-
Open Access Article
1 - An assay on the los1 gene in Ascomycota
A. Azizi, V. Khalaj, M. Bayat,Ascomycota contains the most numerous groups of fungi and playing important roles in most of ecosystems. Diverse aspects of their activities, ascomycetes are known as fascinating subjects of biological studies, including exploration of new strategies for alteration of f MoreAscomycota contains the most numerous groups of fungi and playing important roles in most of ecosystems. Diverse aspects of their activities, ascomycetes are known as fascinating subjects of biological studies, including exploration of new strategies for alteration of fungal lifespan. The gene los1, directly involving in nucleus-cytoplasm tRNA trafficking, plays a critical role in fungal growth rate, as well as its drug resistance. Here, we investigated an upstream region of the gene los1; among 10 species belong to Ascomycota. Furthermore, its homologue was knocked out from Aspergillus fumigatus, and its subsequent influences on any changes in expression of some related genes and drug resistance were evaluated. Our results suggest that in Ascomycota, the upstream region of los1 contains recognition sites for transcription factors SFP1 and FKH1. There is also a low probability that the transcription factor YAP6 binds to the upstream region of this gene. Besides, its deletion may lead to increase of fungal lifespan, as well as its resistance to bleomycin, while it presents more sensitivity to cycloheximide. The results of this study can be used in more targeted and intelligent selection of fungal antibiotics. In addition, information about the role of los1 gene in the growth and lifespan of ascomycetes, as well as their drug resistance and sensitivity, can be used in the design and manufacture of industrial strains. Manuscript profile -
Open Access Article
2 - The role of cis-acting elements of the promoter region in regulating the spatio-temporal expression of the salinity stress-responsive NHX1 gene in Triticum aestivum L.
Shadi Heidari Baharak Heidari Peivand HeidariSoil salinity is one of the most serious issues in wheat cultivation in Iran, which has a detrimental impact on crop production and plant growth. To investigate genes associated with the response to salinity stress in wheat, 3567 expressed sequence tags (ESTs) were anal MoreSoil salinity is one of the most serious issues in wheat cultivation in Iran, which has a detrimental impact on crop production and plant growth. To investigate genes associated with the response to salinity stress in wheat, 3567 expressed sequence tags (ESTs) were analyzed from salinity-tolerant wheat leaf and root libraries collected from the Harvard University Database. EGassembler, CLCbio and IDEG6 softwares were used to analyze gene expression and the GoMapMan comparative classification tool was used to classify functional catalogs. Statistically significant differences were observed between the genes of the two libraries in 7 functional groups. The results showed that NHX1 ion exchangers play an important role in ion homeostasis and salinity stress tolerance in both leaf and root tissues. Because a full understanding of the gene transcription regulation system depends on functional analysis of cis-acting elements, the regulatory elements in the 5' regulatory region of the NHX1 genes were identified using Plant CARE databases. Several regulatory elements related to biological processes, hormonal regulation, and stress response and environmental stimuli were identified. This study provides an insight into the role of the promoter’s cis-acting in regulating the spatio-temporal expression of NHX1 gene under salinity stress. Manuscript profile -
