• فهرست مقالات آرکیا

      • دسترسی آزاد مقاله

        1 - سیستم CRISPR از مواجهه با یک توالی تکراری مرموز برای تکنولوژی تا ویرایش ژنوم
        مجتبی سهرابی زهرا سادات منزوی زهرا عبداللهی حامد سلمانی سمیه دهقانی سانیج عباس مروتی
        تناوب‌هایِ کوتاهِ پالیندرومِ فاصله‌دارِ منظمِ خوشه‌ای (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) ، سیستم های CRISPR- Cas ، سیستم های ایمنی به دست آمده شناخته شده است که در آرکیا و باکتری ها گسترده است. نوکلئاز های RNA راهنما از سیستم های CRISPR- Cas در چکیده کامل
        تناوب‌هایِ کوتاهِ پالیندرومِ فاصله‌دارِ منظمِ خوشه‌ای (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) ، سیستم های CRISPR- Cas ، سیستم های ایمنی به دست آمده شناخته شده است که در آرکیا و باکتری ها گسترده است. نوکلئاز های RNA راهنما از سیستم های CRISPR- Cas در حال حاضر به عنوان ابزار قابل اعتماد برای ویرایش و مهندسی ژنوم در نظر گرفته شده است. نخستین اشاره به آنها در سال 1987 بود، زمانی که در ژنوم اشرشیا کلای در طول تجزیه و تحلیل ژن های دخیل در متابولیسم فسفات یک توالی DNA تکراری غیر معمول کشف شد ، که پس از آن به عنوان یک CRISPR تعریف شد،. الگوهای توالی مشابه پس از آن در طیف وسیعی از باکتری های دیگر و همچنین در آرکی باکتر های نمک دوست گزارش شده است، که نشان می دهد نقش مهمی برای چنین خوشه های تکاملی حفظ شده از توالی های تکراری دارد. یک گام مهم در جهت مشخص کردن ویژگی سیستمCRISPR-Cas ، شناسایی ارتباط بین CRISPR ها و پروتئین های مرتبط با Cas بود که در ابتدا فرض بر این بود که در تعمیرات DNA درآرکی های گرمادوست دخالت داشته باشد. زیست شناسی ساختاری و بیوشیمی پیشرفته می تواند نه تنها در ویرایش ژنوم بر پایه CRISPR-Cas9 و دیگر سیستم های CRISPR-Cas کلاس II دست به دست هم دهد، بلکه درک منشا و تکامل این سیستم از عناصر متحرک ژنتیکی، نشان دهنده عناصر متحرک ژنتیکی است. پرونده مقاله
      • دسترسی آزاد مقاله

