• فهرس المقالات SNP

      • حرية الوصول المقاله

        1 - Design of Kinetic Spectrophotometric Method for Sensing Tartrazine Color in Real Samples Using Sensor Starch-capped ZnSNPs
        Mostafa Ahmadi Alireza Geramizadegan
        Tartrazine is a synthetic organic food dye that can be found in common food products such as bakery products, dairy products, candies, and beverage. The presence and content of tartrazine color must be controlled in food products due to their potential harmfulness to hu أکثر
        Tartrazine is a synthetic organic food dye that can be found in common food products such as bakery products, dairy products, candies, and beverage. The presence and content of tartrazine color must be controlled in food products due to their potential harmfulness to human beings.To determine the tartrazine color in solution, we used a prepared from Starch-capped ZnSNPs sensor and kinetic spectrophotometric method. The calibration curve was linear in the range of 0.01 to 10.0 mg L-1. The standard deviation of 1.0 %, and detection limit of the method (0.01 mg L-1 in time 25 min, 399 nm) were obtained for sensor level response Starch-capped ZnSNPs with (95%) confidence evaluated. The chemical Starch-capped ZnSNPs sensor made it possible as an excellent sensor with reproducibility. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        2 - بررسی پلی مورفیسم ژن1DISCدخیل در تکامل قشر مخ و توسعه شبکة عصبی بیماران اسکیزوفرنی: اولین مطالعه بر روی یک جمعیت ایرانی
        علی رضا پور طالبی فیروزآبادی اباصلت حسین زاده کلاگر جلیل فلاح مهرآبادی غلامرضا بیدخوری
        زمینه و هدف:اسکیزوفرنی یک بیماری شایع روانی با وراثت بالا و فنوتیپ متغیر است و 1 DISCنقش مهمی را در توسعه قشر مخ ایفا می­کند. پلی­مورفیسم در این ژن‌ با مدل‌های بیولوژیکی عصبی اسکیزوفرنی که کمبود قشر مغز در پاتوفیزیولوژی آن دخیل است ارتباط دارد. این پژوهش با هدف تشخیص پل أکثر
        زمینه و هدف:اسکیزوفرنی یک بیماری شایع روانی با وراثت بالا و فنوتیپ متغیر است و 1 DISCنقش مهمی را در توسعه قشر مخ ایفا می­کند. پلی­مورفیسم در این ژن‌ با مدل‌های بیولوژیکی عصبی اسکیزوفرنی که کمبود قشر مغز در پاتوفیزیولوژی آن دخیل است ارتباط دارد. این پژوهش با هدف تشخیص پلی­ مورفیسم2738864 rs، در ژن 1 DISCدر مبتلایان به بیماری اسکیزوفرنی و مقایسه آن با افراد سالم انجام شد.روش کار:این پژوهش برای اولین بار در ایران بر روی ۳۰۰ فرد مبتلا به بیماری اسکیزوفرنی که بر اساس روش DSM-IVانتخاب گردیدند و ۳۰۰ فرد سالم صورت گرفت. در این مطالعه از پرسش‌نامه جهت جمع‌آوری اطلاعات استفاده شد. برای بررسی این پلی­مورفیسم از تکنیک Nested allele specific PCRاستفاده گردید و برای تأیید و صحت پژوهش انجام ‌گرفته ۵۰ عدد از نمونه‌ها توالی­ یابی شده و نتایج با توالی‌های ژنی موجود در بانک ژن هم‌تراز گردید و جواب نهایی با استفاده از نرم‌افزارSPSS ver.22و SNP Analyzerمورد تجزیه‌وتحلیل آماری قرار گرفت.یافته ها:بررسی پلی­ مورفیسم2738864 rsدر جمعیت موردبررسی در ایران نشان داد که این پلی­ مورفیسم با اسکیزوفرنی ارتباط دارد و یافته‌های46/385 Chi-square=، 0000/0pT371/0/C926/0  Allele Frequency=به دست آمد.نتیجه گیری:یافته‌های این تحقیق نشان داد که این پلی­ مورفیسم با بیماری اسکیزوفرنی در جمعیت ایرانی مرتبط است. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        3 - مطالعه تأثیر طول بلوک‌های هاپلوتیپی در بهبود صحت پیش بینی ژنومی به کمک روش‌های بیزی در گوسفند DOR: 20.1001.1.17359880.1400.14.2.2.1
        رضا سید شریفی فاطمه علاء نوشهر نعمت هدایت ایوریق جمال سیف دواتی
        زمینه و هدف: عدم تعادل پیوستگی(LD) و طرح ساختار بلوک‌های هاپلوتیپ سطح جمعیت پارامترهایی هستند که برای مدیریت مطالعات گسترده ژنومی(GWAS) و درک ماهیت رابطه غیر خطی بین فنوتیپ‌ها و ژنوتیپها مفید هستند. در مقایسه با چند شکلی تک نوکلئوتیدی(SNp )، استفاده از آللهای هاپلوتیپ د أکثر
