شماره 31 دوره 9

دسترسی آزاد مقاله

1 - سنتز، ساختار و انتساب های ارتعاشی کمپلکس بیس(3-آمینو- 1- فنیل-2-بوتن-1-اوناتو) نیکل(II)
مینا جامی الاحمدی

بیس(3-آمینو- 1- فنیل-2-بوتن-1-اوناتو) نیکل(II)، Ni(APBO)2، سنتز شد و داده های کریستالوگرافی بهبود یافته اشعه X آن ارائه گردید. ساختار مولکولی این ترکیب با استفاده از محاسبات نظریه تابعی چگال (DFT) مورد بررسی قرار گرفت و نتایج با داده های تجربی مقایسه شد. فرکانس‌های ارتع چکیده کامل

بیس(3-آمینو- 1- فنیل-2-بوتن-1-اوناتو) نیکل(II)، Ni(APBO)2، سنتز شد و داده های کریستالوگرافی بهبود یافته اشعه X آن ارائه گردید. ساختار مولکولی این ترکیب با استفاده از محاسبات نظریه تابعی چگال (DFT) مورد بررسی قرار گرفت و نتایج با داده های تجربی مقایسه شد. فرکانس‌های ارتعاشی هماهنگ Ni(APBO)2 در روش B3LYP با استفاده از مجموعه پایه‌ 6-311G* بدست آمد و همه شیوه‌های ارتعاشی IR و Raman در این سطح محاسبه شد.. فرکانس‌های ارتعاشی محاسبه شده با نتایج تجربی مقایسه شد. توافق خوبی بین فرکانس‌های نظری مقیاس پذیر و پارامترهای ساختاری با داده های تجربی وجود دارد. بر اساس داده‌های تجربی و محاسباتی، پیوند فلز-لیگاند در این کمپلکس، قوی‌تر از ترکیبات Cu(APBO)2 ، Ni(APO)2 و Cu(APO)2 است. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

2 - تحلیل و بررسی کنفورماسیونی دی‌پپتید محافظت شده For-L-Ser-L-Ala-NH2 با استفاده از محاسبات کوانتومی: مطالعه‌ای به روش DFT
بهزاد چهکندی رضوان محمدآبادی مهدی نکوئی

ددر این مطالعه کنفورماسیون‌های مختلف دی‌پپتید For-Ser-Ala-NH2 ‌با استفاده از روشDFT درسطح محاسباتی B3LYP/6-31G(d) مورد بررسی و تحلیل قرار گرفته است. بدین منظور 54 کنفورماسیون حاصل از تغییر زوایای دووجهی زنجیر جانبی سرین و زنجیر اصلی دی‌پپتید Ser-Ala ( و ) را بهینه نموده چکیده کامل

ددر این مطالعه کنفورماسیون‌های مختلف دی‌پپتید For-Ser-Ala-NH2 ‌با استفاده از روشDFT درسطح محاسباتی B3LYP/6-31G(d) مورد بررسی و تحلیل قرار گرفته است. بدین منظور 54 کنفورماسیون حاصل از تغییر زوایای دووجهی زنجیر جانبی سرین و زنجیر اصلی دی‌پپتید Ser-Ala ( و ) را بهینه نموده و با استفاده از محاسبات فرکانس در سطح مشابه ساختارهای پایدار و مقادیر ترمودینامیکی مربوطه بدست آمده-اند. از بین 54 کنفورماسیون‌های مورد بررسی در این پژوهش، 35 کنفورماسیون یافت شدند و 19 کنفورماسیون یافت نشدند. کنفورمرهایی که یافت نشدند به ساختار هندسی دیگری با سطح انرژی پایین‌تر و پایدارتر مهاجرت نموده‌اند. از بین 35 کنفورماسیون یافت شده پایدارترین و ناپایدارترین کنفورماسیون بوده که اختلاف انرژی نسبی بین این دو 64/14 کیلوکالری بر مول است. همچنین از میان 19 کنفورماسیون یافت نشده با ساختارهای کلی و ، مهاجرت به کنفورمر برای باقیمانده‌های سرین و آلانین، بیشترین مهاجرت بوده است، به عبارتی کنفورمر باعث پایداری بیشتر ساختار دی‌پپتید می‌شود. کلمات کلیدی: دی‌پپتید، For-Ser-Ala-NH2 ، نقشه راماچاندران، زنجیر جانبی ، DFT . پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

3 - بررسی نظری پیوند هیدروژنی درون مولکولی در مشتقات هالو، متوکسی و سیانو- مالون آلدهید
هادی زارع یوسفخانی محمد وکیلی وحیدرضا داروگر

