تعیین توالی و آنالیز بیوانفورماتیکی ژن کاپا کازئین در ناحیه اگزون 4 در شتر‪های تک و دو کوهانه ایران

Subject Areas : Camel

م. طهمورث‪پور ¹ , م.ه. سخاوتی ² , ا.ع. کهبیری ³ , ع. محمدهاشمی ⁴

1 - Department of Animal Science, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran
2 - Department of Animal Science, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran
3 - Department of Animal Science, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran
4 - Department of Animal Science, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran

Received: 2014-07-06 Accepted : 2014-11-15 Published : 2016-03-01

Keywords: آنالیز بیوانفورماتیکی, شتر تک کوهانه, شتر دو کوهانه, ژن کاپا-کازئین,

Abstract :

کاپا-کازئین، به عنوان عمده‪ترین پروتئین موجود در شیر، نقش مهمی در شکل‪گیری میسل‪های موجود در شیر و کمک به افزایش حلالیت کلیسم و فسفر را ایفا می‪کند. از اینرو، هدف و رویکرد این مطالعه بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه 4 اگژون ژن کاپا-کازئین (CSN3) در شتر‪های ایران (10 نمونه خون از شتر تک کوهانه و 10 نمونه از شتر دوکوهانه) بود. بعد از استخراج DNA، قسمتی از ناحیه DNA (713 جفت باز) از ژن کاپا کازئین به وسیله پرایمر‪های اختصاصی تکثیر و تعیین توالی و در مرحله بعد با توالی‪های دیگر ژن کاپا-کازئین که توالیشان در بانک اطلاعاتی NCBI موجود بود مقایسه گردید. نتایج نشان داد تفاوت معنی‪داری بین توالی‪های مورد مقایسه مشاهده نشد. همچنین، نتایج آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد بر اساس توالی ژن کاپا-کازئین، شتر‪های تک و دو کوهانه ایرانی کمترین تفاوت را باتوالی همین ژن با گونه لاما داشتند.

References:

Ansari-Renani H., Salehi M., Ebadi Z. and Moradi S. (2010). Identification of hair follicle characteristics and activity of one and two humped camels. Small Rumin. Res. 90, 64-70.

Cui P., Ji R., Ding F., Qi D., Gao H. and Meng H. (2007). A complete mitochondrial genome sequence of the wild two-humped camel (Camelus bactrianus ferus): an evolutionary history of camelidae. BMC Genomics. 8, 241-245.

Giambra I.J., Zubeir E.l. and Erhardt G. (2013). Biochemical and molecular characterization of polymorphisms of αs1-casein in Sudanese camel (Camelus dromedarius) milk. Int. Dairy J. 28, 88-93.

Ikonen T., Ojala M. and Syväoja E.L. (2008). Effects of composite casein and beta-lactoglobulin genotypes on renneting properties and composition of bovine milk by assuming an animal model. J. Dairy Sci. 71, 188-195.

Lutfuaalah G., Amjad A., Amin F. and Ahmad A. (2011). Homology modeling of bovine kappa-casein. J. Chem. Soc. Pakistan.33, 433-438.

Medrano J.F. and Cordova E.A. (1990). Genotyping of bovine kappa-casein loci following DNA sequence amplification. Biotechnology. 8, 144-146.

Nagarajan G., Swami S.K., Ghorui S., Pathak K., Singh R. and Patil N. (2012). Cloning and sequence analysis of IL-2, IL-4 and IFN-γ from Indian Dromedary camels (Camelus dromedarius). Res. Vet. Sci. 92, 420-426.

Pauciullo A., Shuiep E., Cosenza G., Ramunno L. and Erhardt G. (2012). Molecular characterization and genetic variability at κ-casein gene (CSN3) in camels. Gene. 15, 22-30.

RachaganiS. andGupta I.D. (2008). Bovine kappa-casein gene polymorphism and its association with milk production traits. Genet. Mol. Biol. 13, 893-897.

Schlee P. and Rottmann O. (1992). Identification of bovine x-casein C using the polymerase chain reaction. J. Anim. Breed. Genet.109, 153-155.

Schwartz H. (1992). Productive performance and productivity of dromedaries (Camelus dromedarius). Anim. Res. Dev. 35,86-98.

Wilson D.E. (2005). Mammal Species of the World: A Taxonomic and Geographic Reference. JohnsHopkinsUniversity Press. US.

Wilson R.T (1984). The Camel. Longman, London,New York.