Tautomerism

دسترسی آزاد مقاله

1 - Using Implicit/Explicit Salvation Models to Theoretical Study Tautomerism in 7H-purine-2, 6-diamine
javad hosseini

A theoretical study at the B3LYP/6-31++G(d,p) level was performed on the tatumerization of 7H-purine-2, 6-diamine into 9H-purine-2, 6-diamine. Such a tautomerism can take place via three different pathways namely A, B, and C. The energetic results associated with the ga چکیده کامل

A theoretical study at the B3LYP/6-31++G(d,p) level was performed on the tatumerization of 7H-purine-2, 6-diamine into 9H-purine-2, 6-diamine. Such a tautomerism can take place via three different pathways namely A, B, and C. The energetic results associated with the gas phase reveal that pathways A, B, and C display a very high activation Gibbs free energy of 45.1, 68.6 and 48.9 kcal/mol, respectively, indicating this process cannot take place in the gas phase. When solvent effects of water are taken into account through a continuum of a uniform dielectric constant, the gas phase activation Gibbs free energies increase to 58.8, 70.6, and 52.4 kcal/mol along pathway A, B, and C, respectively, emphasizing long range solute-solvent interactions do not play a key role in the considered tautomerization. The studied process can easily take place by inclusion of three molecules of water in which a significantly reduced activation Gibbs free energy of 24.8 kcal/mol indicates the predominance of short range solute-solvent interactions over the long range ones. Combination of short range and long range solute-solvent interactions lead to an activation Gibbs free energy of 23.5 kcal/mol for tatumerization of 7H-purine-2, 6-diamine into 9H-purine-2, 6-diamine. This value clearly points out that employing a polar and protic solvent is able to noticeably reduce the barrier of tatomerization پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

2 - Ab initio and DFT studies on tautomerism of 5-methyl cytosine in gaseous phase
K. Zare M. Monajjemi E. Zahedi H. Aghaie

Ab initio and DFT methods have been used to study the seven tautomeric forms of 5-methylcytosine molecule.The related tautomer in gas phase have been studied at HF/6-31G, HF/6-31G* and B3LYP/6-31G* levels oftheory. The structures,enthalpies,entropies,Gibbs free energies چکیده کامل

Ab initio and DFT methods have been used to study the seven tautomeric forms of 5-methylcytosine molecule.The related tautomer in gas phase have been studied at HF/6-31G, HF/6-31G* and B3LYP/6-31G* levels oftheory. The structures,enthalpies,entropies,Gibbs free energies,relative tautomerization energies of tautomersand tautomeric equilibrium constants were compared and analyzed along with full geometry optimization. Thecalculations showed that the Oxo-amino(6), Oxo-imino(7) and Hydroxy-amino(4) tautomers are the most stablein the gas phase. The results are in a good agreement with the available experimental data. The entropy effecton the Gibbs free energy of the 5-methylcytosine bases is very small and it has a little significance on thetautomeric equilibria of pyrimidine bases.Therefore the enthalpic term is dominant in the determination of theequilibrium constants. 13C-NMR studies have been carried out for these tautomers and the results arediscussed.We have also evaluated the hybridation coefficient for bonds and hetero atom LPS in the aromaticring for the stable tautomers. Natural Bond Orbital Theory (NBO) calculation showed that the stable tautomersmust be considered aromatic. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

3 - Thermodynamic Study and Total Energy Calculation for three systems of Enol↔Keto Tautomerism
H. Aghaie M. Monajjemi L. Papei

Using HartreeFock (HF) and ِِDensity Functional Theory (DFT) calculations the thermodynamic properties such as thermal energy , , thermal enthalpy , , thermal entropy , , thermal Gibbs free energy , , heat capacity ,Cv, and molecular structures of several species involv چکیده کامل

Using HartreeFock (HF) and ِِDensity Functional Theory (DFT) calculations the thermodynamic properties such as thermal energy , , thermal enthalpy , , thermal entropy , , thermal Gibbs free energy , , heat capacity ,Cv, and molecular structures of several species involving in keto↔enol tautomerism related to acetaldehyde (A), 5,5-dimethyl-1,3-cyclohexanedione (dimedone) and acetylacetone (AA) have been investigated. In addition, the geometric structure of all stages intervening in enol ↔ keto conversion related to three above mentioned compounds have been investigated on ab initio calculation and DFT level by using STO-3G, 6-31G, 6-31++G and 6-31++G** basis sets. The results showed that the enol structure related to acetylacetone is more stable because of intramolecular hydrogen bond formation in the enol form while the keto structure is more stable in acetaldehyde and dimedone because of strong C=O bond existence in the keto tautomers. The computed HF/DFT results are in a good agreement with the experimental studies. Moreover,the values of , , and thermodynamic equilibrium constant, Kth, of tautomerization phenomenon related to acetaldehyde, dimedone and acetylacetone are calculated on the basis of DFT-IR method. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

