-
حرية الوصول المقاله
1 - Investigation of Solvent Effect on CUA Codon Mutation: NMR Shielding Study
S. Irani M. Monajjemi S.M Atyabi M. Sadegizadeh M. Heshmat T. NejadsattariP53 is one of the gene that has important role in human cell cycle and in the human cancers too.Models of codon substitution make it possible to separate mutational biases in the DNA fromselective constraints on the protein, and offer a great advantage over amino acid m أکثرP53 is one of the gene that has important role in human cell cycle and in the human cancers too.Models of codon substitution make it possible to separate mutational biases in the DNA fromselective constraints on the protein, and offer a great advantage over amino acid models forunderstanding the evolutionary process of proteins and protein-coding DNA sequences. In thiswork, we investigated about CUA codon in exon5 of p53 that has mutated to CCA codon.We studied solvent effects on CUA codon by theoretical method, because the most of biologicalsystems studied in solution and solvents have essential role in mutation of genes. Five solventsconsist of acetone, ethanol, methanol, DMSO and water are predicated using ab initio method.Also, indirect (Au ind) solvent effects are obtained and NMR shielding tensors (ppm) have beencomputed with the continuous set of the gauge independent atomic orbital (GIAO) method. تفاصيل المقالة -
حرية الوصول المقاله
2 - Study of pH influence on the stability of 175th codon of P53 genes by computational and modeling methods
Nastaran Asghari MoghaddamP53 tumor suppressor gene, also known as “genome guardian” is mutated in more than half of allkind of cancers. In this study we have investigated the controls of environmental pH for P53 genemutation in point of specific sequence which is prone to mutagenesi أکثرP53 tumor suppressor gene, also known as “genome guardian” is mutated in more than half of allkind of cancers. In this study we have investigated the controls of environmental pH for P53 genemutation in point of specific sequence which is prone to mutagenesis. The most probable cancerousmutations occur as point mutations in exons 5-8 of P53 gene. The 175th codon of P53 is the thirdmost mutated codon in this gene. By experimental research, it is revealed that acidic pH raised therate of cancer and mutation in 175 CGC codon of P53 gene. It to some extent is due to protonation ofthis three nucleotide codon. Mutation in this codon changes the encoding amino acid andsubsequently produces a protein which has oncogenic features instead of tumor suppressorcharacteristics of original p53 protein. In current study, we perform investigation on the impact ofprotonation on stability of codon 175CGC in this gene. We used HyperChem software for answeringto our mentioned goal above. Our results suggested a reliable answer about the effect of protonationon mentioned codon and its stability. From theoretical point of view, acidity can decrease theinstability of this specific codon. Along with the experimental investigations, our results can to someextent elaborate acidic pH competency to cause mutation. تفاصيل المقالة -
حرية الوصول المقاله
3 - بررسی تاثیر آلودگی داروی ایبوژروفن بر روی تغییرات ژنتیکی گورخرماهی به روش QPCR