پیوند هیدروژنی درون مولکولی (IHB) مالون آلدهید به عنوان ساده ترین سیستم پیوند هیدروژنی تقویت شده با رزونانس در گروه متقارن O-H…O را انتخاب کرده و مشتقات هالوی آن (F ، Cl وBr )، متوکسی و سیانو در سطح تئوری DFT B3LYP / 6-311 ++ G ** مورد بررسی قرار گرفته است. محاسب چکیده کامل

پیوند هیدروژنی درون مولکولی (IHB) مالون آلدهید به عنوان ساده ترین سیستم پیوند هیدروژنی تقویت شده با رزونانس در گروه متقارن O-H…O را انتخاب کرده و مشتقات هالوی آن (F ، Cl وBr )، متوکسی و سیانو در سطح تئوری DFT B3LYP / 6-311 ++ G ** مورد بررسی قرار گرفته است. محاسبات پارامترهای توپولوژیکی، ساختاری، NBO و طیف سنجی را نیز در همان سطح برای آنها انجام دادیم. همبستگی خطی خوب بین انرژی پیوند هیدروژنی از طریق معادله اسپینوزا و پارامترهای محاسباتی از قبیل طول پیوند هیدروژنی، طول پیوند کووالانسی، فاصله دو اتم اکسیژن، زاویه سیستم پیوند هیدروژنی، پارامترهای توپولوژیکی از قبیل چگالی و لاپلاسین در نقاط بحرانی پیوند هیدروژنی و حلقه کی لیتی، پارامترهای NBO از جمله مرتبه پیوند پیوند هیدروژنی و انرژی برهمکنش فوق مزدوج شدن lp (O) → σ * (O-H) و همچنین پارامترهای طیف سنجی از جمله فرکانس ارتعاش کششی و خمشی O-H و جابجایی شیمایی محاسباتی هیدروژن پل در فاز گازی و محلول به دست آمد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

4 - مطالعه اثر گیاه بومادران بر روی هلیکوباکترپیلوری باکمک روش شبیه سازی داکینگ ملکولی
خدیجه توکلی هفشجانی فاطمه رئیسی سرتیشنیزی الهه صابری

چکیده مقاومت هلیکوباکترپیلوری نسبت به آنتی بیوتیک‌های رایج علت اصلی پایین بودن درصدریشه‌کنی این باکتری درکشورهای درحال توسعه می‌باشد.به همین دلیل نیاز به یک داروی جایگزین برای درمان عفونت هلیکوباکترپیلوری وجود دارد.داروی جدید باید موثر،کم عارضه ،همراه با اثرات خوب برعلی چکیده کامل

چکیده مقاومت هلیکوباکترپیلوری نسبت به آنتی بیوتیک‌های رایج علت اصلی پایین بودن درصدریشه‌کنی این باکتری درکشورهای درحال توسعه می‌باشد.به همین دلیل نیاز به یک داروی جایگزین برای درمان عفونت هلیکوباکترپیلوری وجود دارد.داروی جدید باید موثر،کم عارضه ،همراه با اثرات خوب برعلیه هلیکوباکترپیلوری بوده ودرضمن موجب مقاومت باکتری نسبت به دارو نگردد.استفاده از گیاهان دارویی یکی از راه های حل معضل مقاومت میکروبی به شمار می آید.زیرا ترکیبات ثانویه گیاهان مولکول‌های پیچیده ای هستند که تعدادزیادی از آن‌ها دارای فعالیت های بیولوژیک می‌باشند.توجه محققان به ترکیب های موثر گیاهی ،به عنوان راه حلی برای معضل مقاومت هلیکوباکترپیلوری نسبت به آنتی بیوتیک‌های رایج است ویکی ازآن ها گیاه بومادران می‌باشد که ترکیبات آن سبب ازبین بردن هلیکوباکترپیلوری می‌شود همچنین مطالعات تجربی نشان داد که آنزیم اوره‌آز این باکتری سبب حیات آن در معده می‌شود پس این فرض به وجود آمد که ترکیبات گیاه بومادران ممکن است بر روی آنزیم اوره آز تآثیر داشته باشند مبحث طراحی دارویی گیاهی برای مقابله با هلیکوباکترپیلوری می باشد که با استفاده از شبیه سازی داکینگ مولکولی ونرم افزار اتوداک۴ انجام شد آلفاپنین با انرژی آزاد اتصال(5/15-) وکاریوفلین اکسید با انرژی آزاد اتصال(5/43-) وبیسموت با انرژی آزاد اتصال(4/92-) برای مهار آنزیم اوره آز می توانند استفاده شوند. کاریوفلین اکسید با انرژی اتصال بالامهارکننده بهتری برای آنزیم است. کلمات کلیدی: هلیکوباکتر پیلوری، آنزیم اوره آز، داکینگ ملکولی، آلفاپنین، کاریوفلین اکسید&emsp; پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

