ژنوم

حرية الوصول المقاله

1 - تاملی بر رویکرد فقهای امامیه با تاکید برادله مخالفان اقدامات ژنتیکی
سید حسن مرتضوی راد مسعود راعی دهقی رضا عباسیان حمیدرضا نیکیار

پیدایش علم ژنتیک و انجام تحقیقات در خصوص ژنوم انسانی و کارکردهای جدیدی که بر این موضوع متفرع شده است زمینه گفتگوهای علمی مختلفی بین متخصصان واز جمله فقهاء بوجود آورده است و از آنجا که علم فقه داعیه دار پاسخ دادن مسائل مورد ابتلای مکلفین می باشد،ضروری می نمود که در خصوص أکثر

پیدایش علم ژنتیک و انجام تحقیقات در خصوص ژنوم انسانی و کارکردهای جدیدی که بر این موضوع متفرع شده است زمینه گفتگوهای علمی مختلفی بین متخصصان واز جمله فقهاء بوجود آورده است و از آنجا که علم فقه داعیه دار پاسخ دادن مسائل مورد ابتلای مکلفین می باشد،ضروری می نمود که در خصوص این موضوع نیز دیدگاه فقها مورد توجه قرار گیرد. با رجوع به دیدگاه های ابرازی از سوی فقهاء بدست می آید که اقوال مختلفی اعم از موافقت مطلق تا مخالفت مطلق شکل گرفته است که در این بین ادله ابرازی مخالفان به جهت آثار متفرع بر آن و نوع استدلال ارائه شده از جایگاه ویژه ای برخوردار شده است.آنچه این تحقیق به دنبال پاسخ گویی آن برآمده است از یک سو تبین رویکرد فقها نسبت به این موضوع و از سوی دیگر کشف چرایی مخالفت برخی دیگراز فقهاء با انجام تحقیقات ژنتیکی است. یافته های تحقیق حاکی از آن است که دلایل موافقین علی رغم اختلافاتی که در این بین دارند از جایگاه قوی تری برخوردار است و آنچه به عنوان دلیل مخالفت از سوی مخالفان اقدامات ژنتیکی مطرح شده بیش از آنکه یک دلیل محسوب شود،حاکی از نگرانی فقهی است؛ چرا که انجام تحقیقات در زمینه ژنوم انسانی می تواند با سوء استفاده هایی همراه شود که می تواند کرامت انسانی را با چالش مواجه کند. در عین حال ضرورت تبعیت از ادله فقهی نگاه اکثریت فقها را به سو دیگری سوق داده است که می تواند ضمن تامین وصیانت از کرامت انسانی از سوء استفاده هایی احتمالی نیز جلوگیری کند . تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

2 - مقایسه ساختار و تنوع ژنتیکی اردک سرحنائی( Aythya ferina) با استفاده از ژن میتوکندریایی سیتوکروم ب در مناطق شمالی و جنوبی ایران
شبنم چاوشی جلیل ایمانی حمید رضا رضایی پرگل قوام مصطفوی

10.30495/jest.2022.68014.5700

زمینه و هدف: اردک سرحنائی ( Aythya ferina) یکی از گونه های فراوان و با پراکندگی بالا در جهان، بین مرغابی سانان است. هدف از انجام پژوهش حاضر بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی این گونه در ایران با استفاده از ژن سیتوکروم ب( Cytochrome b) بوده است. روش بررسی: در این پژوهش نمونه ب أکثر

زمینه و هدف: اردک سرحنائی ( Aythya ferina) یکی از گونه های فراوان و با پراکندگی بالا در جهان، بین مرغابی سانان است. هدف از انجام پژوهش حاضر بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی این گونه در ایران با استفاده از ژن سیتوکروم ب( Cytochrome b) بوده است. روش بررسی: در این پژوهش نمونه برداری از 10 قطعه اردک سرحنائی که از مناطق شمال و جنوب کشور در سالهای 1399- 1400 برداشت شده بودند، انجام شد. پس از استخراج و تکثیر قطعات DNA تجزیه تحلیل های هاپلوتایپی و نوکلئوتیدی صورت گرفت. یافته ها: به طور کلی، با بررسی 8 قطعه 929 جفت بازی ژن سیتوکروم b اردک سرحنائی، 7 هاپلوتایپ مختلف شناسائی شد. تنوع هاپلو تایپی 818/0، تنوع نوکلئوتیدی 00149/0 محاسبه شد. مقدار Nm یا میزان جریان ژنی بین منطق نمونه برداری برابر 383/1 بود که نشان از جریان ژنی بالا و به بیان دیگر فاصله ژنی بسیار کم بین جمعیت های این گونه و جمعیت های اروپایی و آسیایی آن است. شاخص راجرز- هارپندینگ، شاخص تاجیما و Fu Fs به ترتیب 112/0، 028/0- و 288/1- محاسبه شد، همچنین نمودار توزیع عدم تطابق به صورت تک نمائی رسم شده، که همه آنها نشان دهنده تاریخچه جمعیتی نامعین و شبیه به مدل گسترش ناگهانی بوده است. بحث و نتیجه گیری: با توجه به نتایج به دست آمده از شبکه هاپلوتایپی و درخت تبار شناختی و همین طور تفاوت اندک ژنتیکی بین جمعیتهای بررسی شده، احتمال مهاجرت این پرنده از هر دو منطقه اروپا و شرق آسیا به ایران وجود دارد. با در نظر گرفتن نتایج پژوهش حاضر، باید تالاب های زیستگاهی این گونه در ایران به عنوان مناطق مهم و کلیدی شناخته شده و اقدامات مدیریتی و حفاظتی لازم در این مناطق صورت گیرد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

3 - مطالعه تأثیر طول بلوک‌های هاپلوتیپی در بهبود صحت پیش بینی ژنومی به کمک روش‌های بیزی در گوسفند DOR: 20.1001.1.17359880.1400.14.2.2.1
رضا سید شریفی فاطمه علاء نوشهر نعمت هدایت ایوریق جمال سیف دواتی

زمینه و هدف: عدم تعادل پیوستگی(LD) و طرح ساختار بلوک‌های هاپلوتیپ سطح جمعیت پارامترهایی هستند که برای مدیریت مطالعات گسترده ژنومی(GWAS) و درک ماهیت رابطه غیر خطی بین فنوتیپ‌ها و ژنوتیپها مفید هستند. در مقایسه با چند شکلی تک نوکلئوتیدی(SNp )، استفاده از آللهای هاپلوتیپ د أکثر