Open Access Article
3 - The comparative effect of prebiotic, growth promoter antibiotic, probiotic, yeast cell wall and acid fire on broiler chickens performance
افشین Zakeri مهدی Taghi Nejad Roudbaneh آیدین Azizpour وحید HajiabalooIn this study 600 Cobb 500 broiler chickens were divided in six similar groups (A, B, C, D, E&F) with 100 chickens in each group (with four replicates of 25 chickens in each group). 100 g/ton growth promoter antibiotic in experimental group (B), 100 g/ton Prebiotic MoreIn this study 600 Cobb 500 broiler chickens were divided in six similar groups (A, B, C, D, E&F) with 100 chickens in each group (with four replicates of 25 chickens in each group). 100 g/ton growth promoter antibiotic in experimental group (B), 100 g/ton Prebiotic in experimental group (C), 800 g/ton Acid fires in experimental group (D), 1 kg/ton MOS in experimental group (E) and 4 kg/ton Yeast cell wall in experimental group (F) were added to the basic diets however the control group (A) chickens were fed only with the basic diet. Every week 100 chickens from each group were selected randomly and productive parameters such as weight gain, FCR, EEF, mortality, feed intake (FI) were calculated. On days 9, 17 and 25 of growth (1 day before and 7, 14 days after first Newcastle B1 vaccination), from each groups, each time 20 chickens were chosen randomly and serum antibody titres of these chickens were measured against Newcastle vaccine by HI test. The results obtained from statistical analysis indicated that using natural growth promoting substances not only increases humoral immunity but it also leads to improvement of productive parameters (p<0.05). Manuscript profile -
Open Access Article
4 - Promoting effects of calcium on the performance of Cu-MgO catalyst in hydrogenation of furfuraldehyde
Vahid Farzaneh Samira Shirvani Samahe Sadjadi Mohammad Ghashghaee -
Open Access Article
5 - بررسی ناحیه تنظیمی ژن GDF8 میوستاتین در گوسفند ایرانی
م. کمانگر ه.ا. روشنفکر ح. گلهداری آ.س. صدر م. ممویی م.ت. بیگی نصیریمیوستاتین یک فاکتور رشد و عضوی از سوپر خانواده TGFβمیباشد. فاکتورهای رشد TGFβ نقش تنظیمی در توسعه جنینی و هومئوستازی بافتها در بلوغ دارند. جهش در نواحی کدکننده ژن میوستاتین در گاو منجر به هایپرپلازی (افزایش در تعداد فیبرها) ماهیچهها و در نتیجه باعث جل Moreمیوستاتین یک فاکتور رشد و عضوی از سوپر خانواده TGFβمیباشد. فاکتورهای رشد TGFβ نقش تنظیمی در توسعه جنینی و هومئوستازی بافتها در بلوغ دارند. جهش در نواحی کدکننده ژن میوستاتین در گاو منجر به هایپرپلازی (افزایش در تعداد فیبرها) ماهیچهها و در نتیجه باعث جلوگیری در تکثیر میوبلاستها میشود. در گاو کاهش فعالیت این ژن باعث ظهور فنوتیپ ماهیچه مضاعف میشود که در بعضی از نژادهای گاوهای اروپایی مشاهده میشود. وجود چند شکلی در ژن میوستاتین در گوسفند نیز بررسی شده است. ژن میوستاتین در توسعه ماهیچهها مؤثر است. این تحقیق به منظور توالییابی ناحیهی پروموتور ژن میوستاتین و تعیین جهشهای احتمالی که باعث تغییر بیان ژن میشوند، انجام شد. در این تحقیق DNA از خون 15 گوسفند عربی و 15 گوسفند کردی استخراج گردید و برای تکثیر قطعه 1034 جفت بازی ژن میوستاتین مورد استفاده قرار گرفت. سه جهش در جایگاه 430، 450 و 530 مشاهده گردید. Manuscript profile -
Open Access Article
6 - The Effects of Different Levels of Nettle Urtica dioica L. (Urticaceae)Medicinal Plant in Starter and Grower Feeds on Performance,Carcass Traits, Blood Biochemical and Immunity Parameters of Broilers
S. Nasiri A. Nobakht A.R. Safamehr -
Open Access Article
7 - تجزیه و تحلیل مولکولی و بیوانفورماتیک تنوع آللی پروموتر ژن IGFBP2 در گوسفندان بومی نژادهای ماکویی و لری بختیاری