        زمینه و هدف: عدم تعادل پیوستگی(LD) و طرح ساختار بلوک‌های هاپلوتیپ سطح جمعیت پارامترهایی هستند که برای مدیریت مطالعات گسترده ژنومی(GWAS) و درک ماهیت رابطه غیر خطی بین فنوتیپ‌ها و ژنوتیپها مفید هستند. در مقایسه با چند شکلی تک نوکلئوتیدی(SNp )، استفاده از آللهای هاپلوتیپ در پیشبینی ژنومی و بهبود صحت پیش بینی کارآمدتر هستند. اما میزان افزایش صحت به چگونگی طراحی بلوکهای هاپلوتیپ بستگی دارد. این مطالعه با هدف آزمون اندازه بهینه برای طول هاپلوتیپ در پیش بینیهای ژنومی صورت گرفت.روش کار: در این مطالعه آللهای هاپلوتیپ با توجه به آللهای SNp در بلوکهای kb 125، kb 250، kb 500 و Mb 1 تعریف و آللهای هاپلوتیپ با فرکانسهای کمتر از 1، 5/2، 5 یا 10 درصد حذف شدند. از دو روش بیزA و بیزB برای پیش بینی اثرات ژنومیSNp ها و هاپلوتیپها در سه صفت با سه سطح وراثتپذیری(تولید شیر (1/0=h2)، وزن لاشه (3/0=h2) و وزن بدن در بلوغ=h2) 45/0)استفاده شد.یافته ها: بیشترین صحت پیش‌بینی ژنومی در صفت وزن بدن در زمان بلوغ توسط روش بیزB(652/0) در طول بلوک هاپلوتیپی kb 250 و کمترین توسط روش بیزA در صفت تولید شیر(407/0) در طول بلوک هاپلوتیپی Mb 1 حاصل گردید. بلوکهای هاپلوتیپی به طول kb 250 با آستانه فرکانس 1 درصد، بالاترین میزان صحت پیشبینی ژنومی را ارائه دادند. در مقایسه دو روش بیزA و بیزB، روش بیزB صحت برآورد بالاتری هم در مدلهای بر پایه SNp و هم بر پایه آللهای هاپلوتیپ ارائه داد.نتیجه گیری: قرار دادن آللهای هاپلوتیپ به جایSNp ها در مدل آماری، درصورت تعریف مناسب طول هاپلوتیپ، سبب بهبود صحت پیشبینی ژنومی میشود. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        4 - ژنوتایپینگ بیست و پنج SNP اتوزومال با درجه آگاهی بخش بالا در جمعیت استان خوزستان با استفاده از روش SNapShot
        پیام حاج بابایی محمود تولایی شهره زارع کاریزی
        استفاده از پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (SNPs) در تشخیص هویت ژنتیکی کاربردهای گسترده ای را نشان داده است. در جمعیت ایرانی جهت ارزیابی فرکانس آللی و نیز تعیین تنوع ژنتیکی SNP ها بر مبنای پایگاه SNIPforID مطالعات محدودی گزارش شده است. مطالعه حاضر با هدف بررسی تنوعات ژنتی أکثر
        استفاده از پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (SNPs) در تشخیص هویت ژنتیکی کاربردهای گسترده ای را نشان داده است. در جمعیت ایرانی جهت ارزیابی فرکانس آللی و نیز تعیین تنوع ژنتیکی SNP ها بر مبنای پایگاه SNIPforID مطالعات محدودی گزارش شده است. مطالعه حاضر با هدف بررسی تنوعات ژنتیکی، تعیین فراوانی آللی و ارزیابی هتروزیگوسیتی، به طور همزمان در بیست و پنج جایگاه SNP اتوزومال آگهی بخش در استان خوزستان با تکنیک SNapShot اجرا شد.در مطالعه حاضر، نتایج ارزیابی های بیوانفورماتیکی نشان داد حداقل 25 جایگاه SNP اتوزمال قدرت تمایز بین قومیت های ایرانی را داشتند. استخراج DNA از نمونه ی خون 50 نفر از افراد با قومیت عرب با روش فنول-کلروفورم انجام شد. تعیین ژنوتیپ SNP های منتخب با استفاده از روش SNapShot با دستگاه ژنتیک آنالایزر اجرا شد. آنالیز های آماری همچون فرکانس اللی و تعادل هاردی واینبرگ با استفاده از نرم افزار های Arlequine 3.5 و GenALEX 6.5 محاسبه شد. میانگین هتروزیگوسیتی مشاهده شده برابر با 442/0 بود. کمترین هتروزیگوسیتی محاسبه شده مربوط به rs2056277 به میزان 080/0 به دست آمد. کمترین فرکانس اللی برای rs2056277 برابر با 040/0 محاسبه شد. مجموع فرکانس آللی SNP های مورد مطالعه از تعادل هاردی-واینبرگ به استثناء rs938283, rs1413212 و rs354439 انحراف نشان دادند. ارزیابی همزمان 25 جایگاه اتوزمال SNP توانایی ایجاد تمایز بین قومیت های درون جمعیتی را دارد. نتایج نشان داد قومیت عرب از نظر ژنتیکی با قومیت های لر، فارس و کرد مشابه می باشد. روش SNapShot از حساسیت و اختصاصیت مناسبی جهت ژنوتایپینگ SNP هابه طور همزمان برخودار بود. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        5 - The Pattern of Linkage Disequilibrium in Livestock Genome
        م. نصرتی