زمینه و هدف: عدم تعادل پیوستگی(LD) و طرح ساختار بلوک‌های هاپلوتیپ سطح جمعیت پارامترهایی هستند که برای مدیریت مطالعات گسترده ژنومی(GWAS) و درک ماهیت رابطه غیر خطی بین فنوتیپ‌ها و ژنوتیپها مفید هستند. در مقایسه با چند شکلی تک نوکلئوتیدی(SNp )، استفاده از آللهای هاپلوتیپ در پیشبینی ژنومی و بهبود صحت پیش بینی کارآمدتر هستند. اما میزان افزایش صحت به چگونگی طراحی بلوکهای هاپلوتیپ بستگی دارد. این مطالعه با هدف آزمون اندازه بهینه برای طول هاپلوتیپ در پیش بینیهای ژنومی صورت گرفت.روش کار: در این مطالعه آللهای هاپلوتیپ با توجه به آللهای SNp در بلوکهای kb 125، kb 250، kb 500 و Mb 1 تعریف و آللهای هاپلوتیپ با فرکانسهای کمتر از 1، 5/2، 5 یا 10 درصد حذف شدند. از دو روش بیزA و بیزB برای پیش بینی اثرات ژنومیSNp ها و هاپلوتیپها در سه صفت با سه سطح وراثتپذیری(تولید شیر (1/0=h2)، وزن لاشه (3/0=h2) و وزن بدن در بلوغ=h2) 45/0)استفاده شد.یافته ها: بیشترین صحت پیش‌بینی ژنومی در صفت وزن بدن در زمان بلوغ توسط روش بیزB(652/0) در طول بلوک هاپلوتیپی kb 250 و کمترین توسط روش بیزA در صفت تولید شیر(407/0) در طول بلوک هاپلوتیپی Mb 1 حاصل گردید. بلوکهای هاپلوتیپی به طول kb 250 با آستانه فرکانس 1 درصد، بالاترین میزان صحت پیشبینی ژنومی را ارائه دادند. در مقایسه دو روش بیزA و بیزB، روش بیزB صحت برآورد بالاتری هم در مدلهای بر پایه SNp و هم بر پایه آللهای هاپلوتیپ ارائه داد.نتیجه گیری: قرار دادن آللهای هاپلوتیپ به جایSNp ها در مدل آماری، درصورت تعریف مناسب طول هاپلوتیپ، سبب بهبود صحت پیشبینی ژنومی میشود. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

4 - چالش‏ها، دست آورد‏ها و افق تحقیقات گل جالیز (Orobanche spp.) در ایران و جهان
سید حسین ترابی محمدحسن هادی&rlm; زاده

به منظور بررسی وضعیت تحقیق‌های گل جالیز در ایران و مقایسه آن با تحقیق‌های جهانی، اطلاعات 1398 مقاله فارسی مربوط به علف های هرز که در چهل سال اخیر منتشر شده اند، به همراه 1477 مقاله انگلیسی مرتبط (2011-2004)، در یک بانک اطلاعاتی تحلیل شد. سهم تحقیق‌های گیاهان انگلی، گل أکثر

به منظور بررسی وضعیت تحقیق‌های گل جالیز در ایران و مقایسه آن با تحقیق‌های جهانی، اطلاعات 1398 مقاله فارسی مربوط به علف های هرز که در چهل سال اخیر منتشر شده اند، به همراه 1477 مقاله انگلیسی مرتبط (2011-2004)، در یک بانک اطلاعاتی تحلیل شد. سهم تحقیق‌های گیاهان انگلی، گل جالیز و سس (Cuscuta spp.)، از کل تحقیق‌های علوم علف های هرز در ایران، به ترتیب شش، چهار و دو درصد بود و نام انگل استریگا (Striga spp.) تنها در یک مقاله مشاهده شد. در جهان سهم تحقیق‌های گل جالیز از کل علف های هرز حدود چهار درصد بود در حالی که این سهم از کل تحقیق‌های گیاهان انگلی حدود 50 درصد بدست آمد. بررسی نتایج نشان می دهد که 75 درصد این تحقیق‌ها در ایران با حمایت مراکز تحقیقاتی وابسته به وزارت جهاد کشاورزی انجام شده است. بررسی روند ها مشخص کرد نسبت تحقیق‌های گل جالیز به کل تحقیق‌های علف های هرز در ایران و جهان رو به کاهش است که احتمالاً به علت افزایش تنوع رشته های علمی در حوزه علوم علف های هرز بوده است. در عین حال در سطح جهانی، سهم تحقیق‌های گل جالیز نسبت به سایر گیاهان انگلی رو به افزایش است که دلایل آن را باید در خصوصیات خاص انگل، وسعت پراکنش و توان خسارت زایی آن نسبت به سایر گیاهان انگلی جستجو کرد. در تحقیق‌های ایران با گذشت زمان موضوع‌ها به ترتیب روی شناسایی، مدیریت و مبارزه بیولوژیکی تمرکز یافته اند. در جهان این تحقیق‌ها جای خود را از بررسی بیولوژی و فیزیولوژی انگل به مطالعات ژنومیکی، استریگولاکتون ها، ایجاد مقاومت در میزبان و شناخت مکانیزم های برهم کنش انگل-میزبان و کار روی بسته های مدیریت تلفیقی داده اند. گل جالیز یکی از مهم ترین گیاهان انگلی در ایران و جهان است و سابقه ی تحقیق‌های طولانی آن بیان گر این واقعیت است که نتایج آن‌ها هنوز به راه کار مدیریتی جامعی منتهی نشده است. در ایران با وجود سابقه به نسبت طولانی، این تحقیق‌ها هنوز جوان محسوب می شوند و اطلاعات کافی حتی در مورد خصوصیات گونه های کشور ارایه نمی کنند. ارزیابی روش های مدیریتی جدید، در سایه پیشرفت های اخیر جهان در اصلاح گیاهان زراعی و ژنتیک ملکولی، در چارچوب سازگار با شرایط کشور می تواند یک استراتژی مناسب برای تحقیق‌های آتی کشور در حل معضل گیاهان انگلی به خصوص گل جالیز باشد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

5 - ساختار ژنتیکی جمعیتهای جغرافیایی پروانه کرم ساقه خوار برنج Chilo suppressalis در شمال ایران براساس ژن سیتوکروم اکسیداز شماره 2 میتوکندری
عباس حیدری علیرضا نظری محمدعلی عشاقی الهام صنعتگر

