List of Articles transition state

• Open Access Article
  • Abstract Page
  • Full-Text
  
  1 - Theoretical Study of Addition Reaction of Carbene and Zigzag Single-walled Carbon Nanotube
  Saeid Abedini Khoramie Shahram Moradi Somayeh Miryousefi Samira Eftekharjoo
  Manuscript profile
• Open Access Article
  • Abstract Page
  • Full-Text
  
  2 - Use of semi empirical method for determination of the activation energy of thermal decomposition of vinyl ethers
  Behnaz Shahrokh Garnik Sargsyan
  Manuscript profile
• Open Access Article
  • Abstract Page
  • Full-Text
  
  3 - ACTIVATION PARAMETERS AND RELATION OF ACTIVATION ENTROPY WITH SOLVENT POLARITY IN THERMAL REARRANGEMENT OF 7,7-DICHLORO-[a,c]- DIBENZO-[4,1,0]-BICYCLOHEPTANE
  Saeed Taghvaei-Ganjali Hassan Kabiri-Fard
  Manuscript profile
• Open Access Article
  • Abstract Page
  • Full-Text
  
  4 - Theoretical investigation of tautomerisation of 3-Amino-1H-1,2,4-Triazol-5(4H)-One by using quantum calculations by DFT method.
  بهزاد چهکندی
  در این تحقیق بررسی توتومریزاسیون و حالت‌های گذار مولکول 3-آمینو-1H-4،2،1- تری‌آزول-5)4H (- اٌن که حاصل از انتقالات 1و3 پروتون بین اتم های اکسیژن و نیتروژن است با استفاده از محاسبات کوانتومی در سطح محاسباتیDFT-B3LYP/6-311++G(d,p)، در فاز گازی و در محیطی با حضور یک و دو م More

  در این تحقیق بررسی توتومریزاسیون و حالت‌های گذار مولکول 3-آمینو-1H-4،2،1- تری‌آزول-5)4H (- اٌن که حاصل از انتقالات 1و3 پروتون بین اتم های اکسیژن و نیتروژن است با استفاده از محاسبات کوانتومی در سطح محاسباتیDFT-B3LYP/6-311++G(d,p)، در فاز گازی و در محیطی با حضور یک و دو مولکول آب انجام شده است. بدین منظور ساختار بهینه توتومرهای مختلف مولکول مورد نظر بدست آمده‌اند. همچنین با استفاده از محاسبات فرکانس در سطح محاسباتی مشابه، خواص ترمودینامیکی تعادل‌های مختلف توتومری از قبیل E∆، H∆، G∆ وKeq بدست آمده‌اند. سپس با استفاده از روش‌های QST2 و QST3 حالت های گذار تعادل‌های توتومری مختلف مولکول3-آمینو-1H-4،2،1- تری‌آزول-5)4H (- اٌن و مقادیر سینتیکی و ترمودینامیکی آنها محاسبه شده‌اند. اثرات تونل‌زنی نیز بر روی سرعت واکنش‌های مربوطه بررسی شده‌اند. نتایج نشان میدهند ثابت سرعت واکنش‌های توتومری مورد بررسی نسبت به اثرات تونل‌زنی حساسیت بالایی دارند و سرعت واکنش های توتومری در حدود چهار تا پنج برابر افزایش می‌یابند. همچنین محاسبات حالت گذارنشان می دهند در غیاب مولکول‌های آب سد انرژی مقدار بالایی دارد و سرعت واکنش های توتومری عمدتاً بدون حضور کاتالیزور خیلی آهسته بوده به عبارتی انجام‌پذیر نیستند. Manuscript profile
• Open Access Article
  • Abstract Page
  • Full-Text
  
  5 - Investigation of C-O tautomerism in a derivative of Flucytosine: A DFT study
  بهزاد چهکندی
  In this research investigation of tautomerism and transition states of 6-Hydroxy 5-Flourocytosine from 1,3 proton transfer between oxygen and carbon atoms in the gas phase and in solution and in a micro hydrated environment with 1-3 water molecules was performed by quan More

  In this research investigation of tautomerism and transition states of 6-Hydroxy 5-Flourocytosine from 1,3 proton transfer between oxygen and carbon atoms in the gas phase and in solution and in a micro hydrated environment with 1-3 water molecules was performed by quantum calculations at the DFT/B3LYP/6-31++G(d,p) level of theory. For this purpose, the optimized geometries of various tautomers of the desired molecule were obtained. Also by using frequency calculations at the same level thermodynamic properties of different tautomeric equilibriums such as ΔE, ΔH, ΔG and Keq were obtained. Then transition states of various tautomeric interconversion of 6-Hydroxy 5-Flourocytosine and it’s kinetic and thermodynamic amounts were calculated by QST2 and QST3 methods. And also the tunneling effects on rates of reaction were investigated. The results show in both gas phase and solution, rate constants of tautomeric reactions have high sensitivity on tunneling effects and rate of tautomeric interconversion increase by about five or more. Also transition state calculations show in absence of water assisted molecules the tautomeric interconversion reacctions have high barrier energy and so are very slow, in other word they can not be done Manuscript profile
• Open Access Article
  • Abstract Page
  • Full-Text
  
  6 - Theoretical investigation of Curtius rearrangement of oxalyl di azide molecule using quantum calculations in gas phase and solution
  Roghaye Taheryan بهزاد چهکندی Ehsan Zahedi
  In this study, was investigated the Curtius rearrangement reaction of the molecule oxalyl diazide (ODA) for syn-syn and anti-anti-conformers in the gas and solvent phases ( water and cyclohexane ). the syn-syn and anti-anti-ODA conformers and transition states related t More

  In this study, was investigated the Curtius rearrangement reaction of the molecule oxalyl diazide (ODA) for syn-syn and anti-anti-conformers in the gas and solvent phases ( water and cyclohexane ). the syn-syn and anti-anti-ODA conformers and transition states related to their rearrangement reactions are optimized in the gas phase using by Density functional theory (DFT) at computational levels WB97XD, M06-2X, B3LYP and the basis sets 6-311 ++ G (2d, d, p) and the CBS-QB3 method .in the solvent phase, calculations have been performed at the level of B3LYP / 6-311 ++ G (2d, d, p).the syn-syn conformer through a concerted mechanism and anti-anti-conformer using a stepwise mechanism product Carbonyl di isosyanate (CAI) , respectively by passing 1 and 2 transition states under curtius rearrangement.in the concerted mechanism the Gibbs free activation energy of the path went is less than the return path of the reaction, in other words, the Gibbs free activation energy of the return path is about 4 times the path went reaction.in the step wise mechanism, the first stage is the endothermic and the second stage is the exothermic process. Manuscript profile