5 - تجزیه شیمیایی روغن اسانسی برگ وگل گیاه Ferula persica Willd.var. Persica با استفاده از تکنیک کروماتوگرافی گازی کوپل شده با طیف سنج جرمی
جعفر ایزدی نیا

چکیده در این تحقیق اسانس گل وبرگ گیاه Ferula. Persica خودروی شهرستان گرمسار واقع در استان سمنان با استفاده از روش تقطیر با آب بدست آمده و با استفاده از تکنیک GC و GC/MS مورد تجزیه شیمیایی قرار گرفتند. در روغن اسانسی حاصل از برگها 31 ترکیب مورد شناسائی قرار گرفت که 4/94 چکیده کامل

چکیده در این تحقیق اسانس گل وبرگ گیاه Ferula. Persica خودروی شهرستان گرمسار واقع در استان سمنان با استفاده از روش تقطیر با آب بدست آمده و با استفاده از تکنیک GC و GC/MS مورد تجزیه شیمیایی قرار گرفتند. در روغن اسانسی حاصل از برگها 31 ترکیب مورد شناسائی قرار گرفت که 4/94 % درصد از کل اسانس بدست آمده را تشکیل می دهند. بررسی ها نشان داد ازترکیبات شناسایی شده 3/72% ترکیبات را مونو ترپن ها و 3/17% ترکیبات را سزکویی ترپن ها تشکیل می دهند. آلفا- پینن(7/19%)، بتا- پینن(3/8 %)، منتول (3/8 %) و میرسن (8/6 %) ترکیبات اصلی اسانس برگ گیاه را تشکیل میدهند. در روغن اسانسی حاصل از گلها 12 ترکیب شناخته شد که 2/90 % کل اسانس حاصل از گل گیاه را تشکیل میدهند، 8/58% ترکیبات را مونوترپن و 4/31%. ترکیبات را سزکوئی ترپن تشکیل میدهند. آلفا- پینن (6/22 %) بی سیکلو جرمکرین(0/17 %)، بتا- فلاندرین (8/16 %)، اسپاتولنول(4/8%) و میرسن (5/7 %) ترکیبات اصلی اسانس گل را تشکیل می دهند. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

6 - مطالعه شیمی کوانتومی پیوند هیدروژنی دیمرهای NH2NW(W=O, S, Se)
صادقعلی باوفا علیرضا نوروزی

در این پژوهش، بررسی پیوند هیدروژنی دوپارهای NH2NW (W=O, S, Se) با استفاده از روش M06-2x و مجموعه پایه‌های 6-311++G(d,p)، 6-311++G(2d,2p) و AUG-cc-pVTZ در فاز گازی انجام شده است. در ابتدا، ساختارهای مولکولی و توزیع الکترونی تک‌پارها به صورت کامل مورد تجزیه و تحلیل قرار گ چکیده کامل

در این پژوهش، بررسی پیوند هیدروژنی دوپارهای NH2NW (W=O, S, Se) با استفاده از روش M06-2x و مجموعه پایه‌های 6-311++G(d,p)، 6-311++G(2d,2p) و AUG-cc-pVTZ در فاز گازی انجام شده است. در ابتدا، ساختارهای مولکولی و توزیع الکترونی تک‌پارها به صورت کامل مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. با توجه به مقادیر پتانسیل الکتروستاتیکی مولکولی (MEP)، مکان‌های فعال شناسایی و با استفاده از آنها قدرت پیوند هیدروژنی پیش بینی شده است. با در نظر گرفتن این مقادیر، نظم میل ترکیبی پروتون (Hcis و Htrans) به شرح زیر است: Htrans: NH2NSe > NH2NS > NH2NO Hcis: NH2NSe  NH2NO > NH2NS علاوه بر این با استفاده از توصیف‌گرهای انرژی، ساختار هندسی، جای نگاریکی و اوربیتال‌های مولکولی دوپارها، قدرت پیوند هیدروژنی آن‌ها تخمین زده شده است. برای همه دوپارها، تشکیل کمپلکس باعث طویل‌تر شدن پیوند NH و به این ترتیب جابجایی به سمت قرمز برای پیوند هیدروژنی مربوطه را نشان می‌دهد. نتایج AIM نشان می‌دهد که ماهیت کوالانسی جزیی در دوپارهای S2 و Se2 وجود دارد. در نهایت آنالیز تجزیه انرژی (EDA) پیشنهاد می‌کند که قطبش‌پذیری به شدت باعث پایداری دوپارهای NH2NS و NH2Se نسبت به دوپار NH2NO می‌شود. پرونده مقاله

XML

فهرست مقالات