مهسا افشاری کاشانیان پرگل قوام مصطفوی علی ماشینچیان مرادیزمینه و هدف: داروی ایبوپروفن به عنوان یک آلاینده دارویی، اثرات مخرب و در برخی موارد جبران ناپذیری بر موجودات آبزی و به طور کلی موجودات زنده می گذارد که در بسیاری از مواقع این اثرات به صورت تخریب های ژنتیکی و آسیب به ساختار DNA می باشد.هدف این تحقیق بررسی تاثیرات غلظت ها أکثرزمینه و هدف: داروی ایبوپروفن به عنوان یک آلاینده دارویی، اثرات مخرب و در برخی موارد جبران ناپذیری بر موجودات آبزی و به طور کلی موجودات زنده می گذارد که در بسیاری از مواقع این اثرات به صورت تخریب های ژنتیکی و آسیب به ساختار DNA می باشد.هدف این تحقیق بررسی تاثیرات غلظت های مختلف داروی ایبوپروفن در تخریب و آسیب به ساختار DNA در گورخرماهی می باشد. روش کار: در این مطالعه تغییرات ژنتیکی ژن P53 و بیان آن در گورخرماهی پس از مواجه دو هفته ای با غلظت های 1/0، 1 و 10 میلی گرم بر لیتر ایبوپروفن در شرایط آزمایشگاهی بررسی شد. در انجام این تحقیق گورخرماهی به مدت دو هفته در معرض غلظت های ذکر شده قرار گرفتند و پس از آن استخراج RNA از آن ها صورت گرفت، با استفاده از روش QPCR نتایج به دست آمده مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. یافته ها: نتایج نشان دادند که غلظت کم دارو یعنی 1/0 میلی گرم بر لیتر تاثیری بر بیان ژن P53 نداشته است، در حالی که در دو غلظت دیگر که به ترتیب 1 و 10 میلی گرم بر لیتر ایبوپروفن بودند، نشان داده شد که اختلاف معناداری بین کنترل و نمونه حاوی دارو بوده است، که در نتیجه آن، ژن P53 به میزان زیادی بیان شده است.همچنین برای ژن کنترل داخلی که GAPDH بود، در کمترین غلظت دارو هیچ گونه اختلاف معناداری بین نمونه تیمار و کنترل مشاهده نشد، در حالی که در تیمارهای بعدی اختلاف معنادار در حد بسیار کم بین نمونه کنترل و تیمار مشاهده شد. تفاصيل المقالة -
حرية الوصول المقاله
4 - Apoptosis induced by Zizyphus jujuba seed essential oil in colorectal cancer cells line HT-29
زهرا زمانی الهام قدوسی دهنوی رضا حاجی حسینی محمد ارجمند سیما نصریBackground & Aim: In traditional medicine, Zizyphus jujuba (jujube) has been used due to its medicinal properties and various physiological functions such as antioxidant, anticancer and anti-inflammatory properties. This study was conducted to study anti-cancer and أکثرBackground & Aim: In traditional medicine, Zizyphus jujuba (jujube) has been used due to its medicinal properties and various physiological functions such as antioxidant, anticancer and anti-inflammatory properties. This study was conducted to study anti-cancer and apoptotic effects of essential oil from Zizyphus jujuba seeds and to evaluate the effect of essential oils on p53, APC and KRAS genes expression in HT-29 colorectal cell line.Experimental: In this study, the essential oil of jujube seeds collected from orchards in Isfahan was prepared by Clevenger apparatus and then analyzed by GC-MS. The effects of toxicity and cell viability were determined using Trypan Blue, MTT and clonogenic methods. DNA fragmentation and apoptosis techniques were used to evaluate the mechanism of the effects of essential oil on cell death by flow cytometry. Finally, Real-time PCR was used to evaluate the expression of p53, APC and KRAS genes and their role in induction of apoptosis.Results: Essential oil of Zizyphus jujuba seeds reduced the viability of cells by concentration and time-dependent manner as compared to the control group. The essential oil also induced apoptosis by increasing gene expression p53 and suppressing gene expression KRAS.Recommended applications/industries: The present results indicated that essential oil of Zizyphus jujuba seeds induces apoptosis by targeting genes involved in colon carcinogenesis. However, further investigations on signaling pathways are needed to fully confirm the results of this study. تفاصيل المقالة -
حرية الوصول المقاله
5 - Anti-proliferative effect of Trifolium pratense extract on Raji cell line in Burkitt's lymphoma
