آنالیزفیلوژنتیکی جمعیتی از گوسفند افشاری با استفاده از توالی HVR-IوcytB میتوکندریDNA
محورهای موضوعی : تکوین جانوری
کیان پهلوان افشاری
1
(گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ورامین-پیشوا، ورامین، ایران)
کلید واژه: تعیین توالی, فیلوژنی, گوسفند افشاری, DNAمیتوکندری, ناحیه HVR1 و CytB,
چکیده مقاله :
سابقه و هدف: در بین نشانگرهای ژنتیکی، توالی یابی ژنوم میتوکندری یکی از بهترین و رایج ترین روش ها برای طبقه بندی ژنتیکی جمعیت ها و گونه های نزدیک به هم، بررسی امکان اشتقاق گونه های مختلف از یک جد مشترک، مطالعه رابطه فیلوژنی هر موجود با سایر گونه ها و نژادها و دستیابی به راهکارهایی برای حفظ ذخایر ژنتیکی می باشد. هدف از این تحقیق تعیین توالی ناحیه HVR1 و CytB از ژنوم میتوکندری گوسفند افشاری می باشد. مواد و روشها: برای انجام این تحقیق تعداد 40 نمونه خون از هر دو جنس از گوسفندان غیر خویشاوند افشاری جمع آوری شد. پس از استخراج DNA، ناحیه HVR1 و CytB توسط پرایمرهای اختصاصی تکثیر شده و تعیین توالی شدند. توالی‌های به‌دست آمده با استفاده از برنامه Chromas Lite 2.01 تجزیه و تحلیل شد. جهت تعیین بالاترین همولوژی توالی گوسفند افشاری از رویه Blast تحت پایگاه NCBI استفاده شد.یافته ها: پس از تعیین توالی، با مقایسه توالی CytB و HVR1 از ژنوم گوسفند افشاری با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژادها از مناطق مختلف جهان به ترتیب 3 هاپلوتیپ و 5 هاپلوتیپ مشاهده شد. علاوه بر این هر دو مقر دارای چندشکلی بالایی بودند.نتیجه گیری: تعیین توالی ژنوم میتوکندری به خوبی می تواند تنوع ژنتیکی و ارتباط خویشاوندی گونه های مختلف گوسفندان را نشان دهد. لذا ابزار قدرتمندی است که می تواند برای بررسی تنوع ژنتیکی سایر نژادهای گوسفندی مورد استفاده قرار گیرد.
Background and objectives: Sheep as a domestic animal have played a key role in food resources of Iranian plateau people and this area is known as the origin of this spice. Among the genetic markers mtDNA sequencing is one of the most useful and common methods employed for inferring phylogenetic relationship among closely related species and population and conservation of species. Materials and Methods: For this study 40 blood samples from unrelated Afshari sheep were collected. The DNA was extracted and the HVR1 and cytB regions of mtDNA were amplified with specific primers using PCR. Results: The HVR1 and cytB of mtDNA of Afshari breed were sequenced, alingned and compared with other breeds from all over the world. Results showed 3 and 5 haplotype respectively. In addition both loci were high polymorphicConclusion: Sequencing of mitochondrial genome can showed genetic variation and genetic relationship between oviane in the world. For this reason it is powerful and applicable tool to determine the level of genetic diversity.
_||_
