پروموتر

دسترسی آزاد مقاله

1 - بررسی پروموتر ژن los1 در آسکومیست‌ها
علی رضا عزیزی وحید خلج منصور بیات

آسکومیکوتا شامل بزرگترین و متنوع ترین گروه قارچی است و از نظر اقتصادی نقش بسیار مهمی در بیشتر اکوسیستم‌ ها برعهده دارند. جنبه‌های مختلف فعالیت زیستی آسکومیست‌ها، آنها را به موضوعی جذاب برای مطالعات زیستی تبدیل کرده است که از آن جمله می‌توان به یافتن راهکارهایی برای تغیی چکیده کامل

آسکومیکوتا شامل بزرگترین و متنوع ترین گروه قارچی است و از نظر اقتصادی نقش بسیار مهمی در بیشتر اکوسیستم‌ ها برعهده دارند. جنبه‌های مختلف فعالیت زیستی آسکومیست‌ها، آنها را به موضوعی جذاب برای مطالعات زیستی تبدیل کرده است که از آن جمله می‌توان به یافتن راهکارهایی برای تغییر طول عمر این قارچ‌ها اشاره نمود. ژن los1 با دخالت مستقیم در حمل و نقل tRNA بین هسته و سیتوپلاسم، نقشی کلیدی در تنظیم سرعت رشد قارچ، طول عمر آن و همچنین مقاومت دارویی برعهده دارد. در این پژوهش، ناحیه بالادستی ژن los1 در بین ۱۰ گونه از آسکومیست‌ها بررسی شد. نتایج حاصل پیشنهاد می‌کنند که ناحیه بالادستی ژن los1 در بین آسکومیست‌ها، حاوی جایگاه‌های اتصالی برای فاکتورهای رونویسی SFP1 و FKH1 است. احتمال ضعیفی نیز برای وجود محل اتصال فاکتور رونویسی YAP6 در ناحیه بالادستی این ژن وجود دارد. همچنین حذف این ژن، احتمالا موجب افزایش طول عمر قارچ و افزایش مقاومت آن به برخی از آنتی‌بیوتیک‌ها می‌شود. در حالی که مقاومت آن به گروه دیگر، کاهش می‌یابد. از نتایج این پژوهش، می‌توان در انتخاب هدفمند و هوشمندانه‌تر آنتی‌بیوتیک‌های قارچی استفاده نمود و همچنین، از اطلاعات مربوط به نقش ژن los1 در رشد و طول عمر آسکومیست‌ها، و نیز مقاومت و حساسیت دارویی آن‌ها، در طراحی و ساخت سویه‌های صنعتی بهره گرفت. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

2 - نقش عناصر cis-acting ناحیه پروموتر در تنظیم بیان مکان-زمانی ژن NHX1 پاسخگو به تنش شوری در Triticum aestivum L.
شادی حیدری بهارک حیدری پیوند حیدری

شوری خاک یکی از جدی ترین مشکلات در کشت گندم در ایران است که تأثیر زیان آور بر تولید محصول و رشد گیاه دارد. به منظور بررسی ژن‌های مرتبط با پاسخ به تنش شوری در گندم، تجزیه و تحلیل 3567 برچسب‌ توالی بیان شده (EST) از کتابخانه‌های برگ و ریشه گندم متحمل به شوری جمع‌آوری شده چکیده کامل

