فهرست مقالات SSR markers

• دسترسی آزاد مقاله
  • صفحه چکیده
  • متن کامل
  
  1 - ارزیابی ژنتیکی برخی جمعیت‌های گیاه دارویی زیره‌ سیاه (Carum carvi)با استفاده از نشانگرهای RAPD و ISSR
  لیلا فهمیده لیلا جانی پور بهمن فاضل نسب
  در این تحقیق به‌منظور، تعیین رابطه خویشاوندی و فاصله ژنتیکی بین جمعیت‌های زیره ی سیاه از نشانگرهای RAPD و ISSR استفاده شد. با استفاده از نشانگر RAPD در مجموع 126 آلل تکثیر شد که آغازگر TIBMBC08 و TIBMBA02 با 7 آلل کمترین تعداد و آغازگر TIBMBC05با 22 آلل بیشترین تعداد دا چکیده کامل

  در این تحقیق به‌منظور، تعیین رابطه خویشاوندی و فاصله ژنتیکی بین جمعیت‌های زیره ی سیاه از نشانگرهای RAPD و ISSR استفاده شد. با استفاده از نشانگر RAPD در مجموع 126 آلل تکثیر شد که آغازگر TIBMBC08 و TIBMBA02 با 7 آلل کمترین تعداد و آغازگر TIBMBC05با 22 آلل بیشترین تعداد داشتند. در نشانگر ISSR در مجموع 79 الل شناسایی که آغازگر UBC112 با 1 الل کمترین تعداد و آغازگر UBC809 با 15 آلل بیشترین تعداد داشتند. در نشانگر RAPD، بیشترین میزان شاخص چند شکلی با میزان 94/0 مربوط به آغازگر TIBMBC05و کمترین میزان شاخص چندشکلی با میزان 8/0 مربوط به آغازگر TIBMBA02 و میزان شاخص تنوع شانن (57/0) و شاخص تنوع نی (38/0) مشاهده گردید. همچنین در نشانگر ISSR، بیشترین میزان شاخص چندشکلی با میزان 92/0 مربوط به آغازگرهای UBC809 و کمترین میزان شاخص چندشکلی مربوط به آغازگر UBC112با میزان صفر و میزان شاخص تنوع شانن (57/0) و شاخص تنوع نی (39/0) مشاهده گردید. بر اساس اطلاعات RAPD و ISSR به‌صورت توأم بیشترین میزان تشابه مربوط به زیره ی سیاه کرمان و زیره ی سیاه جندق (48/0) و کمترین میزان تشابه مربوط به ژنوتیپ های زیره ی سیاه کرمان و زیره ی سیاه نیشابور (115/0) با میانگین 315/0 می باشد. تجزیه خوشه‌ای جمعیت‌های زیره ی سیاه را بر اساس اطلاعات توأم هر دو نشانگر RAPD و ISSR در سه گروه مختلف که تا حدودی با موقعیت جغرافیایی آنها مطابفت داشت، طبقه بندی و از همدیگر تفکیک نمود. پرونده مقاله
• دسترسی آزاد مقاله
  • صفحه چکیده
  • متن کامل
  
  2 - تنوع فیتوشیمیایی، بیوشیمایی و مولکولی انجیر (Ficus carica L.) در استان آذربایجان شرقی
  اکبر قربانی حمید حسن پور سزایی ارجیشلی
  انجیر (Ficus carica) درخت بومی مناطق غرب و شرق مدیترانه از جمله ایران می باشد. ایران یکی از کشورهای مهم تولید کننده انجیر در جهان می باشد. در این پژوهش تنوع صفات بیوشیمایی و فیتوشیمیایی میوه و تنوع مولکولی 38 ژنوتیپ انجیر منطقه ارسباران استان آذربایجان شرقی در سال 1396 چکیده کامل

