بررسی وجود QTL برای برخی از صفات رفتاری و عملکردی بر روی کروموزوم شماره4 در بلدرچین ژاپنی

Subject Areas : Camel

ا. رضوان نژاد ¹ , ا. نصیری فر ²

1 - Department of Biotechnology, Institute Science and High Technology and Environmental Science, Graduate University of Advanced Technology, Kerman, Iran
2 - Department of Biotechnology, Institute Science and High Technology and Environmental Science, Graduate University of Advanced Technology, Kerman, Iran

Received: 2016-06-07 Accepted : 2016-11-15 Published : 2017-06-01

Keywords: وزن بدن, بلدرچین ژاپنی, نرخ رشد روزانه, نقشه‌یابی QTL, عدم تحرک,

Abstract :

مطالعه حاضر به منظور شناسایی وجود QTL برای صفات وزن بدن در سنین 1، 7، 14، 21 و 28 روزگی، نرخ رشد روزانه در سنین 1-0، 2-1، 3-2 و 4-3 هفتگی، وزن لاشه بعد از کشتار و عدم تحرک در بلدرچین ژاپنی انجام شد. دو لاین متمایز بلدرچین ژاپنی شامل لاین وحشی و سفید که در مزرعه تحقیقاتی دانشگاه شهید باهنر کرمان نگهداری می­شدند، مورد استفاده قرار گرفتند. پرندگان دو لاین به صورت تلاقی جابجایی برای تولید نسل F1 با یکدیگر تلاقی داده شدند. نسل F2 از تلاقی تصادفی پرندگان نسل F1 تولید شدند. مدل مورد استفاده برای نقشه یابیQTL  برای صفات اندازه­گیری شده، مدل F2 و ناتنی‌ها در نرم افزار QTL express بود. کل افراد نسل F2 (422 پرنده)، والدین آنها )34 پرنده  (F1و لاین‌های خالص (16 پرنده) توسط 2 نشانگر ریزماهواره بر روی کروموزوم 4 ژنوتایپ شدند. بر روی این کروموزوم، با استفاده از مدل ناتنی، QTL معنی‌داری در سطح 05/0 و 01/0 کروموزوم، شناسایی نشد. اما با مدل F2، یک QTL معنی‌دار در سطح 05/0کروموزوم برای وزن بدن در سن 21 و 28 روزگی، وزن لاشه ونرخ رشد روزانه در طی 2-1، 3-2 و 4-3 هفتگی در موقعیت 54cM شناسایی شد. از آنجاکه صفات رشد صفات پیچیده­ای هستند که تحت تأثیر بسیاری از جایگاه‌های مؤثر بر اشتها، جذب غذا، تخصیص مواد مغذی، میزان سوخت و ساز، فعالیت بدنی و غیره می‌باشند، همهQTL های شناسایی شده کمتر از 4 درصد از واریانس فنوتیپی برای صفات مورد نظر توضیح می­دهند.

References:

Abasht B., Dekkers J.C.M. and Lamont S.J. (2006). Review of quantitative trait loci identified in the chicken. Poult. Sci. 85, 2079-2096.

Beaumont C., Roussot O., Fève K., Plisson-Petit F., Leroux S., Pitel F., Faure J.M., Mills A.D., Guémené D., Leterrier C., Sellier N., Mignon-Grasteau S., Sellier N., Le Roy P., Perez-Enciso M. and Vignal A. (2005). Genetic analysis of tonic immobility in Japanese quail with AFLP markers. Anim. Genet. 36, 401-407.

Churchill G.A. and Doerge R.W. (1994). Empirical threshold values for quantitative trait mapping. Genetics. 138, 963-971.

De Koning D.J., Haley C.S., Windsor D., Hocking P.M., GriffinH. Morris A., Vincent J. and Burt D.W. (2004). Segregation of QTL for production traits in commercial meat-type chickens. Genet. Res. 83, 211-220.

Esmailizadeh A.K., Baghizadeh A. and Ahmadizadeh M. (2012). Genetic mapping of quantitative trait loci affecting body weight on chromosome 1 in a commercial strain of Japanese quail. Anim. Prod. Sci. 52, 64-68.

Falconer D.S. and Mackay T.F.C. (1996). Introduction to Quantitative Genetics. Longman, London, United Kingdom.

Helms C. (1990). Salting out procedure for human DNA extraction. In the Donis-Keller Lab- Lab Manual Home Page. Available at: http://hdklab.wustl.edu/lab_manual/dna/dna2.html.

Kayang B.B., Vignal A., Inoue-Murayama M., Miwa M., Monvoisin J.L., Ito S. and Minvielle F. (2004). A first generation micro satelite linkage map of the japaneas quail. Anim. Genet. 35, 195-200.

Lander E.S. and Kruglyak L. (1995). Genetic dissection of complex traits: Guidelines for interpreting and reporting linkage results. Nat. Genet. 11, 241-247.