10.30495/sarj.2023.1977771.1115

گیاه برنج یکی از مهمترین وقدیمی ترین محصولات زراعی بوده و یکی از سه غذای اصلی در دنیامحسوب می گردد. کرم ساقه خواری برنج Chilo suppressalis از افات درجه اول (کلیدی) برنج می باشد و تا 33 درصد باعث کاهش عملکرد برنج میگردد. شناخت صحیح و بهتر ساختار ژنتیکی این افت می تواند د أکثر

گیاه برنج یکی از مهمترین وقدیمی ترین محصولات زراعی بوده و یکی از سه غذای اصلی در دنیامحسوب می گردد. کرم ساقه خواری برنج Chilo suppressalis از افات درجه اول (کلیدی) برنج می باشد و تا 33 درصد باعث کاهش عملکرد برنج میگردد. شناخت صحیح و بهتر ساختار ژنتیکی این افت می تواند در بکارگیری و بهبود روش های کنترل ان موثر واقع شود. هدف از این مطالعه بررسی ساختار ژنتیکی ژن سیتوکروم اکسیداز شماره 2 میتوکندری (mtDNA-COII) کرم ساقه خوار برنج در شمال ایران می باشد. در این مطالعه صید و جمع آوری نمونه های کرم ساقه خوار برنج از دو استان مازندران و گیلان در طول فصل کاشت برنج در سالهای 1395 و 1396 به انجام رسید. ساختار ژنتیکی نمونه های 18 جمعیت جغرافیایی این افت با تکنیک ملکولی PCR ژن COIIو تعیین توالی ژن مشخص شدند. توالی های حاصله با همدیگر و نیز با توالی های موجود در بانک جهانی ژن Genbank مقایسه و مشابهت انها با نمونه های جهانی بدست امد. در مجموع، 312 نمونه از استان گیلان و 676 نمونه از استان مازندران صید گردید. نتایج بررسی ساختار ژنتیکی نماینده هایی از 18 جمعیت شمال ایران نشان داد که همه نمونه ها دارای ساختار ژنتیکی مشابه هم هستند. توالی ژن COII نمونه های ایرانی این افت شباهت زیادی با جمعیت کره جنوبی با شماره دسترسی MK207057 موجود در بانک جهانی ژن (GenBank) دارد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

6 - مقاله مروری: ژنتیک معکوس در بیماری‌شناسی گیاهی: روش‌ها، مزایا و چالش‌ها
جلال غلام نژاد

با ظهور دانش زیسـت‌شناسی مولکـولی، عملـکرد بسیـاری از ژن‌ها با مطالعه فنوتیپ ژن‌های جهش‌یافته (Forward genetics) تا حدی مشخص ‌شد و سر نخی از عملکرد ژن مورد نظر به دست ‌آمد. سپس با اختراع روش تعیین توالی DNA در مقیاس گسترده، هزاران ژن در موجودات گوناگون بدون این که عملکر أکثر

با ظهور دانش زیسـت‌شناسی مولکـولی، عملـکرد بسیـاری از ژن‌ها با مطالعه فنوتیپ ژن‌های جهش‌یافته (Forward genetics) تا حدی مشخص ‌شد و سر نخی از عملکرد ژن مورد نظر به دست ‌آمد. سپس با اختراع روش تعیین توالی DNA در مقیاس گسترده، هزاران ژن در موجودات گوناگون بدون این که عملکرد شان مشخص باشد، شناسایی شدند. امروزه با استفاده از دانش ژنتیک معکوس، به عنوان کارآمد ترین روش ارزیابی نقش و عملکرد ژن‌ها در حال حاضر، عملکرد بسیاری از ژن‌های تعیین توالی شده، مشخص شده است. امروزه توالی بسیاری از ژن های موجودات زنده شناخته شده است، اما فنوتیپ این توالی ها اغلب ناشناخته مانده اند. بنابراین استراتژی های ژنتیک معکوس مورد توجه بسیاری از محققین ژنتیک قرار گرفته است؛ البته این استراتژی ها کاربرد مشابهی در همه موجودات ندارند. Reverse genetics تکنیکی است برای کشف عملکرد ژن هایی که به وسیلۀ تکنولوژی DNA sequencing تعیین توالی شده اند. در واقع در این روش، عملکرد ژن ها به وسیلۀ مطالعۀ موجوداتی که عملکرد ژن های آن ها تغییر داده شده است، تعیین می شود. در گذشته تحقیقات به این صورت بود که مطالعات ژنتیکی با مطالعۀ فنوتیپ های جهش یافته صورت می گرفت؛ ولی امروزه با پیشرفت در علوم زیستی، پژوهشگران قادرند ویژگی های فنوتیپی منسوب به یک ژن خاص را تعیین نمایند. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

7 - مقایسه کیفی و کمی نتایج مربوط به چند روش استخراج DNA از ژنوم مایکوباکتریوم‌های بیماری‌زا و ساپروفیت
علی نصیری یونس انزابی محمد رضا مشایخی

با توجه به اینکهنخستینمرحلهجهتانجامآزمایش هایمولکولیمانند واکنش زنجیره ای پلی مراز (Polymerase Chain Reaction; PCR)داشتن DNA کافیوباکیفیتمی باشد، هدفازانجاماینمطالعهمقایسهپنج روشمختلفاستخراج DNAژنومی مایکوباکتریوم هابه منظور معرفی بهترین روش بود. بدین منظور از پرگنه ه أکثر

با توجه به اینکهنخستینمرحلهجهتانجامآزمایش هایمولکولیمانند واکنش زنجیره ای پلی مراز (Polymerase Chain Reaction; PCR)داشتن DNA کافیوباکیفیتمی باشد، هدفازانجاماینمطالعهمقایسهپنج روشمختلفاستخراج DNAژنومی مایکوباکتریوم هابه منظور معرفی بهترین روش بود. بدین منظور از پرگنه های خالص مایکوباکتریوم اویوم پاراتوبرکلوزیس به عنوان مایکوباکتریوم بیماری زا و نیز سویه ای از یک مایکوباکتریوم ساپروفیت به نام مایکوباکتریوم فلئی استفاده شد. کمیت و کیفیتDNAهای به دست آمده توسط هریکاز روش ها، به ترتیب بر اساس غلظت DNAاستخراجی (نانوگرم در میکرولیتر) در طول موج 260 نانومتر و نیز بر مبنای نسبت OD در طول موج های 280/260 با استفاده از دستگاه نانودراپ محاسبه و موردارزیابی قرارگرفت. استخراج DNA از ژنوم مایکوباکتریوم هابااستفادهازروش CTAB (Cetyltrimethylammonium bromide) بیشترین میزان و روشمبتنی بر جوشانیدن کمترینمیزانDNAرا حاصل کرد. همچنین مقایسهمیزانخلوصDNAاستخراج شدهدراینروش ها نیزنشانداد که استخراج DNA بااستفادهاز روشCTABبیشترینمیزان وروشمبتنی بر جوشانیدن بازهم کمترین میزانخلوصراداشتهاست. همچنین بین دو نوع باکتری از نظر کیفیت DNAهای استخراج‌شده در هیچ یک از روش های استفاده شده برای استخراج DNA اختلاف معنی داری وجود نداشت. با توجه به نتایج مطالعه حاضر به نظر می رسد که استفادهازروش CTAB یکی از مناسب ترین روش ها جهت استخراج DNAژنومیاز مایکوباکتریوم هاجهتتشخیص مولکولی آنها در نمونه های مختلفمی باشد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