شوری خاک یکی از جدی ترین مشکلات در کشت گندم در ایران است که تأثیر زیان آور بر تولید محصول و رشد گیاه دارد. به منظور بررسی ژن‌های مرتبط با پاسخ به تنش شوری در گندم، تجزیه و تحلیل 3567 برچسب‌ توالی بیان شده (EST) از کتابخانه‌های برگ و ریشه گندم متحمل به شوری جمع‌آوری شده از بانک اطلاعاتی دانشگاه هاروارد انجام شد. نرم افزارهای EGassembler، CLCbio و IDEG6 به منظور تجزیه و تحلیل بیان ژن و ابزار طبقه‌بندی مقایسه‌ای GoMapMan به منظور دسته‌بندی کاتالوگ‌های عملکردی استفاده شد. اختلاف آماری معنی‌دار بین ژن‌های دو کتابخانه در 7 گروه کارکردی مشاهده شد. نتایج نشان داد که تبادلگرهای یون NHX1 نقش مهمی در هموستاز یون و تحمل تنش شوری در هر دو بافت برگ و ریشه ایفا می‌کنند. از آنجا که درک کامل سیستم تنظیم رونویسی ژن به تجزیه و تحلیل عملکردی عناصر cis-acting بستگی دارد، بنابراین عناصر تنظیم‌کننده موجود در ناحیه '5 تنظیمی ژن‌های NHX1 با استفاده از پایگاه های داده Plant CARE شناسایی شدند. چندین عنصر تنظیمی مرتبط با فرآیندهای بیولوژیکی، تنظیم هورمونی و پاسخ به تنش‌ها و محرک‌های محیطی شناسایی شدند. این پژوهش بینشی در مورد نقش عناصر cis-acting پروموتر در تنظیم بیان مکان- زمانی ژن NHX1 تحت تنش شوری ارائه می‌دهد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

3 - Molecular and Bioinformatics Analysis of Allelic Diversity in IGFBP2 Gene Promoter in Indigenous Makuee and Lori-Bakhtiari Sheep Breeds
ع. ولی‌پور کوتنایی ا. فرهادی س.ح. حافظیان م. قلی‌زاده

The aim of this study was to perform molecular and bioinformatics analysis of IGFBP2 gene promoter in association with some economic traits in indigenous Makuee (MS) and Lori-Bakhtiari (LB) breeds. DNA was extracted from blood samples of 120 MS and 200 LB and a 297 bp f چکیده کامل

The aim of this study was to perform molecular and bioinformatics analysis of IGFBP2 gene promoter in association with some economic traits in indigenous Makuee (MS) and Lori-Bakhtiari (LB) breeds. DNA was extracted from blood samples of 120 MS and 200 LB and a 297 bp fragment from the upstream sequences of studied gene was amplified and genotyped by single-strand conformational polymorphism (SSCP) technique. Two genotypes of AB and BB were seen in MS and LB breeds. Then one sample from each genotype was send to sequencing. After obtaining the sequencing result, the sequences homology was performed on the National Center for Biological Information NCBI server by basic local alignment search tool (BLAST) program. The alignment of the obtained sequences and their comparison with reference sequences from the Gene Bank were done using CLUSTALW multiple alignment tool of BioEdit software. In addition, the DNASIS MAX software was used to identify DNA motifs. The bioinformatics analysis revealed differences in sequences of IGFBP2 between observed genotypes. Ten motifs in promoter sequence of IGFBP2 genes were seen, so that the CAP_site motif was most abundant in both fragments motif. Statistical analysis using general linear method model (GLM) procedure of SAS software showed significant (P<0.05) association of IGFBP2 with thigh round (TR) trait in Makuee sheep. Further studies in other indigenous sheep breeds and investigation of other genetic regions along with regulatory sites seem to be necessary. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

4 - Distribution of Allele Frequencies at 5′-Flanking Region of CYP19 and ERα Genes between Iranian Simmental and Three Indigenous Cattle Breeds
ف. محمد نژاد سنگدهی ق. رحیمی میانجی م. صفدری شاهرودی س.ع. رضوی-ششده م. غلامی

This study was performed to investigate two polymorphic sites from Cyp19 gene (PvuII and MspI) and one polymorphic site from ERα gene (SnaBI) in four cattle breeds including Mazandarani, Taleshi, Sistani and Simmental. In overall 278 samples for CYP19 and 206 samp چکیده کامل