        Linkage disequilibrium (LD) is bases of genomic selection, genomic marker imputation, marker assisted selection (MAS), quantitative trait loci (QTL) mapping, parentage testing and whole genome association studies. The Particular alleles at closed loci have a tendency to أکثر
        Linkage disequilibrium (LD) is bases of genomic selection, genomic marker imputation, marker assisted selection (MAS), quantitative trait loci (QTL) mapping, parentage testing and whole genome association studies. The Particular alleles at closed loci have a tendency to be co-inherited. In linked loci this pattern leads to association between alleles in population which is known as LD. Two metric parameter Dˊ and r2 were suggested for measuring the extent of LD in population. D' are more influenced by variation in allele frequencies than r2. Until recently all research on LD was carried out by microsatellite, which reported high level of Dˊ in wide extent. As progressing on large scale genomes sequencing a huge number of single nucleotide polymorphism (SNPs) were detected on genome and microsatellite replaced by SNP in such researches. By using SNP, high level of LD in short distance has been reported. Many factors can affect LD such as selection, migration, genetic drift, mutation, small finite population size and recombination. So, LD is basic tools for exploring the genetic basis of quantitative traits in livestock. Likewise, comparative LD maps make a capable us to examine the degree of diversity between breeds and to discover genomic regions that have been subject to selection. Therefore, this review states concept and current approach to estimating LD and extent of LD in livestock population. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        6 - Polymorphism of Β-Lactoglobulin (Β-Lg) Gene and Its Association with Milk Yield and Milk Composition on Senduro Goats
        F.E. Wardani J. Palayukan A. Furqon S. Suyadi T.E. Susilorini
        The objective of this research was to examine the β-lactoglobulin gene polymorphism and its association with milk yield and composition in Senduro goats. A total of 60 lactation Senduro goats aged 2 to 4 years were used in this study. Milk yield and blood samples w أکثر
        The objective of this research was to examine the β-lactoglobulin gene polymorphism and its association with milk yield and composition in Senduro goats. A total of 60 lactation Senduro goats aged 2 to 4 years were used in this study. Milk yield and blood samples were collected from dairy goat farms in Burno and Kandangtepus Senduro villages. The 480 bp β-lactoglobulin gene DNA fragments were amplified using the polymerase chain reaction (PCR) method at 60 ˚C annealing for 35 cycles. The genotypes of the β-lactoglobulin gene were determined using the restriction fragment length polymorphism (RFLP) technique with the Sac II restriction enzyme. Association of β-lactoglobulin genotypes with milk yield and composition were analyzed using the ANOVA test. The result showed that the single nucleotide polymorphism (SNP) c.497G > A was detected. The β-lactoglobulin was polymorphic in Senduro goats. There were three genotypes (AA, AG, GG) and two alleles (A and G). The frequency of AA, AG, GG genotypes were 0.4, 0.52, 0.08, respectively, while the frequencies of A and G alleles were 0.66 and 0.34, respectively. There was no association between β-lactoglobulin gene polymorphism and milk yield and composition on Senduro goats. In conclusion, the genotype of the β-lactoglobulin gene did not effect on milk yield, protein, fat, density, lactose, salt, SnF, and total solid. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        7 - Study of Dopamine Receptor Gene Polymorphisms and Their Association with Growth and Egg Production Traits in West Azerbaijan Native Chicken