8 - پروژه ژنوم انسان با رویکردی به دیدگاه اخلاقی و آزادی انسان
امیررضا محمودی عباس تقوایی سیده مهشید میری بالاجورشری

10.30495/bioem.2022.695035

در این تحقیق، نتایج پروژه ژنوم انسانی (HGP) و مشکلات اخلاقی احتمالی که امکان دارد ایجاد نماید، از طریق مثال‌های عینی مورد ارزیابی قرار گرفت. در این مطالعه سعی شده است به‌تفصیل آشکار گردد که چگونه حقوق و آزادی‌های اجتماعی، اخلاق، هنجارهای اجتماعی و ارزش‌های فرد تحت تأثیر أکثر

در این تحقیق، نتایج پروژه ژنوم انسانی (HGP) و مشکلات اخلاقی احتمالی که امکان دارد ایجاد نماید، از طریق مثال‌های عینی مورد ارزیابی قرار گرفت. در این مطالعه سعی شده است به‌تفصیل آشکار گردد که چگونه حقوق و آزادی‌های اجتماعی، اخلاق، هنجارهای اجتماعی و ارزش‌های فرد تحت تأثیر قرار داده و مرزهای خطرات احتمالی که پروژه ژنوم انسانی به همراه دارد، از کجا شروع و به کجا ختم می‌شوند. در مورد این مسئله که مداخلات ژنتیکی فرد می‌تواند مورداستفاده ابزاری قرار بگیرد و به کالا تبدیل شود، بحث‌ شده و‌ متأسفانه مشخص شد که مداخلات در ساختار ژنتیکی می‌تواند به عنوان مداخله در حقوق و آزادی‌های اساسی فرد درنظر گرفته شود. هدف از این مطالعه نشان دادن زمینه‌های استفاده از پروژه ژنوم انسانی و بررسی نتایج این پروژه ازنظر پیامدهای اخلاقی ،تکنیک‌ها و کاربردهای مورداستفاده هست. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

9 - The Pattern of Linkage Disequilibrium in Livestock Genome
م. نصرتی

Linkage disequilibrium (LD) is bases of genomic selection, genomic marker imputation, marker assisted selection (MAS), quantitative trait loci (QTL) mapping, parentage testing and whole genome association studies. The Particular alleles at closed loci have a tendency to أکثر

Linkage disequilibrium (LD) is bases of genomic selection, genomic marker imputation, marker assisted selection (MAS), quantitative trait loci (QTL) mapping, parentage testing and whole genome association studies. The Particular alleles at closed loci have a tendency to be co-inherited. In linked loci this pattern leads to association between alleles in population which is known as LD. Two metric parameter Dˊ and r2 were suggested for measuring the extent of LD in population. D' are more influenced by variation in allele frequencies than r2. Until recently all research on LD was carried out by microsatellite, which reported high level of Dˊ in wide extent. As progressing on large scale genomes sequencing a huge number of single nucleotide polymorphism (SNPs) were detected on genome and microsatellite replaced by SNP in such researches. By using SNP, high level of LD in short distance has been reported. Many factors can affect LD such as selection, migration, genetic drift, mutation, small finite population size and recombination. So, LD is basic tools for exploring the genetic basis of quantitative traits in livestock. Likewise, comparative LD maps make a capable us to examine the degree of diversity between breeds and to discover genomic regions that have been subject to selection. Therefore, this review states concept and current approach to estimating LD and extent of LD in livestock population. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

10 - Accuracy of Genomic Prediction under Different Genetic Architectures and Estimation Methods
ع. عاطفی ع.ا. شادپرور ن. قوی حسین-زاده

The accuracy of genomic breeding value prediction was investigated in various levels of reference population size, trait heritability and the number of quantitative trait locus (QTL). Five Bayesian methods, including Bayesian Ridge regression, BayesA, BayesB, BayesC and أکثر

The accuracy of genomic breeding value prediction was investigated in various levels of reference population size, trait heritability and the number of quantitative trait locus (QTL). Five Bayesian methods, including Bayesian Ridge regression, BayesA, BayesB, BayesC and Bayesian LASSO, were used to estimate the marker effects for each of 27 scenarios resulted from combining three levels for heritability (0.1, 0.3 and 0.5), training population size (600, 1000 and 1600) and QTL numbers (50, 100 and 150). A finite locus model was used to simulate stochastically a historical population consisting 100 animals at first 100 generations. Through next 100 generations, the population size gradually increased to 1000 individuals. Then the animals in generations 201 and 202 having both known genotypic and phenotypic records were assigned as reference population, and individuals at generations 203 and 204 were considered as validation population. The genome comprised five chromosomes of 100 cM length and 500 single nucleotide polymorphism markers for each chromosome that distributed through the genome randomly. The QTLs and markers were bi-allelic. In this study, the heritability had great significant positive effect on the accuracy (P<0.001). By increasing the size of the reference population, the average genomic accuracy increased from 0.64±0.03 to 0.70 ± 0.04 (P<0.001). The accuracy responded to increasing number of QTLs non-linearly. The highest and lowest accuracies of Bayesian methods were 0.40 ± 0.04 and 0.84 ± 0.05, respectively. The results showed having the greatest amount of information (i.e. highest heritability, highest contribution of gene action in phenotypic variation and large reference population size), the highest accuracy (0.84) was obtained, with all investigated methods of estimation. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

11 - The Impact of Different Genetic Architectures on Accuracy of Genomic Selection Using Three Bayesian Methods
ف. علاء نوشهر س.ع. رأفت ر. ایمانی-نبئی ص. علیجانی ک. روبرت گرنیه

Genome-wide evaluation uses the associations of a large number of single nucleotide polymorphism (SNP) markers across the whole genome and then combines the statistical methods with genomic data to predict the genetic values. Genomic predictions relieson linkage disequi أکثر

