شناسایی عوامل بیماری بلایت باکتریایی گیاه یاس هلندی در تهران و کرج

محورهای موضوعی : دو فصلنامه تحقیقات بیماریهای گیاهی

زهرا نوبختی ¹ , نادر حسن زاده ² , جواد رزمی ³

1 - دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.
2 - دانشیار، گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.
3 - استادیار، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.

تاریخ دریافت : 1398/10/16 تاریخ پذیرش : 1400/08/22 تاریخ انتشار : 1399/03/01

کلید واژه: بلایت باکتریایی, یاس هلندی, پارک‌های تهران و کرج, ژن 16S rRNA,

چکیده مقاله :

طی ماه‌های تابستان تا پاییز سال 1396 تعداد 50 نمونه مشکوک به بیماری باکتریایی از گیاه یاس هلندی از پارک­ها و فضای سبز شهرهای تهران و کرج جمع آوری شد. نمونه‌ها جهت بررسی­های بیشتر به آزمایشگاه منتقل شد. ابتدا از نمونه‌های آلوده پس از شستشو و ضد عفونی سطحی با محلول 1% آب ژاول و شستشوی مجدد با آب مقطر استریل، سوسپانسیون لازم تهیه شد. سپس یک لوپ از هر سوسپانسیون روی محیط کشت­های نوترینت آگار(NA) و کینگس-بی (KB) کشت گردید. تک کلنی‌های غالب در هر پتری ابتدا خالص سازی و سپس اثبات بیماریزایی شدند. جدایه­های باکتریایی که قادر به ایجاد فوق حساسیت روی گیاه شمعدانی و لکه برگی و پژمردگی روی گیاه یاس هلندی بودند انتخاب شدند. از بین جدایه­های منتخب، تعداد 7 جدایه که دارای صفات فنوتیپی متفاوت از بعد صفات مرفولوژیکی، فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی بودند انتخاب شدند. با استفاده از PCR، ژن 16S rRNA جدایه­های منتخب توسط جفت آغازگر عمومی P1 و P6 تکثیر شدند. پس از توالی یابی محصولات PCR و بلاست توالی­ها مشخص شد که 7 جدایه منتخب به جنس/گونه Stenotrophomonas maltophilia، Pseudomonas plecoglossida، Staphylococcus sp.، Ochrobactrum sp.، Achromobacter sp.، Bacillus sp. و Paenibacillus sp. تعلق دارند.

چکیده انگلیسی:

Abstract
During the summer months until the fall of 2017, 50 diseased samples of ligustrum plants suspected to bacterial disease were collected from all around Tehran and Karaj parks and green spaces. The diseased samples were transferred to the laboratory for further investigation. The dominant single colonies with distinguished morphology were selected and fulfilled their pathogenicity on geranium and detached stems and leaves of the host plant. Seven pathogenic bacterial isolates were further analyzed by morphological, physiological and biochemical traits. Using PCR, the 16S rRNA gene of the selected isolates was amplified DNAs were first extracted by alkaline lysis method and their 16S rRNA genes were amplified with primer pair P6/P1.
The PCR products were sequenced by Macrogen Co. (Seoul, Korea) and the edited sequences were compared with deposited sequences in Genbank nucleotide database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov). According to the results, heterogeneous species include strains of Stenotrophomonas maltophilia, strains of Pseudomonas plecoglossida, strains of Bacillus sp., strains of Paenibacillus sp., strain of Ochrobactrum sp., strains of Achromobacter sp., and strains of Staphylococcus epidermidls were identified. The presence of a wide range of not-so-well-known bacteria, but the pathogen confirms their importance, at least as secondary pathogens. This is the first report of isolating certain novel bacterial agents on ligustrum in Iran.

Keywords: Bacterial leaf spot, ligustrum, Tehran and Karaj parks, 16S rRNA gene.