        م. غلامی م. غفاری ع. هاشمی
        The objective of this study was to search for single nucleotide polymorphism (SNP)-type polymorphisms in the dopamine D1 receptor in West Azerbaijani native chicken and look for their association with egg production and body weight traits of chickens by polymerase chain أکثر
        The objective of this study was to search for single nucleotide polymorphism (SNP)-type polymorphisms in the dopamine D1 receptor in West Azerbaijani native chicken and look for their association with egg production and body weight traits of chickens by polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP). For this purpose 180 blood samples were taken from native chickens in a poultry breeding station in West Azerbaijan, Iran. DNA was extracted from blood samples using the salting-out procedure. Specific primers were designed for PCR amplification of the 283 base segment of the dopamine D1 receptor gene. In order to demonstration of gene polymorphism, Single-stranded conformation polymorphism followed by sequencing was performed. Four samples from each banding pattern were sent for sequencing. The polymorphism was found in the D1 receptor gene (G123A). We detected three genotypes in DRD1 gene. The frequencies of three genotypes were 0.42 (AA), 0.49 (AG), and 0.09 (GG), respectively. The analysis of variance was performed using of SAS software. The Result shows that there was a significant relationship between genotypes of dopamine D1 receptor gene with egg production traits. This finding indicates that the dopamine D1 receptor gene was polymorphic and could be a candidate locus or linked to a major gene that influences reproductive traits in chickens. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        8 - Polymorphisms of Candidate Genes for Muscle Perform and Male Fertility in Brazilian Mangalarga Horses
        L.C.M. Armeiro R.A. Curi L.A.L. Chardulo J.N.P. Puoli Filho M.D. Silveira da Mota
        The aims of the present study were to propose apolymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphismPCR-RFLP genotyping method for the AY_376689:c.773C>T single nucleotide polymorphism SNP of the equine PRKAG3 gene, related to muscle performance, as well أکثر
        The aims of the present study were to propose apolymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphismPCR-RFLP genotyping method for the AY_376689:c.773C>T single nucleotide polymorphism SNP of the equine PRKAG3 gene, related to muscle performance, as well as to characterize this SNP and a second polymorphism, AAWR_02017454:g.121684T>C of the SPATA1 gene, related to male fertility, in Mangalarga horses, in order to provide a basis for future studies investigating the association between markers and traits of interest in this breed. For this, 151 Mangalarga horses of both sexes, representatives of the population of the Sate of São Paulo, Brazil, were used. Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphismPCR-RFLP was found to be adequate for the genotyping of the AY_376689:c.773C>T single nucleotide polymorphismSNP of the PRKAG3 gene. However, this polymorphism probably does not segregate in Mangalarga horses, a fact impairing association studies with muscle performance traits. The estimates of population genetic parameters obtained for the AAWR_02017454:g.121684T>C polymorphism of the equine SPATA1 gene demonstrated the possibility of association studies between this marker and traits related to male fertility. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        9 - Novel Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in Intron 2 and Exon 3 Regions of Leptin Gene in Sumba Ongole Cattle