Genome-wide evaluation uses the associations of a large number of single nucleotide polymorphism (SNP) markers across the whole genome and then combines the statistical methods with genomic data to predict the genetic values. Genomic predictions relieson linkage disequilibrium (LD) between genetic markers and quantitative trait loci (QTL) in a population. Methods that use all markers simultaneously may therefore result in greater reliabilities of predictions of the total genetic merit, indicating that a larger proportion of the genetic variance is explained. This is hypothesized that the genome-wide methods deal differently with genetic architecture of quantitative traits and genome. The genomic nonlinear Bayesian variable selection methods (BayesA, BayesBand Bayesian LASSO) are compared using the stochastic simulation across three effective population sizes (Ne). Thereby, a genome with three chromosomes, 100 cM each was simulated. For each animal, a trait was simulated with heritability of 0.50, three different marker densities (1000, 2000 and 3000 markers) and number of the QTL was assumed to be either 100, 200 or 300. The data were simulated with two different QTL distributionswhich were uniform and gamma (α=1.66, β=0.4). Marker density, number of the QTL and the QTL effect distributions affected the genomic estimated breeding value accuracy with different Ne (P<0.05). In comparison of three methods, the greatest genomic accuracy obtained by BayesB method for traits influenced by a low number of the QTL, high marker density, gamma QTL distribution and high Ne. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

12 - Comparing Different Marker Densities and Various Reference Populations Using Pedigree-Marker Best Linear Unbiased Prediction (BLUP) Model
ش. برجسته غ.ر. داشاب م. رکوعی م.م. شریعتی م. وفای واله

In order to have successful application of genomic selection, reference population and marker density should be chosen properly. This study purpose was to investigate the accuracy of genomic estimated breeding values in terms of low (5K), intermediate (50K) and high (77 أکثر

In order to have successful application of genomic selection, reference population and marker density should be chosen properly. This study purpose was to investigate the accuracy of genomic estimated breeding values in terms of low (5K), intermediate (50K) and high (777K) densities in the simulated populations, when different scenarios were applied about the reference populations selecting. After simulating the historical (undergoing drift and mutation) and recent (undergoing selection) population structures, 800 individuals were remained in reference population. Three scenarios were considered for reducing the reference population number including: 1) 400 individuals which had the highest relationships with the validation set, 2) 400 individuals which had the highest inbreeding, and 3) 400 selected individuals by random. The genomic breeding values were predicted for traits with two heritability levels (0.25 and 0.5) using best linear unbiased prediction (BLUP) with different markers and pedigree information combinations of included pedigree-based BLUP (ABLUP), which was used a numerator relationships matrix (A) only, genomic best linear unbiased prediction (GBLUP) which was used a genomic relationship matrix (G) only, and BLUP|GA, which combined both A and G by using a weight parameter (l). By increasing l, the prediction model was changed from GBLUP (l=0) to ABLUP (l=1). The results indicated that without considering the panel density effects, G matrix (l=0) and A matrix (l=1) usages had the highest and lowest prediction accuracy, respectively. Comparative analyses of different scenarios of reference population selection revealed that all individuals’ inclusion in reference population yielded the highest estimation accuracy for breeding values (p <0.05). On the contrary, using reduced single nucleotide polymorphism (SNP) panels considerably decreased the accuracy of breeding value prediction. Individuals selecting in the reference set with a high genetic relationship to target animals, considerably improved the reduction in genomic prediction accuracy because of small reference population size. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

13 - The Effect of Dams of Sire Path Management on Genetic and Economic Parameters in a Simulated Genomic Selection Program
س. عزیزیان ع.ا. شادپرور س. جوئزی-شکالگورابی ن. قوی حسین-زاده

A deterministic model based on the gene flow method, considering the features of Iranian Holstein cattle population, was implemented in this study to evaluate the effect of altering the number of age-classes in the dams of future sire (DS) path and the number of dams re أکثر

A deterministic model based on the gene flow method, considering the features of Iranian Holstein cattle population, was implemented in this study to evaluate the effect of altering the number of age-classes in the dams of future sire (DS) path and the number of dams required for breeding a young bull (YB), to be evaluated as future sire, on genetic gain and resultant economic efficiency of a genomic selection program for milk production as a selection goal. Based on the simulation, changing the number of age-classes from 10 to 1 resulted in higher replacement rate of DS path (from 0.22 to 1) and shorter generation interval. Consequently, the economic efficiency of the program increased up to a maximum point and then a descending trend was observed. The maximum economic efficiency (25.68) was obtained when 7 age-classes in DS path was assumed. By chaining the number of dams required for breeding a YB from 7 to 1, the genetic gain in selection goal increased from 0.0232 to 0.0264 kg per dairy cattle and therefore, the economic efficiency rose from 25.42 to 28.52. The results revealed that a decrease in generation interval does not necessarily result in maximum economic efficiency and there is an optimum level for generation interval. Less number of required dams per YB could result in higher economic efficiency and therefore should be considered as an effective management strategy to improve the economic efficiency of a genomic selection program for milk production. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

14 - Spermatozoa Molecules in Relation to Bulls Fertility
اس.آ. لون ر. سینها آ. رحیم ب.آ. جانایی آ. سینق ن. شاه

Bull fertility may be defined as the process by which spermatozoa fertilize and activate the ovum and then support embryonic development. Bull fertility is a complex trait having relatively low heritability and plays a vital role for efficient production and reproductio أکثر

Bull fertility may be defined as the process by which spermatozoa fertilize and activate the ovum and then support embryonic development. Bull fertility is a complex trait having relatively low heritability and plays a vital role for efficient production and reproduction of bovine. Various mechanisms involved in regulating bull fertility associated phenotype and reliable biomarkers are poorly defined. Primary spermatozoa physiology indicators namely sperm molecules and epigenetic factors may play a vital role in predicting sperm physiology and fertility. Spermatozoa and their fingerprints or patterns can play a pivotal role in prediction of fertility in bovine. No reliable tests exist despite genomic selection for evaluating quality of semen and fertility of bull. This review focuses on various molecules related to bull fertility viz., sperm RNAs, seminal plasma proteins, sperm proteins and sperm epigenome. In combination with single-nucleotide polymorphism (SNP), microarrays or sperm molecules and epigenome markers can be used to determine sperm quality and to predict bull fertility. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

15 - Genome Wide Association Studies, Next Generation Sequencing and Their Application in Animal Breeding and Genetics: A Review
ح. خانزاده ن. قوی حسین-زاده ش. قوتی

