16S rRNA

حرية الوصول المقاله

1 - بررسی فعالیت داکسی ریبونوکلئازی در باکتری استافیلوکوکوس پاستوری
امین البرزیان ده شیخ رامین حسینی

تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

2 - جداسازی و بررسی تکامل نژادی گونه جدید باسیلوس مولد آمیلاز ازچشمه آبگرم قینرجه آذربایجان شرقی
سحر حسینی مهدی ابراهیمی معصومه مهدوی اورتاکند خدیجه پورداداش روزبه یلفانی

سابقه و هدف: آمیلازها در صنایع غذایی، تولید شوینده ها، تولید گلوکز، نساجی و کاغذسازی کاربرد گسترده ای دارند. باسیلوس‌ها از مهمترین ریزموجودات تولیدکننده ی آمیلاز میباشند. هدف از این پژوهش جداسازی و بررسی تکامل نژادی باسیلوس گرما دوست مولد آنزیم آلفا-آمیلاز از چشمه آب گر أکثر

سابقه و هدف: آمیلازها در صنایع غذایی، تولید شوینده ها، تولید گلوکز، نساجی و کاغذسازی کاربرد گسترده ای دارند. باسیلوس‌ها از مهمترین ریزموجودات تولیدکننده ی آمیلاز میباشند. هدف از این پژوهش جداسازی و بررسی تکامل نژادی باسیلوس گرما دوست مولد آنزیم آلفا-آمیلاز از چشمه آب گرم قینرجه واقع در استان آذربایجان شرقی می‌باشد. مواد و روش کار: پس از نمونه‌‌گیری از چشمه آب گرم قینرجه، مراحل کشت بر محیط‌های شناخته‌ شده انجام شد. کلنی‌های بدست آمده از لحاظ تولید آنزیم آمیلاز مورد بررسی قرارگرفتند. نمونه مولد آمیلاز با استفاده از روش‌های مورفولوژیک و میکروسکوپی به عنوان یک باسیل گرم مثبت شناسایی شد. در ادامه باسیل مورد نظر پس از استخراج DNA ژنومی، تکثیر و تعیین توالی قطعه 16s rDNA از لحاظ فیلوژنیک با دو روش ماکزیمم لایکلیود و ماکزیمم پارسیمونی مورد بررسی قرارگرفت. نتایج: براساس نتایج بدست آمده از آنالیزهای مرفولوژیک و بیوشیمیایی، مشخص شد که جدایه بدست آمده یک باسیل گرم مثبت با قابلیت تولید اندوسپور و مصرف گلوکز، فروکتوز و ساکارز است اما قادر به استفاده از گالاکتوز و لاکتوز نیست. تست سیرات، اندول و VP برای این باکتری مثبت بوده ولی تست کاتالاز و اکسیداز منفی بدست آمد. نتیجه گیری: براساس نتایج مطالعه فیلوژنتیک با هر دو روش، نمونه باسیل آمیلاز مثبت جداشده از چشمه آب‌گرم قینرجه یک سویه باسیل گرم مثبت جدید از گونه باسیلوس سوبتیلیس (Bacillus subtilis) می‌باشد. در این مطالعه سویه جدیدی از باسیلوس سوبتیلیس با موفقیت از چشمه آب گرم قینرجه جداسازی شد که توانایی تولید آنزیم آمیلاز را دارد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

3 - بررسی فیلوژنی 16 گونه ازدوکفه ای ها در سواحل خلیج فارسجزایر هنگام، لارک، قشم و لنگه )با استفاده از ژن 16srRNA
شهره مسائلی پرگل قوام مصطفوی همایون حسین زاده صحافی سعید تمدنی عبدالرضا نبی نژاد وحید نعمان

زمینه و هدف:رده دوکفه ای ها ازبزرگ ترین رده های شاخه نرمتنان میباشد. بسیاری از گونه های نرم تنان خلیج فارس شاخص و از نظر تجاری حائز اهمیت اند و برخی از نظر تنوع زیستی، چرخه غذایی و مطالعات تکاملی اهمیت دارند. مطالعات بسیاری برای شناسایی و رده بندی دوکفه ای های ایران ص أکثر

زمینه و هدف:رده دوکفه ای ها ازبزرگ ترین رده های شاخه نرمتنان میباشد. بسیاری از گونه های نرم تنان خلیج فارس شاخص و از نظر تجاری حائز اهمیت اند و برخی از نظر تنوع زیستی، چرخه غذایی و مطالعات تکاملی اهمیت دارند. مطالعات بسیاری برای شناسایی و رده بندی دوکفه ای های ایران صورت گرفته است که منجر به شناسایی آن ها شده است. هدف از مطالعه حاضر بررسی فیلوژنتیکی و مورفولوژیک دوکفه ای ها در خلیج فارس می باشد.روش کار:نمونه برداری در سواحل بندر عباس، قشم، لارک، هنگام و لنگه در خلیج فارس انجام گردید و پس از بررسی ویژگی های مورفولوژیک ، سپس استخراج DNAبا روش فنل کلروفرم ایزوآمیل الکل و روش تکثیر s rRNA16 و سپس توالی یابی انجام شد. در این مطالعه توالی ها برای اولین بار ازخلیج فارس گزارش شده است. داده ها با نرم افزارهای فیلوژنی تحلیل شد.یافته ها:مقایسه توالی ژن 16sاین گونه ها با گونه های مطالعه شده از سایر مناطق کره زمین که اطلاعات مولکولی آن ها در دسترس بود، نشان داد که برخی از گونه های دوکفه ای در ایران تشابه ژنتیکی قابل توجه ای با سایر گونه های مطالعه شده ندارند و در ایران ایزوله شده اند و تعدادی تشابه ژنتیکی بالایی با گونه های مطالعه شده دارند و در یک کلاد با بوت استرپ بالا با گونه های سایر دنیا قرار می گیرندنتیجه گیری:نتایج نشان داد رده بندی صورت گرفته بر اساس تعیین توالی ژن 16sکاملاًمطابق با رده بندی های انجام شده بر اساس صفات ریختی است و این دو تایید کننده هم دیگر هستند. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

4 - شناسایی باکتری‌های روده گونه موریانه Microcerotermes diversus Silvestri (Isoptera: Termitidae) و جداسازی باکتری‌های تجزیه کننده لیگنین
بهزاد حبیب پور زینب فتح اللهی سهراب ایمانی نادر حسن زاده محمد عبدی گودرزی

لیگنین فراوان ترین پلیمر معطر (فنلی) و دومین ماده اولیه فراوان در محیط زیست است. لیگنین در طبیعت توسط باکتری ها و قارچ ها تخریب می شود. جهت ارزیابی نقش باکتری های همزیست موریانه ها در تخریب لیگنین، چهار کلنی از گونه موریانه Microcerotermes diversus Silvestri (Termitidae أکثر

لیگنین فراوان ترین پلیمر معطر (فنلی) و دومین ماده اولیه فراوان در محیط زیست است. لیگنین در طبیعت توسط باکتری ها و قارچ ها تخریب می شود. جهت ارزیابی نقش باکتری های همزیست موریانه ها در تخریب لیگنین، چهار کلنی از گونه موریانه Microcerotermes diversus Silvestri (Termitidae) که از طریق تله گذاری در مناطق اهواز، بندرعباس و دو جزیره خارک و کیش جمع آوری شدند. سوسپانسیون روده موریانه های هر منطقه در 5 میلی لیتر D.H2O تهیه شد. نمونه ها در محیط کشت مغذی آگار (NA) کشت داده شدند. پتری دیش های حاوی نمونه کشت داده شده در دمای 270C به مدت 24-72 ساعت درانکوباتور قرار گرفتند. کلنی باکتریایی متنوع با مورفولوژی های متفاوت انتخاب و خالص سازی شدند. برای تمایز باکتری های تجزیه کننده لیگنین، تمام 47 جدایه باکتریایی برروی محیط کشت حاوی آگار لیگنین مختلف استخراج شده حاوی MSM رشد داده شدند. در مجموع، 45 جدایه از نظر تجزیه لیگنین مثبت بودند. تعیین توالی 16S rDNA در ترکیب با روش های کشت کلاسیک برای شناسایی باکتری ها استفاده شد. شناسایی شامل جنس / گونه Stenotrophomonas maltophilia ، Elizabethkingia anopheles ، Ochrobactrum anthropic ، Serratia marcescens ، Lysinibacillus pakistanensis ، Actinetobacter pitti ، Pseudomonas spp. و Bacillus spp بودند. برای تعیین میزان فعالیت لیگنینولیتیک ، باکتری ها از خانواده های شناسایی شده در محیط لیگنین آگار پرورش داده شدند. هیدرولیز لیگنین با استفاده از متیلن بلو بر روی محیط کشت مورد بررسی قرار گرفت. حاله های ایجاد شده دراطراف کلنی باکتری ها اندازه گیری شدند. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

