سابقه و هدف: شیوع عفونت، به‌ همراه گسترش باکتری‌ها‌ی مقاوم به آنتی‌بیوتیک‌، سبب شده است که ترکیبات پپتیدی تولید شده توسط باکتری‌ها (باکتریوسین‌ها) مورد توجه قرار گیرند. این مطالعه با هدف مقایسه اثر ضد میکروبی در باکتری‌های دارای توانایی تولید باکتریوسین انجام شد.مواد و روش ‌ها: فعالیت بازدارندگی باکتری‌های جدا شده از خاک نواحی مختلف سمنان (کلکسیون میکروبی دانشگاه سمنان (DDBCC ، علیه باکتری‌های شاخص به روش ‌انتشار ‌در آگار بررسی گردید. سویه‌های منتخب با آزمون‌های بیوشیمیایی و مولکولی شناسایی شدند. پس از تغلیظ باکتریوسین‌های منتخب با کمک غلظت اشباعی سولفات آمونیوم، اثرات تخریب بیوفیلم در هر باکتریوسین‌ مطالعه و سپس به روش کروماتوگرافی لایه نازک تخلیص و فعالیت ضد میکروبی آنها بررسی شد.یافته ‌ها: نتایج تعیین توالی نشان داد که سویه‌های منتخب DDBCC38 و DDBCC51 دارای شباهت 95 درصدی به اشریشیا کلی و سویه DDBCC46 شباهت 96 درصدی به باسیلوس سوبتلیس بود. باکتریوسین‌ های تغلیظ شده DDBCC51 و DDBCC38 رشد باسیلوس سرئوس، باسیلوس آنتراسیس، کلبسیلا نمونیه را پس از 52 ساعت مهار کرده و بیوفیلم سودوموناس ائروجینوسا و استافیلوکوکوس اورئوس را به ترتیب 12، ‌40 درصد و 19.6، 40 درصد تخریب کرد. در مقابل باکتریوسین سویه DDBCC46 در 72 ساعت علیه کلبسیلا نمونیه و سودوموناس ائروجینوسا موثر بود. اما تاثیری بر تخریب بیوفیلم نشان نداد. تخلیص باکتریوسین DDBCC38 و DDBCC51، با استفاده از کروماتوگرافی لایه نازک، قطر هاله عدم رشد را علیه کلبسیلا نمونیه 2 میلی‌متر افزایش داد. اما باکتریوسین DDBCC46 قطر هاله را 4 میلی‌متر کاهش داد.نتیجه‌گیری: با توجه به ویژگی های ضد بیوفیلمی و آنتاگونیسمی جدایه های مورد بررسی، انجام مطالعات تکمیلی به منظور بهینه سازی شرایط تولید و شناسایی مولکولی نوع باکتریوسین تولیدی پیشنهاد می گردد. تفاصيل المقالة

سابقه و هدف: امروزه پپتید های ضد میکروبی تولید شده از حشرات بهدلیل تاثیر ضد باکتری‌ های بیماری‌ زا با اثرات جانبی کمتر، مورد توجه هستند. هدف از این مطالعه، بررسی خواص فیزیکی-شیمیایی آتاسین 1a بهعنوان ترکیب ضد باکتریایی برای انجام پژوهش‌ های آزمایشگاهی بر پایه‌ ی تولید حامل‌ های دارو رسانی و طراحی واکسن، با استفاده از روش‌ های بیوانفورماتیک است.مواد و روش‌ ها: در این پژوهش توالی ژن کد کننده پپتید ضد میکروبی آتاسین 1a تولید شده از حشره T. molitor، از پایگاه داده NCBI، با نشانی www.ncbi.nlm.nih.gov، در فرمت FASTA دریافت شد. وزن مولکولی، میزان مشابهت و تفاوت میان توالی‌ های آتاسین1a با سایر پپتید‌‌ های همولوگ، و مشخصات فیزیکی-شیمیایی مولکول بررسی گردید. همچنین ساختار دوم و شکل فضایی پپتید آتاسین1a، با استفاده از نرم افزار‌های بیوانفورماتیک پیشگویی و میزان عملکرد و ایمنی زایی پپتید مطالعه شد.یافته ها: توالی آمینو اسیدی پپتید آتاسین1a، با پپتید های مشابه در 10 عضو از زیر راسته Polyphaga، در نواحی مرکزی و انتهایی (-cترمینال) مشابه است. ویژگی‌ های ساختاری و بیوشیمیایی آتاسین1a، 51% آمینو اسید های غیر قطبی با شاخص بی نظمی %61 و انعطاف پذیری 53% را نشان می‌ دهد. ساختار دوم آتاسین1a، شامل 52/60% پیچ های تصادفی، 1/43% صفحات بتا و 21/43% مارپیچ آلفا است. پیشگویی ساختار سوم در پایگاه Phyre2، 32% هم‌ پوشانی و 31/1% اعتبار سنجی به پروتین متعلق به بتا شبه ایمونوگلوبولین (d2aw2a1) را نشان می دهد. این پپتید توانایی بالایی در تحریک سیستم ایمنی ندارد.نتیجه گیری: فراوانی صفحات بتا در ساختار آتاسین 1a، دلیلی بر پایداری مولکول و افزایش توانایی آن در عبور از غشای سلولی باکتری‌ ها است. تفاصيل المقالة