شناسائی ژن عامل رونویسی متصل شونده به عناصر پاسخ دهنده به کم‌آبی (DREB2) در علف هرز بروموس ژاپنی (Bromus japonicus) تحت شرایط تنش شوری
محورهای موضوعی : پژوهش علف های هرز
محبوبه بصیری
1
,
سید محسن موسوی نیک
2
,
سید کاظم صباغ
3
,
داوود نادری
4
,
آسیه سیاهمرگویی
5
,
خداداد مصطفوی
6
1 - فارغ التحصیل
2 - استاد گروه زراعت دانشگاه زابل
3 - دانشیار گروه زیست دانشکده علوم دانشگاه یزد
4 - کارشناس آزمایشگاه، پژوهشکده زیست فناوری گیاهی دانشگاه زابل
5 - گروه زراعت، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران
6 - گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کرج، کرج، ایران
کلید واژه: توالی ژن, ناحیه AP2, عامل رونویسی, مقاومت به شوری,
چکیده مقاله :
گونه‌های گیاهی مهاجم که به عنوان علف هرز شناخته می شوند گیاهان مقاوم به شرایط نامساعد محیطی هستند که از این ویژگی می‌توان در جهت دستکاری‌های ژنتیکی و تراریختی جهت مقاوم کردن گیاهان زراعی استفاده نمود. این تحقیق با هدف شناسائی ژن درگیر در تحمل گیاهان به تنش‌های غیرزنده و محیطی با نام DREB2 در علف هرز بروموس ژاپنی اجرا گردید. بدین منظور ابتدا تنش شوری به گیاه بروموس ژاپنی با بکارگیری نمک کلرید سدیم اعمال گردید و پس از آن با توالی‌یابی و شناسائی ژن موثر در عمل مقاومت به تنش در این گیاه، توالی بدست آمده مورد بررسی قرار گرفت. تحلیل و مقایسه توالی بدست آمده با توالی این ژن در گیاهان دیگر با نرم افزارهای مختلف ار قبیل BLAST، ExPasy، ELM، ClustalW و MegAlign صورت گرفت. نتایج موید این مطلب بود که قطعه تکثیر شده، مربوط به بخشی از ژن سنتز کننده فاکتور رونویسی متصل شونده به عناصر پاسخ دهنده تحت تنش شوری در این گیاه می‌باشد. مقایسه توالی ژن DREB2 گیاه بروموس ژاپنی با سایر توالی‌های این ژن در گونه‌های گیاهی دیگر، ثابت کرد که Bromus japonicus و Aegilops tauschii با 9/89 درصد بیشترین شباهت (کمترین فاصله ژنتیکی) را دارد. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی اسیدآمینه حاصل از ترجمه توالی نوکلئوتیدی ژن DREB2 در این گیاه از طریق نرم‌افزار CDDsearch نشان داد که در این توالی، ناحیه DomainAP2 وجود دارد. این توالی با شماره دسترسی KP406596 در بانک جهانی ژن (NCI) به ثبت رسید.
Invasive plant species that are characterized as weed, plants are resistant to environmental hard conditions that this feature can be used to the genetic alternation and transformation to resistant crops. The aim of this study was identification of gene involved in tolerance to abiotic environmental stresses in the Bromus japonicus called DREB2. in this subject, salinity stress was applied via sodium chloride, Sequencing and Identification of stress resistance gene in this plant and then sequence obtained was examined. Sequence Analysis and Comparing sequence obtained with sequences this gene in other plants was performed with softwares such as BLAST, ExPasy, ELM, Clustal W, Meg Align. The result was showed that the amplified fragment belonged to part of salinity-responsive element binding-factor gene in this plant. The comparison DREB2 gene sequence with other sequences this gen in the other plant species was confirm the Bromus japonicus and Aegilops tauschii have the most similarity with 89.9% the highest likeness (the lowest genetic distance). Bioinformatics analysis of the amino acid sequence of the translated nucleotide sequence of the gene DREB2 in the Bromus japonicus through software CDD search showed that AP2 Domain area is in this sequence, These sequence was submitted to GenBank, Its accession code is KP406596.
_||_