5 - شناسایی میکروفلور باکتریائی لاروهای خوراکی تازه سوسک زرد آرد (Tenebrio molitor L.)
ستاره محمدسلیم سهراب ایمانی محمد عبدی گودرزی نادر حسن زاده وحید زرین نیا

در اکثر کشورهای آسیایی حشرات خوراکی به عنوان یک منبع جایگزین پروتئین حیوانی مصرف می گردند. از آنجا که شواهد محدودی در مورد ایمنی آنها به ویژه از جنبه های میکروبیولوژیکی وجود دارد، تلاش شد تا با ارزیابی سوسک زرد آرد (Tenebrio molitor L.) در شرایط آزمایشگاهی، این مورد ارز أکثر

در اکثر کشورهای آسیایی حشرات خوراکی به عنوان یک منبع جایگزین پروتئین حیوانی مصرف می گردند. از آنجا که شواهد محدودی در مورد ایمنی آنها به ویژه از جنبه های میکروبیولوژیکی وجود دارد، تلاش شد تا با ارزیابی سوسک زرد آرد (Tenebrio molitor L.) در شرایط آزمایشگاهی، این مورد ارزیابی گردد. کلنی اولیه سوسک میل ورم از بازار محلی ساری- ایران خریداری گردیده شد. نمونه های میکروبی از هر دو سطح بدن و روده ها تهیه شد. نمونه ها بصورت جداگانه در محیط کشت نوترینت آگار (NA) کشت داده و در دمای 27 درجه سانتیگراد بمدت 24-72 ساعت انکوبه شدند. کلنی ها متمایز انتخاب و خالص سازی شدند. براساس ویژگی های فنوتیپی، پاسخ حساس (HR) روی برگهای شمعدانی و همچنین آنالیز توالی ژن 16s rRNA، جدایه ها به دو گروه طبقه بندی شدند. جدایه های بیماری زا به عنوان Bacillus cereus ، Staphylococcus sp. ، Pseudomonas aeruginosa ، Enterobacter asburiae ، Bacillus firmus و Serratia marcescens شناسایی شدند. در حالی که، باکتریهای Enterobacter cloacae و Bacillus thuringiensis بعنوان باکتری های غیر بیماریزا تعیین شدند. بدون شک وجود میکروب های بیماری زا در میکرو فلور لارو میل ورم با مصرف مستقیم و غیرمستقیم حشرات ممکن است تهدیدی برای سلامت انسان و حیوان ایجاد کنند.این یافته ها بیانگر اجرای برخی از روش های فراوری بمنظور کاهش یا ریشه کن کردن خطرات آلودگی میکروبی در رژیم های غذایی با استفاده از حشرات طبیعی را نشان میدهد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

6 - جداسازی و شناسایی باکتری‌های لاکتیکی از محصولات لبنی سنتی کلیبر، هریس و ورزقان
طاهره نریمانی علیرضا تاری‌نژاد محمد‌امین حجازی

پروبیوتیک ها مکمل های غذایی از میکروارگانیسم های زنده ای هستند که با قرار گرفتن در محیط روده می توانند تعادل میکروبی را در جهت افزایش سودمندی آن ها اصلاح کنند و با فعالیت خود مانع از فعالیت میکروارگانیسم های غیر مفید و بیماری‌زا شوند. از میان باکتری ها، باکتری های اسیدل أکثر

پروبیوتیک ها مکمل های غذایی از میکروارگانیسم های زنده ای هستند که با قرار گرفتن در محیط روده می توانند تعادل میکروبی را در جهت افزایش سودمندی آن ها اصلاح کنند و با فعالیت خود مانع از فعالیت میکروارگانیسم های غیر مفید و بیماری‌زا شوند. از میان باکتری ها، باکتری های اسیدلاکتیک، متداول ترین نوع باکتری هایی هستند که به عنوان پروبیوتیک معرفی شده اند. این باکتری ها در محصولات لبنی وجود داشته و در طول مراحل تخمیر، اسید لاکتیک تولید می کنند. هدف از این تحقیق، جداسازی و شناسایی باکتری‌های پروبیوتیک از فلور موجود در شیر، ماست و دوغ سنتی مناطق کلیبر، هریس و ورزقان می باشد. جهت انجام این مطالعه، باکتری های لاکتیکی توسط روش های متداول کشت و شناسایی بر اساس خواص بیوشیمیایی شناسایی شدند و مقاومت به اسید معده و نمک های صفراوی مورد ارزیابی قرار گرفت. سپس برای شناسایی دقیق تر با جفت آغازگرهای اختصاصی، ژن 16SrRNA باکتری ها تکثیر داده شد و بعد از خالص سازی محصول PCR، ژن مورد نظر تعیین توالی گردید. در نتیجه این بررسی، 17 سویه لاکتوباسیلوس و 6 سویه انتروکوکوس از مناطق کلیبر، هریس و ورزقان جدا شده اند که می توانند کاندید مناسبی برای بررسی های بیشتر به عنوان پروبیوتیک باشند. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

7 - شناسایی مولکولی و مطالعه فیزیولوژیک و مورفولوژیک سیانوباکتری Nostoc sp. ISC101 تحت تیمارهای مختلف نفت خام
فریبا امیرلطیفی ندا سلطانی سارا سعادتمند شادمان شکروی مهروز دزفولیان

نفت یک فرآورده سمی برای سیستم‌های بیولوژیک و یکی از آلوده‌کننده‌های اصلی محیط‌زیست محسوب می‌شود. میکروارگانیسم‌های تجزیه کننده هیدروکربن‌های نفتی معمولاً در محیط‌های دریایی یافت می‌شوند. در این بررسی اثر نفت خام بر بیومتری، ریخت‌شناسی، ساختار سلولی و پاسخ‌های فیزیولوژیک أکثر

نفت یک فرآورده سمی برای سیستم‌های بیولوژیک و یکی از آلوده‌کننده‌های اصلی محیط‌زیست محسوب می‌شود. میکروارگانیسم‌های تجزیه کننده هیدروکربن‌های نفتی معمولاً در محیط‌های دریایی یافت می‌شوند. در این بررسی اثر نفت خام بر بیومتری، ریخت‌شناسی، ساختار سلولی و پاسخ‌های فیزیولوژیک سیانوباکتریNostoc sp.ISC101 مورد آزمایش قرار گرفت و شناسایی مولکولی توسط بررسی توالی جزئی ژن 16s rRNA انجام پذیرفت. پس از خالص سازی، نمونه در محیط کشت مایع BG110، تحت تیمارهای مختلف نفت خام (شاهد، 1، 5/2، 5 و 7 درصد) قرار گرفت. بررسی‌های مورفولوژیک و ساختاری توسط میکروسکوپ نوری و الکترونی (SEM) انجام گردید. نتایج نشان داد که تفاوت معنی‌داری در اندازه سلول‌های رویشی و هتروسیست‌ها با تغییرات نفت مشاهده نشد. سنجش کلروفیل و فیکوبیلی پروتئین‌ها در فاز لگاریتمی و با روش طیف سنجی انجام شد. نتایج فیزیولوژیک حاکی از آن بود که میزان رشد با افزایش میزان نفت خام افزایش یافت، بیشترین میزان رشد در تیمار 7درصد نفت خام مشاهده شد. میزان کلروفیل در نمونه شاهد بیشترین مقدار بود. میزان فیکوبیلی‌پروتئین‌ها در شاهد و تیمارها اختلاف معنی‌داری نداشت. نتایج این تحقیق نشان داد که نمونه بقای خود را در تیمارهای اعمال شده حفظ نموده و ترکیبات نفتی برای آن سمی نبود. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