ع. ولیپور کوتنایی ا. فرهادی س.ح. حافظیان م. قلیزادههدف از پژوهش حاضر تجزیه و تحلیل مولکولی و بیوانفورماتیک تنوع آللی پروموتر ژن IGFBP2 در ارتباط با برخی صفات مهم اقتصادی در گوسفندان بومی نژادهای ماکویی و لری بختیاری بوده است. نمونه­های DNA از خون 120 رأس گوسفند ماکویی و 200 رأس گوسفند لری بختیاری استخراج و یک توالی Moreهدف از پژوهش حاضر تجزیه و تحلیل مولکولی و بیوانفورماتیک تنوع آللی پروموتر ژن IGFBP2 در ارتباط با برخی صفات مهم اقتصادی در گوسفندان بومی نژادهای ماکویی و لری بختیاری بوده است. نمونه­های DNA از خون 120 رأس گوسفند ماکویی و 200 رأس گوسفند لری بختیاری استخراج و یک توالی 297 جفت بازی مربوط به ناحیه بالادست ژن مورد مطالعه تکثیر و با تکنیک SSCP تعیین ژنوتیپ شد. دو ژنوتیپ AB و BB در نژادهای ماکویی و لری بختیاری مشاهده شدند. سپس از هر ژنوتیپ یک نمونه برای تعیین توالی ارسال شد. پس از دریافت نتایج توالی­یابی، بررسی همولوژی توالی­ها با برنامه BLAST روی سایت NCBI انجام شد. هم­ترازی توالی­های بدست آمده و مقایسه آنها با توالی رفرنس از بانک ژنیبا ابزار با CLUSTALW نرم­افزار Bio Edit صورت گرفت. علاوه بر این، شناسایی موتیف­های DNA با استفاده از نرم­افزار DNASIS MAX انجام شد. بررسی­های بیوانفورماتیک تفاوت­هایی را بین توالی ژنوتیپ­های مختلف IGFBP2 نشان داد. 10 موتیف در توالی پروموتر ژن IGFBP2 مشاهده شد، به ­طوری که بیشترین فراوانی مربوط به موتیف CAP­_site بود. بررسی ارتباط آماری با پروسه GLM نرم­افزار آماری SAS وجود ارتباط معنی­دار آماری (05/0P<) بین پروموتر ژن IGFBP2 و صفت دور ران (TR) در گوسفند ماکویی را نشان داد. انجام پژوهشهای بیشتر در سایر نژادهای بومی و بررسی سایر نواحی ژنی همراه با نواحی تنظیمی این جایگاه پیشنهاد می­شود. Manuscript profile -
Open Access Article
8 - Comparative Study of Probiotic, Acidifier, Antibiotic Growth Promoters and Prebiotic on Activity of HumoralImmune and Performance Parameters of Broiler Chickens
S. Mahdavi A. Zakeri Y. Mehmannavaz A. Nobakht -
Open Access Article
9 - توزیع فراوانی آللها در ناحیه ′5 ژنهای CYP19 و ERα در گاوهای سیمنتال و سه نژاد بومی ایران
ف. محمد نژاد سنگدهی ق. رحیمی میانجی م. صفدری شاهرودی س.ع. رضوی-ششده م. غلامیپژوهش حاضر به منظور بررسی دو جایگاه پلی مورف از ژن CYP19 (PvuII و MspI) و یک جایگاه پلی مورف از ژن ERα (SnaBI) در چهار نژاد گاو شامل مازندرانی، تالشی، سیستانی و سیمنتال انجام شد. در مجموع 278 نمونه برای ژن CYP19 و 206 نمونه برای ژن ERα با استفاده از تکنیک PC Moreپژوهش حاضر به منظور بررسی دو جایگاه پلی مورف از ژن CYP19 (PvuII و MspI) و یک جایگاه پلی مورف از ژن ERα (SnaBI) در چهار نژاد گاو شامل مازندرانی، تالشی، سیستانی و سیمنتال انجام شد. در مجموع 278 نمونه برای ژن CYP19 و 206 نمونه برای ژن ERα با استفاده از تکنیک PCR-RFLP تعیین ژنوتیپ شدند. برای جایگاه CYP19/PvuII، فراوانی آلل A دامنه­ای از 89/0 در نژاد مازندرانی تا 98/0 در نژاد تالشی داشت. برای جایگاه CYP19/MspI، تالشی تنها نژاد مونو مورف با ژنوتیپ AA بود. سایر نژادها پلی مورف بودند و فراوانی آلل A از 93/0 (سیمنتال) تا 98/0 (سیستانی) متغیر بود. ژنوتیپ BB در نمونه مورد مطالعه مشاهده نشد. با در نظر گرفتن دو جایگاه در ترکیب با یکدیگر، تنها 5 ژنوتیپ از 8 ژنوتیپ ترکیبی ممکن مشاهده شد. برای جایگاه ERα/SnaBI، همه جمعیت­ها پلی مورف بودند. بیشترین و کمترین فراوانی آلل A به ترتیب در نژادهای سیستانی (55/0) و سیمنتال (96/0) مشاهده شد. بر اساس شاخص نی، بیشترین فاصله ژنتیکی بین دو نژاد سیستانی و سیمنتال، و کمترین فاصله ژنتیکی بین دو نژاد مازندرانی و تالشی مشاهده شد. نتایج پژوهش حاضر نشان دهنده وجود اختلاف معنی دار در فراوانی­های ژنوتیپی و آللی در بین چهار نژاد مورد بررسی بود. این یافته­ها ممکن است در مطالعات آتی مانند مطالعات ارتباطی برای صفات عملکردی در اصلاح نژاد گاو مورد استفاده قرار گیرد. Manuscript profile -
Open Access Article
10 - Effect Analysis of Prolactin (PRL) Gene Polymorphisms on Chicken Egg Productivity (Gallus gallus domesticus) BC1 from Crossbreeding between Pelung and Layer Chicken