Recently genetic studies have been revolutionized by next generation sequencing (NGS) technology, and it is expected that the use of this technology will largely eliminate defects in the methods of association studies. The NGS technology is becoming the premier tool in أکثر

Recently genetic studies have been revolutionized by next generation sequencing (NGS) technology, and it is expected that the use of this technology will largely eliminate defects in the methods of association studies. The NGS technology is becoming the premier tool in genetics. However, at the moment the use of this method is limited especially in the livestock due to high cost and computational problems. But it is expected that the development of sequencing and computing technologies and reducing the cost will have significant impacts on the livestock health and production. This study reviews the literature on genetic association studies, NGS technologies and their application in animal breeding. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

16 - Potential of Genomic Breeding Program in Iranian Native Chickens
س. ابراهیم&rlm;پورطاهر ص. علیجانی س.ع. رأفت ا.ر. شریفی

Development of genomic selection can be a new strategy in breeding of native chicken. The main aim of this study was to evaluate application of a genomic selection program in Iranian native chickens from economic and genetic points of view. In this study, two scenarios أکثر

Development of genomic selection can be a new strategy in breeding of native chicken. The main aim of this study was to evaluate application of a genomic selection program in Iranian native chickens from economic and genetic points of view. In this study, two scenarios including conventional scenario with 3360 and 3380 animals and genomic scenario were compared using ZPLAN+ software. The traits in the selection index were egg number, body weight, mean weight of egg and age at sexual maturity. In genomic scenario different reference population size were considered. In this scenario the genomic information from cocks (800 cocks were genotyped) was added to available information in conventional scenario based on selection index method. The generation interval was 14.5 months for all conventional and genomic scenarios. In comparison of scenarios, genetic gain and the economic profit increased by increasing reference population size in genomic scenario (€126.88-€147.45 with 80 cocks) and (€140.20 to €160.77 with 60 cocks) per animal unit. The reliability of selection index was 0.33 for cocks in conventional scenario. The reliabilities of genomic scenarios were 0.61-0.84 for 80 selected cocks and 0.66-0.87 for 60 selected cocks and that were high in comparison to conventional scenario. This study showed that genomic selection can increase the genetic improvement rate of native chickens. However, the costs of genomic scenarios were higher than conventional scenario, but genomic information increased accuracy of selection and genetic gain in breeding goals traits. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

17 - Analyzing Simple Sequence Repeats Derived from Expressed Sequence Tags in Dromedary Camels
ا. برازنده م. مختاری م. مقبلی دامنه ز. رودباری

The objective of the current research was to make a character description of simple sequence repeats (SSR) derived from expressed sequence TAGs (EST) markers of dromedary camels (EST-SSR markers) and to conduct a practical analysis of these sequences for their applicati أکثر

The objective of the current research was to make a character description of simple sequence repeats (SSR) derived from expressed sequence TAGs (EST) markers of dromedary camels (EST-SSR markers) and to conduct a practical analysis of these sequences for their application in comparative genomics and molecular genetics studies. A complete of 862 SSRs were discovered from 17155 EST sequences using the SSR Locator software. 827 EST out of 17155 EST had SSRs, that 794 (96%), 31 (3.8%) and 2 (0.2%) of them contained 1, 2 and 3 SSRs, respectively. The dimeric motifs were the most abundant SSRs (38.86%), followed by 27.15%, 21.46%, 6.96%, and 5.57% for tri-, hexa-, tetra- and pentameric motifs. The most plentiful dimer, trimer, tetramer, pentamer and hexamer motif were AC/TG (54%), GCC/GGC (19.2%), TTTA (13.3%), AAAAG (10.4%) and AACCAC (67.6 %), respectively. BLASTX was used to examine the final non-redundant EST-SSRs. Almost all of EST-SSRs were found out to be protected in the macromolecule catabolic process and RNA processing and splicing. EST-SSR markers might be applied as a novel resource of useful markers in the biological survey. Also, these markers may be a valuable source for further molecular genetics and genomics research of camels and related species. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

18 - Predicting CpG Islands and Their Relationship with Genomic Feature in Cattle by Hidden Markov Model Algorithm
A. برازنده م.ر. محمدآبادی م. قادری ح. نظام آبادی پور

Cattle supply an important source of nutrition for humans in the world. CpG islands (CGIs) are very important and useful, as they carry functionally relevant epigenetic loci for whole genome studies. As a matter of fact, there have been no formal analyses of CGIs at the أکثر

Cattle supply an important source of nutrition for humans in the world. CpG islands (CGIs) are very important and useful, as they carry functionally relevant epigenetic loci for whole genome studies. As a matter of fact, there have been no formal analyses of CGIs at the DNA sequence level in cattle genomes and therefore this study was carried out to fill the gap. We used hidden markov model algorithm to detect CGIs. The total number of predicted CGIs for cattle was 90668. The number of detected CGIs and CGI densities downwardly varied across chromosomes. Chromosome 25 had the largest number of CGIs (4556) and the highest CGI density (106.20 CGIs/Mb).A significant positive correlation observed among CGI densities with guanine-cytosine (GC) content, ObsCpG/ExpCpG, recombination rate and gene density. When the size of chromosomes increased, the CGI densities decreased and a trend of higher CGI densities in the telomeric regions observed. This feature may be the reason of a positive correlation between CGI density and recombination rate. To detect information on CGI density differences between cattle and other vertebrate genomes, CGI density was also scanned in eleven vertebrate genomes. The CGI densities varied greatly among genomes. These discoveries may contribute to a better understanding of epigenomic role of CGIs and their molecular evolution in the cattle. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

19 - Effects of Marker Density, Number of Quantitative Trait Loci and Heritability of Trait on Genomic Selection Accuracy
ف. علاء نوشهر س.ع. رأفت ر. ایمانی-نبئی ص. علیجانی ک. روبرت گرنیه

The success of genomic selection mainly depends on the extent of linkage disequilibrium (LD) between markers and quantitative trait loci (QTL), number of QTL and heritability (h2) of the traits. The extent of LD depends on the genetic structure of the population and mar أکثر