8 - شناسایی مولکولی و مطالعه اثر کلرید سدیم بر پاسخ‌های فیزیولوژیک و مورفولوژیک سیانوباکتری Leptolyngbya sp. ISC25
شقایق ایرانشاهی ندا سلطانی طاهر نژاد ستاری شادمان شکروی مهروز دزفولیان

تنش شوری یک عامل محدود کننده مهم محیطی می‌باشد که در صنعت کشاورزی اثر می‌گذارد. شناخت رفتار مورفولوژیک سیانوباکتری‌ها در سال‌های اخیر به‌دلیل پتانسیل بالای آن‌ها در برابر تنش شوری از اهمیت زیادی برخوردار شده است. در این تحقیق تاثیر شوری بر پاسخهای فیزیولوژیک، بیومتری و أکثر

تنش شوری یک عامل محدود کننده مهم محیطی می‌باشد که در صنعت کشاورزی اثر می‌گذارد. شناخت رفتار مورفولوژیک سیانوباکتری‌ها در سال‌های اخیر به‌دلیل پتانسیل بالای آن‌ها در برابر تنش شوری از اهمیت زیادی برخوردار شده است. در این تحقیق تاثیر شوری بر پاسخهای فیزیولوژیک، بیومتری و مورفولوژی سیانوباکتری Leptolyngbya sp. ISC25 مورد آزمایش قرار گرفت. همچنین شناسایی مولکولی توسط بررسی توالی جزئی ژن 16s rRNA انجام پذیرفت. بدین منظور نمونه سیانوباکتری پس از کشت خاک و خالص سازی به محیط کشت مایع BG11 منتقل گردید و تحت تیمارهای مختلف شوری (0 و 1 و2 و3 و4 و5 درصد) قرار گرفت. از ابتدای تیماردهی، هر روز وضعیت کلنیزاسیون و بیومتری نمونه‌ها مورد بررسی قرار گرفت. مطالعات ساختاری و بیومتری به‌ترتیب با کمک میکروسکوپ الکترونی روبشی SEM و نوری انجام شد. سنجش کلروفیل و فیکوبیلی پروتئین‌ها در فاز لگاریتمی و با روش طیف سنجی انجام شد. نتایج حاکی از آن بود که بهترین نرخ رشد مربوط به شاهد بود. میزان رنگیزه‌ها اعم از کلروفیل و تمامی فیکوبیلی‌پروتئین‌ها با افزایش نمک کاهش نشان دادند. بررسی مورفولوژی با میکروسکوپ نوری حاکی از تکه تکه شدن ریسه‌ها در شوری 4 و 5 درصد بود. بررسی تغییرات ساختاری با کمک عکس الکترونی SEM در شاهد و تیمار شوری نشان دهنده اضمحلال نسبی سلول‌ها در تیمار 5 درصد شوری بود. بطورکلی نتایج نشان داد که نمونه مورد آزمایش نسبت به شوری حساس بوده و افزایش کلرید سدیم تاثیرات مخرب بر متابولیسم، ریخت‌شناسی و ساختار این سیانوباکتری دارد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

9 - جداسازی، شناسایی و توصیف باکتری‌های اسید لاکتیک از فرآورده‌های لبنی سنتی استان مازندران
پیوند کارنما علی پاکدین شقایق نصر

باکتری‌های اسید لاکتیک یک گروه متنوع از میکروارگانیسم‌ها می‌باشند که در صنایع لبنی و تخمیری اهمیت بسیاری دارند. غربالگری برای یافتن سویه‌های لاکتوباسیل با خصوصیات مطلوب بطور پیوسته در حال انجام است. باگسترش تولید صنعتی محصولات لبنی، امکان ازدست رفتن باکتری‌های بومی موجو أکثر

باکتری‌های اسید لاکتیک یک گروه متنوع از میکروارگانیسم‌ها می‌باشند که در صنایع لبنی و تخمیری اهمیت بسیاری دارند. غربالگری برای یافتن سویه‌های لاکتوباسیل با خصوصیات مطلوب بطور پیوسته در حال انجام است. باگسترش تولید صنعتی محصولات لبنی، امکان ازدست رفتن باکتری‌های بومی موجود درمحصولات لبنی سنتی وجود دارد، ازاین رو جداسازی، شناسایی و تعیین خصوصیات مفید این باکتری‌ها به منظور کاربردهای آتی ضروری می‌باشد. در تحقیق حاضر باکتری‌های اسید لاکتیک از فرآورده‌های لبنی جمع‌آوری شده از مناطق مختلف استان مازندران بر روی محیط کشت اختصاصی MRS جداسازی شدند. باکتری‌های گرم مثبت و کاتالاز منفی انتخاب شده و توانایی رشد این ایزوله‌ها در غلظت های مختلف نمک (2 تا 8 درصد) و همچنین توانایی تخمیر قندهای مختلف برای تمایز و شناسایی مقدماتی آنها بررسی شد. شناسایی مولکولی سویه‌های باکتری با استفاده از تکثیر و توالی‌یابی ژن 16S rRNA انجام شد. نتایج بدست آمده تنوع نسبتاً زیاد در باکتری‌های جداسازی شده از مناطق مختلف را نشان داد که در این میان دو گونه از جنس‌ انتروکوکوس (E. faecalis و E. faesium) و یک گونه لکونوستوک (Leu. mesenteroides) خصوصیات پروبیوتیک قابل ملاحظه‌ای نشان دادند. به نظر می‌رسد محصولات لبنی سنتی استان از پتانسیل بالایی جهت جستجو برای باکتری‌های با توانایی مفید جهت استفاده در صنایع مختلف برخوردار می‌باشند. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

10 - Polymerase Chain Reaction of Mgc2 and 16S rRNA Genes for Detection of <i>Mycoplasma gallisepticum</i>
ا. ذاکری

Mycoplasmas are very small bacteria lacking cell walls that belong to various genera within the class Mollicutes, and also the smallest organisms that can live independently. They are able to cause serious and chronic disease because of some unique characteristics. Myco أکثر

Mycoplasmas are very small bacteria lacking cell walls that belong to various genera within the class Mollicutes, and also the smallest organisms that can live independently. They are able to cause serious and chronic disease because of some unique characteristics. Mycoplasma gallisepticum (MG) is an important avian pathogen causing significant economical losses within the poultry industry. The aim of the present study was to investigate the prevalence of M. gallisepticum in poultry by PCR of mgc2 and 16 s rRNA. We examined the differentiating potential of diagnostic polymerase chain reaction (PCR) primers targeted to the 16S rRNA and mgc2 genes present in MG. For serological screaming test, we selected 26 farms and took blood samples for RSAT assay. For 16S rRNA and mgc2 PCR assay, we took 109 samples from 10 rapid slide agglutination test (RSAT) positive farms, including: lung, air sacs and tracheal swabs. The 16S rRNA and mgc2 PCR diagnostic primers are specific for MG in tests of all avian Mycoplasmas or bacteria present in the chicken trachea and are sensitive enough to readily detect MG in tracheal swabs from field outbreaks. 530 bp and 300 bp PCR products on electrophoresis gel appeared respectively with 16S rRNA and mgc2 PCR diagnostic primers, specific for MG. The test was successfully applied in vivo for detection of MG in clinical samples. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