مرتضی داودی شهریار سعیدیان رضا صغیری زهرا زمانی غلام رضا بخشی خانیکیBackground & Aim: In folk medicine, red clover (Trifolium pratense) use to treat some diseases such as whooping cough, asthma, eczema, and some ophthalmic dysfunction. Due to its phytoestrogens and antioxidant-rich compounds, it is recommended to alleviate some canc أکثرBackground & Aim: In folk medicine, red clover (Trifolium pratense) use to treat some diseases such as whooping cough, asthma, eczema, and some ophthalmic dysfunction. Due to its phytoestrogens and antioxidant-rich compounds, it is recommended to alleviate some cancers. This paper was conducted to study the anti-cancer and apoptosis effects of red clover extract (RCE) on the Raji cell line in Burkitt's lymphoma.Experimental: Red clover lyophilized powder (CAS = 85085-25-2) with a fixed ratio of Formononetin, Biochanin A, Daidzein, and Genistein was acquired from Sigma Aldrich German company. Raji cells were obtained from the Pasteur Institute of Iran-Tehran. Raji cells were treated with different concentrations of RCE, and viable cells were measured at an interval of 24, 48, and 72 hours incubation in three days by MTT assay. Agarose gel electrophoresis was used to determine the DNA degradation. Annexin V-FITC/PI kit and flow cytometry assay were used to determine the percent of apoptotic and necrotic treated Raji cells. Also, expression changes incMYC,ID3, andP53genes were measured by real-time PCR.Results: Red clover extract can prevent in vitro proliferation of the Raji cells in a time and dose-dependent manner. RCE, as well asc-MYCgene suppression and induction ofID3andP53genes, enters the Raji cells in the apoptosis stages with an acceptable percentage and has complication cure potential in Burkitt's lymphoma.Recommended applications/industries: The extract used in this studycombines four components. The individual evaluation effects ofFormononetin, Biochanin A, Daidzein, and Genistein on Raji cells are recommended. تفاصيل المقالة -
حرية الوصول المقاله
6 - Effect of Spirulina platensis on the immunological and hematological factors in comparison with levamisole in Persian shepherd dogs
سام ترکان محمد جواد عکاشهBackground & Aim: Spirulina microalgae is known to has beneficial effects in the treatment of many animals diseases. Effects of Spirulina platensis microalgae, singly or in comparison with levamisole drug are not still studied in dogs. Thus, the present study was co أکثرBackground & Aim: Spirulina microalgae is known to has beneficial effects in the treatment of many animals diseases. Effects of Spirulina platensis microalgae, singly or in comparison with levamisole drug are not still studied in dogs. Thus, the present study was conducted to investigate the effects of this microalgae on hematological and immunological parameters in dogs.Experimental: In this research, 24 native breed dogs were used for 30 days. The dogs were divided into three groups of eight randomly, including a control group, treatment group (received 2 g Spirulina orally) and the third group received 5 mg/kg Levamisole. At the end of mentioned period, hematocrit percent, Hb, RBC, WBC, Neutrophil, Lymphocyte, Eosinophil, monocyte, basophil levels and immunological factors including IgM, total protein and phagocytic precent were measured.Results: Hematocrit in levamisole receiving group increased significantly (P<0.05). Results showed that RBC