تجزیه و تحلیل مولکولی جمعيتي از بز نجدي با استفاده از توالی HVR1 ژنوم میتوکندری
الموضوعات : Journal of Animal Biology
روح الله خادمی
1
,
سیده ام البنین قاسمیان
2
,
حمید رضا سیدآبادی
3
,
امین کاظمی زاده
4
1 - گروه علوم دامی، واحد بهبهان، دانشگاه آزاد اسلامی، بهبهان، ایران
2 - گروه دامپزشکی، واحد بهبهان، دانشگاه آزاد اسلامی، بهبهان، ایران
3 - موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
4 - بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان لرستان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، خرم آباد، ایران
الکلمات المفتاحية: ژنوم میتوکندری, ناحیه HVR1 , تعیین توالی, فیلوژنی, بز نجدي,
ملخص المقالة :
این مطالعه با هدف تعیین توالی ناحیه HVR1 ژنوم میتوکندری بز نجدي انجام گرفت. برای انجام این تحقیق تعداد 30 عدد نمونه خون از هر دو جنس از بزهاي غير خويشاوند جمع¬آوری شد. پس از استخراج DNA، ناحیه مورد نظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک PCR تکثیر شد و تعیین توالی شد. براي مقايسه، فیلوژنی توالي ناحيه HVR1 بدست آمده از بز نجدي با سایر نژادها در جهان برای تعیین گروه هاپلوتیپی رسم گردید. درخت فيلوژنتيكي ترسيم شده براي نمونهها نشان داد كه همگي از يك جمعيت منشأ گرفتهاند و تعداد 5 هاپلوتیپ مختلف بر اساس 20 نوكلئوتيد چند شكل (SNP) براي ناحيه HVR1 موجود در توالیها تعیین گردید. همچنين توالي ناحيه HVR1 نمونه مورد بررسي با 11 توالي ثبت شده از 6 گروه هاپلوتیپی از کشورهای مختلف موجود در پایگاه NCBI نشان داد که بز نجدي جز گروه هاپلوتیپی A می باشد. مقایسه توالي ناحيه HVR1 با توالیهای موجود در بانک ژن میتواند به اطلاعات ما درباره نژادهای بز نجدی کمک کند و زمینه را برای استفاده بهتر از آنها در برنامههای اصلاحی باز کند. بر اساس نتایج بدست آمده تنوع ژنتیکی بز نجدی در طی سالهای متمادی افزایش یافته است، که این افزایش تنوع ژنتیکی میتواند به دلیل آمیختهگری این نژاد با نژادهای دیگر باشد که میتواند در آینده منجر به انقراض بز نجدی گردد، که نیازمند توجه بیشتر به این موضوع میباشد.