11 - Genetic Transformation of Amylase Gene to Ruminal <i>Bacteroides</i> Species Using Conjugation Consequence for Improvement of Rumen Enzyme
ح. عقبی طلب ف. مرادیان ق. رحیمی ح. رحیمیان

Rumen bacterial strains can potentially be manipulated to perform functions different from wild type species. The most numerous species of bacteria in the rumen and gut are species of the familyBacteroidetes, whichcan have the potential for genetic modification for enzy أکثر

Rumen bacterial strains can potentially be manipulated to perform functions different from wild type species. The most numerous species of bacteria in the rumen and gut are species of the familyBacteroidetes, whichcan have the potential for genetic modification for enzyme production. One of the genetic manipulation of rumen bacteria can perform for production of starch digestive enzyme for the enhancement of nutrient flow to the rumen. In this study, Bacteroides species were isolated from rumen of cows. The 16S rRNA gene analysis was used to confirm the classification of the Bacteroides species. The amylase gene from Bacillus spp. was cloned into expression vector pET28A and then subcloned in Escherichia coli-Bacteroides pGFK114.1 shuttle vector. Conjugation between Escherichia coli and a Bacteroides strainwas accomplished with two Escherichia coli donors containing pGFK114.1 and pRK231 and one Bacteroides strain as a recipient. Transfer of amylase gene by vector was confirmed using a marker cefoxcitin antibiotic resistant gene. The amylase activity assay showed that successful expression of enzyme occurred in ruminal Bacteroides species. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

12 - تنوع زیستی باکتری های گرم منفی نمک دوست در سواحل تنگه هرمز
تارا موسیوند عباس اخوان سپهی شیلا صفائیان

خلیج فارس یا دریای پارس آبراهی است که در امتداد دریای عمان و در میان ایران و شبه جزیره عربستان قرار دارد. تنگه استراتژیک هرمز باریکه خمیده شکلی است که فلات ایران را از شبه جزیره عربستان جدا می کند و آب های خلیج فارس را به دریای عمان و اقیانوس هند پیوند می دهد. تلاش برای أکثر

خلیج فارس یا دریای پارس آبراهی است که در امتداد دریای عمان و در میان ایران و شبه جزیره عربستان قرار دارد. تنگه استراتژیک هرمز باریکه خمیده شکلی است که فلات ایران را از شبه جزیره عربستان جدا می کند و آب های خلیج فارس را به دریای عمان و اقیانوس هند پیوند می دهد. تلاش برای بررسی تنوع گونه های باکتری های نمک دوست موجود در سواحل تنگه هرمزکه بخشی از تنوع زیستی این تنگه است، هدف اجرای مطالعه حاضر بود در بهمن ماه سال 1390به تعداد 12 نمونه از آب و رسوب مناطق و عمق های مختلف سواحل تنگه هرمز جمع آوری و در شرایط استریل به آزمایشگاه منتقل شدند. غنی سازی نمونه ها در محیط براث اختصاصی Alkaline Peptone Water و محیط عمومی Nutrient Broth انجام گرفت. نمونه ها بر روی محیط های کشت جامد EMB،Endo وMac Conkey Agar کشت داده شدند .در نهایت 70 جدایه از محیط های کشت بدست آمد. سرانجام آزمون ژنتیکی بر پایه Sequencing 16S rRNA انجام گرفت. آنالیز فیلوژنتیکی سویه ها بر اساس rRNA 16S نشان داد که سویه هایی از هالوموناس به نام هایHalomonas alkaliphila ، sulfidaeris Halomonas و Halomonas venustaجدا سازی شد .این مطالعه نشان داد که سواحل تنگه هرمز می تواند محیط مطلوبی برای رشد باکتری های گرم منفی نمک دوست )هالوموناس ( باشد که می توانند کاربردهای بیوتکنولوژیکی فراوان داشته باشند. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

13 - جداسازی، شناسایی و ارزیابی تولید صمغ زانتان توسط زانتوموناس کامپستریس جدا شده از برگ های درختان لیمو
صبا امیری کجوری زهیر حشمتی پور اسمعیل قربانعلی نژاد

سابقه و هدف: صمغ زانتان یک هتروپلی ساکارید خارج سلولی است و توسط باکتری های جنس زانتوموناس که برای تعداد زیادی از گیاهان به عنوان آفت محسوب می شوند، سنتز می گردد. این مطالعه با هدف جداسازی و تشخیص سویه زانتوموناس از برگ های درختان لیمو ترش و تولید صمغ زانتان در آنها انج أکثر

سابقه و هدف: صمغ زانتان یک هتروپلی ساکارید خارج سلولی است و توسط باکتری های جنس زانتوموناس که برای تعداد زیادی از گیاهان به عنوان آفت محسوب می شوند، سنتز می گردد. این مطالعه با هدف جداسازی و تشخیص سویه زانتوموناس از برگ های درختان لیمو ترش و تولید صمغ زانتان در آنها انجام شد. مواد و روش ها: این مطالعه به صورت مقطعی بر روی برگ های درختان لیموترش آلوده به شانکر باکتریایی انجام گرفت. جداسازی عامل بیماری با استفاده از محیط کشت YDC انجام شد. کلنی های به دست آمده با کلنی های زانتوموناس کامپستریس PTCC 1473 از نظر خصوصیات مورفولوژیکی مورد مقایسه قرار گرفتند. برای تولید صمغ زانتان از محیط تولید صمغ استفاده شد. به منظور شناسایی نهایی باکتری جداسازی شده از روش 16S rRNA استفاده گردید. یافته ها: در این مطالعه یک سویه جدید زانتوموناس کامپستریس به نام saba.ton شناسایی و با شماره دسترسی KF706548.1 در بانک ژن ثبت گردید. میزان تولید صمغ زانتان این جدایه در محدودهg/100ml 1.5-0.081 گزارش گردید. نتیجه گیری: در این مطالعه یک سویه جدید از باکتری زانتوموناس جداسازی گردید. این سویه به عنوان یک سویه بومی ایران بدون بهینه سازی شرایط رشد دارای توان بالقوه ای در تولید صمغ زانتان بود. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

14 - جداسازی و شناسایی مولکولی لیزنی باسیلوس ماکروئیدس از ریشه گندم و بررسی فعالیت ضد قارچی آن علیه گونه های تریکودرمایی
محبوبه چوپان وامرزانی حمیدرضا پردلی مجید مقبلی

سابقه و هدف: باکتری لیزنی باسیلوس باکتری اندوفتیک است که از گیاه در برابر شرایط فیزیولوژیکی و زیست محیطی حفاظت می نماید. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی مولکولی باکتری اندوفیت لیزنی باسیلوس ماکروئیدس از ریشه گندم و بررسی فعالیت ضد قارچی آن علیه گونه های تریکودرمایی أکثر

سابقه و هدف: باکتری لیزنی باسیلوس باکتری اندوفتیک است که از گیاه در برابر شرایط فیزیولوژیکی و زیست محیطی حفاظت می نماید. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی مولکولی باکتری اندوفیت لیزنی باسیلوس ماکروئیدس از ریشه گندم و بررسی فعالیت ضد قارچی آن علیه گونه های تریکودرمایی انجام شد. مواد و روش ها: به منظور جداسازی باکتری های اندوفتیک از عصاره ریشه و ساقه گندم های کشت شده در مناطق مختلف استان مازندران و گلستان استفاده گردید. فعالیت ضد قارچی آن ها با روش کشت متقابل بر روی محیط سیب زمینی دکستروز آگار(PDA) مورد ارزیابی قرار گرفت. پس از استخراج DNA ژنومی، از روش PCR به منظور تکثیر ژن16S rRNA استفاده گردید. به منظور شناسایی دقیق باکتری جداسازی شده، محصول PCR تعیین توالی و ترادف بازی آن BLAST گردید. یافته ها: باکتری جداسازی شده قادر به مهار رشد قارچ های بیوکنترلی بود. نتایج تعیین توالی نشان داد که باکتری جداسازی شده متعلق به جنس لیزنی باسیلوس است و شباهت 99 درصدی به گونه لیزنی باسیلوس ماکروئیدس W1 دارد. نتیجه گیری: این مطالعه اولین گزارش جداسازی لیزنی باسیلوس از گیاه تحت عنوان اندوفتیک است. باکتری اندوفیت جداسازی شده در این بررسی می تواند به منظور استخراج، شناسایی و به کارگیری متابولیت های مهاری آن در طراحی و تولید داروهای ضد قارچی مورد استفاده قرار گیرد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

