فهرست مقالات طراحی پرایمر

• دسترسی آزاد مقاله
  • صفحه چکیده
  • متن کامل
  
  1 - بررسی فراوانی و الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی عفونت های Acinetobacter spp. در مراکز درمانی شهرکرد
  توحید پیری قراقیه عباس دوستی سیدعباس میرزایی
  10.30495/jdb.2021.686587
  مطالعه انجام شده به برآورد میزان شیوع و الگوی مقاومت ضد میکروبی ایزوله های Acinetobacter spp. از نمونه های مختلف بالینی پرداخته است. با نرم افزارهای بیوانفورماتیکی Primer Express و Gene Runner طراحی پرایمر برای جنس Acinetobacter spp. انجام شد. تایید صحت پرایمر توسط ابزا چکیده کامل

  مطالعه انجام شده به برآورد میزان شیوع و الگوی مقاومت ضد میکروبی ایزوله های Acinetobacter spp. از نمونه های مختلف بالینی پرداخته است. با نرم افزارهای بیوانفورماتیکی Primer Express و Gene Runner طراحی پرایمر برای جنس Acinetobacter spp. انجام شد. تایید صحت پرایمر توسط ابزار آنلاین BLASTn و برنامه Sequence Match انجام شد. ایزوله های Acinetobacter از نمونه‌های مختلف بالینی با روش‌های استاندارد بیوشیمیایی و تست PCR شناسایی شدند. آزمایشات حساسیت ضدمیکروبی و تشخیص بیوفیلم برای ایزوله‌های شناسایی شده به روش استاندارد دیسک‌دیفیوژن مطابق پروتکل CLSI‌ و میکروتیترپلیت انجام شد. پرایمر طراحی شده Acinetobacter spp را با Query Cover و نمره Per. Ident برابر با 100% شناسایی کرد. از 60 نمونه بالینی، 243 ایزوله باکتریایی به دست آمد.‌131ایزوله (9/53 %) مربوط به باکتری های گرم مثبت و 112 ایزوله (09/46 %) مربوط به باکتری های گرم منفی بود که 43 ایزوله (69/17 %) به عنوان Acinetobacter ، شناسایی شد. مطابق آزمون PCR 31 سویه (5/77 %) به عنوان Acinetobacter baumannii، 7 سویه (5/17 %) به عنوانAcinetobacter lwoffii ، 2 سویه (5%) به عنوان junii Acinetobacter شناسایی شد. مطالعه حساسیت آنتی بیوتیکی نشان داد که تمام سویه های جداشده MDR بوده و 5/87 % ایزوله ها XDR بودند. تمام ایزوله های Acinetobacter بیوفیلم مثبت بوده و با میانگین کل 213/0 به عنوان بیوفیلم قوی شناخته شدند. با توجه به بررسی انجام شده پیشگیری و جلوگیری از عفونت این جنس باکتریایی خصوصا Acinetobacter baumannii بسیار مهم و ضروری می باشد. پرونده مقاله
• دسترسی آزاد مقاله
  • صفحه چکیده
  • متن کامل
  
  2 - تکثیر هم‌دمایی به واسطه حلقه: روش تشخیص سریع و کم هزینه عوامل عفونی
  اعظم عسکری محمد کارگر صادق قربانی دالینی عباس دوستی
  روش تکثیر هم دمایی به واسطه حلقه (LAMP) مبتنی بر تکثیر اسید نوکلئیک در دمای ثابت ˚C 65-62 است. در این روش بدون نیاز به مرحله واسرشت شدن حرارتی، به کمک آنزیم DNA پلی مراز Bst به صورت هم زمان امکان جداسازی و تکثیر دو رشته DNA وجود دارد. بنابراین بر خلاف سایر روش های متداو چکیده کامل

  روش تکثیر هم دمایی به واسطه حلقه (LAMP) مبتنی بر تکثیر اسید نوکلئیک در دمای ثابت ˚C 65-62 است. در این روش بدون نیاز به مرحله واسرشت شدن حرارتی، به کمک آنزیم DNA پلی مراز Bst به صورت هم زمان امکان جداسازی و تکثیر دو رشته DNA وجود دارد. بنابراین بر خلاف سایر روش های متداول تکثیری ، بدون نیاز به چرخه های دمایی و دستگاه ترموسایکلر و با استفاده از تجهیزات ارزان قیمتی مانند حمام آب گرم و یا بلوک حرارتی قابل انجام است. برای طراحی واکنش LAMP نیاز به 6 عدد پرایمر وجود دارد که توانایی اتصال کاملاً اختصاصی به 8 ناحیه مجزا از توالی هدف را داشته باشند. در نتیجه واکنش LAMP مقدار بسیار زیادی محصول ایجاد می شود که بدون نیاز به روش پر زحمت الکتروفورز در ژل، به کمک روش های ساده تری مانند مشاهده کدورت و یا تغییر رنگ ناشی از رنگ های فلورسنس در مخلوط واکنش به سادگی قابل تشخیص می باشد. بدین ترتیب روش LAMP با توجه به مزایایی مانند حساسیت و ویژگی مناسب ، کارایی بالا ، عدم نیاز به تجهیزات آزمایشگاهی گران قیمت و سادگی تشخیص، می تواند به عنوان ابزاری ارزشمند برای تشخیص سریع بیماری های عفونی در آزمایشگاه های کلینیکی و بیمارستانی به ویژه در کشورهای درحال توسعه به کار برده شود. این مقاله با هدف معرفی مبانی و کاربردهای روش LAMP در تشخیص عوامل عفونی تدوین گردیده است. پرونده مقاله