فهرست مقالات آتاسین

• دسترسی آزاد مقاله
  • صفحه چکیده
  • متن کامل
  
  1 - مطالعه بیوانفورماتیک پپتید ضد باکتریایی آتاسین a1 از حشرهTenebrio molitor
  محمدحسین کریمی گرجی مهدی گلستانی نسب شکیبا درویش علیپور
  10.30495/jmw.2022.1958619.2020
  سابقه و هدف: امروزه پپتید های ضد میکروبی تولید شده از حشرات بهدلیل تاثیر ضد باکتری‌ های بیماری‌ زا با اثرات جانبی کمتر، مورد توجه هستند. هدف از این مطالعه، بررسی خواص فیزیکی-شیمیایی آتاسین 1a بهعنوان ترکیب ضد باکتریایی برای انجام پژوهش‌ های آزمایشگاهی بر پایه‌ ی تولید چکیده کامل

  سابقه و هدف: امروزه پپتید های ضد میکروبی تولید شده از حشرات بهدلیل تاثیر ضد باکتری‌ های بیماری‌ زا با اثرات جانبی کمتر، مورد توجه هستند. هدف از این مطالعه، بررسی خواص فیزیکی-شیمیایی آتاسین 1a بهعنوان ترکیب ضد باکتریایی برای انجام پژوهش‌ های آزمایشگاهی بر پایه‌ ی تولید حامل‌ های دارو رسانی و طراحی واکسن، با استفاده از روش‌ های بیوانفورماتیک است.مواد و روش‌ ها: در این پژوهش توالی ژن کد کننده پپتید ضد میکروبی آتاسین 1a تولید شده از حشره T. molitor، از پایگاه داده NCBI، با نشانی www.ncbi.nlm.nih.gov، در فرمت FASTA دریافت شد. وزن مولکولی، میزان مشابهت و تفاوت میان توالی‌ های آتاسین1a با سایر پپتید‌‌ های همولوگ، و مشخصات فیزیکی-شیمیایی مولکول بررسی گردید. همچنین ساختار دوم و شکل فضایی پپتید آتاسین1a، با استفاده از نرم افزار‌های بیوانفورماتیک پیشگویی و میزان عملکرد و ایمنی زایی پپتید مطالعه شد.یافته ها: توالی آمینو اسیدی پپتید آتاسین1a، با پپتید های مشابه در 10 عضو از زیر راسته Polyphaga، در نواحی مرکزی و انتهایی (-cترمینال) مشابه است. ویژگی‌ های ساختاری و بیوشیمیایی آتاسین1a، 51% آمینو اسید های غیر قطبی با شاخص بی نظمی %61 و انعطاف پذیری 53% را نشان می‌ دهد. ساختار دوم آتاسین1a، شامل 52/60% پیچ های تصادفی، 1/43% صفحات بتا و 21/43% مارپیچ آلفا است. پیشگویی ساختار سوم در پایگاه Phyre2، 32% هم‌ پوشانی و 31/1% اعتبار سنجی به پروتین متعلق به بتا شبه ایمونوگلوبولین (d2aw2a1) را نشان می دهد. این پپتید توانایی بالایی در تحریک سیستم ایمنی ندارد.نتیجه گیری: فراوانی صفحات بتا در ساختار آتاسین 1a، دلیلی بر پایداری مولکول و افزایش توانایی آن در عبور از غشای سلولی باکتری‌ ها است. پرونده مقاله