15 - جداسازی و بررسی هویت مولکولی مایکوپلاسما هومینیس دستگاه تناسلی زنان و مردان نابارور در کرمان
سمانه جمالیزاده بهاآبادی بابک خیرخواه علیرضا فارسی نژاد ویکتوریا حبیب زاده

سابقه و هدف: مایکوپلاسماها یکی از عوامل میکروبی ناباروری در انسان می باشند. مایکوپلاسماهای تناسلی اثرات مخربی بر اندام های تناسلی داشته و موجب اختلالات باروری و مرگ نوزادان می گردند. این مطالعه با هدف تعیین هویت مولکولی مایکوپلاسما هومینیس جدا شده از دستگاه تناسلی زنان أکثر

سابقه و هدف: مایکوپلاسماها یکی از عوامل میکروبی ناباروری در انسان می باشند. مایکوپلاسماهای تناسلی اثرات مخربی بر اندام های تناسلی داشته و موجب اختلالات باروری و مرگ نوزادان می گردند. این مطالعه با هدف تعیین هویت مولکولی مایکوپلاسما هومینیس جدا شده از دستگاه تناسلی زنان و مردان نابارور در کرمان انجام شد. مواد و روش ها: این مطالعه به صورت توصیفی بر روی 100 زن و 100 مرد نابارور مراجعه کننده به مرکز ناباروری کرمان به مدت 6 ماه به صورت هدف دار انجام شد. نمونه های مایع منی و سواپ واژینال برای بررسی وجود مایکوپلاسما هومینیس با روش واکنش زنجیره ای پلی مراز مورد آزمایش قرار گرفتند. محصول PCR نمونه های مثبت برای تعیین هویت مولکولی انتخاب گردیدند. همردیف کردن توالی نمونه ها با استفاده از نرم افزار MEGA 5 و با روش Neighbor-joining انجام گرفت. یافته ها: در این مطالعه 45 درصد از نمونه های مردان آلوده به جنس مایکوپلاسما بودند. از این میان فراوانی گونه مایکوپلاسما هومینیس 33 درصد بود. همچنین 43 درصد از نمونه های زنان آلوده به جنس مایکوپلاسما بودند. از این میان فراوانی گونه مایکوپلاسما هومینیس 41.8 درصد بود. آنالیز توالی های مایکوپلاسما هومینیس های جدا شده نشان داد که جدایه ها در 5 دودمان کاملاً مجزا قرار می گیرند. نتیجه گیری: در این پژوهش مایکوپلاسما هومینیس به عنوان مهم ترین عامل میکروبی مایکوپلاسمایی ناباروری در جامعه آماری مورد مطالعه مطرح بود. تجزیه و تحلیل توالی نوکلئوتیدی جدایه ها، تشابه ژنوتیپی بسیار ناچیزی را بین برخی از جدایه ها نشان داد. در نتیجه می توان این جدایه ها را در گروه های متفاوت به عنوان سویه بومی ایران طبقه بندی نمود. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

16 - جداسازی باکتری های حل کننده تری کلسیم فسفات از خاک مزارع گندم و جو شهرستان مرودشت
فاطمه ناصری نیما بهادر مجید باصری مهدی کارگر

سابقه و هدف: بسیاری از میکروارگانیسم های خاک می توانند فسفر غیر قابل دسترس را از طریق فعالیت های متابولیکی با ترشح اسیدهای آلی حل کنند. این مطالعه با هدف جداسازی باکتری های فعال حل کننده تری کلسیم فسفات از خاک مزارع گندم و جو دشت مرودشت انجام شد. مواد و روش ها: این مطا أکثر

سابقه و هدف: بسیاری از میکروارگانیسم های خاک می توانند فسفر غیر قابل دسترس را از طریق فعالیت های متابولیکی با ترشح اسیدهای آلی حل کنند. این مطالعه با هدف جداسازی باکتری های فعال حل کننده تری کلسیم فسفات از خاک مزارع گندم و جو دشت مرودشت انجام شد. مواد و روش ها: این مطالعه به صورت مقطعی-توصیفی بر روی خاک 50 مزرعه جو و 50 مزرعه گندم دشت مرودشت انجام گرفت. در ابتدا نمونه های خاک در محیط NRIP حاوی تری کلسیم فسفات (10 درصد) غنی سازی شدند. باکتری های دارای هاله شفاف حل کننده تری کلسیم فسفات با آزمون های بیوشیمیایی، PCR و تعیین توالی شناسایی گردیدند. دو باکتری فعال جداسازی شده از خاک مزارع گندم و جو به منظور بررسی تولید اسید های آلی ترشح شده با روش HPLC آنالیز شدند. یافته ها: از مجموع نمونه های جمع آوری شده، 9 باکتری (18%) حل کننده تری کلسیم فسفات از مزرعه جو و 6 باکتری (12%) حل کننده تری کلسیم فسفات از مزرعه گندم دشت مرودشت جداسازی گردید. نتایج حاصل از تزریق نمونه های باکتریایی به دستگاه HPLC نشان داد که باکتری های جداسازی شده از مزرعه جو دارای 4 نوع اسید مختلف با وزن مولکولی پایین و در مزرعه گندم دارای 3 نوع اسید مختلف می باشند. نتیجه گیری: از آنجایی که در مطالعه حاضر بیشترین و فعال ترین باکتری های حل کننده فسفات از خاک مزارع جو جداسازی شدند می توان دریافت که این باکتری ها بیشتر در خاک های که کود های شیمیایی فسفره مصرف کمتری دارند، گستردگی بیشتری دارند. همچنین غربالگری باکتری های موجود در مزارع مختلف و نیز شناسایی آنها می تواند در تهیه کودهای بیولوژیک و رشد گیاهان منطقه موثر باشد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

17 - جداسازی، شناساﻳﻲ و ارزیابی پتانسیل ضد قارچی باکتری های تجزﻳﻪ کننده کیتین جدا شده از خاک ریزوسفر گیاهان
طاهره صلاحی نژاد زهیر حشمتی پور مسعود هاشمی کروئی

سابقه و هدف: ﻛﻴﺘﻴﻨﺎز ﻳﻜﻲ از مهم ترﻳﻦ آنزﻳﻢهای صنعتی می باشد که در سال های اخیر به دلیل کاربرد وسیع، به ویژه در کنترل زیستی قارچ های بیماری زا مورد توجه بسیاری قرار گرفته است. این مطالعه با هدف جداسازی و شناساﻳﻲ باکتری های تجزیه کننده کیتین از خاک ریزوسفر گیاهان و نیز بر أکثر

