تعیین خصوصیات مولکولی نژادهای بز بومی عراق با استفاده از نشانگرهای RAPD

Subject Areas : Camel

Y. Muhammad Salih Al-Barzinj ¹ , ر. اسمات اوراماری ² , ر. عبد الغنی ال-سنجوری ³

1 - Department of Animal Resources, College of Agriculture, University of Salahaddin, Erbil, Iraq
2 - Department of Animal Production, Faculty of Agriculture, University of Duhok, Duhok, Iraq
3 - Department of Animal Science, College of Veterinary, University of Mosul, Mosul, Iraq

Received: 2016-01-07 Accepted : 2016-04-01 Published : 2016-09-01

Keywords: تنوع ژنتیکی, کشمیر, مرز, بز سیاه و نژادهای شامی,

Abstract :

کشمیر تنها توسط نژاد بز مرخز (مرز یا کردی) در ناحیه کردستان عراق تولید می­شود. هدف از این مطالعه بررسی تنوع ژنتیکی تیپ­های رنگی مرخز، بز سیاه و نژادهای شامی با استفاده از نشانگرهای RAPD بود. 14 آغازگر استفاده شده و 9 نشانگر از بین آنها بر مبنای تعداد نوارها (NB) و خصوصیات چندشکلی انتخاب گردیدند. این نشانگرها 154 نوار در محدوده 100 تا 2800 جفت باز تولید کردند. در بین کل نوارها، تنها 50 نوار چند شکل تشخیص داده شدند. 13 نوار منحصر به فرد در بز مرخز شناسایی گردیده و بیشترین تعداد نوارهای منحصر به فرد نیز در آغازگر ژنگاه 7-MO2 به دست آمد. تنوع ژنی کُل نِی (تنوع ژنی تقسیم بر هتروزیگوسیتی) به طور متوسط 40/0 بود. ولی شاخص تنوع شانون برابر با 58/0 (بین 45/0 تا 69/0) بود. در درختان تبارنما سه خوشه مشاهده گردید. خوشه اول شامل نژاد بز سیاه و خوشه دوم شامل نژاد بز شامی با بز سیاه و بز مرخز قهوه­ای روشن بود. خوشه سوم نیز شامل بزهای مرخز سفید و قهوه­ای تیره گردید. تیپ­های رنگی مرخز در یک خوشه که حاوی تیپ­های سفید و قهوه­ای تیره بودند گروه­بندی گردیده و تیپ­های سیاه با قهوه­ای روشن در خوشه دیگری قرار گرفتند. این نتایج نشان می­دهند که نژاد بز مرخز قرابت بیشتری با بز شامی در مقایسه با نژاد بز سیاه دارد.

References:

Adam A.A., Hamza N.B., Salim M.A. and Khaleil K.S. (2015). Genetic diversity among three goat breeds in Saudi Arabia using DNA markers. J. Global Vet. 15(3), 304-308.

Anous M.R., Rashed M.A., Metawi H.R.M. and Saad Y.M. (2009). Identification of fecundity gene in Egyptian goats using genetic markers II. Molecular polymorphic markers. Egyptian J. Sheep. Goat. Sci. 4(1), 1-19.

Bearden H.J. and Fuquay J.W. (2000). Applied Animal Reproduction. Prentice HallInc.UpperSaddleRiver. New Jersey.

El-Tarras A.E., Shahaby A.F. and Banaja A.E. (2015). Assessment of genetic diversity in Saudi goats, Saudi Arabia using genetic finger printing. Int. J. Curr. Microbiol. App. Sci. 4(4), 223-231.

FAO. (2007). Food and Agriculture Organization Statistical Database. Available at: http://faostat. fao.org/site/497/default.aspx.

FAO. (2009). Food and Agriculture Organization of the United Nations the State of Food Insecurity in the World.

Galal S. (2005). Biodiversity in goats. Small Rumin. Res. 60, 75-81.

Henderson C.R. (1984). Application of Linear Models in Animal Breeding. University of Guleph Publications, Guelph, Canada.

Kanaan A., Issa B. and Lawand S. (2014). Evaluation of genetic diversity in Shami goats using inter-simple sequence repeat technique (ISSR). J. Damascus Univ. Agric. Sci. 30(1), 141-150.

Kumari N., Singh L.B. and Kumar S. (2013). Molecular characterization of goats using random amplified polymorphism DNA. Am. J. Anim. Vet. Sci. 8(1), 45-49.

Marle-Koster E.V. and Nel L.H. (2003). Genetic markers and their application in livestock breeding in South Africa. South African J. Anim. Sci. 33, 1-10.

Mason I.L. (1981). Breeds. Pp. 57-110 in Goat Production. C. Gall Ed. Academic Press, London, England.

Moradi M.H., Rostamzadeh J., Rashidi A., Vahabi K. and Farahmand H. (2014). Analysis of genetic diversity in Iranian mohair goat and its color types using Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) markers. J. Agric. Commun. 2(1), 55-62.

Oliveira R.R., Andrea A.E., Maria N.R., Samuel R.P., Maria S.M., Silvia R.C., Arthur D.M. and Manuel A. (2005). Genetic characterization of the Moxotó goat breed using RAPD markers. Pesq. Agropec. Br. 40(3), 233-239.

Oliver J.J., Cloete S.W., Schoeman S.J. and Muller C.J.C. (2005). Performance testing and recording in meat and dairy goats. Small Rumin. Res. 60, 89-93 .

Raymond M. and Rousset F. (1995).GENEPOP (version 3.3): Population genetics software for exact tests and ecumenicism. J. Heredity. 86, 248-249.

Scherf B.D. (2000). World Watch List of Domestic Animal Diversity. Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO), Rome, Italy.

Steele M. (1996). The Tropical Agriculturalist: Goats. Macmillan. Education Ltd. London and Basingstoke. UK.

Sulaiman B.K. (2012). Evaluation of the genetic diversity in Iraqi local breeds of goat using random amplified polymorphic DNA markers. Al-Anbar J. Vet. Sci. 5(1), 179-176.

Vahidi S.M., Tarang A.R, Naqvi A., Anbaran M.F., Boettcher P., Joost S., Colli L., Garcia J.F. and Ajmone-Marsan P. (2014). Investigation of the genetic diversity of domestic Capra hircus breeds reared within an early goat domestication area in Iran. Genet. Select. Evol. 46, 27-35.