تعیین الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی و بررسی فراوانی ژن‌های اوپرون ica در سویه های استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس جدا شده از موارد کلینیکی شهرستان شهرکرد
الموضوعات :فروغ صدیقی 1 , حسین آقاجانی 2 , حسین خدابنده شهرکی 3 , فاطمه نعمت الهی 4 , الهه تاج بخش 5
1 - 1.گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران
2 - گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران
3 -
4 - گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران
5 - گروه زیست شناسی دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد
الکلمات المفتاحية: استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس, اوپرون ica, عفونت ادراری, ژن¬های مقاومت آنتی¬بیوتیکی,
ملخص المقالة :
استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس یکی از عوامل عفونت مجاری ادراری میباشد. با توجه به گستردگی سویهها و وجود عوامل بیماری‌زا هزینههای بالایی جهت جداسازی، تشخیص و درمان این باکتری صورت میگیرد. این مطالعه بهمنظور تعیین الگوی مقاومت آنتیبیوتیکی و فراوانی ژن‌های اوپرون ica در ایزولههای استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس جدا شده از مواد عفونت ادراری در شهرستان شهرکرد انجام گرفت. این تحقیق بر روی 34 ایزوله استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس جدا شده از موارد عفونت ادراری در شهرستان شهرکرد صورت گرفت. بعد از انجام تست‌های بیوشیمیایی بهمنظور تشخیص باکتری، الگوی مقاومت آنتیبیوتیکی به روش کربی بائر بررسی گردید. جهت بررسی فراوانی ژن‌های tetK ، ant(4)-Ia ،vanA، ermA و icaA/C/D/B/R آزمون واکنش زنجیره‌ای پلی مراز با استفاده از زوج پرایمرهای اختصاصی صورت گرفت. بیشترین مقاومت نسبت به پنی سیلین (2/91 درصد) و کمترین مقاومت نسبت به وانکومایسین (9/5 درصد) گزارش شد. فراوانی ژن tetK 7/64 درصد، ermA 88/55 درصد ، ant(4)-Ia 58/20 درصد و vanA صفر درصد گزارش گردید. در 25 ایزوله ژن icaA ( 52/73 درصد)، در 22 ایزوله icaD (70/64 درصد) در 7 ایزوله icaC ( 58/20 درصد ) در 5 ایزوله icaB ( 7/14 درصد) و در 5 ایزوله icaR (7/14 درصد) گزارش گردید.
نتایج نشان میدهد استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس نسبت به تعدادی از آنتیبیوتیکهای انتخابی درمان عفونتها مقاومت دارد. عدم وجود ارتباط آماری معنی دار بین مقاومت با دیسک و مقاومت به روش مولکولی نشان دهنده انتقال مقاومت آنتیبیوتیکی در بین ایزولهها از طریق عوامل دیگری نظیر اینتگرونها و ترانسپوزونها میباشد
1. Gotz F, Bannerman T, Schleifer KH. The Genera Staphylococcus and Micrococcus. prokaryotes. 2006; 4 (1): 5-75.
2. Fowler VG Jr, Fey PD, Reller LB, Chamis AL, Corey GR, Rupp ME. The intercellular adhesion locus ica is present in clinical isolates of Staphylococcus aureus from bacteremic patients with infected and uninfected prosthetic joints. Med Microbiol Immunol. 2001; 189 (3):127-131.
3 Murray PR, Rosenthal KS, Kobayashi GS, Pfaller MA. Staphylococcus, In: Medical Microbiology, 4th ed, Washington, and Mosby. 2002; 202-216.
4. Nash C, Chn A, Allexander K, Hageman J. Coagulase negative Staphylococci in the neonatal intensive care unit: Are we any smarter? Infect Dis. 2013; 14(6): 284-293.
5. Gould D, Chamberlaine A. Staphylococcus aureus: a review of the literature. J Clin Nurs. 1995; 4: 5-12.
6. Cunha Mde L, Rugolo LM, lopes CA. Study of virulence Factors in coagulase negative Staphylococci isolated from newborns. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz. 2006; 101 (6): 661-668.
7. Otto M. Virulence factors of the coagulase negative Staphylococci. Front Bio Sci. 2004; 1(9): 841-863.
8 Mardh PA, Colleen S, Hovelius B. Attachment of bacteria to exfoliated ells from urogenital tract. Investigative Urology. 2006; 16(5): 322-326.
