استفاده از ساختار سازمانی صحیح، منجر به بهبود اساسی در عملکرد سازمان می‌شود. امروزه رقابت جهانی سازمان‌ها را به سمت باریک و ساده شدن سوق داده و بسیاری از سازمان‌ها به سمت مهندسی مجدد فرایندها به عنوان ابزاری برای تغییرات ریشه‌ای در نحوه اجرای فرایندهایشان روی آورده‌اند. با توجه به حجم بالای تجارت و سرعت فزاینده معامله‌های تجاری، ضرورت دارد گمرک نیز متحول شود. پژوهش حاضر با هدف بررسی تأثیر مهندسی مجدد ساختار سازمانی بر بهره وری گمرکات کشور انجام شده است که از نظر هدف در حیطه پژوهش‌های کاربردی و بر اساس ماهیت و روش گردآوری داده‌ها، یک پژوهش توصیفی-پیمایشی است. به منظور جمع آوری داده‌ها از پرسشنامه و برای آزمون مدل مفهومی پژوهش از PLS که یک فن مدل‌سازی معادلات ساختاری واریانس محور است و امکان بررسی نظریه و سنجه‌ها را به طور همزمان فراهم می‌سازد، استفاده شد. در نهایت، ۱۵ فرضیه مورد بررسی قرار گرفت که نشان از تأثیر مهندسی مجدد ساختار سازمانی بر بهره وری گمرکات کشور دارد. تفاصيل المقالة