جداسازی و شناسایی مولکولی لیزنی باسیلوس ماکروئیدس از ریشه گندم و بررسی فعالیت ضد قارچی آن علیه گونه های تریکودرمایی

محورهای موضوعی : میکروب شناسی گیاهی

محبوبه چوپان وامرزانی ¹ (کارشناس ارشد، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد دامغان، دانشکده علوم زیستی، گروه میکروب شناسی)
حمیدرضا پردلی ² (استادیار، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد گرگان، دانشکده علوم زیستی, گروه میکروب شناسی)
مجید مقبلی ³ (استادیار، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد دامغان، دانشکده علوم زیستی، گروه میکروب شناسی)

تاریخ دریافت : 1394/02/13 تاریخ پذیرش : 1394/06/24 تاریخ انتشار : 1394/10/11

کلید واژه: ژن 16S rRNA, لیزنی باسیلوس ماکروئیدس, اندوفتیک, آنتاگونیست,

چکیده مقاله :

سابقه و هدف: باکتری لیزنی باسیلوس باکتری اندوفتیک است که از گیاه در برابر شرایط فیزیولوژیکی و زیست محیطی حفاظت می نماید. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی مولکولی باکتری اندوفیت لیزنی باسیلوس ماکروئیدس از ریشه گندم و بررسی فعالیت ضد قارچی آن علیه گونه های تریکودرمایی انجام شد. مواد و روش ها: به منظور جداسازی باکتری های اندوفتیک از عصاره ریشه و ساقه گندم های کشت شده در مناطق مختلف استان مازندران و گلستان استفاده گردید. فعالیت ضد قارچی آن ها با روش کشت متقابل بر روی محیط سیب زمینی دکستروز آگار(PDA) مورد ارزیابی قرار گرفت. پس از استخراج DNA ژنومی، از روش PCR به منظور تکثیر ژن16S rRNA استفاده گردید. به منظور شناسایی دقیق باکتری جداسازی شده، محصول PCR تعیین توالی و ترادف بازی آن BLAST گردید. یافته ها: باکتری جداسازی شده قادر به مهار رشد قارچ های بیوکنترلی بود. نتایج تعیین توالی نشان داد که باکتری جداسازی شده متعلق به جنس لیزنی باسیلوس است و شباهت 99 درصدی به گونه لیزنی باسیلوس ماکروئیدس W1 دارد. نتیجه گیری: این مطالعه اولین گزارش جداسازی لیزنی باسیلوس از گیاه تحت عنوان اندوفتیک است. باکتری اندوفیت جداسازی شده در این بررسی می تواند به منظور استخراج، شناسایی و به کارگیری متابولیت های مهاری آن در طراحی و تولید داروهای ضد قارچی مورد استفاده قرار گیرد.

چکیده انگلیسی:

Background & Objectives: Lysinibacillus is an endophytic bacterium that protects plant against environmental and physiological condition. The purpose of this study was to isolation and molecular identification of Lysinibacillus macroides from wheat roots and to analyse their antifungal activity against Trichoderma spp. Material & Methods: The extract of root and stem cultivated wheats in different areas of Mazandaran and Golestan were used for isolation of endophytic bacteria. Their antifungal activity was evaluated in a dual culture method on the Potato Dextros Agar (PDA) medium. After genomic DNA extraction, 16S rRNA gene was amplified using PCR. Then the PCR product was sequenced by BLAST. Results: The isolated bacteria were able to inhibit the growth of biocontrol fungi. Based on the 16srRNA sequence studies, this bacterium belonged to Lysinibacillus and showed 99% similarity to L. macroides 1w. Conclusion: This study is the first report of isolation of Lysinibacillus from the endophytic plants. The endophytic bacteria isolated in this study can be used for extraction, identification and application of its inhibitory metabolites for design and the production of antifungal agents.