        و.پ.ب. پوترا پ.پ. آگونگ
        The bovine leptin (LEP) gene was widely used as a candidate gene for molecular selection to improve productivity traits of cattle. This study was carried out to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the LEP gene of Sumba Ongole (SO, Bos indicus) cows using أکثر
        The bovine leptin (LEP) gene was widely used as a candidate gene for molecular selection to improve productivity traits of cattle. This study was carried out to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the LEP gene of Sumba Ongole (SO, Bos indicus) cows using sequencing method. A total of 31 animals were used in this study for analyses. Research showed that total of 16 SNPs were detected in the LEP gene. Along 2025 bp of LEP gene sequence was analyzed in this study and consisted of intron 2 (1002 bp) and exon 3 (1023 bp). The polymorphic informative content (PIC) value was reached from 0.06 (low) to 0.37 (moderate). Total of 16 SNPs in LEP gene of SO cattle had moderate PIC value (0.25<PIC<0.50) and consisted of twelve SNPs in intron 2 and four SNPs in exon 3. The SNPs with moderate PIC value were detected in intron 2 (g.2325G/T; g.2423A/C; g.2448C/T; g.2456C/G; g.2466C/T; g.2778T/A; g.2857G/A) and exon 3 (g.3260T/C; g.3272T/C; g.3356C/T; g.3468G/A). The SNP of g.3468G/A as the novel SNP in LEP gene of SO cattle that not reported in other breeds of cattle. This SNP was changed the amino acid from glycine (GGG) to arginine (AGG). Two type of mutation were detected in the LEP gene of SO cattle and consisted of transversions (44%) and transitions (56%). It was concluded that the LEP gene in SO cattle was showed polymorphisme and potential for molecular selection in the breeding program through depth research. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        10 - A Profile of Single Nucleotide Polymorphisms in Fecundity Genes Among Iranian Sheep Breeds by Using Polymerase Chain Reaction–Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) Method
        پ. پتکی س.ض. میرحسینی ف. افراز س.م.ف. وحیدی
        Ovulation rate and litter size are traits of fecundity and have a very remarkable economic value that leads to an increase in the production of meat, wool and milk. Therefore, exploring on the candidate and functional genes for these traits is very important. Growth dif أکثر
        Ovulation rate and litter size are traits of fecundity and have a very remarkable economic value that leads to an increase in the production of meat, wool and milk. Therefore, exploring on the candidate and functional genes for these traits is very important. Growth differentiation factor 9 (GDF9), bone morphogenetic protein 15 (BMP15) and bone morphogenetic protein receptor-1B (BMPR1B) are the most important of these genes containing single nucleotide polymorphisms (SNPs) markers that are associated with high fertility in sheeps. The aim of this study was to determine the allelic and genotypic frequencies of seven of these SNPs including; G1, G4, G7 and G8 in GDF9 gene, B2 and B4 in BMP15 gene and FecB in BMPR1B gene among 532 sheeps from eleven of Iranian native breeds using polymerase chain reaction–restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. For each mutation region, polymerase chain reactions and digestion reactions with specific endonuclease enzymes, were performed. The results showed that G1 mutation presents among ten breeds except Zandi, G4 mutation in all breeds, and the FecB mutation in two breeds; Kalakuei and Zandi. The G7, G8, B2 and B4 mutations were not observed in any of breeds, and all sheeps were homozygote wild type for these four positions. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        11 - Allelic Variation of MYF5 Gene Detected in the <i>Camelus bactrianus</i>
