بررسی خصوصیات ساختاری و فیلوژنی پروتئین سیتوکروم P450 در حشرات

الموضوعات :

ثمین صدیق ¹ (استادیار، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد ورامین-پیشوا، دانشکده کشاورزی، گروه گیاهپزشکی، ورامین، ایران)

تاريخ الإرسال : 23 الأربعاء , شعبان, 1436 تاريخ التأكيد : 04 الثلاثاء , ربيع الأول, 1437 تاريخ الإصدار : 11 السبت , جمادى الأولى, 1437

الکلمات المفتاحية: بیوانفورماتیک, سیتوکروم P450 (cyp), درخت فیلوژنی, حشرات, تجزیه و تحلیل ساختاری,

ملخص المقالة :

آنزیم های سیتوکروم P450 (cyps) منواکسیژناز های حاوی هِم هستند که در متابولیسم مواد داخلی و خارجی دخالت دارند. آن ها شامل یک بالاخانواده از آنزیم ها هستند که در موجودات مختلف مانند پستانداران، گیاهان، باکتری ها و حشرات یافت می شوند. cyp ها متنوع بوده و سوبسترا های زیادی را متابولیزه می کنند، اما ساختار آن ها بسیار حفاظت شده است. در این مطالعه، تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی آنزیم های P450 در سی گونه از حشرات متعلق به خانواده های مختلف انجام گرفت. بر اساس موتیف های به دست آمده از ابزار های MEME و MAST، 3 موتیف در تمام حشرات مشترک بود. آنالیز ساختاری هفت گونه از حشرات انتخاب شده توسط ابزار های ProtParam و SOPMA در پایگاه EXPASY انجام شد. ساختار سوم Drosophila melanogaster (شماره دسترسی: NP_525031) به عنوان حشره نمونه و شش گونه دیگر با استفاده از سرور Phyre2 و با استفاده از مدل “c4lxjA” (کد دسترسی: 4lxj) پیش بینی گردید. توالی پروتئین ها با استفاده از الگوریتم ClustalW توسط نرم افزار MEGA 6.06 هم تراز سازی شده و درخت فیلوژنی با استفاده از روش اتصال-همسایگی (NJ) ترسیم گردید. با توجه به نتایج، شباهت زیادی بین پروتئین هـای cyp در گونه های مختلف حشرات وجود دارند به طوری که احتمالا از یک جد مشترک مشتق شده اند. داده های به دست آمده پیش زمینه ای را برای مطالعات بیوانفورماتیکی راجع به عملکرد و تکامل این پروتئین در حشرات فراهم می آورد.