R. Kilatsih A.B.I. Perdamaian T. Joko S.H. Purwanto B.S. Daryono -
Open Access Article
11 - Dual Promoter Vector Construction for Simultaneous Gene Expression Using Spliced Overlap Extension by Polymerase Chain Reaction (SOE-PCR) Technique
م.ه. سخاوتی م. طهمورثپور ط. عباسی-دلوئی س. یوسفی ع.ا. خبیری ر. اکبری E. شکاری -
Open Access Article
12 - تاثیر اسید جیبرلیک و نیتروژن بر ویژگیهای خوراکی بنفشه بومی (Viola odorata) و تجاری (Viola tricolor)
ندا نکویار روح انگیز نادری داود هاشم آبادی علی محمدی ترکاشوندپرورش گلهای خوراکی از جمله بنفشه که بومی ایران است راهکاری مناسب جهت افزایش دسترسی بشر به این منابع جدید و با ارزش غذایی است. در این راستا در پژوهش حاضر اثر متقابل اسید جیبرلیک (GA) (0، 150 و 300 میلیگرم در لیتر) و نیتروژن (N) (0، 100 و 200 میلیگرم در لیتر) روی ویژگی Moreپرورش گلهای خوراکی از جمله بنفشه که بومی ایران است راهکاری مناسب جهت افزایش دسترسی بشر به این منابع جدید و با ارزش غذایی است. در این راستا در پژوهش حاضر اثر متقابل اسید جیبرلیک (GA) (0، 150 و 300 میلیگرم در لیتر) و نیتروژن (N) (0، 100 و 200 میلیگرم در لیتر) روی ویژگیهای دو گونه بنفشه (Viola tricolor and Viola odorata) بصورت آزمایش فاکتوریل در قالب طرح کاملا تصادفی در سه تکرار بررسی شد. نتایج نشان داد که کاربرد اسید جیبرلیک و نیتروژن بطور معناداری موجب بهبود ویژگیهای خوراکی در هر دو رقم بنفشه میشود. بطوریکه بیشترین پروتئین، کاروتنوئید، آهن و روی گلبرگ در هر دو گونه بنفشه با کاربرد "GA300 × N200" بدست آمد. مقدار آنتوسیانین گلبرگ در بنفشه معطر با کاربرد "GA0 × N100" (58.32 mg 100g-1 F.W.) و در بنفشه تجاری با کاربرد "GA300 × N100" (66.84 mg 100g-1 F.W.) بیشترین مقدار بود. بنفشه تجاری از نظر سلنیوم غنیتر از بنفشه معطر بود و تیمارهای "GA300 × N200"، "GA300 × N100" و "GA150 × N200" بیشترین غلظت سلنیوم را در بنفشه تجاری بخود اختصاص دادند. در هر دو نوع بنفشه بیشترین فلاونوئید طول موجهای 300 و 330 نانومتر با کاربرد "GA300 × N200" و "GA150 × N200" بدست آمد. اما اثر تیمارها روی فلاونوئید 270 نانومتر معنیدار نبود. ظرفیت آنتیاکسیدانی بنفشه معطر بیشتر از بنفشه تجاری بود و بیشترین ظرفیت آنتی اکسیدانی در بنفشه معطر (84.83 % DPPHsc) و بنفشه تجاری (78.17 % DPPHsc) با کاربرد "GA150 × N200" حاصل شد. با توجه به نتایج حاصل، دو رقم بنفشه مورد مطالعه بهعنوان منابع موثری از پروتئین، عناصر معدنی و ترکیبات آنتیاکسیدانی معرفی میشوند. همچنین کاربرد "GA300 × N200" و "GA150 × N200"جهت بهبود ویژگیهای خوراکی این دو گونه گیاهی پیشنهاد میشود. Manuscript profile -
Open Access Article
13 - Study of LncRNA RMRP expression profile and RMRP gene promoter region mutations in breast cancer patients
Majid Sadeghizadeh ملیحه انتظاری Zohreh AkbariBackground: Gene expression ‎regulators and mutations are a kind of biomarker and new ‎therapeutic target for human diseases like cancer. LncRNAs are involved in Several regulatory processes. RNA components of ‎mitochondrial RNA processing ‎endoribonucle MoreBackground: Gene expression ‎regulators and mutations are a kind of biomarker and new ‎therapeutic target for human diseases like cancer. LncRNAs are involved in Several regulatory processes. RNA components of ‎mitochondrial RNA processing ‎endoribonuclease is a lncRNA that its ‎regulatory position has been identified ‎in some cancers. Regarding the importance of the RMRP gene, we are investigating changes in the expression of this gene that are caused by promoter region mutations in breast cancer patients.Methods: In this study, LncRNA RMRP gene expression was evaluated on 25 tumor samples and 25 control samples by semi-quantitative RT PCR technique, and confirmed by Real time PCR technique for a number of samples. Also, to detect the mutation in the promoter region of