• Home
  • Leila Khalatbari

    List of Articles Leila Khalatbari


  • Article

    1 - Protein Secondary Structure Prediction: a Literature Review with Focus on Machine Learning Approaches
    Journal of Computer & Robotics , Issue 1 , Year , Winter 2015
    DNA sequence, containing all genetic traits is not a functional entity. Instead, it transfers to protein sequences by transcription and translation processes. This protein sequence takes on a 3D structure later, which is a functional unit and can manage biological inter More
    DNA sequence, containing all genetic traits is not a functional entity. Instead, it transfers to protein sequences by transcription and translation processes. This protein sequence takes on a 3D structure later, which is a functional unit and can manage biological interactions using the information encoded in DNA. Every life process one can figure is undertaken by proteins with specific functional responsibilities. Consequently protein function prediction is a momentous task in bioinformatics. Protein function can be elucidated from its structure. Protein secondary structure prediction has attracted great attention since it’s the input feature of many bioinformatics problems. The variety of proposed computational methods for protein secondary structure prediction is very extensive. Nevertheless they couldn’t achieve much due to the existing obstacles such as abstruse protein data patterns, noise, class imbalance and high dimensionality of encoding schemes of amino acid sequences. With the advent of machine learning and later ensemble approaches, a considerable elevation was made. In order to reach a meaningful conclusion about the strength, bottlenecks and limitations of what have been done in this research area, a review of the literature will be of great benefit. Such review is advantageous not only to wrap what has been accomplished by far but also to cast light for the future decisions about the potential and unseen solutions to this area. Consequently in this paper it’s aimed to review different computational approaches for protein secondary structure prediction with the focus on machine learning methods, addressing different parts of the problem’s area. Manuscript profile

  • Article

    2 - ساختار پسامدرن به مثابه‌ی الگوی اصلی جامعه شناختی در آثار فیلیپ سولرس
    Social Research , Issue 5 , Year , Winter 2019
    به‌منظور تعیین جایگاه سولرس در جامعه و ادبیات معاصر فرانسه و تاثیر پسامدرنیسم به مثابه‌ی یکی از اصلی‌ترین الگوهای جامعه شناختی بر ساختار نوشتار او چه درزمینه‌ی رمانی و چه درزمینه‌ی جستاری، شناخت ویژگی‌های بارز آثارش ضروری است که مهم‌ترینِ آن‌ها عبارت‌اند از حضور مؤلفه‌ه More
    به‌منظور تعیین جایگاه سولرس در جامعه و ادبیات معاصر فرانسه و تاثیر پسامدرنیسم به مثابه‌ی یکی از اصلی‌ترین الگوهای جامعه شناختی بر ساختار نوشتار او چه درزمینه‌ی رمانی و چه درزمینه‌ی جستاری، شناخت ویژگی‌های بارز آثارش ضروری است که مهم‌ترینِ آن‌ها عبارت‌اند از حضور مؤلفه‌های ساختاری پسامدرن همچون نقل‌قول، انواع بینامتنیت و سرعت‌بالای روایت داستان‌؛ همچنین پرهیز از هرگونه اضافه گویی و درنتیجه ریتم بسیار سریع روایت‌، رفت‌وآمد پرسوناژ بین رُمان و جستار، وام‌گیری از ادبیات اجتماعی، وفور مولفه‌های جامعه شناختی و درنهایت نوع لحن و زبان پرسوناژهای داستان از طبقات اجتماعی مختلف . این مؤلفه‌ها را می‌توان تعیین‌کننده‌ی سبک نوشتاری فیلیپ سولرس دانست. در مقاله‌ی پیشِ رو، سعی خواهیم کرد این مؤلفه‌های ساختاری پسامدرن را به‌صورت موردی و با به‌کارگیری مثال‌های ملموس بررسی کنیم تا درنهایت به این نکته‌ی بسیار مهم دست پیدا کنیم که اگر جهانِ آثار ارزشمند سولرس، که بازنمای منبعی غنی از الهام و الگوهای زیبایی‌شناختی و جامعه شناختی است، در جایگاه بالایی قرار دارد، به دلیل وجود ساختارهای اصلی تشکیل‌دهنده‌ی پسامدرنیسم موجود در جامعه‌ی معاصری است که او در جستارها و رمان‌هایش به تصویر کشیده است. Manuscript profile