Minvielle F. (2004). The future of Japanese quail for research and production.World's Poult. Sci. 60, 500-507.

Minvielle F., Kayang B.B., Inoue-Murayama M., Miwa M., Vignal A., Gourichon D., Neau A., Monvoisin J.L. and Ito S. (2005). Microsatellite mapping of QTL affecting growth, feed consumption, egg production, tonic immobility and body temperature of Japanese quail. BMC Genet. 6, 87-96.

Moazeni S.M., Mohammadabadi M.R., Sadeghi M., Moradi H.S., Esmailizadeh A.K. and Bordbar F. (2016). Association between UCP gene polymorphisms and growth, breeding value of growth and reproductive traits in Mazandaran indigenous chicken. Open. J. Anim. Sci. 6, 1-8.

Mohammadabadi M.R., Nikbakhti M., Mirzaee H.R., Shandi M.A., Saghi D.A., Romanov M.N. and Moiseyeva I.G. (2010). Genetic variability in three native Iranian chicken populations of the Khorasan province based on microsatellite markers. Rusian J. Genet. 46, 572-576.

Mohammadifar A., Amirnia S., Omrani H., Mirzaei H.R. and Mohammadabadi M.R. (2009). Analysis of genetic variation in quail population from Meybod Research Station using microsatellite markers. Anim. Sci. J. (Pajouhesh and Sazandegi). 22(1), 72-79.

Moradian H., Esmailizadeh A.K., Sohrabi S. and Mohammadabadi M.R. (2015). Identification of quantitative trait loci associated with weight and percentage of internal organs on chromosome 1 in Japanese quail. J. Agric. Biotechnol. 6(4), 143-158.

Moradian H., Esmailizadeh A.K., Sohrabi S.S., Nasirifar E., Askari N., Mohammadabadi M.R. and Baghizadeh A. (2014). Genetic analysis of an F2 intercross between two strains of Japanese quail provided evidence for quantitative trait loci affecting carcass composition and internal organs. Mol. Biol. Rep. 41(7), 4455-4462.

Ori R.J., Esmailizadeh A.K., Charati H., Mohammadabadi M.R. and Sohrabi S.S. (2014). Identification of QTL for live weight and growth rate using DNA markers on chromosome 3 in an F2 population of Japanese quail. Mol. Biol. Rep. 41(2), 1049-1057.

Roussot O., Fève K.Plisson-Petit F., Pitel F., Faure J.M., Beaumont C. and Vignal A. (2003). AFLP linkage map of the Japanese quail Coturnix japonica. Gen. Sel. Evol. 35, 559-572.

SAS Institute. (1996). SAS^®/STAT Software, Release 6.11. SAS Institute, Inc., Cary, NC. USA.

Sewalem A., Morrice D.M., Law A., Windsor D., Haley C.S., Ikeobi C.O., Burt D.W. and Hocking P.M. (2002). Mapping of quantitative trait loci forbody weight at three, six and nine weeks of age in a broilerlayer cross. Poult. Sci. 81, 1775-1781.

Sohrabi S.S., Esmailizadeh A.K., Baghizadeh A., Moradian H., Mohammadabadi M.R., Askari N. and Nasirifar E. (2012). Quantitative trait loci underlying hatching weight and growth traits in an F2 intercross between two strains of Japanese quail. Anim. Prod. Sci. 52(11), 1012-1018.

Tsudzuki M.(2008). Mutations of Japanese quail (Coturnix japonica) and recent advances of molecular genetics for this species. J. Poult. Sci. 45, 159-179.

Vallejo R.L., Bacon L.D., Liu H.C., Witter R.L., Groenen M.A.M., Hillel J. and Cheng H.H. (1998). Genetic mapping of quantitative trait loci afecting susceptibility to Marek’s disease virusinduced tumors in F intercross chickens. Gene. 148, 349-360.

Van Kaam J.B., Groenen M., Bovenhuis H., Veenendaal A., Vereijken A.L. and van Arendonk J.A. (1999). Whole genome scan in chickens for quantitative trait loci affecting growth and feed efficiency. Poult. Sci. 78, 15-23.

Van Kaam J.B., Van Arendonk J.A.M., Groenen M.A.M., Bovenhuis H., Vereijken A.L.J., Crooijmans R.P.M.A., Van der Poel J.J. and Veenendaal A. (1998). Whole genomes scan for quantitative trait loci affecting body weight in chickens using a three generation design. Livest. Prod. Sci. 54, 133-150.

Weller J.I. (2001). Quantitative trait loci analysis in animals. CABI Publishing, London, United Kingdom.

West B. and Zhou B.X. (1989). Did chicken go north? New evidence for domestication. World's Poul. Sci. 45, 205-218.

Zhou H., Deeb N., Evock-Clover C.M., Ashwell C.M. and Lamont S.J. (2006). Genome-wide linkage analysis to identify chromosomal regions affecting phenotypic traitsinthe chicken. I .Growth and average daily gain. Poult. Sci. 85, 1700-1711.