        ن. هدایت-ایوریق س.ر. میرایی-آشتیانی م. مرادی شهر بابک و. واحدی ح. عبدی
        The myogenic factors (MYF) 5 gene has been reported to contribute to muscle growth and development, therefore they are considered as candidate genes for growth and meat quality related traits. The MYF5 gene is expressed during proliferation of myoblasts and comprises 3 أکثر
        The myogenic factors (MYF) 5 gene has been reported to contribute to muscle growth and development, therefore they are considered as candidate genes for growth and meat quality related traits. The MYF5 gene is expressed during proliferation of myoblasts and comprises 3 exons. To ascertain whether there is any variation in the camel MYF5 gene, we have used a polymerase chain reaction-single strand conformational polymorphism (PCR-SSCP) method for the analysis. In this study, coding region (exon 1) of the MYF5gene was investigated. Four unique SSCP patterns were detected in exon 1. Two Single nucleotide polymorphisms (SNPs) were detected - A/G and G/A in 98 and 366 position, respectively that create four haplotype, related to banding patterns. The variations detected in this study leads to a serin/asparagine and tryptophan/stop codon amino acid changes, respectively and could be considered for the development of gene-assisted selection in camel breeding. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        12 - Identification of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) in β-Lactoglobulin Gene and Its Association with Milk Composition in Iranian Indigenous Khalkhali Goats
        ن. هدایت-ایوریق S. Zalpour R. Seyed Sharifi R. Khalkhali-Evrigh B. Navidshad K. Pourasad H. Shirzadi
        &beta;-lactoglobulin is one of the important milk proteins in several ruminants like goats, sheep and cattle. This study was performed to investigate the genetic polymorphism of exon 7 and 3&rsquo; UTR region of &beta;-lactoglobulin (BLG) gene and its association with m أکثر
        &beta;-lactoglobulin is one of the important milk proteins in several ruminants like goats, sheep and cattle. This study was performed to investigate the genetic polymorphism of exon 7 and 3&rsquo; UTR region of &beta;-lactoglobulin (BLG) gene and its association with milk composition in 120 unrelated individuals of Iranian indigenous Khalkhali goats. Purified polymerase chain reaction (PCR) products (427 bp) were sequenced under standard conditions using Sanger sequencing. Alignment of sequenced fragments against reference sequence leads to identification of one single nucleotide polymorphism (SNP), substitution A (frequency equal to 0.44) to C (frequency equal to 0.56) in the 3&rsquo; UTR region of BLG gene. Observed frequencies of AA, AC and CC genotypes were 0.12, 0.64 and 0.24, respectively. The effects of identified genotypes on milk composition were analysed using general linear model. We found that BLG gene genotypes have a significant effect on milk parameters except for lactose percentage (p &lt; 0.05). The milk of goats with AA and AC genotypes had higher protein and fat percentages, respectively, in compaired with other genotypes (p &lt; 0.05). Obtained results revealed that, identified genotypes in the BLG gene of Khalkhali goats is not in Hardy-Weinberg equilibrium. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        13 - Molecular and biochemical protective roles of sodium nitroprusside in tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) under salt stress
