بررسی جهش ها در ژن NF1 در بیماران ایرانی مبتلا به نوروفیبروماتوز نوع 1

محورهای موضوعی : ژنتیک

نیلوفر یاوری ¹ , فهیمه باغبانی آرانی ² , سحر هنرمند جهرمی ³

1 - گروه ژنتیک و بیوتکنولوژی، دانشکده علوم زیستی، واحد ورامین- پیشوا، دانشگاه آزاد اسلامی، ورامین، ایران
2 - گروه ژنتیک و بیوتکنولوژی، دانشکده علوم زیستی، واحد ورامین- پیشوا، دانشگاه آزاداسلامی، ورامین، ایران.
3 - گروه زیست شناسی، دانشکده علوم زیستی، واحد ورامین- پیشوا، دانشگاه آزاد اسلامی، ورامین، ایران

تاریخ دریافت : 1400/05/17 تاریخ پذیرش : 1400/06/23 تاریخ انتشار : 1399/12/01

کلید واژه: توالی یابی DNA, بیماری NF1, اگزون های غیرشایع, نوروفیبرومین,

چکیده مقاله :

نوروفیبروماتوز نوعی بیماری پوستی-عصبی است و با بروز تومورهایی در اطراف اعصاب مشخص می‌گردد. ژن NF1 حدود 350 کیلو جفت باز طول داشته و شامل ۶۰ اگزون است و پروتئینی به نام نوروفیبرومین را کد می کند. به دلیل اندازه بزرگ ژن NF1 و نیز تنوع انواع جهش‌ها، شناسایی جهش‌های این ژن چالشی بزرگ است بنابراین در این تحقیق به بررسی جهش های ‌ ژن NF1 در 10 بیماران ایرانی مبتلا به نوروفیبروماتوز نوع1 پرداخته شد. پس از خونگیری و استخراجDNA ژنومی 15 اگزون از ژن NF1 با استفاده از تکنیک PCR تکثیر و توالی یابی انجام شد. در نهایت قطعات توالی یابی شده با توالی اگزون های مرجع با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی مقایسه گردید و جهش های موجود شناسایی شد. نتایج نشان داد که در اگزون 40 جهش c.5811-5811 delT، در اگزون 35 جهش c.4537 C>T، و در اگزون های 41-42 جهش c.6259-6260 insA وجود دارد. نتایح این مطالعه ضمن گزارش جهش های رخداده در بیماران ایرانی می تواند در مشاوره ژنتیکی و بررسی های بیشتر این بیماری در ایران کمک کننده باشد.

چکیده انگلیسی:

Neurofibromatosis is a skin-neurological disease characterized by tumours around the nerves. The NF1 gene has 350kb long and contains 60 exons and encodes a protein called neurofibromin. Due to the large size of the NF1 gene and the diversity of mutations, identifying mutations in this gene is a major challenge. In this study, 10 patients with Type 1 neurofibromatosis were taken and genomic DNA was purified using salting out method. Following the design of the primers, sequencing was performed after amplification of the 15 exon fragments using PCR. Finally, sequenced fragments were compared with reference exons using the Pairwise Sequence Alignment software, and mutations were identified by considering the polymorphism and variants. The results showed that small-scale mutations such as deletion, insertion, replacement in exons of NF1 gene were present, as well as exons 40 (c.5811-5811 delT), exon 35 (c.4537 C>T) and exone 41-42 ( c.6259-6260 insA .( In conclusion, these results help to better understand the molecular mechanisms of the disease, as well as genetics counseling of NF1.