9. Kuroda M, Yamashita A, Hirakawa H, Kumano M, Morikawa K, Higashide M, Maruyama A, Inose Y, Matoba K, Toh H, Kuhara S, Hattori M, Ohta T. Whole genome sequence of Staphylococcus saprophyticus reveals the pathogenesis of uncomplicated urinary tract infection. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. 2005; 102 (37): 13272-13277.
10. Arber N, Militianu A, Ben-Yehuda Arie, Pinkhas J, et al. Native valve Staphylococcus epidermidis Endocarditis: report of seven cases and review of the literature. Am J Med. 1991; 90 (6):758-762
11. Eiffcv, Peters G, Heilmann C. Pathogenesis of infection due to coagulase negative Staphylococci. Lancet Infect Dis. 2002; 2 (11): 677-685.
12. Turkylimaz S, Kaya O. Determination of some virulence factors in Staphylococcus spp. isolated from various clinical samples. Turk J Vet Animal Sci. 2006; 30 (1): 127-132.
13. Klinenegberg C, Aarag E, Ronnestad A, Sollid JE, Abrahamsen TG, Kjeldsem G, Flaegstad T. Coagulase negative Staphylococcal sepsis in neonates. Association between antibiotic resistance, biofilm formation and the host inflammatory response. Ped Infect Dis J. 2005; 24 (9): 817-822.
14. Widerström M, Wiström J, Sjöstedt A, Monsen T. Coagulase negative Staphylococci: update on the molecular epidemiology and clinical presentation, with a focus on Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus saprophyticus. Europ J Clin Microb Infect Dis. 2012; 31 (1): 7-20.
15 Duran N, Ozer B, Duran GG, Onlen Y, Demir C. Antibiotic resistance genes and susceptibility patterns in Staphylococci. Ind J Medl Res. 2012:135 (3): 389–396.
16. Cunha ML, Sinzato YK, Silveira LV. Comparison of Methods for the identification of coagulase negative Staphylococci. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz. 2004; 99(8): 855-860.
17. Jorgensen JH, Ferraro MJ. Antimicrobial susceptibility testing: a review of general principles and contemporary practices. Clin infect Dis. 2009; 49(11):1749-55.
18. Wayne PA. CLSI document M100-S21 Performance standards for antimicrobial susceptibility testing twenty first informational supplements. Clin Lab Standards Institute. 2011.
19. Yadegar A, Sattari M, Amir Mozafari N, Goudarzi GR. Prevalence of the genes encoding aminoglycoside modifying enzymes and methicillin resistance among clinical isolates of Staphylococcus aureus in Tehran, Iran. Microb Drug Resist. 2009; 15 (2): 109-113.
20. Werckenthin C, Schwarz S. Molecular analysis of the translational attenuator of a constitutively expressed ermA gene from Staphylococcus intermedium. J Antimicrob Chemother. 2000; 45 (5): 785–788.
21. Chakraborty SP, Kar Mahapatra S, Bal M, Roy S. Isolation and Identification of vancomyc in resistant Staphylococcus aureus from Postoperative pus sample. Al Ameen J Med Sci. 2011; 4 (3): 152 -168.
22. Rohde H, Knobloch JK, Horstkotte MA, Mack D. Correlation of biofilm expression types of Staphylococcus epidermidis with polysaccharide intercellular adhesion synthesis: evidence for involvement of icaADBC genotype independent factors. Med Microbiol Immunol. 2001; 190 (3):105-112.
23. Arciola CR, Gamberini S, Campoccia D, Visai L, Speziale P, Baldassarri L, Montanaro L. A multiplex PCR method for the detection of all five individual genes of ica locus in Staphylococcus epidermidis. A survey on 400 clinical isolates from prosthesis-associated infections. J Biomed Materials Res. 2005; 75 (2): 408-413.
24. Ziebuhr W, Krimmer V, Rachid S, LöBner I, Götz F, Hacker J. A novel mechanism of phase variation of virulence in Staphylococcus epidermidis. Evidence for control of the polysaccharide intercellular adhesion synthesis by alternating insertion and excision of the insertion sequence element IS256. Mol Microbiol. 1999; 32 (2): 345-356.
25. Cafiso V, Bertuccio T, Santagatic M, Campanile F, Amicosant G. presence of the ica operon in clinical isolates of Staphylococcus epidermis and its role in biofilm production. Clin Microbiol Infect. 2004; 10(12): 1081-1088.
