بیماری التهابی روده، بیماری مزمن دستگاه گوارش است و درمان قطعی دارویی برای این بیماری وجود ندارد. اگر از پیشرفت این بیماری جلوگیری نشود موجب بروز بیماری های خطرناکی از جمله سرطان روده بزرگ می شود. سیانوباکتری اسپیرولینا یک منبع منحصر به فرد از مواد زیست فعال طبیعی با خواص بالقوه در سلامت زایی می باشد. هدف مطالعه حاضر، تهیه آنزیم سیستئین پروتئاز میوه کیوی و بهینه سازی استخراج پپتید زیست فعال اسپیرولینا پلاتنسیس توسط آنزیم سیستئین پروتئاز و بررسی خاصیت ضدالتهابی پپتیدهای استخراج شده اسپیرولینا در موش های مبتلا به التهاب روده می باشد. بدین منظور از روش سطح پاسخ RSM عملکرد بهینه آنزیم مشخص شد و پپتیدهای استخراج شده در خشک کن انجمادی خشک و برای تعیین وزن مولکولی پپتید، الکتروفورز SDS page space گردید. پپتیدهای حاصل در دمای 20- درجه نگهداری شد. جهت بررسی اثرات ضدالتهابی در 28 سر موش Balb/C با اسیداستیک چهار درصد التهاب القا گردید. پس از اطمینان از التهاب پپتید با غلظت (8/3 میلی گرم بر کیلوگرم) و داروی امپرازول به عنوان کنترل مثبت و آب به عنوان کنترل منفی به موش های Balb/C مبتلا به زخم روده، گاواژ انجام شد. نتایج نشان داد وزن مولکولی آنزیم سیستئین پروتئاز 24 کیلودالتون است و بهینه شرایط هیدرولیز آنزیمی سیستئین پروتئاز در دمای 60 درجه سانتی گراد، زمان 210دقیقه و pH 5/7 بدست آمد. نتایج بافت شناسی وجود التهاب در گروه شاهد و در موش هایی که پپتید با غلظت 8/3 میلی گرم بر کیلوگرم بافت روده ترمیم، کریپت و مخاط روده در طول درمان کاملاً بازسازی شده بود را نشان داد. آنزیم آلکالین فسفاتاز در موش هایی که پپتید دریافت کردند پایین آمده که نشانه بهبود التهاب در موش ها است. در نتیجه پپتیدهای زیست فعال اسپیرولینا توانسته التهاب موجود در روده موش ها را درمان کند. Manuscript profile