and Hb levels in Spirulina receiving group were significantly higher than the control and levamisole groups. Alb and Neutrophil levels in Spirulina receiving group were lower than the other two groups. In addition, Eosinophil and WBC levels in control group were significantly lower than the other two groups, but monocyte and Lymphocyte levels in control group increased significantly (P<0.001). Also, on the 30th day, total protein and phagocytic percent in Spirulina receiving group were significantly higher than others groups. In addition, in Spirulina and levamisole groups a significant increase in IgM level was observed (P<0.001).Recommended applications/industries: It can be concluded that the use of Spirulina in dogs for a short time could improve hematological and immunological factors and the effects of Spirulina alga in the most factors is comparable to levamisole drug. تفاصيل المقالة -
حرية الوصول المقاله
7 - Vitexin modifying the expression of APC, p53, KRAS genes with metabolome profile changes in HT-29 colorectal cancer cell line
الهام قدوسی دهنوی رضا حاجی حسینی محمد ارجمند سیما نصری زهرا زمانیBackground & Aim: Colorectal canceris a clinically heterogeneous disease resulting from metabolome pattern alterations of many metabolites and their genetic factor interactions in man. Chemotherapy in colorectal cancer is generally followed by multiple side effects, أکثرBackground & Aim: Colorectal canceris a clinically heterogeneous disease resulting from metabolome pattern alterations of many metabolites and their genetic factor interactions in man. Chemotherapy in colorectal cancer is generally followed by multiple side effects, including drug resistance; It is well established that herbal medicines are gaining worldwide interest in treating many cancers. Vitexin is an apigenin flavone glycoside present in hawthorn has exhibited therapeutic properties. This study was performed to assess the antitumor properties of Vitexin on the expression of p53, KRAS, and APC genes and the metabolome profile alterations associated with these genetic modifications.Experimental: Cells were treated with different concentrations of Vitexin, and toxicity and cell growth inhibition were ascertained in vitro using the MTT assay method. Cells were treated with Vitexin, and gene expression was determined. Following metabolome 1HNMR spectroscopy with 1D NOESY protocol and the resulting spectra scrutinized to classify differentiated metabolites and their biochemical pathways. Integrative systems biology analysis software examined the metabolites and the genes, and the main pathways modulated by gene expression were identified.Results: Our finding revealed that a 50% inhibitory concentration for Vitexin was 16.32 μM, while the relative expression of tumor suppressor genes APC and p53 in treated cells enhanced and the expression of the KRAS oncogene gene decreased significantly compared to the control group. The crucial changes in convergent metabolic phenotype with genes were identified in this investigation.Recommended applications/industries: Our findings revealed that Vitexin exhibits antitumor properties by targeting a specific biochemical pathway in the cell's metabolome profile due to changes in genes involved in colon cancer. تفاصيل المقالة -
حرية الوصول المقاله
8 - بررسی اثر داروهای اگزالی‌پلاتین و پاکلی تاکسل برسلول‌های سرطان کولون (HT29) و آنالیز بیان ژن‌های آپوپتوزی کاسپاز3، کاسپاز9 وP53