The success of genomic selection mainly depends on the extent of linkage disequilibrium (LD) between markers and quantitative trait loci (QTL), number of QTL and heritability (h2) of the traits. The extent of LD depends on the genetic structure of the population and marker density. This study was conducted to determine the effects of marker density, level of heritability, number of QTL, and to compare the accuracy of predicting breeding values using two diverse approaches: GBLUP and BayesA using simulated data under two different distributions of the QTL effect. Thereby, three traits (milk production, carcass weight and mature body weight) were simulated with the heritability of 0.10, 0.30 and 0.50, respectively; for each ovine animal, a genome with three chromosomes, 100 cM each. Three different marker densities was considered (1000, 2000 and 3000 markers) and the number of QTL was assumed to be either 100, 200 or 300. Data were simulated with two different distributions of the QTL effect which were uniform and gamma (α=1.66 and β=0.4) the marker density, number of the QTL, the QTL effect distributions and heritability levels significantly affected the accuracy of genomic breeding values (P<0.05). The BayesA produced estimates with greater accuracies in traits influenced by a low number of the QTL and with the gamma QTL effects distribution. Based on the findings of this simulation, heritability, as well as dense marker panels, aiming to increase the level of LD between the markers and QTL, is likely to be needed for successful implementation of the genomic selection. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

20 - Predictive Ability of Statistical Genomic Prediction Methods When Underlying Genetic Architecture of Trait Is Purely Additive
م. مومن ا. آیت‌آللهی مهرجردی ا. شیخی ع. اسماعیلی‌زاده م. اسدی فوزی

A simulation study was conducted to address the issue of how purely additive (simple) genetic architecture might impact on the efficacy of parametric and non-parametric genomic prediction methods. For this purpose, we simulated a trait with narrow sense heritability h2= أکثر

A simulation study was conducted to address the issue of how purely additive (simple) genetic architecture might impact on the efficacy of parametric and non-parametric genomic prediction methods. For this purpose, we simulated a trait with narrow sense heritability h2= 0.3, with only additive genetic effects for 300 loci in order to compare the predictive ability of 14 more practically used genomic prediction models based on four criteria (mean squared error (MSE), Bias, γy,GEBV and γGEBV,TBV). Results suggested that parametric genomic prediction models have greater superiority over non parametric genomic models under a simple purely additive genetic architecture. Our result also showed that, all parametric methods, other than ridge-regression BLUP (RR-BLUP), could explain most of phenotypic variation because they showed lower MSE, higher predictive correlation (γy,GEBV), the least amount of bias (by,GEBV) and the higher correlations between true breeding values and the estimated genomic breeding values (γTBV,GEBV). Random forest regression had the worst performance among non parametric methods. The simulation results suggested that there is a large difference between performances of non parametric methods in comparison with parametric methods when underlying architecture is purely additive. But this may not happen when dominance and epistatic genetic effects contributing to both additive and non-additive genetic variances. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

21 - بررسی تنوع و فراوانی جمعیت باکتریایی چشمه آبگرم قینرجه: شناسایی اکوسیستم میکروبی داغترین چشمه آبگرم ایران با روشهای مستقل از کشت و بر پایه توالی یابی نسل جدید
رضا آذربایجانی لاله پارسا یگانه

زیست بومهای اکستریم چشمه های آبگرم آنها یک منبع بیولوژیکی مهم برای شناسایی ذخایر ژنتیکی میکروارگانیسم های گرمادوست و ویژگی های بیولوژیکی آنها از نظر تحمل و بقا در دماهای بالا و استفاده از این پتانسیل در صنایع مختلف و بیوتکنولوژی هستند. اگر چه مطالعات متعددی بر روی میکرو أکثر

زیست بومهای اکستریم چشمه های آبگرم آنها یک منبع بیولوژیکی مهم برای شناسایی ذخایر ژنتیکی میکروارگانیسم های گرمادوست و ویژگی های بیولوژیکی آنها از نظر تحمل و بقا در دماهای بالا و استفاده از این پتانسیل در صنایع مختلف و بیوتکنولوژی هستند. اگر چه مطالعات متعددی بر روی میکروبیوم این زیست بومها در سالهای اخیر در دنیا صورت گرفته است اما تا کنون مطالعات کمی بر روی چنین محیطهای اکستریم بومی ایران انجام گرفته است. کشور ایران دارای مناطق ژئوترمال و آتشفشانی مختلف بوده و چشمه های آبگرم متعدد و منحصر به فرد دارای خصوصیات ضد میکربی و ضد قارچی، ضد روماتیسم و سایر دردهای عضلانی را در خود جای داده است. در این مطالعه شناسایی ترکیب و تعیین فراوانی تاکسون های مختلف جامعه باکتریایی چشمه آبگرم قینرجه به عنوان یکی از داغترین چشمه های کلرایدی جهان با روشهای مستقل از کشت و با استفاده از تکنیکهای نسل جدید توالی یابی انجام گردید. جهت پروفایلینگ کمی جامعه باکتریایی مربوطه و یا اصطلاحا آنالیز متاژنومیکس، ساخت کتابخانه های ژن 16s rRNA از سه ناحیه عملکردی طبقه بندی تاکسونومیک V1 تا V3 و با آغازگر های بارکد شده صورت پدیرفت. با آنالیز بیوانفورماتیکی داده ها با سامانه های MG-RAST و SILVAngs ، تعداد 200 تاکسون مختلف مربوط به خانواده ها و جنس های مختلف باکتریایی مورد شناسایی قرار گرفتند. تاکسون های غالب به ترتیب از بیشترین فروانی شامل Pediococcus acidilactici، uncultured (unclassified) bacterium، Lactobacillus rhamnosus، Thermus scotoductus، Thermus sp. HR13 و Thermus sp. BXR می باشند. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

22 - ویژگی های ژنومی و آنالیز فیلوژنتیک سویه ایرانی با دامنه میزبانی محدود زانتوموناس سیتری زیرگونه سیتری NIGEB-88
امیر جلالی سید مهدی علوی محمد حسین سنگتراش

سابقه و هدف: باکتری زانتوموناس سیتری زیرگونه سیتری (Xcc) عامل بیماری شانکر در مرکبات است. نتایج به دست آمده از آزمون های تشخیصی اولیه، نشان دهنده وجود سویه هایی با دامنه میزبانی گسترده (فرم بیماری زای A) و محدود (فرم های بیماری زای A* و Aw) در ایران است. با این حال، آنا أکثر

