MDR (100% جدایهها)، 20 جدایه (64/52 %) فنوتیپ XDR دارند. فراوانی ژن hcp در 18 جدایه (58%) و ompC در تمامی جدایه‌ها (100%) تایید شد. همچنین فراوانی ژن ompC در جدایههای MDR و XDR ،100% بود. اما ژن hcp تنها در فنوتیپ XDR با فراوانی 90% مشاهده شد.نتیجه‌گیری: نتایج این پژوهش تاثیر احتمالی ژن hcp در سازگاری جدایههای اسینتوباکتر بامانی با شرایط نامساعد و بروز فنوتیپ مقاومت را نشان داد. پرونده مقاله

  • مقاله

    3 - بررسی فراوانی سویههای اسینتوباکتر بومانی حامل ژنهای ویرولانسLPS و سیدروفور جدا شده از نمونههای بالینی
    دنیای میکروب ها , شماره 4 , سال 14 , پاییز 1400
    سابقه و هدف: امروزه افزایش میزان مقاومت به آنتیبیوتیکها در جدایههای اسینتوباکتر بومانی به نگرانی عمده جهانی تبدیل شده است. مکانیسم تامین مواد غذایی به واسطه تامین آهن از طریق سیدروفورها از مهمترین عوامل سازگاری کننده باکتری با شرایط نامساعد میباشد. بررسی فراوانی حضو چکیده کامل
    سابقه و هدف: امروزه افزایش میزان مقاومت به آنتیبیوتیکها در جدایههای اسینتوباکتر بومانی به نگرانی عمده جهانی تبدیل شده است. مکانیسم تامین مواد غذایی به واسطه تامین آهن از طریق سیدروفورها از مهمترین عوامل سازگاری کننده باکتری با شرایط نامساعد میباشد. بررسی فراوانی حضور ژنهای سیدروفور در جدایههای بالینی درک بالایی از مکانیسم مقاومت باکتری را فراهم میکند. از این رو در این مطالعه فراوانی مقاومت آنتیبیوتیکی در جدایههای دارای ژن سیدروفور بررسی شد. مواد و روشها: نمونههای بالینی از بیماران بستری شامل نمونههای تنفسی، زخم، ادرار و خون جمعآوری شد. آزمونهای بیوشیمیایی برای جداسازی باکتری و آزمون مولکولی PCR برای تایید سویههای اسینتوباکتر بومانی و بررسی حضور ژنهای هدف انجام شد. تست حساسیت میکروبی به روش دیسک دیفیوژن مطابق با دستورالعمل CLSI انجام و ارتباط بین مقاومت میکروبی با بیان ژنهای سیدروفور در جدایهها بررسی شد. یافتهها: مطابق با نتایج PCR، از 64 جدایه شناسایی شده به وسیله آزمونهای بیوشیمایی، 28 مورد (43/75%) به عنوان اسینتوباکتر بومانی شناسایی شد. تمام 28 جدایه (100%) دارای ژنهای LPS ، و 15 جدایه (53/57%) دارای ژن سیدروفور بودند که با 93/3% مقاومت به کارباپنمها و 26/6% به کلیستین سولفات و انواع آنتیبیوتیکها به عنوان سویههایXDR وMDR شناسایی شدند. نتیجه گیری: مقاومت به آنتیبیوتیکها و شیوع ژنهای سیدروفور و LPS در سویههای اسینتوباکتر بومانی نگران کننده است و نیاز به اقدامات کنترل عفونت از جمله مدیریت مصرف آنتیبیوتیکها و شناسایی سریع جدایههای مقاوم میباشد. پرونده مقاله