        2 - بهینه سازی شرایط تولید رنگدانه کاروتنویید توسط سویه بومی هالوآرکیا لیپولیتیکال
        معصومه محمدی احمدعلی پوربابایی علی جوادی
        سابقه و هدف: یکی از منابع تولید کننده رنگدانه های کاروتنوییدی آرکیاهای هالوفیلیک می باشند. ویژگی های آنتی اکسیدانی، ضد توموری و رنگدهی کاروتنوییدها موجب به کارگیری آنها در صنایع داروسازی، غذایی و شیلات شده است. این مطالعه با هدف بهینه سازی شرایط تولید رنگدانه کاروتنویید چکیده کامل
        سابقه و هدف: یکی از منابع تولید کننده رنگدانه های کاروتنوییدی آرکیاهای هالوفیلیک می باشند. ویژگی های آنتی اکسیدانی، ضد توموری و رنگدهی کاروتنوییدها موجب به کارگیری آنها در صنایع داروسازی، غذایی و شیلات شده است. این مطالعه با هدف بهینه سازی شرایط تولید رنگدانه کاروتنویید توسط سویه بومی آرکیای هالوفیل، هالوآرکیا لیپولیتیکال انجام شد. مواد و روش ها: این مطالعه به صورت تجربی بر روی هالوآرکیا لیپولیتیکال جداسازی شده در پژوهش های قبلی از آب های بندر بوشهر انجام گرفت. به منظور دست یابی به شرایط بهینه تولید رنگدانه و رشد در هالوآرکیا لیپولیتیکال، عواملی مانند: دما، pH، منابع کربن، منابع نیتروژن، غلظت کلرید سدیم ، تاثیر یون ها و فلزات سنگین و مقایسه آن ها با منحنی استاندارد مورد ارزیابی قرار گرفت. یافته ها: آنالیزهای آماری نشان داد که شرایط بهینه تولید رنگدانه کاروتنویید: دمای 35 درجه سیلیسیوس در ساعت 88 به وزن 39.3 میکروگرم، 8 pH در ساعت 120 به وزن 15.77 میکروگرم، منبع نیتروژنی کازیین پپتون همراه با عصاره مخمر در ساعت 72 به وزن 13.38 میکروگرم، غلظت نمک 16 درصد در ساعت 96 به وزن 15.77 میکروگرم، منبع کربن نشاسته در ساعت 96 به وزن 44.4 میکروگرم و حضور سولفات منگنز در ساعت 120 به وزن 56 میکروگرم می باشد. نتیجه گیری: به دلیل غیر بیماری زا بودن آرکیا، در دسترس بودن منابع رشد و میزان غلظت نمک بالا در محیط کشت، استفاده از این سویه در تولید محصولات کاروتنوییدی در صنایع مختلف پیشنهاد می گردد. پرونده مقاله
      • دسترسی آزاد مقاله

        3 - پپتیدهای ضدمیکروبی آرکیاهای نمک دوست: خواص و کاربرد هالوسین
        سهیلا عباسی گیتی امتیازی
        بروز بالای باکتریهای مقاوم به دارو، در حال حاضر نگرانی عمده سلامت جهانی است و خواستار جستجوی فوری ساز و کارهای ضد میکروبی جدید است. بنابراین عوامل جدید و پپتیدهای ضد میکروبی با یک عملکرد جدید نیاز است. هالوسینها که توسط هالوآرکیاها سنتز میشوند، معمولاً مقاوم به شرایط چکیده کامل
        بروز بالای باکتریهای مقاوم به دارو، در حال حاضر نگرانی عمده سلامت جهانی است و خواستار جستجوی فوری ساز و کارهای ضد میکروبی جدید است. بنابراین عوامل جدید و پپتیدهای ضد میکروبی با یک عملکرد جدید نیاز است. هالوسینها که توسط هالوآرکیاها سنتز میشوند، معمولاً مقاوم به شرایط سخت هستند و این ویژگیها به آنها توانمندی زیادی در زمینه زیست فناوری داده است. در مطالعه حاضر از بانکهای اطلاعاتی مختلف شامل Elsevier databases،Pubmed ،Google Scholar ،Scopus ، MEDLIB،SID ،Magiran ،Iranmedex ، Irandoc استفاده شده و پپتیدهای ضد میکروبی حاصل از آرکیاهای مطرح شده در مقالات منتشر شده در سالهای 1992 تا 2021 استخراج ومطالعه مروری بر روی آنها انجام گرفته است. دلیل استفاده از ترکیبات ضد میکروبی آرکیاها، میتواند ناشی از مکانیسم عمل و دقت در شناسایی مولکول هدف باشد. اما تولید هالوسین خالص به دلیل تکنیکهای مشکل برای کشت آرکیا و خالص سازی ترکیبات فعال تولید شده بسیار مشکل است. به طور کلی، پپتیدهای ضد میکروبی اهدافی جذاب برای توسعه دارو هستند. از کاربردهای مهم هالوسینها میتوان به فعالیت ضد میکروبی، نگهدارنده برای محصولات غذایی شور، حفظ پوست دباغی شده، جلوگیری از صدمات قلبی، فعالیت ضد سرطانی و به عنوان ابزار جذب DNA اشاره کرد. پرونده مقاله