4 - Computational Investigation on Alcohol Nano Sensors in Combination with Carbon Nanotube; A Monte Carlo and Ab Initio Simulation
M. Falahati M. Monajjemi

Single walled nanotubes (SWNT) are common interested nanovehicle to make biosensors more sensitive.Carbon nanotubes (CNTs) have many distinct properties make them to be exploited to develop the nextgeneration of such nano sensors .The Keto-Enol tautomerization is one of چکیده کامل

Single walled nanotubes (SWNT) are common interested nanovehicle to make biosensors more sensitive.Carbon nanotubes (CNTs) have many distinct properties make them to be exploited to develop the nextgeneration of such nano sensors .The Keto-Enol tautomerization is one of the most common investigatedsubjects of isomerism in this regards, sensors are devices that are able to detect and change the physicalproperties of such reactions to measurable electrical signal. Some chemicals with the properties to do Keto-Enoltautomerization are substituted to CNTs and the physico chemical properties are simulated. Hyperchem is usedas main software to design the CNT Sensor and the main physical properties are calculated after monte carlosimulation. The systems have been optimized at first by UFF method. In all situation the energy minimizationhave been done by MAC and the frilly optimized systems have transferred to Guassian98, after finaloptimization with 6-31G , 1-IF method. The stability, electrical changes and physico chemical properties werecalculated and compared to find in which situation Caffeic Acid and SWNT have the most stability state. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

5 - بررسی تئوری توتومریزاسیون 3-Amino-1H-1,2,4-Triazol-5(4H)-One با استفاده از محاسبات کوانتومی به روش DFT
بهزاد چهکندی

در این تحقیق بررسی توتومریزاسیون و حالت‌های گذار مولکول 3-آمینو-1H-4،2،1- تری‌آزول-5)4H (- اٌن که حاصل از انتقالات 1و3 پروتون بین اتم های اکسیژن و نیتروژن است با استفاده از محاسبات کوانتومی در سطح محاسباتیDFT-B3LYP/6-311++G(d,p)، در فاز گازی و در محیطی با حضور یک و دو م چکیده کامل

در این تحقیق بررسی توتومریزاسیون و حالت‌های گذار مولکول 3-آمینو-1H-4،2،1- تری‌آزول-5)4H (- اٌن که حاصل از انتقالات 1و3 پروتون بین اتم های اکسیژن و نیتروژن است با استفاده از محاسبات کوانتومی در سطح محاسباتیDFT-B3LYP/6-311++G(d,p)، در فاز گازی و در محیطی با حضور یک و دو مولکول آب انجام شده است. بدین منظور ساختار بهینه توتومرهای مختلف مولکول مورد نظر بدست آمده‌اند. همچنین با استفاده از محاسبات فرکانس در سطح محاسباتی مشابه، خواص ترمودینامیکی تعادل‌های مختلف توتومری از قبیل E∆، H∆، G∆ وKeq بدست آمده‌اند. سپس با استفاده از روش‌های QST2 و QST3 حالت های گذار تعادل‌های توتومری مختلف مولکول3-آمینو-1H-4،2،1- تری‌آزول-5)4H (- اٌن و مقادیر سینتیکی و ترمودینامیکی آنها محاسبه شده‌اند. اثرات تونل‌زنی نیز بر روی سرعت واکنش‌های مربوطه بررسی شده‌اند. نتایج نشان میدهند ثابت سرعت واکنش‌های توتومری مورد بررسی نسبت به اثرات تونل‌زنی حساسیت بالایی دارند و سرعت واکنش های توتومری در حدود چهار تا پنج برابر افزایش می‌یابند. همچنین محاسبات حالت گذارنشان می دهند در غیاب مولکول‌های آب سد انرژی مقدار بالایی دارد و سرعت واکنش های توتومری عمدتاً بدون حضور کاتالیزور خیلی آهسته بوده به عبارتی انجام‌پذیر نیستند. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

6 - بررسی توتومریزاسیون (C-O) یکی از مشتقات فلوسیتوزین با استفاده از روش DFT
بهزاد چهکندی

در این تحقیق بررسی توتومریزاسیون و حالت‌های گذار 6-هیدروکسی 5-فلوئوروسیتوزین که حاصل از انتقالات 1و3 پروتون بین اتم های اکسیژن و کربن است با استفاده از محاسبات کوانتومی در سطح محاسباتیDFT-B3LYP/6-311++G(d,p)، در فاز گازی و حلال و در محیطی با حضور یک تا سه مولکول آب انجا چکیده کامل