هما محمودزاده جواد بهارآرا یگانه رضایی دلوییهدف: هدف بررسی اثرات سمیت سلولی پاکلی‌تاکسل و اگزالی‌پلاتین بر رده سلولی سرطان کولون (HT29) و آنالیز بیان ژن‌های آپوپتوزی کاسپاز 3، 9و P53 می‌باشد. مواد و روش ها: ابتدا سمیت سلولی داروهای پاکلی‌تاکسل و اگزالی پلاتین و اثر توام آنها با غلظتهای مختلف بر رده سلولی HT29 با أکثرهدف: هدف بررسی اثرات سمیت سلولی پاکلی‌تاکسل و اگزالی‌پلاتین بر رده سلولی سرطان کولون (HT29) و آنالیز بیان ژن‌های آپوپتوزی کاسپاز 3، 9و P53 می‌باشد. مواد و روش ها: ابتدا سمیت سلولی داروهای پاکلی‌تاکسل و اگزالی پلاتین و اثر توام آنها با غلظتهای مختلف بر رده سلولی HT29 با روش MTT بررسی شد و غلظت 50 درصد کشندگی (IC50) آن تعیین شد. میزان بیان ژن‌های آپوپتوزی کاسپاز 3 و 9 نسبت به ژن مرجع GAPDH با استفاده از روش Real-Time PCR بررسی شد. هم چنین بررسی آپوپتوز سلول ها با استفاده از رنگ آمیزی Annexin V/PI و DAPI انجام شد. نتایج :پاکلی‌تاکسل و اگزالی‌پلاتین به ترتیب در غلظت های 25/3 و 00062/0 میکروگرم در میلیلیتر بیشترین اثر سمیت سلولی را دارد و میزان IC50 آن 00016/0 و µg/ml 5/12 محاسبه شد. تیمار همزمان داروها زنده‌مانی سلول‌ها را کاهش داد . بیان ژن‌های کاسپاز 3 و 9, P53 نسبت به ژن مرجع GAPDH در سلول های سرطان کولون تیمار شده نیز افزایش یافت. نتایج آزمون DAPI نشان دهنده ی قطعه قطعه شدن هسته‌ها و آپوپتوز در گروههای تیماری همزمان بود. بررسی آپوپتوز با استفاده از Annexin V/PI نشان می‌دهد که 98 درصد سلولهای گروه شاهد سالم می باشند و درصد زیادی از سلول‌ها تحت تیمار دچار آپوپتوز شده اند . نتیجه گیری: با توجه به سمیت سلولی و القای فرایند آپوپتوزیس در رده سلولی سرطان کولون توسط داروهای پاکلی‌تاکسل و اگزالی-پلاتین، میتوان نتیجه‌گیری کرد که این داروها گزینه مناسب جهت درمان سرطان کولون می باشند. تفاصيل المقالة -
حرية الوصول المقاله
9 - اثر نانوذرات مغناطیسی آهن بر بیان پروتئین P53 در مغز موشهای نژاد Balb/C به روش ایمونوهیستوشیمی
لیدا فرهادی ویدا حجتی عبدالحسین شیروینانوذرات به دلیل خواص فیزیکوشیمیایی خود بهعنوان حاملهای دارویی در درمان سلولهای سرطانی در محیطهای زنده استفادههای گستردهای دارند .از این نانوذرات میتوان به منظور دارورسانی هدفمند و موثر به محل عفونت استفاده نمود. نانوذرات مغناطیسی آهن دارای خواص بیولوژیکی فعالی أکثرنانوذرات به دلیل خواص فیزیکوشیمیایی خود بهعنوان حاملهای دارویی در درمان سلولهای سرطانی در محیطهای زنده استفادههای گستردهای دارند .از این نانوذرات میتوان به منظور دارورسانی هدفمند و موثر به محل عفونت استفاده نمود. نانوذرات مغناطیسی آهن دارای خواص بیولوژیکی فعالی هستند و میتوانند توسط فاگوسیتوز یا اندوسیتوز وارد سیستم رتیکولوآندوتلیال شوند یا توسط سلولهای فاگوسیتیک مانند مونوسیتها، ماکروفاژها و الیگودندروسیتها گرفته شوند. نانوذرات میتوانند توسط افزایش استرس اکسیداتیو به سلول آسیب برسانند. پروتئین p53 یک سرکوبگر تومور است و در اغلب سرطانهای انسانی یا غیرفعال میشود یا عملکرد آن مختل میشود. هدف از این تحقیق بررسی اثر نانوذرات اکسید آهن بر روی بیان پروتئین P53 در بافت مغز موشهای نژاد Balb/C بوده است. به این منظور 15 سر موش سوری نر به سه گروه پنج تایی تقسیم شدند. گروههای تیمار ا و 2 به ترتیب به مدت 8 روز، دوزهای 100 و 300 ppm نانوذرات مغناطیسی آهن را بطور روزانه و از راه تزریق درون صفاقی دریافت نمودند. پس از اتمام دوره 8 روزه حیوانات تشریح شده، مغز آنها خارج گردید و تحت رنگآمیزی ایمونوهیستوشیمی با Avedin قرار گرفتند. نتایج نشان داد که نانوذرات اکسید آهن با نفوذ به بافت مغز و ایجاد پاسخ التهابی باعث افزایش پروتئین P53 گردیدند و به نظر میرسد که نانوذرات اکسید آهن در غلظتهای بالا تاثیر قابل توجهی بر بیان پروتئین P53 دارند. تفاصيل المقالة
سند
Sanad is a platform for managing Azad University publications
الروابط
المراكز ذات الصلة
دعامة
الصفحات الرسمية
حقوق هذا الموقع الإلكتروني مملوكة لنظام SANAD Press Management. © 1442-1446