• Home
  • علی رضا نیازمند

    List of Articles علی رضا نیازمند


  • Article

    1 - تعیین فراوانی آلل های تیپ های آمیزشی در جمعیت های آلترناریا آلترناتا مرکبات جنوب کشور با روش واکنش زنجیره ای پلی مراز
    Journal of Microbial World , Issue 2 , Year , Autumn 2016
    سابقه و هدف: تاکنون فرم جنسی برای گونه آلترناریا آلترناتا گزارش نشده است. اما سطوح بالایی از تنوع ژنتیکی و ریخت شناسی مشاهده شده در بین جمعیت های این قارچ بیانگر وجود مکانیسم های ناشناخته و مرموز تولید مثل جنسی است. در قارچ های آسکومیستی مشابه با این قارچ، تولید مثل جنس More
    سابقه و هدف: تاکنون فرم جنسی برای گونه آلترناریا آلترناتا گزارش نشده است. اما سطوح بالایی از تنوع ژنتیکی و ریخت شناسی مشاهده شده در بین جمعیت های این قارچ بیانگر وجود مکانیسم های ناشناخته و مرموز تولید مثل جنسی است. در قارچ های آسکومیستی مشابه با این قارچ، تولید مثل جنسی توسط یک ژن گاه منفرد به نام MAT1 کنترل می شود که دارای دو آلل MAT1-1 و MAT1-2 می باشند. این مطالعه با هدف تعیین فراوانی و نحوه پراکنش آلل های ژن MAT1 در جمعیت قارچ آلترناریا آلترناتا مرکبات جنوب کشور انجام شد. مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی- توصیفی، استخراج DNA با روش CTAB، از ریسه های جوان نمونه های برگی 45 جدایه قارچ آلترناریا آلترناتا که قبلاً از گونه ها و ارقام مختلف باغات مرکبات جنوب کشور جمع آوری و خالص سازی شده بودند، انجام گردید. به منظور تعیین تیپ های آمیزشی، از آغازگرهای اختصاصی برای تکثیر ناحیه های MAT1-1 و MAT1-2 در واکنش زنجیره ای پلی مراز استفاده شد. یافته ها: جدایه های تیپ های آمیزشی MAT1-1 و MAT1-2 به ترتیب تکثیر قطعات 642 و 882 جفت بازی را داشتند. به طور کلی تیپ های آمیزشی در این ناحیه از فراوانی مساوی برخوردار نبودند. در مجموع، 16 جدایه دارای تیپ آمیزشی MAT1-1 و 29 جدایه دارای تیپ آمیزشی MAT1-2 بودند. فراوانی های تیپ های آمیزشی در شهرستان های مختلف و در گونه های مختلف مرکبات متفاوت بود. نتیجه گیری: نتایج نشان داد که در برخی از مناطق جنوب کشور و در برخی از میزبان ها عوامل ناشناخته ای در القای مرحله جنسی قارچ آلترناریا آلترناتا دخالت دارند. Manuscript profile

  • Article

    2 - بررسی تنوع ژنتیک جدایه های قارچ آلترناریا عامل بیماری لکه برگی مرکبات به روش IGS-RFLP
    Journal of Microbial World , Issue 2 , Year , Summer 2013
    سابقه و هدف: امروزه به منظور بررسی تفاوت های درون گونه ای و نژادی از روش RFLP ناحیه IGS استفاده می شود. این مطالعه با هدف شناسایی گونه های بیماری زای آلترناریا عامل تولید لکه برگی مرکبات با استفاده از روش های مورفولوژیک و توالی یابی ناحیه ITS1 در شهرستان ممسنی و نیز برر More
    سابقه و هدف: امروزه به منظور بررسی تفاوت های درون گونه ای و نژادی از روش RFLP ناحیه IGS استفاده می شود. این مطالعه با هدف شناسایی گونه های بیماری زای آلترناریا عامل تولید لکه برگی مرکبات با استفاده از روش های مورفولوژیک و توالی یابی ناحیه ITS1 در شهرستان ممسنی و نیز بررسی تفاوت های ژنتیکی جدایه های این قارچ بر اساس RFLP ناحیه IGS انجام گردید. مواد و روش ها: این پژوهش به صورت مقطعی- توصیفی بر روی70 نمونه برگی گونه ها و ارقام مختلف مرکبات دارای علایم ظاهری مانند لکه قهوه ای و لکه برگی جمع آوری شده از باغات مرکبات شهرستان ممسنی در پاییز سال 1390 انجام شد. نمونه ها بر روی محیط سیب زمینی آگار کشت گردیدند. پس از خالص سازی قارچ به روش تک اسپور، شناسایی گونه ها با استفاده از بررسی خصوصیات مورفولوژیک انجام گرفت. اثبات بیماری زایی جدایه ها با استفاده از اصول کخ روی برگ ها صورت گرفت. تکثیر نواحیITS1 و IGS با استفاده از آغازگرهای اختصاصی انجام پذیرفت. ناحیه ITS1 جدایه ها توالی یابی شدند و ناحیه IGS پس از برش با استفاده از آنزیم های برش دهنده با روش RFLP ارزیابی شد. یافته ها: تمامی جدایه های مورد بررسی از لحاظ مورفولوژیک و توالی یابی ناحیه ITS1 به عنوان گونه آلترناریا آلترناتا شناسایی شدند. دندروگرام ترسیمی برای الگوهای برشی آنزیم های مورد استفاده، جدایه ها را در 3 گروه متمایز قرار داد. جدایه هایی که از ارقام پرتقال جمع آوری شده بودند همگی در یک گروه و جدایه های لیمو در یک گروه متمایز دیگر قرار گرفتند. همچنین جدایه لیموشیرین ویکوا در یک گروه کاملاً مجزا از سایر جدایه ها قرار گرفت. نتیجه گیری: نتایج نشان داد که به کارگیری الگوهای برش آنزیمی ناحیه IGS می تواند مشکل مربوط به طبقه بندی جدایه های آلترناریا آلترناتا مرکبات بر حسب نوع میزبان را که در حال حاضر مورد بحث بسیار زیادی می باشد تاحدودی حل نماید. Manuscript profile