در این تحقیق بررسی توتومریزاسیون و حالت‌های گذار 6-هیدروکسی 5-فلوئوروسیتوزین که حاصل از انتقالات 1و3 پروتون بین اتم های اکسیژن و کربن است با استفاده از محاسبات کوانتومی در سطح محاسباتیDFT-B3LYP/6-311++G(d,p)، در فاز گازی و حلال و در محیطی با حضور یک تا سه مولکول آب انجام شده است. بدین منظور ساختار بهینه توتومرهای مختلف مولکول مورد نظر بدست آمده‌اند. همچنین با استفاده از محاسبات فرکانس در سطح محاسباتی مشابه، خواص ترمودینامیکی تعادل‌های مختلف توتومری از قبیل E∆، H∆، G∆ وKeq بدست آمده‌اند. سپس با استفاده از روش‌های QST2 و QST3 حالت های گذار تعادل‌های توتومری مختلف مولکول -هیدروکسی 5-فلوئوروسیتوزین و مقادیر سینتیکی و ترمودینامیکی آنها محاسبه شده-اند. اثرات تونل‌زنی نیز بر روی سرعت واکنش‌های مربوطه بررسی شده‌اند. نتایج نشان میدهند ثابت سرعت واکنش‌های توتومری مورد بررسی در هر دو فاز گاز و حلال نسبت به اثرات تونل‌زنی حساسیت بالایی دارند و سرعت واکنش های توتومری در حدود پنج برابر یا بیشتر افزایش می‌یابند. همچنین محاسبات حالت گذارنشان می دهند در غیاب مولکول‌های آب سد انرژی مقدار بالایی دارد و سرعت واکنش های توتومری عمدتاً بدون حضور کاتالیزور خیلی آهسته بوده به عبارتی انجام‌پذیر نیستند. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

7 - مطالعه نظری توتومری در2-آمینو-7 H– پورین- 6- تیول با استفاده از تئوری تابعی چگال
سید جواد حسینی بیتا محمداصغری

مطالعه در سطح محاسباتی(B3LYP/6-31++G(d,p روی توتومری در مولکول2-آمینو-7 H-پورین- 6- تیول به 2-آمینو-9H- پورین- 6- تیول انجام شد. ابن توتومری می‌تواند از طریق سه راه مختلف کهA،B و C نامیده شده اند انجام شود. نتایج مربوط به فاز گاز نشان می‌دهد که هر سه مسیرA، B و C دارای چکیده کامل

مطالعه در سطح محاسباتی(B3LYP/6-31++G(d,p روی توتومری در مولکول2-آمینو-7 H-پورین- 6- تیول به 2-آمینو-9H- پورین- 6- تیول انجام شد. ابن توتومری می‌تواند از طریق سه راه مختلف کهA،B و C نامیده شده اند انجام شود. نتایج مربوط به فاز گاز نشان می‌دهد که هر سه مسیرA، B و C دارای انرژی آزاد گیبس فعال سازی بسیار بالای به ترتیبkcal/mol6/47 ،4/69 و1/52 بوده ، بنابراین ابن فرایند نمی‌‌‌تواند در فاز گاز انجام شود. در صورت لحاظ اثر ثابت دی الکتریک حلال (آب)انرژی آزاد گیبس فعال سازی به ترتیبkcal/mol1/51 ، 1/71 و4/55 افزایش می‌یابدکه نشان دهنده عدم نقش کلیدی اثرات دوربرد حلال در این فرایند است. گنجاندن سه مولکول آب و مشارکت مستقیم آنها در فرایند انتقال پروتون موجب کاهش انرژی آزاد گیبس فعال سازی بهkcal/mol 8/24می‌شود که نشان دهتده اهمیت اثرات کوتاه برد مولکول های حلال در این فرایند است. ترکیب اثرات کوتاه و دوربرد مولکول های حلال نیز منجر کاهش انرژی آزاد گیبس فعال سازی بهkcal/mol 6/23 شد. نتایج به وضوح نشان می دهد یک حلال قطبی پروتیک می‌تواندسد انرژی را در توتومری در مولکول2-آمینو-7 H- پورین- 6- تیول به -آمینو-9H- پورین- 6- تیول کاهش دهد. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

8 - Investigation into the regioisomeric composition of some fused tetrazoles
Paria Nasehi Omid Baravaye Sanaz Hafezi Birgani Mohsen Nikpour