        Sahar Taheri sakineh Saeidisar Nahid Masoudian Mostafa Ebadi Bostan Roudi
        Salinity stresses act as inhibitor factors of plant growth. They can change the physiological characteristics and limit the production of crops. Sodium nitroprusside (SNP) is a stable free radical which use as a signalling molecule in plants and participates in various أکثر
        Salinity stresses act as inhibitor factors of plant growth. They can change the physiological characteristics and limit the production of crops. Sodium nitroprusside (SNP) is a stable free radical which use as a signalling molecule in plants and participates in various plant&rsquo;s physiological, biochemical and molecular processes and also in plant&rsquo;s responses to environmental stresses. We investigated the effect of SNP on physiological parameters such as photosynthetic and non-enzymatic pigments, biochemical like APX and SOD enzymes and HKT1.2 and SLWRKY 8 genes expression as a molecular section on tomato under salt stress. In this study, SNP was used as nitric oxide (NO) donor. Tomato seedlings roots were subjected to various levels of salinity including 0, 40, 80 and 120 mM and SNP (0, 50 and 100 mM) for 20 days. The SNP had protective effects on photosynthetic parameters by increase in non-enzymatic and enzymatic antioxidants. It had also decrease and additive effect in HKT1.2 and SLWRKY 8 genes expression respectively. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        14 - بررسی ارتباط چهار پلی مورفیسم در ژن TNP2 با روند اسپرماتوژنز و ایجاد ناباروری مردان
        الهام سیاسی احمد آل یاسین جواد مولا
        در اسپرماتوژنز انسان، پروتامین ها به عنوان پروتئین های متصل شونده به DNA اسپرم جایگزین هیستون ها می شوند. برای تمایز و بلوغ اسپرم جایگزینی هیستون ها با پروتامین ها ضروری است. آسیب در ژن های کد کننده پروتامین ها می تواند منجر به تخریب اسپرماتوژنز و عدم تشکیل اسپرم کامل أکثر
        در اسپرماتوژنز انسان، پروتامین ها به عنوان پروتئین های متصل شونده به DNA اسپرم جایگزین هیستون ها می شوند. برای تمایز و بلوغ اسپرم جایگزینی هیستون ها با پروتامین ها ضروری است. آسیب در ژن های کد کننده پروتامین ها می تواند منجر به تخریب اسپرماتوژنز و عدم تشکیل اسپرم کامل شده و در نتیجه سبب ناباروری مردان گردد. در این تحقیق به بررسی حضور چهار پلی مورفیسم در ژن TNP2 از ژن های خانواده پروتامین ها و ارتباط آن با ایجاد ناباروری ادیوپاتیک در مردان ازواسپرمی و الیگواسپرمی ایرانی پرداخته شده است. حضور چهار پلی مورفیسم T1019G،G1272C، G deletion at 1036 and 1046در ژن TNP2، پس از استخراج DNA از نمونه خون 96 مرد ازواسپرم و اولیگو اسپرم با ناباروری ادیوپاتیک و 100 نفر گروه کنترل با روش PCR-RFLP و PCR-SSCP بررسی شد و سپس با روش Sequencing نتایج تایید شد.فراوانی ژنوتایپ CC از پلی مورفیسم G1272C بین گروه بیمار و کنترل تفاوت نشان داد ولی با آنالیز آماری اختلاف معنی دار بین حضور این پلی مورفیسم در مقایسه گروه بیمار با کنترل مشاهده نشد (P&gt;0/05). همچنین پلی مورفیسم های T1019G و G deletion at 1036 and 1046در هیچ یک از گروه بیمار و کنترل مشاهده نشد. مقایسه نتایج این تحقیق با مطالعات انجام شده در این زمینه نشان داد که بین حضور این چهار پلی مورفیسم بررسی شده در ایجاد ازواسپرمی و اولیگواسپرمی با ناباروری ادیوپاتیک در جمعیت مردان ایرانی ارتباط معنی داری وجود ندارد. تفاصيل المقالة