ترادف‌یابی کامل ژنوم یک جدایه از ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی از منطقه عسلویه و تعیین جایگاه تاکسونومیکی آن

الموضوعات :

کاووس ایازپور ¹ (هیات علمی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد جهرم)
نگهدار اولاد حسین ² (گروه بیماری شناسی گیاهی، واحد جهرم، دانشگاه آزاد اسلامی، جهرم، ایران)
علی پاک نیت ³ (گروه گیاهپزشکی، مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی فارس، شیراز، ایران)

تاريخ الإرسال : 07 الأربعاء , جمادى الثانية, 1442 تاريخ التأكيد : 17 الثلاثاء , ذو الحجة, 1442 تاريخ الإصدار : 15 الإثنين , محرم, 1443

الکلمات المفتاحية: استان بوشهر, بگومو ویروس, آغازگر Farsc/PAL1v1987, Farsv/TYLCV-[Ab]1997c,

ملخص المقالة :

سابقه و هدف: بیماری پیچیدگی برگ زرد گوجهفرنگی یکی از شایعترین و مهمترین بیماریهای گوجهفرنگی در ایران است. تعیین ترادف ژنوم ویروس و شناسایی نژاد آن به تولید نژاد مقاوم کمک میکند. هدف از این تحقیق تعیین ترادف کامل ژنوم یک جدایه از ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجهفرنگی، تعیین نژاد و جایگاه تاکسونومیکی آن بود. مواد و روش‌ها: به منظور ترادفیابی ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجهفرنگی در استان بوشهر، یک جدایه ویروسی از مزارع گوجهفرنگی عسلویه انتخاب و بررسی شد. ابتدا با کمک جفت آغازگرهای دژنره بگومو ویروسها قطعهای به طولbp500 در آزمون PCR تکثیر و ترادفیابی گردید. سپس با استفاده از ترادف این قطعه یک جفت آغازگر برای دستیابی به ژنوم کامل ویروس با نامFarsc/Farsv طراحی شد. با کمک ترکیب جفت آغازگر Farsc/PAL1v1987 و جفت آغازگر Farsv/TYLCV-[Ab]1997c ترادف کامل ژنوم ویروس تعیین گردید. با کمک برنامه‌های بیوانفورماتیک و مقایسه ژنوم کامل ویروس با سایر ویروسهای منطقه و جهان، جایگاه تاکسونومیکی ویروس عسلویه تعیین گردید. یافتهها: آنالیزهای فیلوژنتیکی نشان داد که جدایه مذکور دارای ژنوم یک بخشی بوده و با نژاد عمانی ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجهفرنگی شباهت بیش از 93% دارد. لذا این جدایه واریانتی از نژاد عمانی ویروس است. در تحقیقات دیگر محققین بیان شده بود که در استان بوشهر فقط نژاد TYLCV-IL وجود دارد در حالیکه نتایج این تحقیق وجود نژاد TYLCV-OMN را در استان بوشهر به اثبات میرساند. نتیجه‌گیری: با توجه به مطالعات انجام شده جدایه عسلویه عضوی از گروه عمانی ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجهفرنگی است که زردی شدید ایجاد میکند.