  انجیر (Ficus carica) درخت بومی مناطق غرب و شرق مدیترانه از جمله ایران می باشد. ایران یکی از کشورهای مهم تولید کننده انجیر در جهان می باشد. در این پژوهش تنوع صفات بیوشیمایی و فیتوشیمیایی میوه و تنوع مولکولی 38 ژنوتیپ انجیر منطقه ارسباران استان آذربایجان شرقی در سال 1396 و در آزمایشگاه علوم باغبانی دانشگاه ارومیه مورد بررسی قرار گرفتند. با توجه به نتایج تجزیه واریانس صفات اندازه گیری شده از قبیل مواد جامد محلول، pH، شاخص طعم، ویتامین ث، ظرفیت آنتی اکسیدانی، آنتوسیانین، فلاونوئید و فنل کل میوه در سطح احتمال یک درصد معنی دار بودند. بطوریکه در بیشتر صفات بیوشیمیایی مورد بررسی تنوع بسیار بالایی مشاهده گردید. همچنین نتایج داده های مولکولی نیز نشان داد در مجموع 131 باند تکثیر شده بود که از این میزان 121 باند (92 درصد) چند شکل بودند. میزان PIC برای آغازگرهای مورد استفاده در تجزیه ISSR بین 22/0 در آغازگر ISSR7 تا 47/0 در آغازگر ISSR20 متغیر بود. همچنین شاخص نشانگری از 51/0 تا 50/2 برای نشانگرهای ISSR7 و ISSR20 متفاوت بود. بر اساس نتایج تجزیه خوشه ای، ژنوتیپ های مورد بررسی انجیر در دو گروه اصلی قرار گرفتند که اکثر ژنوتیپ های جمع آوری شده از کلیبر در گروه دوم قرار داشتند که نشان دهنده این است که موقعیت جغرافیایی ژنوتیپ های مورد بررسی انجیر عامل اصلی تفکیک آنها به وسیله این نشانگر می باشد. با توجه به نتایج حاصله می توان ژنوتیپ های Kh9 و H17 را برای برنامه های اصلاحی آینده پیشنهاد نمود. پرونده مقاله
• دسترسی آزاد مقاله
  • صفحه چکیده
  • متن کامل
  
  3 - Genetic diversity and relationships among traits in potato genotypes using agronomic traits and molecular marker (SSR).
  Hossein Afshari Ehsan Barzin Ghanbar laei Morteza Noryan
  10.30495/ijpp.2017.533563
  The molecular marker (SSR) has been used to investigate the markers associated with the agronomic traits including days to 50% flowering, tube ring time, days to maturity, plant height, the number of main stems per plant, the number of tubers per plant, dry matter conte چکیده کامل

  The molecular marker (SSR) has been used to investigate the markers associated with the agronomic traits including days to 50% flowering, tube ring time, days to maturity, plant height, the number of main stems per plant, the number of tubers per plant, dry matter content, main stem diameter, a single tuber weight, average single tuber weight, and the total yield in potato genotypes. Ten primers used in 16 potato genotypes were investigated and principal component analysis and cluster analysis were used to determine genetic distance and genotype classification. A significant difference was found between all cultivars, indicating high genetic diversity for the traits under study, except for the diameter of stem trait. Yield showed a significant positive correlation with the number of tubers per plant, weight of tubers per plant, single tuber weight, and the number of main stems per plant. Special values resulted from components of 1-5 were higher than 1 in principal component analysis and totally justifying 76.70% of all variables variances. Molecular diversity of cultivars was measured using parameters of polymorphic information, the number of effective alleles, and Shannon index and the average of 39.03 SSR bands was achieved among which 9.41 bands were polymorphic. The average number of polymorphic bands varied for each primer from 1.56 to 2.12. Maximum and minimum polymorphic bands belonged to the HVM70 primer with 2.12 and the Bmacoo40 primer with 1.56, respectively. Also, the mean maximum band (4.4) and minimum band (3.1) belonged to Agra and Deyta cultivars, respectively. The morphologic data did not conform to the molecular data indicating that SSR marker had no genetic relationship with positions controlling the measured morphologic traits. Since the SSR markers were located in non-coding area of genome, no relationship between classifications of molecular markers and morphologic data was unexpected. پرونده مقاله
• دسترسی آزاد مقاله
  • صفحه چکیده
  • متن کامل
  
  4 - بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ‌های متحمل به تنش خشکی در گندم دوروم با استفاده از مارکرهای مولکولی SSR
  سید سعید نوری نیا شهاب سادات
  به منظور بررسی گزینش به کمک مارکرها و همچنین شاخص تحمل به تنش خشکی (STI). 20 رقم گندم دوروم با استفاده از طرح اسپلیت پلات در قالب کاملا تصادفی کشت، و اجزاء عملکرد محاسبه شد. در سطح مولکولی از 20 جفت آغازگر (SSR) جهت بررسی تنوع ژنتیکی بین ارقام و تعیین ژنوتیپ‌های متحمل ب چکیده کامل