سابقه و هدف: ﻛﻴﺘﻴﻨﺎز ﻳﻜﻲ از مهم ترﻳﻦ آنزﻳﻢهای صنعتی می باشد که در سال های اخیر به دلیل کاربرد وسیع، به ویژه در کنترل زیستی قارچ های بیماری زا مورد توجه بسیاری قرار گرفته است. این مطالعه با هدف جداسازی و شناساﻳﻲ باکتری های تجزیه کننده کیتین از خاک ریزوسفر گیاهان و نیز بررسی میزان پتانسیل ضد قارچی آنها انجام شد. مواد و روش ها: در این پژوهش 38 نمونه خاک از ریزوسفر بوته های چای، شعمدانی و شبدر به صورت تصادفی جمع آوری گردید. پس از تعیین رقت و کشت نمونه ها بر روی محیط کیتین کلوئیدال آگار (CCA)، جدایه های دارای هاله شفاف انتخاب شدند. سنجش آنزیم کیتیناز با دستگاه اسپکتروفتومتر انجام شد. پتانسیل ضد قارچی باکتری های جداسازی شده علیه قارچ فوزاریوم سولانی مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت، تعیین هویت مولکولی سویه ها با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلی مراز و تعیین توالی ناحیه 16S rRNA انجام شد. یافته ها: در این مطالعه تنها یک سویه جدید به نام سراشیا سویه صلاحی با فعالیت تجزیه کنندگی کیتین جداسازی گردید. بیشترین میزان فعالیت آنزیمی این سویه در دمای 30 درجه سانتی گراد و پس از 4 روز معادل U/ml 4.37 بود. همچنین فعالیت ضد قارچی این باکتری با هاله عدم رشد 1.5 سانتی متر به اثبات رسید. نتیجه گیری: نتایج این پژوهش نشان داد که این سویه جدید پتانسیل کاربرد به عنوان یک آفت کش طبیعی محصولات زراعی، جایگزین آفت کش های سنتزی و سرطان زا را دارد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

18 - جداسازی و شناسایی مولکولی باکتری های تولید کننده L- آسپاراژیناز از خلیج فارس
فاطمه ایزدپناه قشمی صدیقه جوادپور کیانوش ملک زاده

سابقه و هدف: L-آسپاراژیناز یک ماده آنتی نئوبلاستیک می باشد که در شیمی درمانی لوسمی لنفوبلاستیک حاد به کار می رود. این آنزیم در بسیاری از جانوران و میکروارگانیسم ها وجود دارد. با این وجود باکتری ها منبع مناسبی برای استخراج این آنزیم به شمار می روند. این مطالعه با هدف جدا أکثر

سابقه و هدف: L-آسپاراژیناز یک ماده آنتی نئوبلاستیک می باشد که در شیمی درمانی لوسمی لنفوبلاستیک حاد به کار می رود. این آنزیم در بسیاری از جانوران و میکروارگانیسم ها وجود دارد. با این وجود باکتری ها منبع مناسبی برای استخراج این آنزیم به شمار می روند. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی مولکولی باکتری های تولید کننده L-آسپاراژیناز از خلیج فارس انجام شد. مواد و روش ها: در مطالعه تجربی حاضر از نمونه های آب و رسوبات خلیج فارس نمونه گیری به عمل آمد. به منظور غربالگری باکتری های تولید کننده L-آسپاراژیناز از محیط کشت M9 استفاده گردید. پس از تهیه عصاره خام، میزان فعالیت آنزیم با روش رنگ سنجی تعیین شد. 13 سویه که دارای بیشترین فعالیت آنزیمی بودند، انتخاب و با روش PCR و تعیین توالی ژن 16S rRNA شناسایی گردیدند. یافته ها: در مجموع 181 کلنی از نمونه های مورد بررسی جداسازی گردید. از این میان 57 کلنی توانایی تولید آنزیم L-آسپاراژیناز را داشتند. آنالیز توالی ژن 16S rRNA نشان داد که از مجموع 13 باکتری با بیشترین فعالیت آنزیمی، 8 سویه (61/5%) متعلق به جنس باسیلوس، دو سویه (15/4%) سودوموناس و 1 سویه به هر کدام از جنس های زوبللا (7/7%)، اوشنیموناس (7/7%)، و اسنیتوباکتر (7/7%) تعلق داشت. همچنین اسینتوباکتر سویهPG_14 کمترین فعالیت آنزیمی (IU 0/07) و سودوموناس سویهPG_01 بیشترین فعالیت آنزیمی (IU 6/1) را دارا بودند. نتیجه گیری: باکتری های جدا شده از خلیج فارس منبع بالقوه ای از L-آسپاراژیناز می باشند. از فعالیت بالای سودوموناس سویهPG_01 می توان به منظور تولید این آنزیم استفاده نمود. مطالعه حاضر، اولین گزارش تولید L-آسپاراژیناز توسط جنس زوبللا می باشد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

19 - جداسازی باسیلوس سرئوس تولید کننده α-آمیلاز از ریزوسفر درختان پرتقال
مهناز رمضانی علی ریاحی مدوار موج خالقی

سابقه و هدف: : باکتری های موجود در ناحیه ریزوسفر با محلول نمودن فسفات و تولید ترکیباتی از قبیل فیتوهورمون ها و ترشح آنزیم هایی مانند α-آمیلاز و کیتیناز به رشد گیاهان کمک می&zwnj;نمایند. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی باسیلوس&zwnj;های تولید کننده α-آمیلا أکثر

سابقه و هدف: : باکتری های موجود در ناحیه ریزوسفر با محلول نمودن فسفات و تولید ترکیباتی از قبیل فیتوهورمون ها و ترشح آنزیم هایی مانند α-آمیلاز و کیتیناز به رشد گیاهان کمک می&zwnj;نمایند. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی باسیلوس&zwnj;های تولید کننده α-آمیلاز از ریزوسفر درختان پرتقال و نیز ارزیابی تولید و فعالیت α-آمیلاز در حضور منابع مختلف کربن و دامنه های مختلف pH انجام شد. مواد و روش ها: این پژوهش به صورت مقطعی به منظور جداسازی باسیلوس های تولید کننده α-آمیلاز از ریزوسفر باغات پرتقال دلفارد در استان کرمان انجام شد. پس از جمع آوری نمونه، به منظور جداسازی باکتری از محیط آگار حاوی نشاسته استفاده گردید. از آزمون&zwnj;های بیوشیمیایی و مولکولی تعیین توالی ناحیه 16S rRNA برای شناسایی دقیق سویه مورد نظر استفاده شد. به منظور بررسی فعالیت آمیلازی از تست سریع هیدرولیز نشاسته استفاده گردید. همچنین تولید آنزیم در حضور منابع مختلف کربن شامل گلوکز، فروکتوز و نشاسته مورد بررسی قرار گرفت. یافته ها: پس از شناسایی بیوشیمیایی و تعیین توالی سویه برتر تولید کننده آنزیم با عنوان باسیلوس سرئوس سویه MR-R3 با شماره دستیابی KC306945.1 در بانک جهانی ژن ثبت گردید. همچنین نتایج نشان داد که نشاسته و گلوکز بیشترین اثر مثبت بر تولید آنزیم α-آمیلاز را در غلظت 0/5 گرم بر لیتر و فروکتوز بیشترین اثر را در غلظت 0/25 گرم بر لیتر دارا می&zwnj;باشند. نتیجه گیری: با توجه به کفایت مناسب تولید α-آمیلاز سویه جداشده در شرایط آزمایشگاهی، انجام مطالعات های گسترده تر در حد بالاتر به منظور شناسایی دقیق تر ویژگی های آنزیمی آن پیشنهاد می گردد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

20 - بهینه سازی تولید پلی هیدروکسی‌بوتیرات سویه جدید باسیلوس سرئوس جدا شده از پساب پتروشیمی
خسرو عیسی‌زاده صبا امیری کجوری زهیر حشمتی پور میرساسان میرپور سعید ضرابی

سابقه و هدف: پلی هیدروکسی بوتیرات یک بیوپلی مر تولید شده توسط باکتری ها است. این ترکیبات با وجود داشتن خواص فیزیکی و شیمیایی مشابه با پلاستیک های مصنوعی کاملاً زیست تخریب پذیر و سازگار با محیط زیست می باشند. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی یک سویه بومی تولید کننده أکثر

