بررسی تغییرات بیانLncRNA SNHG15 در بافت بیماران گلیوبلاستوما مولتی فرم با روش Real Time PCR
محورهای موضوعی : فصلنامه زیست شناسی جانوری
سحر شاکری یکتا
1
(گروه علوم سلولی و مولکولی، دانشکده علوم و فناوریهای نوین، علوم پزشکی تهران، دانشگاه آزاد اسلامی تهران، ایران)
الهام مسلمی
2
(گروه علوم سلولی و مولکولی، واحد تهران شرق، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران)
سویار ساری
3
(گروه علوم سلولی و مولکولی، دانشکده علوم و فناوریهای نوین، علوم پزشکی تهران، دانشگاه آزاد اسلامی تهران، ایران)
فاطمه روح اله
4
(گروه علوم سلولی و مولکولی، دانشکده علوم و فناوریهای نوین، علوم پزشکی تهران، دانشگاه آزاد اسلامی تهران، ایران)
حمیدرضا خیری
5
(گروه زیست فناوری دارویی، دانشگاه علوم پزشکی زنجان، زنجان، ایران)
کلید واژه: Real-time PCR, بیان ژن, گلیوبلاستوما مولتی فرم, SNHG15, LncRNA,
چکیده مقاله :
گلیوبلاستوما یک تومور بدخیم تهاجمی مغز و نخاع است. شواهد متعدد نقش انکوژنی مولکول های RNA طولانی غیرکدکننده (lncRNA) را در طیف گسترده ای از انواع سرطان ها از جمله گلیوما نشان می دهد و بسیار مهم است، با این حال، عملکرد تومورزایی lncRNA در گلیوم تا حد زیادی نامشخص است. شواهد فزاینده نشان داده که lncRNA ها ازجمله LncRNA SNHG15، نقش مهمی در پاتوفیزیولوژی بیماری های انسانی، به ویژه در پاتوژنز و پیشرفت سرطان ها دارند. در این مطالعه 25 بلوک بافت پارافینه مبتلایان به گلیوبلاستوما مولتی فرم و بافت حاشیه توموری جمع آوری و استخراج RNA انجام شد. سنتز cDNA و بررسی بیان SNHG15 با تکنیک Real Time PCR انجام گرفت. منحنی ROC جهت بررسی ارزش بیومارکری رسم و تجزیه و تحلیل آماری توسط GraphPad Prism v.8.0.1 انجام شد. افزایش بیان بالای SNHG15 در نمونه بافت افراد بیمار نسبت به بافت حاشیه توموری به ثبت رسید (0001/0>p ) ارتباط معناداری در بیان این ژن، در بیماران با سنین بیش از 50 سال و کمتر از 50 سال (6573/0p =)، در لوب های پیشانی، گیجگاهی، آهیانه، پس سری (9802/0 p =)، بقا در بیش از 12 ماه و کمتر از 12 ماه (5007/0p =) مشاهده نشد و فقط در جنسیت زن و مرد ارتباط معنادار به ثبت رسید (0001/0p =). بیان LncRNA SNHG15 در بافت توموری بیماران مبتلا به گلیوبلاستوما مولتی فرم بیشتر از بافت حاشیه توموری به ثبت رسید. با بررسی منحنی ROC این احتمال می رود که LncRNA SNHG15 بتواند به عنوان مارکر زیستی مطرح شود اما نیاز به مطالعات بیشتری دارد.
Glioblastoma is an aggressive malignant tumor of the brain and spinal cord. Several lines of evidence indicate an important oncogenic role of highly non-coding RNA (lncRNA) molecules in a variety of cancers including glioma, however, the tumorigenic function of lens in glioma remains largely unclear. Increasing evidence has shown that lncRNAs, including LncRNA SNHG15, play an important role in the pathophysiology of human diseases, especially in the pathogenesis and progression of cancers. In this study, 25 paraffin tissue blocks of patients with glioblastoma multiforme and tumor margin tissue were collected and RNA extracted. Synthesis of cDNA and analysis of SNHG15 expression was done by Real-Time PCR technique. ROC curve was drawn to check the biomarker value and statistical analysis was done by GraphPad Prism v.8.0.1. An increase in the expression of SNHG15 was recorded in the tissue samples of patients compared to the tissue of the tumor margin (p < 0.0001). There was a significant relationship in the expression of this gene in patients aged more than 50 years and less than 50 years (p = 0.6573), Frontal, Temporal, Parietal, Occipital, and Other locations (P value = 0.9802), survival in more than 12 months and less than 12 months (p = 0.5007) was not observed, only in male and female sex (p = 0.0001) was registered. The expression of LncRNA SNHG15 was recorded in the tumor tissue of patients with glioblastoma multiforme more than in the peripheral tumor tissue. By examining the ROC curve, it is possible that LncRNA SNHG15 can be proposed as a biomarker, but it needs more studies.
495(2):1594-1600.
_||_