چند‌شکلی ژن کالپاستاتین در بز تالی و رایینی در استان کرمان

Subject Areas : Camel

و. بهرام‌پور ¹ , ا. محمدی ²

1 - Department of Animal Science, Technical and Vocational University, Kerman, Iran
2 - Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Zabol, Zabol, Iran

Received: 2017-01-04 Accepted : 2017-03-31 Published : 2017-09-01

Keywords: PCR-RFLP, ژنوتیپ, کالپاستاتین, بز رایینی, بز تالی,

Abstract :

در این مطالعه چند‌شکلی ژن کالپاستاتین در بز تالی و رایینی استان کرمان مورد بررسی قرار گرفت. ژن کالپاستاتین بر روی کیفیت و تردی گوشت تأثیر دارد. برای تعیین فراوانی ژنی و ژنوتیپی این ژن به طور تصادفی 150 بز رایینی و 150 بز تالی انتخاب گردید و کلیه نمونه خون‌ها درون لوله‌های حاوی EDTA قرار گرفت و از نمونه خون‌ها، به منظور بررسی چند‌شکلی ژنوتیپی در بزها با استفاده از کیت DNA استخراج شد. نمونه DNA برای انجام PCR استفاده گردید. دو الل (A, B) و سه ژنوتیپ (AA, AB, BB) در این مطالعه مشاهده شد. نتایج فراوانی ژنوتیپی برای ژن کالپاستاتین در بز تالی و راینی 52، 6/9، 4/38 و 12، 71 و 17 به ترتیب برای ژنوتیپ‌های AA, BB و BB تعیین شد. میزان فراوانی اللی A و B، 53/0، 47/0 و 88/0، 12/0 برای بز تالی و بز رایینی به ترتیب مشاهده گردید و همچنین نشان داده شد که روش RFLP یک روش مناسب برای بررسی چند‌شکلی ژن کالپاستاتین در بز می‌باشد.

References:

Alfnes F., Rickertsen K. and Ueland Ø. (2008). Experimental evidenceof risk aversion in consumer markets: the case of beef. Appl. Econom. 40, 3039-3049.

Asadi N. and Khederzadeh S. (2015). Polymorphism of candi-date genes for meat quality in sheep. Middle-East J. Sci. Res. 23, 2001-2004.

Averna M., Tullio R.D., Passalacqua M., Salamini F., Ponteremoli S. and Mellon E. (2001). Changes in intracellular calpastatin localization are mediated by reversible phosphorylation. Biochem. J. 354, 25-30.

Bastos E., Cravador A., Azevedo J. and Guedes-Pinto H. (2001). Single strand conformation polymorphism (SSCP) detection in six genes in the portuguese indigenous sheep breed “Churra da Terra Quente”. Biotechnol. Agron. Soc. Environ. 5, 7-15.

Busch W.A., Stromer M.H., Goll D.E. and Suzuki A. (1972). Ca2+-specific removal of Z lines from rabbit skeletal muscle. J. Cell. Biol. 52(2), 367-381.

Casas E., White S.N., Wheeler T.L., Shackelford S.D., Koohmaraie M., Riley D.G., Chase C.C.J., Johnson D.D. and Smith T.P. (2006). Effects of calpastatin and micro-calpain markers in beef cattle on tenderness traits. J. Anim. Sci. 84, 520-525.

Goll D.E., Thompson V.F., Li H., Wei W. and Cong J. (2003). The calpain system. Physiol. Rev. 83, 731-801.

Kapelanski W., Grajewska S., Kurył J., Bocian M., Jan-kowiak H. and Wisniewska J. (2004). Calpastatin (CAST) gene polymorphism and selected meat quality traits in pigs. Anim. Sci. 22, 435-411.

Koohmaraie M., Kent M.P., Shackelford S.D., Veiseth E. and Wheeler T.L. (2002). Meat tenderness and muscle growth: is there any relationship? Meat Sci. 62, 345-352.

Kuryl J., Kapelanski W., Pierzchała M., Grajewska S. and Bocian M. (2003). Preliminary observations on the effect of calpastatin gene (CAST) polymorphism on carcass traits in pigs. Anim. Sci. Pap. Rep. 21, 87-95.

Mohammadi M., Beigi Nasiri M.T., Alami-Saeid K., Fayazi J., Mamoee M. and Sadr A.S. (2008). Polymor-phism of calpastatin gene in Arabic sheep using PCR-RFLP. African J. Biotechnol. 7, 2682-2684.

Murachi T. (1983). Calpain and calpastatin. Trends Biochem. Sci. 8, 167-169.

Nassiry M.R., Tahmoorespour M., Javadmanesh A., Soltani M. and Foroutani Far S. (2006). Calpastatin polymorphism and its association with daily gain in Kurdi sheep. Iranian J. Biotechnol. 4, 188-192.

Palmer B.R., Robert N., Hickford J.G.H. and Bickerstaffe G. (1998). Rapid Comunication: PCR-RFLP for MSPI and NCOI in the ovine calpastatin gene. J. Anim. Sci. 76, 1499-1500.

Palmer B.R., Robert N. and Kent M.P. (1999). A candidate gene approach to animal quality traits. Proc. Soc. Anim. Prod. 57, 294-296.

Rohrer G.A., Nonneman D.J., Miller R.K., Zerby H. and Moeller S.J. (2012). Association of single nucleotide polymorphism (SNP) markers in candidate genes and QTL regions with pork quality traits in commercial pigs. Meat Sci. 92, 511-518.

Schenkel F.S., Miller S.P., Jiang Z., Mandell I.B., Ye X., Li H. and Wilton J.W. (2006). Association of a single nu-cleotide polymorphism in the calpastatin gene with carcass and meat quality traits of beef cattle. J. Anim. Sci. 84, 291-299.

Shahroodi F.E., Nassiry M.R., Valizadeh R., Nosrati M., Javadmanesh A. and Tahmourespour M. (2005). The genetic polymorphism of calpastatin gene in Karakul sheep. J. Agric. Sci. Natal. Res. 2, 1-10.

Yeh F.C., Yang R.C., Timothy B.J., Ye Z. and Judy M. (1997). Popgene, the User Friendly Shareware for Population Genetic Analysis. Molecular Biology and Biotechnology Center. Alberta, Cnada.

Zhang Z.R., Jiang X.S., Du H., Zhu Q., Li X.C., Yang C.W. and Liu Y.P. (2012). Characterization of the expression profiles of calpastatin (CAST) gene in chicken. Mol. Biol. Rep. 39, 1839-1843.

Zhou H. and Hickford J.G. (2008). Allelic variation of the bovine calpastatin (CAST) gene. Mol. Cell. Probes. 22, 129-130.