the LncRNA RMRP gene, DNA extraction and sequencing were performed.Results: The expression of the RMRP gene in tumor samples showed a significant increase relative to control samples. Expression of RMRP gene was shown a significant decrease in positive HER2 samples compared to negative HER2 specimens and a significant increase in positive metastatic tumor samples compared to negative metastatic samples . Also, sequencing of the promoter region revealed differences in the region's sequence in tumor and normal samples.Based on sequencing results, there was no mutation in the RMRP promoter sequence of the tumor .Conclusion: The RMRP gene can be suggested as a tumor and metastatic marker for the detection of breast cancer. But more clinical and molecular research is still needed to prove it more accurately. Manuscript profile -
Open Access Article
14 - Detection of GMO soybean by Camv 35S Promoter and Lectin genes in baby food and soybean samples
Mahsa Kavousi Fateme Salmani ZakariaIn most countries today the area under cultivation of transgenic crops has increased due to the increasing population.In Iran, there is no system for labeling transgenic products.Although baby food is one of the most important needs for growth and health of the baby, it MoreIn most countries today the area under cultivation of transgenic crops has increased due to the increasing population.In Iran, there is no system for labeling transgenic products.Although baby food is one of the most important needs for growth and health of the baby, it is no exception.Therefore, in this study,we try to identify the transgenic products by PCR by examining the internal control gene Lectin and Camv 35S Promoter gene transcriptome.25 soybean samples were collected from shops and Twenty-five samples of baby food were collected from pharmacies in Tehran. Samples were extracted with TLAB brand tissue extraction kit. After analyzing the concentration and quality of DNA extracted by the nanodrop machine, the samples were screened by PCR.25 soybean samples were analyzed for 23 of the total samples (%92) for the presence of Lectin internal gene and 15 samples from all samples (%63) had Camv 35S Promoter gene.Of the 25 samples of baby food, 20 (%83) were positive for the presence of the inner gene,Lectin positive, and 13 (%52) were positive for Camv 35S Promoter gene transformation index. None of the products containing Camv 35S Promoter gene, indicating that the product was transgenic, were not labeled.It can be concluded that the rate of transgenicity in the samples tested is significantly higher.In baby foods, the transgenicity rate of Camv 35S Promoter gene was higher in Iranian samples than in foreign samples. In soybean samples, Camv 35S Promoter gene was present in Iranian products, while none of the samples tested had transgenic label Manuscript profile -
Open Access Article
15 - STUDY OF CO HYDROGENATION TO VALUABLE PRODUCTS USING IRON-BASED CATALYST, WITH AND WITHOUT GAMMA-ALUMINA Support PROMOTER
Neda Choodari Milani Yahya Zamani Sahar Baniyaghoob Ali Nakhaei PourPromoted and unpromoted iron-based catalysts in the Fischer-Tropsch synthesis were prepared by the impregnation method. The composition of the final iron catalysts, regarding to the atomic ratio is as follow 20%Fe/-Al2O3, 20%Fe/5%Cu/3%Zr/-Al2O3. The catalysts were cha MorePromoted and unpromoted iron-based catalysts in the Fischer-Tropsch synthesis were prepared by the impregnation method. The composition of the final iron catalysts, regarding to the atomic ratio is as follow 20%Fe/-Al2O3, 20%Fe/5%Cu/3%Zr/-Al2O3. The