سابقه و هدف: پلی هیدروکسی بوتیرات یک بیوپلی مر تولید شده توسط باکتری ها است. این ترکیبات با وجود داشتن خواص فیزیکی و شیمیایی مشابه با پلاستیک های مصنوعی کاملاً زیست تخریب پذیر و سازگار با محیط زیست می باشند. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی یک سویه بومی تولید کننده پلی هیدروکسی بوتیرات با قابلیت تولید مناسب برای اهداف صنعتی انجام شد. مواد و روش ها: در این مطالعه تحلیلی، نمونه برداری از پساب شرکت پتروشیمی انجام شد. وجود پلی هیدروکسی بوتیرات در جدایه ها با رنگ آمیزی سودان سیاه مورد بررسی قرار گرفت. یک جدایه باسیلوس به منظور افزایش تولید پلی هیدروکسی بوتیرات انتخاب شد. این جدایه با روش های بیوشیمیایی و تعیین توالی ژن 16S rRNA شناسایی شد.تأیید نهایی سنتز پلی هیدروکسی بوتیرات توسط آنالیزهای طیف سنجی مادون قرمز و رزونانس مغناطیسی هسته پروتون انجام شد. به منظور تولید بیشتر پلی هیدروکسی بوتیرات تأثیر عوامل مختلف مانند منابع کربن و نیتروژن، pH و دما ارزیابی شدند.یافته ها: در مجموع 8 جدایه باکتریایی تولید کننده پلی هیدروکسی بوتیرات جداسازی شد که از این میان یک سویه جدید باسیلوس سرئوس به عنوان جدایه برتر انتخاب گردید. شرایط بهینه به منظور تولید بیشتر پلی هیدروکسی بوتیرات، استفاده از گلوکز به عنوان منبع کربن، سولفات آمونیوم به عنوان منبع نیتروژن، pH 7 و دمای 30 درجه سلسیوس بود.نتیجه گیری: مطالعه حاضر نتایج ارزشمندی را در مورد شرایط بهینه برای تولید پلی هیدروکسی بوتیرات فراهم آورده است که می تواند در سطح صنعتی برای تولید پلی هیدروکسی بوتیرات به عنوان یک جایگزین سریع پلاستیک های مصنوعی مبتنی بر نفت مورداستفاده قرار گیرد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

21 - جداسازی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس تولید کننده لیزواستافین، از ورم پستان گاوی و شناسایی آن بر اساس تعیین توالی 16S rRNA
سجاد یزدان ستاد مجید مقبلی هاتف آجودانی فر

سابقه و هدف: استافیلوکوکوس سیمولانس یک کوکسی گرم مثبت و خوشه ای می باشد که از پوست، ادرار و نمونه های بالینی انسان و حیوان به ویژه عفونت پستان گاوی جداسازی شده است. این پژوهش با هدف جداسازی و شناسایی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس تولید کننده لیزواستافین، از ورم پستان گا أکثر

سابقه و هدف: استافیلوکوکوس سیمولانس یک کوکسی گرم مثبت و خوشه ای می باشد که از پوست، ادرار و نمونه های بالینی انسان و حیوان به ویژه عفونت پستان گاوی جداسازی شده است. این پژوهش با هدف جداسازی و شناسایی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس تولید کننده لیزواستافین، از ورم پستان گاوی و نیز معرفی آن به عنوان یک عامل درمانی جدید در درمان عفونت های استافیلوکوکی انجام شده است. مواد و روش ها: این پژوهش به صورت مقطعی-توصیفی بر روی نمونه های جمع آوری شده از پستان گاوهای مبتلا به عفونت پستان در گاوداری مرکز علمی و کاربردی جهاد کشاورزی واقع در کیلومتر6 جاده چشمه علی دامغان، استان سمنان انجام گرفت. نمونه ها پس از کشت بر روی محیط نوترینت آگار با رنگ آمیزی گرم و آزمون های بیوشیمیایی مورد بررسی قرار گرفتند. پس از استخراج DNA از نمونه های مشکوک به استافیلوکوکوس سیمولانس، به منظور شناسایی دقیق باکتری و بررسی وجود ژن لیزواستافین در سویه از روش PCR و تعیین توالی استفاده گردید. یافته ها: از مجموع 61 کوکسی گرم مثبت خوشه ای جداشده از نمونه های ورم پستان گاوی، یک مورد باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس شناسایی گردید. تعیین توالی قطعه 16S rRNA باکتری نیز صحت جداسازی را تأیید نمود. نتیجه گیری: با توجه به اولین گزارش جداسازی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس از ورم پستان گاوی در ایران و نیز کارایی بالقوه لیزواستافین تولید شده توسط باکتری، می توان از این ترکیب در درمان عفونت های باکتریایی مقاوم به آنتی بیوتیک استفاده نمود. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

22 - جداسازی و شناسایی مولکولی رودوباکتر اسفروئیدیس از استخر بی هوازی سیستم تصفیه فاضلاب
مجید مقبلی محمدرضا شفاعتی

سابقه و هدف: رودوباکتر باکتری گرم منفی، میله&zwnj;ای شکل و فتوتروفیک ارغوانی است که با اکسیداسیون سولفید هیدرژن به گوگرد قادر به حذف این ترکیب از محیط می&zwnj;باشد. هدف از این پژوهش، جداسازی و شناسایی مولکولی رودوباکتر بود. مواد و روش&zwnj;ها: به منظور جداسازی رودوباکت أکثر

سابقه و هدف: رودوباکتر باکتری گرم منفی، میله&zwnj;ای شکل و فتوتروفیک ارغوانی است که با اکسیداسیون سولفید هیدرژن به گوگرد قادر به حذف این ترکیب از محیط می&zwnj;باشد. هدف از این پژوهش، جداسازی و شناسایی مولکولی رودوباکتر بود. مواد و روش&zwnj;ها: به منظور جداسازی رودوباکتر، نمونه&zwnj;های پساب از استخر بی&zwnj;هوازی تصفیه خانه فاضلاب مهدی شهر جمع آوری و بر روی محیط فیننیگ I کشت داده شدند. پس از استخراج DNA ژنومی از باکتری&zwnj;های رشد کرده بر روی محیط یاد شده، از روش PCR به منظور تکثیر ژن 16S rRNA استفاده گردید. سپس محصول PCR تعیین توالی و به منظور شناسایی دقیق باکتری جداسازی شده، ترادف بازی آن BLAST گردید. نتایج: باکتری جداسازی شده از نظر ماکروسکوپی، بر روی محیط کشت اختصاصی کلنی قرمز ایجاد کرد و از نظر میکروسکوپی، میله&zwnj;ای گرم منفی بود. نتایج به دست آمده از مقایسه ترادف بازی 16S rRNA باکتری جداسازی شده نشان داد که این باکتری متعلق به جنس رودوباکتر است و شباهت 99% به گونه رودوباکتر اسفروئیدس دارد.. نتیجه گیری: این مطالعه اولین گزارش جداسازی رودوباکتر در ایران می&zwnj;باشد. همچنین در این بررسی برای اولین بار یک سویه جدید از گونه رودوباکتر اسفیروئیدس از فاضلاب جداسازی و به عنوان سویه IRSMM1 در بانک جهانی ژن با شماره JX262384 ثبت گردید. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

23 - پایش باکتری های تولید کننده سیمان زیستی و تثبیت کننده خاک در زیستگاه های کویری ایران
مهدی کارگر محمد کارگر

سابقه و هدف: یکی از روش های پیشنهاد شده به منظور تثبیت و استحکام خاک رسوب کلسیت به واسطه تحریک میکروبی (MICP) است. این مطالعه با هدف جداسازی باکتری های تجزیه کننده اوره موثر در ایجاد سیمان زیستی از خاک های خشک و کویری انجام شد.مواد و روش ها: این پژوهش به صورت مقطعی-توصی أکثر