  به منظور بررسی گزینش به کمک مارکرها و همچنین شاخص تحمل به تنش خشکی (STI). 20 رقم گندم دوروم با استفاده از طرح اسپلیت پلات در قالب کاملا تصادفی کشت، و اجزاء عملکرد محاسبه شد. در سطح مولکولی از 20 جفت آغازگر (SSR) جهت بررسی تنوع ژنتیکی بین ارقام و تعیین ژنوتیپ‌های متحمل به تنش خشکی استفاده گردید. پس از استخراج DNA و تعیین کمیت و کیفیت آن، PCR به روش Touch down صورت گرفت. در مجموع 58 آلل از 20 لوکوس شناسایی گردید. بیشترین آلل متعلق به Xgwm601 و Xbarc108با چهار آلل و کمترین آن با دو آلل متعلق به مارکرهای Xgwm413، Xgdm132، Xwmc48، Xbarc40، Xbarc121‌ و Xgwm375 بود. میانگین آلل تولید شده برای هر لوکوس در این تحقیق 9/2 آلل است. امتیازبندی و طول قطعات تولید شده با استفاده از نرم افزار UVDOC مشخص گردید. ماتریس تشابه، تجزیه کلاستر به روش UPGMA و نیز رسم دندروگرام همگی با استفاده از نرم افزار NTSYS انجام گرفت. معیار آماری ضریب همبستگی کوفنتیک نیز محاسبه و عدد 86% بدست آمد. دندروگرام، نشان دهنده دو کلاستر، در یک کلاستر ژنویپ‌های شماره یک، 2، 15، 16، 20، 13، 3، 4، 19، 8، 12، 7، 9، 5 و 14 و در کلاستر دیگر ژنوتیپ‌های شش، 18، 10، 17 و 11 قرار دارند. ژنوتیپ‌های 5 و 14 از شاخص تحمل به تنش بالاتری نسبت به سایر ارقام برخوردارند. نتایج نشان داد خصوصیت چند آللی یک پدیده کاملاً متداول و معمول در مارکرهای SSR می‌باشد که بیانگر پیوستگی صفات یا تاثیر ژن‌های چند اثره می‌تواند باشد. پرونده مقاله
• دسترسی آزاد مقاله
  • صفحه چکیده
  • متن کامل
  
  5 - آنالیز مولکولی و تبدیل میکوتوکسین دی اکسی نیوالنول به فرم 3- استیل در 20 رقم گندم دوروم خوزستان از طریق تکنیک PCR و تعیین ژن مقاومت AYT1
  سید سعید نوری نیا ندا باغستانی
  این پژوهش به منظور ارزیابی واکنش 20 توده گندم دوروم بومی خوزستان، موجود در کلکسیون بخش تحقیقات غلات مؤسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر نسبت به بیماری بلایت فوزاریومی سنبله طی دو سال زراعی 96-1395 و 98-1397 در شرایط مزرعه در دو منطقه‌ی مختلف، خوزستان، با دو شرایط آب و چکیده کامل

  این پژوهش به منظور ارزیابی واکنش 20 توده گندم دوروم بومی خوزستان، موجود در کلکسیون بخش تحقیقات غلات مؤسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر نسبت به بیماری بلایت فوزاریومی سنبله طی دو سال زراعی 96-1395 و 98-1397 در شرایط مزرعه در دو منطقه‌ی مختلف، خوزستان، با دو شرایط آب و هوایی، اجرا گردید. صفات مورد مطالعه شامل خوشه‌‌های آلوده، آلودگی سنبلچه، آلودگی بذر، تراکم خوشه، ارتفاع بوته و عملکرد بیولوژیک بود که به منظور اندازه گیری و تعیین فواصل ژنتیکی و نیز الگو پذیری تنوع در اجزاء مقاومت به فوزاریوم سنبله گندم، از روش تجزیه خوشه‌ای استفاده شد. ارزیابی توده‌های آزمایشی با استفاده از روش اسپورپاشی در مزرعه نشان داد که بیشتر توده‌های مورد بررسی، از نظر میانگین شاخص بیماری از مقاومت مطلوبی در برابر بیماری برخوردار هستند. به نظر می‌رسد که علت مقاومت اساس ژنتیکی داشته و به وجود مقاومت نوع I در آن‌ها مربوط می‌شود. از بیست رقم گندم دوروم مورد بررسی می‌توان به عنوان والدهای مقاوم به بیماری در تلاقی‌های مربوط به برنامه‌های اصلاح گندم استفاده نمود، نتایج نشان داد، که ژن AYT1 در ارقام گندم مورد بررسی به عنوان ژن مقاوم، بیان می‌شود همچنین با استفاده و معرفی تکنیک PCRو استفاده از نشانگرهای ملکولی SSR در این تحقیق به منظور تکثیر یک نسخه منفرد یا نسخه‌های کمی از یک قطعه DNA با توالی خاص به تعداد هزار یا میلیون‌ها نسخه، جهت دستیابی به ماهیت ژنتیکی ارقام می‌توان این روش را به عنوان روش مطلوب جهت ثکثیر ژن‌های مقاوم در این پژوهش معرفی نمود. پرونده مقاله