This study was performed to investigate two polymorphic sites from Cyp19 gene (PvuII and MspI) and one polymorphic site from ERα gene (SnaBI) in four cattle breeds including Mazandarani, Taleshi, Sistani and Simmental. In overall 278 samples for CYP19 and 206 samples for ERα marker sites were genotyped using polymerase chain reactionsingle-strand conformation polymorphism (PCR-RFLP) procedure. For CYP19/PvuII, the frequency of A allele ranged from 0.89 in Mazandarani to 0.98 in Taleshi. For CYP19/MspI, Taleshi was the only monomorphic breed with just AA genotype. Other breeds were polymorphic with A allele frequency ranging from 0.93 (Simmental) to 0.98 (Sistani). No BB individuals were observed in the studied sample. Considering two loci in combination with each other, only 5 out of 8 theoretically possible combined genotypes were observed in the genotyped samples. For ERα/SnaBI, all populations showed polymorphism. The highest and lowest frequencies of A allele were observed in Sistani (0.55) and Simmental (0.96), respectively. Based on Nei’s method, the most genetic distance was observed between Sistani and Simmental and the least genetic distance was observed between Mazandarani and Taleshi breeds. The results of the present study showed significant differences in genotypic and allelic frequencies among four investigated breeds. These findings may be used in further researches, such as association studies for performance traits in cattle breeding. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

5 - بررسی تغییرات بیان LncRNA RMRP و موتاسیون های ناحیه پروموتری ژن RMRP در بیماران مبتلا به سرطان سینه
مجید صادقی زاده ملیحه انتظاری زهره اکبری

10.30495/jdb.2021.680721

زمینه و هدف: تنظیم کننده های بیان ژن و جهش توموری ، ازمارکرهای پیش آگهی دهنده وتشخیصی برای سرطان می باشند. RNAهای بلند غیرکد کننده (lncRNAs) ، درفرآیندهای تنظیمی متعدد نقش دارند. RMRP یک lncRNA می باشد که نقش تنظیمی آن دربرخی ازسرطان هامشخص شده است. با توجه به اهمیت RMR چکیده کامل

زمینه و هدف: تنظیم کننده های بیان ژن و جهش توموری ، ازمارکرهای پیش آگهی دهنده وتشخیصی برای سرطان می باشند. RNAهای بلند غیرکد کننده (lncRNAs) ، درفرآیندهای تنظیمی متعدد نقش دارند. RMRP یک lncRNA می باشد که نقش تنظیمی آن دربرخی ازسرطان هامشخص شده است. با توجه به اهمیت RMRP، به بررسی تغییرات بیان آن که به دنبال موتاسیون های ناحیه پروموتردربیماران مبتلا به سرطان سینه ایجاد می شود، پرداخته شد.روش بررسی: دراین پژوهش بیان LncRNA RMRP با استفاده از تکنیک نیمه کمی RT-PCR ، برروی 25 نمونه توموری و 25 نمونه کنترل حاشیه تومور ارزیابی شد و توسط تکنیک Real time PCR برای تعدادی از نمونه ها تایید گردید. همچنین برای بررسی وجود جهش در ناحیه پروموتری ژن LncRNA RMRP ، استخراج DNA و تعیین سکانس صورت گرفت.یافته ها: بیان RMRP درنمونه های توموری نسبت به نمونه های کنترل، افزایش بیان معناداری نشان داد. RMRP درنمونه های HER2 مثبت نسبت به نمونه های HER2 منفی کاهش بیان و در نمونه های توموری متاستاز مثبت نسبت به نمونه های متاستاز منفی افزایش بیان معناداری را نشان داد. توالی پروموتری ژن RMRP نمونه توموری هیچ جهشی وجود نداشت و تفاوتی با سکانس wild type مشاهده نشد.نتیجه گیری: نتایج بدست آمده در این پژوهش، حاکی از آن است که RMRP می تواند به عنوان تومور مارکر و متاستاز مارکری برای شناسایی گروه های مختلف سرطان سینه پیشنهاد گردد. اما همچنان به بررسی های بالینی و مولکولی بیشتری برای اثبات دقیق تر آن نیاز می باشد. پرونده مقاله

فهرست مقالات پروموتر

سکوی نشر دانش

پیوندهای سایت

مراکز مرتبط

پشتیبانی

صفحات رسمی