منابع و مأخذ:

1. AKE, Agricultural Articles Center [Internet]. 2010. Tehran: Iran's largest agricultural blog [cited 2021 Feb 12]. Available from: http://www.ake.blogfa.com/post/8539/Ligustrum vulgarl


2. Bagheri N, Ahmadzadeh M and Heydari R. 2014. Effects of Pseudomonas fluorescens strain UTPF5 on the mobility, mortality and hatching of root-knot nematode Meloidogyne javanica. Archives of phytopathology and plant protection 47(6): 744–752.


3. 2020. Privet (Ligustrum). Plant Pest Handbook (Douglas SM and Cowles RS eds.) Hartford, Connecticut: The Connecticut Agricultural Experiment Station [cited 2020 Nov 18]. Available from: https://portal.ct.gov/CAES/Plant-Pest-Handbook/pphP/Privet-Ligustrum


4. Denet E, Vasselon V, Burdin B, Nazaret S, Favre-Bonté S. 2018. Survival and growth of Stenotrophomonas maltophilia in free-living amoebae (FLA) and bacterial virulence properties. PLoS ONE 13(2): e0192308.


5. Elboutahiri N, Thami-Alami I and Udupa SM. 2010. Phenotypic and genetic diversity in Sinorhizobium meliloti and medicae from drought and salt affected regions of Morocco. BMC Microbiology 10: 15. https://doi.org/10.1186/1471-2180-10-15


6. European Food Safety Authority. 2016. Update of a database of host plants of Xylella fastidiosa. EFSA Journal 14(2):4378.


7. Gilman EF and Watson DG. 1994. Syringa reticulata ‘Ivory Silk’; ‘Ivory Silk’ Japanese tree Lilac. Fact Sheet ST-611. 4 p.


8. Grady, EN, MacDonald J, Liu L, Richman A and Yuan ZC. 2016. Current knowledge and perspectives of Paenibacillus: a review. Microbial Cell Factories 15: 203.


9. Janse JD, Derks JHJ, Spit BE and Van Der Tuin WR.1992. Classification of fluorescent soft rot Pseudomonas bacteria, including marginalis strains, using whole cell fatty acid analysis. Systematic and Applied Microbiology 15(4): 538–553.


10. Kämpfer P, Sessitsch A, Schloter M, Huber B, Busse HJ, Scholz HC. 2008. Ochrobactrum rhizosphaerae nov. and Ochrobactrum thiophenivorans sp. nov., isolated from the environment. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 58: 1426–1431.


11. Lebuhn M, Achouak W, Schloter M, Berge O, Meier H and Barakat M. 2005. Taxonomic characterization of Ochrobactrum isolates from soil samples and wheat roots, and description of Ochrobactrum tritici sp. nov. and Ochrobactrum grignonense sp. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 50: 2207–2223.


12. Navarro B, Loconsole G, Giampetruzzi A, Aboughanem‐Sabanadzovic N, Ragozzino A, Ragozzino E and Di Serio F. 2017. Identification and characterization of privet leaf blotch-associated virus, a novel idaeovirus. Molecular Plant Pathology 18(7), 925–936.


13. Prabhat JHA and Kumar A. 2009. Characterization of novel plant growth promoting endophytic bacterium Achromobacter xylosoxidans from wheat plant. Microbial Ecology 58: 179–188.


14. Schaad NW, Jones JB and Chun W. 2001. Laboratory Guide for Identification of Plant Pathogenetic bacteria. 3^rd New York: APS Press. 373 p.


15. Tripathi AK, Verma SC, Chowdhury SP, Lebuhn M, Gattinger A and Schloter M. 2006. Ochrobactrum oryzae nov. an endophytic bacterial species isolated from deep-water rice in India. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56(7): 1677–1680.


16. Vandamme P, Moore ERB, Cnockaert M, De Brandt E, Svensson-Stadler L, Houf K, Spilker T, LiPuma JJ. 2013. Achromobacter animicus nov., Achromobacter mucicolens sp. nov., Achromobacter pulmonis sp. nov. and Achromobacter spiritinus sp. nov., from human clinical samples Systematic and Applied Microbiology 36: 1–10.


17. Wang W, Wang S, Ma X and Gong J. 2011. Recent advances in catalytic hydrogenation of carbon dioxide. Chemical Society Reviews 40(7): 3703–3727.