26. Gad GF, El-Feky MA, El-Rehewy MS, Hassan MA, Abolella H, El-Baky RM. Detection of icaA, icaD genes and biofilm production by Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis isolated from urinary tract catheterized patients. J Infecti Develop Count. 2009; 3 (5): 342-351
27. Zhou sh, chao X, Fei M, Dai Y, Liu B. Analysis of S. epidermidis icaA and icaD genes by polymerase chain reaction and Slime production. a case control Study. BMC Infecti Dis. 2013; 13 (3): 242
28. Arciola CR, Baldassarri L, Montanaro L. Presence of icaA and icaD genes and slime production in a collection of Staphylococcus strains from catheter associated infections. J Cli Microbiol. 2001; 39 (6): 2151-2156.
29. Chaieb K, Zmantar T, Chehab O, Bouchami O, Ben Hasen A, Mahdouani K, Bakhrouf A. Antibiotic resistance genes detected by multiplex PCR assays in Staphylococcus epidermidis strains isolated from dialysis fluid and needles in a dialysis service. Japan J Infect Dis. 2007; 60 (4): 183-187.
30. Oliveira A, Cunha ML. Comparison of methods for the detection of biofilm production in coagulase negative Staphylococci. BMC Rese Notes. 2010; 3 (5): 260-269.
31. Wojtyczka R, orlewska K, Kepa M, Idzik D, Dziekzic A, Mularz T, Krawczyk M, Miklasinska M, Wasik T. Biofilm formation and antimicrobial susceptibility of Staphylococcus epidermidis strain from a Hospital Environment. Intern J Environ Res. 2014; 11 (5): 4619-4633.
32. Alcaraz LE, Satorres SE, Lucero RM, centorbio ONP. Species identification slime production and oxacillin Suseeptbility in coagulase-negative Staphylococci isolated from nosocomial specimens. Brazi J Microbiol. 2003; 34 (1): 45-57.
33. Eftekhar F, Mirmohamadi Z. Evaluation of biofilm production by Staphylococcus epidermidis isolates from nosocomial infections and skin of healthy volunteers. Intern J Med Sci. 2009; 1 (10): 438-441.
34. Byrne-Bailey KG, Gaze WH, Kay P, Boxall ABA, Hawkey PM, Wellington EMH. Prevalence of sulfonamide resistance genes in bacterial isolates from manure agricultural soils and pig slurry in the United Kingdom. Antimicrob Agents Chemother. 2009; 53 (2): 696-702.
35. Kümmerer K. Resistance in the environment. J Antimicrob Chemother. 2004; 54 (2): 311–320.
36. Kausar J, Afia Z, Rumina H. Frequency and sensitivity pattern of extended spectrum beta lactamases producing isolates in a tertiary care hospital laboratory of Pakistan. J Pak Med Associat. 2005; 55 (10):436-439.
37. Rahimi F, Arabestani M, Karimi SH. Antibiotic resistance pattern
Staphylococcus epidermidis strains of methicillin resistant isolates from clinical samples in Tehran. Jundi J Microbiol. 2013; 6 (2): 144-149.
38. Koksa F, Yasar H, Samasti M. Antibiotic resistance patterns of coagulase-negative Staphylococcus strains isolated from blood cultures of septicemic patients in Turkey. Microbiol Res. 2009; 164 (4): 404-410.
39. Islami G, Taheri S, Nalchi F, Baseri N, Samadi R. Investigation of bacteria that cause skin infections and antibiotic resistance pattern referred to Shohada and Loghman in 1389-1390. Pajohandeh. 2012; 35 (4): 205-210
40. Alborzi A, PourabbasB, Salehi H, Oboodi B, Panjeshin MR. Prevalence and pattern of antibiotic sensitivity of methicillin sensitive and methicillin resistant Staphylococcus aureus in Shiraz Iran. Iranian J Med Sci. 2000; 25 (5): 1-8
41. Bryan A, Shapir N, Sadowsky MJ. Frequency and distribution of tetracycline resistance genes ingenetically diverse, nonselected, and nonclinical Escherichia coli strains isolated from diverse human andanimal sources. Appl Environment Microb. 2004; 70 (4): 2503-7250.
42. Scheel O, Iversen G. Resistant strains isolated from bacteremia patients in Northern Norway. Scand J Infect Dis. 1991; 23 (5): 599-605.
43. Zmantar T, Kouidhi B, Miladi H, Bakhrouf A. Detection of macrolide and disinfectant resistance genes in clinical Staphylococcus aureus and coagulase negative Staphylococci. BMC Res Notes. 2011; 4: 453-459.
44. Ullah F, Malik S A, Ahmed J, Ullah F, Shah M, Ayaz M, et al. Investigation of the genetic basis of tetracycline resistance in Staphylococcus aureus from Pakistan. Trop J Pharmaceut Res. 2012; 11 (6): 925-931.