Treatment of 7-chloro-1-phenylpyrimido[4,5-e][1,3,4]thiadiazines with hydrazine in boiling ethanol gave corresponding7-hydrazinyl derivatives. Diazotization of the latter compounds acheived a mixture of 5H-tetrazolo[1',5':1,2]pyrimido[4,5-e][1,3,4]thiadiazine and 9H-tet چکیده کامل

Treatment of 7-chloro-1-phenylpyrimido[4,5-e][1,3,4]thiadiazines with hydrazine in boiling ethanol gave corresponding7-hydrazinyl derivatives. Diazotization of the latter compounds acheived a mixture of 5H-tetrazolo[1',5':1,2]pyrimido[4,5-e][1,3,4]thiadiazine and 9H-tetrazolo[5',1':2,3]pyrimido[4,5-e][1,3,4]thiadiazines. Ratio of these two group of products determined by 1HNMR studies and no significant preference was observed for their formation. Efforts for separation of the products were unsuccessful and its reason is discussed. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

9 - Change of the tautomeric preference for radical cation of pyruvic acid. DFT studies in the gas phase
Ewa Daniela Raczyńska Malgorzta Hallmann Kinga Duczmal

Keto-enol tautomerism was investigated for ionized pyruvic acid using the DFT(B3LYP) method and the larger basis sets [6-31++G(d,p), 6-311++G(3df, 3pd) and aug-cc-pVDZ]. Change of the tautomeric preference was observed when going from the neutral to ionized tautomeric m چکیده کامل

Keto-enol tautomerism was investigated for ionized pyruvic acid using the DFT(B3LYP) method and the larger basis sets [6-31++G(d,p), 6-311++G(3df, 3pd) and aug-cc-pVDZ]. Change of the tautomeric preference was observed when going from the neutral to ionized tautomeric mixture. Ionization favors the enolization process (ketoenol) of pyruvic acid, whereas the ketonization (ketoenol) is preferred for the neutral system. Ionization influences also -electron delocalization, which increases exceptionally in the enol form, and slightly decreases in the keto form. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

10 - Tautomeric equilibria for ionized oxamic acid - inhibitor of LDH
Ewa D. Raczyńska Małgorzata Hallmann Kinga Duczmal

Amide-iminol tautomerism was studied for ionized oxamic acid (OA+•) in the gas phase using theDFT method with the UB3LYP functional and various basis sets {6-31++G(d,p), 6-311+G(d,p), and augcc-pVDZ}. Among twenty tautomers-rotamers possible for OA+•, eleven i چکیده کامل

Amide-iminol tautomerism was studied for ionized oxamic acid (OA+•) in the gas phase using theDFT method with the UB3LYP functional and various basis sets {6-31++G(d,p), 6-311+G(d,p), and augcc-pVDZ}. Among twenty tautomers-rotamers possible for OA+•, eleven isomers were found to bethermodynamically stable. Similarly as for the neutral molecule, ionization (OA → OA+• + e) favors theamidization process (amide ← iminol). Isomerization seems to change solely the conformationalpreferences. π-Electron delocalization in the NCO and OCO moieties is close to that for n-π conjugatedfragments. پرونده مقاله

دسترسی آزاد مقاله

11 - Tautomeric behaviors of 5-arylazobarbituric acids in different concentrations
Nader Noroozi Pesyan Jabbar Khalafy Karim Akbari Dilmaghani, Saeed Rastgar, Zahra Malekpoor, Mina Mohammadzadeh

The NMR spectra of azo dyes, 5-arylazobarbituric (5a-g), 5-arylazo-1,3-dimethylbarbituric(6a-g) and 5-arylazothiobarbituric acids (7a-g) were studied in DMSO-d6 in differentconcentrations. An intramolecular hydrogen bond was observed and indicating that thehydrazone for چکیده کامل

The NMR spectra of azo dyes, 5-arylazobarbituric (5a-g), 5-arylazo-1,3-dimethylbarbituric(6a-g) and 5-arylazothiobarbituric acids (7a-g) were studied in DMSO-d6 in differentconcentrations. An intramolecular hydrogen bond was observed and indicating that thehydrazone forms is mostly predominant. The peak of the hydrazone proton was severelybroadened and its chemical shift appeared at down field due to intramolecular hydrogen bond.Existence of nitro group at ortho-position on phenyl ring caused the chemical shift value of theproton of hydrazone form in 5a-7a to be more deshielded than other hydrazone protons in 5bg−7b-g due to bifurcated intramolecular hydrogen bond and anisotropic ring-current effect. Dyes6 shows two tautomers in NMR time scale at low concentration in DMSO-d6. پرونده مقاله

فهرست مقالات Tautomerism

سکوی نشر دانش

پیوندهای سایت

مراکز مرتبط

پشتیبانی

صفحات رسمی