سابقه و هدف: یکی از روش های پیشنهاد شده به منظور تثبیت و استحکام خاک رسوب کلسیت به واسطه تحریک میکروبی (MICP) است. این مطالعه با هدف جداسازی باکتری های تجزیه کننده اوره موثر در ایجاد سیمان زیستی از خاک های خشک و کویری انجام شد.مواد و روش ها: این پژوهش به صورت مقطعی-توصیفی بر روی 280 نمونه جمع آوری شده ازخاک های مناطق مختلف ایران انجام شد. کشت نمونه ها بر روی محیط اوره براث انجام شد. سپس سنجش فعالیت آنزیم اوره آز باکتری های تجزیه کننده اوره انجام شد. باکتری های فعال توسط آزمون های متداول بیوشیمیایی و روش16S rRNA تعیین هویت شدند. تولید سیمان زیستی در باکتری های اوره از مثبت جداسازی شده در pH و دما های مختلف مورد ارزیابی قرار گرفت و با سویه استاندار اسپوروسارسینا پاسترویی ATCC 11589 مقایسه گردید. در نهایت کریستال های کربنات کلسیم در شرایط بهینه دمای 25 درجه سلیسیوس و 8.5 pH با آزمون بلورشناسی پرتو ایکس (XRD) مورد بررسی قرار گرفتند.یافته ها: 304 جدایه از 5 جنس مختلف جداسازی گردید. جنس های باسیلوس و اسپوراسارسینا از مهم ترین باکتری های تجزیه کننده اوره جداسازی از مناطق خشک و کویری بودند. بیشترین میزان کربنات کلسیم در دمای 25 درجه سلیسیوس و 8.5 pH تولید شد. 10 جدایه برتر موثر در تولید آنزیم اوره آز و سیمان زیستی با استفاده از روش مولکولی تعیین هویت و در بانک ژنی ثبت گردیدند. همچنین تولید سیمان زیستی سویه های برتر با استفاده از آزمون XRD تایید گردید.نتیجه گیری: نتایج نشان که در تولید کریستال های کربنات کلسیم مقدار اوره و کلرید کلسیم نقش اساسی دارند. همچنین باکتری اسپوروسارسینا پاستورویی از مهم ترین باکتری های تولید کننده سیمان زیستی بود. از این رو بهینه سازی شرایط رشد در حد بالاتر به منظور استفاده کاربردی از این باکتری در تثبیت شن های روان، استحکام زمین و پل سازی پیشنهاد می گردد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

24 - ارزیابی شیوع هلیکوباکتر هپاتیکوس با روش PCR در موش‌های خانگی (Mus musculus)استان اصفهان
عباس دوستی علی ظهور مریم باقرنژاد صادق قربانی دالینی

سابقه و هدف: هلیکوباکتر هپاتیکوس یکی از شایع&zwnj;ترین گونه&zwnj;های هلیکوباکتر می&zwnj;باشد. این باکتری یکی از عوامل مهم ایجاد بیماری&zwnj;های گوناگون گوارشی، صفراوی و کبدی می&zwnj;باشد. موش متداول&zwnj;ترین میزبان این باکتری است و نقش مهمی در انتقال بیماری&zwnj;های مش أکثر

سابقه و هدف: هلیکوباکتر هپاتیکوس یکی از شایع&zwnj;ترین گونه&zwnj;های هلیکوباکتر می&zwnj;باشد. این باکتری یکی از عوامل مهم ایجاد بیماری&zwnj;های گوناگون گوارشی، صفراوی و کبدی می&zwnj;باشد. موش متداول&zwnj;ترین میزبان این باکتری است و نقش مهمی در انتقال بیماری&zwnj;های مشترک انسان و حیوان دارد. هدف از این پژوهش تعیین میزان شیوع هلیکوباکتر هپاتیکوس در موش&zwnj;های خانگی سطح استان اصفهان با روش PCR می&zwnj;باشد. مواد و روش ها: این پژوهش یک بررسی مقطعی- توصیفی است که در تابستان 1388 بر روی 261 موش جمع&zwnj;آوری شده از سطح استان اصفهان انجام گردید. پس از تشریح موش&zwnj;ها در شرایط استریل، نمونه&zwnj;ها (بافت کبد) جداسازی گردید. سپس از پرایمر&zwnj;های عمومی به منظور شناسایی جنس هلیکوباکتر و از پرایمر&zwnj;های اختصاصی برای شناسایی هلیکوباکتر هپاتیکوس استفاده گردید. یافته&zwnj;ها: جنس هلیکوباکتر در 72% از کل نمونه&zwnj;ها شناسایی گردید. از این میزان 42% متعلق به گونه هپاتیکوس بود. با آزمون آماری نسبت&zwnj;ها مشخص شد که ارتباط معنی&zwnj;داری بین جنس هلیکوباکتر و گونه هپاتیکوس در تمام مناطق مورد بررسی وجود دارد. نتیجه گیری: با توجه به اینکه منطقه مورد بررسی، یکی از مناطق پرخطر از نظر ابتلا به گونه&zwnj;های مختلف هلیکوباکتر محسوب می&zwnj;شود، انجام پایش گسترده و حذف موش&zwnj;های خانگی به منظور کاهش خطر ابتلا به بیماری&zwnj;های مختلف ضروری به نظر می&zwnj;رسد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

25 - جداسازی و شناسایی ویژگیهای ضد میکروبی اکتینومیستهای بومی جدا شده از خاک های کشاورزی استان گیلان
الهام امیری میر ساسان میر پور خسرو عیسی زاده بهنام راستی

اکتینومیست ها به عنوان بزرگترین مخزن آنتی بیوتیک های طبیعی در جهان شناخته می شوند. هدف از این تحقیق جداسازی و شناسایی مولکولی اکتینومیست ها با خاصیت ضدمیکروبی ازخاکهای کشاورزی مناطق بومی استان گیلان می باشد. نمونه های خاک از مناطق کشاورزی جنوب غربی استان گیلان جمع آ أکثر

اکتینومیست ها به عنوان بزرگترین مخزن آنتی بیوتیک های طبیعی در جهان شناخته می شوند. هدف از این تحقیق جداسازی و شناسایی مولکولی اکتینومیست ها با خاصیت ضدمیکروبی ازخاکهای کشاورزی مناطق بومی استان گیلان می باشد. نمونه های خاک از مناطق کشاورزی جنوب غربی استان گیلان جمع آوری شدند. برای جداسازی اکتینومیست ها از رقیق سازی متوالی استفاده گردید. سپس به شناسایی مورفولوژی، فیزیولوژی و بیوشیمیایی نمونه ها پرداخته شد و در نهایت شناسایی مولکولی ایزوله ها با استفاده از توالی یابی 16S rRNA و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک انجام گرفت. بررسی فعالیت ضدمیکروبی در برابر میکروارگانیسم های پاتوژن انجام گردید. در مجموع 14 ایزوله شناسایی شد. 2 ایزوله با خاصیت ضد میکروبی بیشتر انتخاب شد. براساس نتایج مطالعات فیلوژنتیکی و توالی یابی 16S rRNA سویه Amycolatopsis roodepoortensis Strain EA7 با 63/99% اطمینان و سویه EA6 Streptomyces Microfluve Strain با 92/93 % اطمینان شناسایی شدند.باکتری های جدا سازی شده دارای فعالیت ضدمیکروبی بیشترعلیه میکروارگانیسم های پاتوژن گرم مثبت Staphylococcus aureus و نمونه استاندارد PTCC 1112 بودند. این تحقیق اولین گزارش از شناسایی اکتینومیست ها با خاصیت ضد میکروبی در خاکهای کشاورزی مناطق جنوب غربی استان گیلان واقع در کوههای البرز می باشد. شناسایی سویه نادرroodepoortensis Strain EA7 Amycolatopsis از مناطق شمالی ایران خاک های این مناطق را بسیار ارزشمند می سازد. تفاصيل المقالة

فهرس المقالات 16S rRNA

سند

الروابط

المراكز ذات الصلة

دعامة

الصفحات الرسمية