نقشه پراکنش ویروس‌های عامل پیچیدگی برگ (زرد) گوجه فرنگی در مزارع گوجه فرنگی استان فارس
محورهای موضوعی : گیاه پزشکی
علی پاک نیت
1
()
ساسان قاسمی
2
()
عبداله کاربر
3
()
کلید واژه: PCR, Degenerate primers, نقشه پراکنش, Distribution map, ویروس عامل پیچیدگی برگ (زرد) گوجه فرنگی پراکندگی, آغازگر دژنره, آزمون پی. سی. آر, TYLCV,
چکیده مقاله :
طی زمستان سال 1390 و بهار و تابستان 1391 به منظور تعیین پراکندگی جمینی ویروس های مولد بیماری پیچیدگی برگ (زرد) گوجه فرنگی از مناطق عمده گوجه فرنگی کاری استان فارس که شامل شهرستان های لامرد، لار، فراشبند، کازرون، ممسنی، شیراز، سعادت شهر و آباده بازدید به عمل آمد. پس از شناسایی مزارع آلوده نمونه های مشکوک از مزارع گوجه فرنگی دارای علائم پیچیدگی شدید برگ همراه با کوتولگی و زردی در حاشیه برگ ها، ریزش گل و کوتولگی گیاه بودند در این مناطق جمع آوری شدند. پس از استخراج دی ان ای ازآلودگی نمونه های دارای علائم با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی جدایه آباده و جفت آغازگرهای دژنره ویروس پیچیدگی برگ (زرد) گوجه فرنگی مورد بررسی پی سی آر قرار گرفتند. در این تحقیق بیماری در مناطق لامرد، لار، سعادت شهر، آباده و ممسنی با استفاده از جفت آغازگرهای مذکور ردیابی و نقشه پراکنش این ویروس در استان تهیه شد.
A survey was conducted to detect the distribution of tomato (yellow) leaf curl disease in tomato fileds of Fars province including Lamerd, Lar, Farashband, Kazeroon, Mamasani, Shiraz, SaadatShahr, and Abadeh region during winter, spring and summer of 2012. suspected samples that showed severe leaf curl associate with stunting and yellowing around the leaves were collected. After DNA extraction, samples were tested with specific primers of Abadeh isolate and degenerate primers of begomoviruses using polymerase chain reaction (PCR). The results showed that Lamerd, Lar, Saadatshahr, Abadeh and Mamasani regions are infected and distribution map of TYLCV was drown in Fars Province.
Bananej, K., Kheyr-Pour, A., Salekdeh, G. H. & Ahoonmanesh, A. 2004. Complete nucleotide sequence of Iranian tomato yellow leaf curl virus isolate: Further evidence for natural recombination amongst begomoviruses. Archives of Virology 149: 1435-1443.
Bedford, I. D., Briddon, R. W., Brown, J. K., Rosell, R. C. & Markham, P. G. 1994. Geminivirus-transmission and biological characterization of Bemisia tabaci (Gennadius) biotypes from different geographic regions. Annals of Applied Biology, 125: 311-325.
Behjatnia, S. A. A., Izadpanah, K. Dry, I. B. & Rezaian, M. A. 2004. Molecular characterization and taxonomic position of the Iranian isolate of tomato leaf curl virus. Iranian Journal of Plant Pathology, 40: 77-94.
Czosnek, H. 2007. Tomato Yellow Leaf Curl Virus Disease, Management, Molecular Biology, Breeding for Resistance. Published by Springer Dordrecht, The Netherlands.
Czosnek, H. and Laterrot, H. 1997. A worldwide survey of tomato yellow leaf curl viruses. Archives of Virology, 142: 1391-1406.
De Barro, P. J. 1995. Bemisia tabaci biotype B: A review of its biology, distribution and control. In "Division of entomology technical paper No. 33". Commomwealth Sientific and Industrial Research Organisation, Canberra, Australia.
Deng, D., McGrath, P. F., Robinson, D. J. & Harrison, B. D. 1994. Detection and differentiation of whitefly-transmitted geminiviruses in plants and vector insects by the polymerase chain reaction with degenerate primers. Annals of Applied Biology, 125: 327-336.
Fauquet, C. M., Briddon, R. W. Brown, J. K., Moriones, E., Stanley, J., Zerbini, M. & Zhou, X. 2008. Geminivirus strain demarcation and nomenclature Archives of Virology, 153: 783–821.
Hajimorad, M. R., KheyrPour, A., Alavi, V., Ahoonmanesh, A., Bahar, M., Rezaian, M. A. & Gronenborn, B. 1996. Identification of whitefly transmitted tomato yellow leaf curl geminivirus from Iran and a survey of its distribution with molecular probes. Plant Pathology, 45: 418-425.
Moriones, E. & Navas-Castillo, J. 2000. Tomato yellow leaf curl virus, an emerging virus complex causing epidemics worldwide. Virus Research, 71: 123-134.
Navas-Castillo, J., Sanchez-Campos, S., Noris, E., Louro, D., Accotto, G. P. & Moriones, E. 2000. Natural recombination between Tomato yellow leaf curl virus-Is and Tomato leaf curl virus . Journal of General Virology, 81: 2797- 2801.
Pakniat, A. Behjatnia, S. A. A. Kharazmi, S. Shahbazi, M. & Izadpanah, K. 2010. Molecular characterization and construction of infectious clone of a new strain of Tomato yellow leaf curl virus in southern Iran. Iranian journal of plant pathology, 46: 101-115.
Pico, B., Diez, M. J. & Nuez, F. 1996. Viral diseases causing the greatest economic losses to the tomato crop: The tomato yellow leaf curl virus - A review. Scientia Horticulturae, 67: 151-196.
Seal, S. E., Jeger, M. J. & Van den Bosch, F. 2006. Begomovirus evolution and disease management. Advances in Virus Research, 67: 297–316.
Stanley, J., Bisaro D. M., Briddon, R. W., Brown, J. K., Fauquet, C. M., Harrison, B. D., Rybicki, E. P. & Stenger, D. C. 2005. Geminiviridae. In: Virus Taxonomy, Eighth Report of The International Committee On Taxonomy of Viruses, pp 301-326. Edited by C. M. Fauquet, M. A. Mayo, J. Maniloff, U. Desselberger & L. A. Ball. London: Elsevier/Academic Press
Rochester, D. E., Kositratana, W. & Beachy, R. N. 1990. Systemic movement and symptom production following agroinoculation with a single DNA of tomato yellow leaf curl geminivirus (Thailand). Virology, 178: 520-526.
Rojas, M.R., Hagen.C., Lucas, W.J. & Gilbertson, R.L. 2005. Exploiting chinks in the plant's armor: Evolution and emergence of geminiviruses. Annual Review of Phytopathology, 43: 361-394
Rojas, M. R., Gilbertson, R. J., Russell, D. R. & Maxwell, D. P. 1993. Use of degenerate primers in the polymerase chain-reaction to detect whitefly-transmitted geminiviruses. Plant Disease, 77: 340-347.
Zhang, Y. P., Uyemoto, J. K. & Kirpatrick, B. 1998. A small-scale procedure for extracting nucleic acids from woody plants infected with various phytopathogenic for PCR assay. Journal of virological methods, 71: 45-50.