سابقه و هدف: باکتری زانتوموناس سیتری زیرگونه سیتری (Xcc) عامل بیماری شانکر در مرکبات است. نتایج به دست آمده از آزمون های تشخیصی اولیه، نشان دهنده وجود سویه هایی با دامنه میزبانی گسترده (فرم بیماری زای A) و محدود (فرم های بیماری زای A* و Aw) در ایران است. با این حال، آنالیزهای تفکیکی جدید انجام شده در سال 2014 بر مبنای نتایج MLVA-14 وMLVA-31 نشان می دهد که این سویه ها از نظر ژنتیکی تنها به فرم بیماری زای A* تعلق دارند. این مطالعه با هدف بررسی ویژگی های ژنومی و آنالیز فیلوژنتیک سویه XccA* NIGEB-88 باکتری زانتوموناس سیتری زیرگونه سیتری با دامنه میزبانی محدود انجام شد.مواد و روش ها: در این مطالعه به منظور به دست آوردن اطلاعات بیشتر درباره ویژگی های ژنتیکی و روابط فیلوژنتیک سویه های ایرانی باکتری زانتوموناس سیتری، با استفاده از روش Illumina ژنوم سویه ایرانی NIGEB-88 به طور کامل تعیین توالی و به وسیله نرم افزارهای مختلف بررسی شد.یافته ها: مشخصات کلی ژنوم مانند اندازه، تعداد پلاسمیدها، میانگین محتوای GC، تعداد مناطق کد کننده پروتئینی و ساختار RNA سویه ایرانی مورد مطالعه، مشابه با سویه های فرم های بیماری زای دیگر باکتری Xcc بود. همچنین مطالعه عوامل بیماری زای بالقوه و عوامل شرکت کننده در تعیین دامنه میزبانی، مانند افکتورهای سیستم ترشحی تایپ 3، اجزای سیستم ترشحی تایپ 4 و لیپوپلی ساکاریدهای سطحی نشان داد که شباهت زیادی با سویه های دو فرم بیماری زای A و Aw وجود دارد.نتیجه گیری: نتایج آنالیزهای فیلوژنتیکی و بررسی ژن های بیماری زایی و تعیین دامنه میزبانی نشان داد که سویه ایرانی XccA*NIGEB-88 ، شباهت زیادی به سویه ایرانی XccA*NIGEB-386 و سویه های فرم بیماری زای A* با دامنه میزبانی محدود دارد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

23 - تجزیه و تحلیل مولکولی جمعيتي از بز نجدي با استفاده از توالی HVR1 ژنوم میتوکندری
روح الله خادمی سیده ام البنین قاسمیان حمید رضا سیدآبادی امین کاظمی زاده

10.22034/ascij.2023.1999044.1550

این مطالعه با هدف تعیین توالی ناحیه HVR1 ژنوم میتوکندری بز نجدي انجام گرفت. برای انجام این تحقیق تعداد 30 عدد نمونه خون از هر دو جنس از بزهاي غير خويشاوند جمع¬آوری شد. پس از استخراج DNA، ناحیه مورد نظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک PCR تکثیر شد و تعیین توالی شد. براي أکثر

این مطالعه با هدف تعیین توالی ناحیه HVR1 ژنوم میتوکندری بز نجدي انجام گرفت. برای انجام این تحقیق تعداد 30 عدد نمونه خون از هر دو جنس از بزهاي غير خويشاوند جمع¬آوری شد. پس از استخراج DNA، ناحیه مورد نظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک PCR تکثیر شد و تعیین توالی شد. براي مقايسه‎، فیلوژنی توالي ناحيه HVR1 بدست آمده از بز نجدي با سایر نژادها در جهان برای تعیین گروه هاپلوتیپی رسم گردید. درخت فيلوژنتيكي ترسيم شده براي نمونه‎ها نشان داد كه همگي از يك جمعيت منشأ گرفته‎اند و تعداد 5 هاپلوتیپ مختلف بر اساس 20 نوكلئوتيد چند شكل (SNP) براي ناحيه HVR1 موجود در توالی‎ها تعیین گردید. همچنين توالي ناحيه HVR1 نمونه مورد بررسي با 11 توالي ثبت شده از 6 گروه هاپلوتیپی از کشورهای مختلف موجود در پایگاه NCBI نشان داد که بز نجدي جز گروه هاپلوتیپی A می باشد. مقایسه توالي ناحيه HVR1 با توالی‎های موجود در بانک ژن می‎تواند به اطلاعات ما درباره نژادهای بز نجدی کمک کند و زمینه را برای استفاده بهتر از آن‎ها در برنامه‎های اصلاحی باز کند. بر اساس نتایج بدست آمده تنوع ژنتیکی بز نجدی در طی سال‎های متمادی افزایش یافته است، که این افزایش تنوع ژنتیکی می‎تواند به دلیل آمیخته‎گری این نژاد با نژادهای دیگر باشد که می‎تواند در آینده منجر به انقراض بز نجدی گردد، که نیازمند توجه بیشتر به این موضوع می‎باشد. تفاصيل المقالة

حرية الوصول المقاله

24 - گزارش یک مورد ابتلاء به مارک کانونی همراه با انسداد در ژئوژنوم مرغ تخمگذار
فریبرز معـیّر پیام حقیقی خوشخو

بیماری مارک از بیماری های ویروسی رایج نئوپلاستیک و لنفوپرولیفراتیو ماکیان است که ارگانهای مختلف را در بدن مبتلا می نماید. ویروس مولد این بیماریکه یک هرپس ویروس لنفوتروپیک می باشد موجب بروز ضایعات پاتولوژیک مختلف در بسیاری از گله های مرغ گوشتی و تخمگذار در نقاط مختلفجهان أکثر

بیماری مارک از بیماری های ویروسی رایج نئوپلاستیک و لنفوپرولیفراتیو ماکیان است که ارگانهای مختلف را در بدن مبتلا می نماید. ویروس مولد این بیماریکه یک هرپس ویروس لنفوتروپیک می باشد موجب بروز ضایعات پاتولوژیک مختلف در بسیاری از گله های مرغ گوشتی و تخمگذار در نقاط مختلفجهان گردیده است.در این گزارش فرم کانونی بیماری مارک در توده برجسته ای به طول 5سانتی متر که موجب انسداد ناحیه ژئوژنوم یک مرغ تخمگذار شده بود، تشخیص دادهشد. در بررسی میکروسکوپی نفوذ شدید سلولهای چند شکلی تک هسته ای شامل لنفوسیت های کوچک و متوسط، لنفوبلاست ها، سلولهای اختصاصی مارکو تعدادی پلاسماسل، ماکروفاژ و سلول های هتروفیل در تمامی لایه های روده از ویلی ها تا زیر مخاط و عضلات مشاهده شد که موجب آتروفی، دژنرسانسو درنهایت از بین رفتن بافت طبیعی ناحیه مبتلا شده بود. سلولهای نئوپلاستیک دارای پلئومورفیسم مشخص بوده و مراحل مختلف میتوز در آنها یافت می شد تفاصيل المقالة

فهرس المقالات ژنوم

سند

الروابط

المراكز ذات الصلة

دعامة

الصفحات الرسمية