catalysts were characterized by X-ray diffraction (XRD), inductively coupled plasma (ICP), field emission scanning electron microscopy (FE-SEM), hydrogen temperature programmed reduction (H2-TPR), and BET techniques. The catalyst activity and product selectivity were studied in a fixed bed reactor under 20 bar of pressure, H2/CO = 1, in the temperature (270, 285, and 300 °C) and GHSV range of (2, 4, and 6 l.h-1.gcat-1). Then, the effect of temperature, GHSV and promoters (Cu and Zr) on the catalyst performance were investigated. Increasing the temperatures and GHSV were change CO conversion and product selectivity. The promoted iron-based catalysts have higher C5+ selectivity than the unpromoted catalyst, while C2-C4 selectivity decreased because of simultaneous use of Cu and Zr for promoting the iron catalyst. The Zr and Cu promoters increased the reduction rate of Fe2O3 by providing H2 dissociation sites. The unpromoted and promoted catalysts were tested, where the promoted catalyst showed desirable performance. Manuscript profile -
Open Access Article
16 - The role of growth promoters in improvement of yield and physiological properties of Red bean under different irrigation levels
M.K. Aliloo محسن Roshdi S. Rezadoost J. Khalili Mahaleh An experiment in the form of split-plot design with randomized complete blocks was performedin three replications in Pyrmosi village of Khoi city during 1400 in order to evaluate theresponse of yield and physiological properties of red beans to the application of More An experiment in the form of split-plot design with randomized complete blocks was performedin three replications in Pyrmosi village of Khoi city during 1400 in order to evaluate theresponse of yield and physiological properties of red beans to the application of growthpromoters under different irrigation levels. Irrigation was considered as the main factor in threeirrigation levels, i.e., once in 8, 11 and 14 days, and the growth promoting compounds wereviewed as the secondary factors in 5 levels, i.e., the use of humic acid mixed with irrigationwater, amino acid foliar spraying, rooting stimulant, potassium and non-use of growthpromoters was (control). The results of analysis of variance indicated that irrigation had asignificant impact on all the traits studied, and the growth promoters affected the leaf relativewater content, chlorophyll a, protein percentage, number of lateral branches, seed yield, andharvest index significantly. The interaction of the two factors had significant effects on thenumber of lateral branches, seed yield, harvest index, and seed protein percentage. Theapplication of humic acid resulted in increased seed yield, and as the water deficit increased, theeffect of humic acid on increasing seed yield became significant. The highest seed yield was3076.12 kg per hectare observed in the irrigation level of once every 8 days and under thehumic acid treatment, and the lowest level of this trait was 1220.96 kg observed in the irrigationlevel of once 14 days and under the control treatment. It seems that increased irrigation intervalduring the growing season led to yield loss and degradation of physiological properties such asleaf area index, chlorophyll, and leaf relative water content, and the use of compounds such ashumic acid moderated the decreasing drought stress effects to some extent. Manuscript profile
Sanad
Sanad is a platform for managing Azad University publications
Links
Related Centers
Technical Support
Official pages
The rights to this website are owned by the Raimag Press Management System.
Copyright © 2021-2024