• Home
  • محمد هادی سخاوتی

    List of Articles محمد هادی سخاوتی


  • Article

    1 - بررسی بیوانفورماتیکی پپتید بتا دفنسین گیاهی و همسانه سازی ژن کد کننده‌ی این پپتید در وکتور بیانیpAMJ1653 در باکتری لاکتوکوکوس لاکتیس
    Iranian Plant and Biotechnology , Issue 2 , Year , Autumn 2024
    استفاده مکرر و بیش از حد ازآنتی‌بیوتیک‌ها در صنعت دامپزشکی موجب مقاومت باکتری‌های بیماریزا نسبت به انواع آنتی-بیوتیک‌های رایج گردیده است. با توجه به این مسئله، محققان به دنبال روش‌های جدیدی برای جایگزین کردن آنتی‌بیوتیک‌ها می‌باشند که می‌توان به پپتید‌های ضدمیکروبی (AMP More
    استفاده مکرر و بیش از حد ازآنتی‌بیوتیک‌ها در صنعت دامپزشکی موجب مقاومت باکتری‌های بیماریزا نسبت به انواع آنتی-بیوتیک‌های رایج گردیده است. با توجه به این مسئله، محققان به دنبال روش‌های جدیدی برای جایگزین کردن آنتی‌بیوتیک‌ها می‌باشند که می‌توان به پپتید‌های ضدمیکروبی (AMP) اشاره کرد. لذا؛ هدف از مطالعه حاضر بررسی بیوانفورماتیکی اثر افزودن his taq بر فعالیت ضدباکتریایی پپتید بتا‌دفنسین گیاهی و همسانه‌سازی ژن کدکننده آن در وکتور بیانیpAMJ1653 در باکتری لاکتوکوکوس‌لاکتیس است. ساختار سوم پپتید بتادفنسین همراه با his-taq از طریق I-TASSER پیش بینی شد و توسط نرم افزارهای SAVE 6 و prosA صحت سنجی گردید. در نهایت داکینگ مولکولی از طریق نرم افزار Cluspro بین بتا دفنسین با و بدون توالی his-taq با آنتی‌ژن LPTD باکتری اشرشیاکلای انجام شد. در بخش آزمایشگاهی، ژن بتادفنسین همراه با توالی his-taq و سیگنال ترشحی در وکتور تکثیری pGEM-DFF و میزبان تکثیری DH5α مورد استفاده قرار گرفت. پس از استخراج پلاسمید و هضم آنزیمی توسط آنزیم‌های Sap1 و Sal1ژن بتادفنسین گیاهی به داخل وکتور بیانیpAMJ1653 همسانه‌سازی گردید و با استفاده از روش الکتروپویشن به داخل باکتری لاکتوکوکوس لاکتیس سویه 1543 انتقال یافت. کلونی‌های مثبت حاوی وکتور نوترکیب با روش کلونی PCR بررسی و در نهایت هضم آنزیمی صورت گرفت. در بخش بیوانفورماتیک، ساختار سوم ساختار با صحت قابل قبولی پیش بینی شد. نتایج داکینگ نشان داد پپتید بتادفنسین با و بدون his-taq به آنتی‌ژن LPTDدر موقعیت مناسب در تماس است. در بخش آزمایشگاهی نشان داده شد که ژن کد کننده بتا دفنسین گیاهی با موفقیت در وکتور بیانی pAMJ1653 همسانه‌سازی شد. Manuscript profile